MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_015697	AAT	2	6	863287	863292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203225
16003	NC_015697	CAA	2	6	863309	863314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203225
16004	NC_015697	CAA	2	6	863318	863323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203225
16005	NC_015697	AAT	2	6	863355	863360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203225
16006	NC_015697	TAA	2	6	863423	863428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203225
16007	NC_015697	ATA	2	6	863491	863496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203225
16008	NC_015697	ACA	2	6	863575	863580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203225
16009	NC_015697	GGA	2	6	863612	863617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338203225
16010	NC_015697	CAT	2	6	863747	863752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203225
16011	NC_015697	GTA	2	6	863761	863766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203225
16012	NC_015697	ATT	2	6	863966	863971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338203226
16013	NC_015697	AAT	2	6	864046	864051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16014	NC_015697	CAA	2	6	864063	864068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203226
16015	NC_015697	AGC	2	6	864133	864138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16016	NC_015697	TCA	2	6	864182	864187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203226
16017	NC_015697	TAA	2	6	864210	864215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16018	NC_015697	CGTTGA	2	12	864236	864247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338203226
16019	NC_015697	CCA	2	6	864248	864253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338203226
16020	NC_015697	CAA	2	6	864276	864281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203226
16021	NC_015697	CTT	2	6	864297	864302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203226
16022	NC_015697	CTG	2	6	864315	864320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16023	NC_015697	TGC	2	6	864419	864424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16024	NC_015697	T	6	6	864466	864471	0 %	100 %	0 %	0 %	338203226
16025	NC_015697	TCC	2	6	864562	864567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338203226
16026	NC_015697	AAT	2	6	864568	864573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16027	NC_015697	GCA	2	6	864761	864766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16028	NC_015697	AACAAA	2	12	864784	864795	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338203226
16029	NC_015697	CAT	2	6	864808	864813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203226
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16032	NC_015697	AAT	2	6	864953	864958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16033	NC_015697	AAT	2	6	865130	865135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16034	NC_015697	CAT	2	6	865156	865161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203226
16035	NC_015697	AAT	2	6	865165	865170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203226
16036	NC_015697	AC	3	6	865235	865240	50 %	0 %	0 %	50 %	338203226
16037	NC_015697	GCA	2	6	865241	865246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16038	NC_015697	CAT	2	6	865270	865275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203226
16039	NC_015697	CACC	2	8	865416	865423	25 %	0 %	0 %	75 %	338203226
16040	NC_015697	ATTG	2	8	865427	865434	25 %	50 %	25 %	0 %	338203226
16041	NC_015697	TGC	2	6	865480	865485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203226
16042	NC_015697	CGG	2	6	865560	865565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338203226
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16046	NC_015697	ATCT	2	8	865749	865756	25 %	50 %	0 %	25 %	338203227
16047	NC_015697	GAT	2	6	865799	865804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203227
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16049	NC_015697	TAAT	2	8	865892	865899	50 %	50 %	0 %	0 %	338203227
16050	NC_015697	T	6	6	865913	865918	0 %	100 %	0 %	0 %	338203227
16051	NC_015697	ATT	2	6	865989	865994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338203227
16052	NC_015697	AAT	2	6	866055	866060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203227
16053	NC_015697	TGA	2	6	866065	866070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203227
16054	NC_015697	AAT	2	6	866089	866094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203227
16055	NC_015697	TAG	2	6	866114	866119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338203227
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16057	NC_015697	AAT	2	6	866186	866191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203227
16058	NC_015697	AATC	2	8	866400	866407	50 %	25 %	0 %	25 %	338203228
16059	NC_015697	TTC	2	6	866417	866422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338203228
16060	NC_015697	TAA	2	6	866429	866434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203228
16061	NC_015697	A	7	7	866433	866439	100 %	0 %	0 %	0 %	338203228
16062	NC_015697	GAA	2	6	866466	866471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338203228
16063	NC_015697	ATC	2	6	866497	866502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203228
16064	NC_015697	A	6	6	866553	866558	100 %	0 %	0 %	0 %	338203228
16065	NC_015697	CTG	2	6	866605	866610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203228
16066	NC_015697	GCT	2	6	866760	866765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338203228
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16077	NC_015697	CATCTA	2	12	867590	867601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203229
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16102	NC_015697	TA	3	6	869387	869392	50 %	50 %	0 %	0 %	338203232
16103	NC_015697	AGC	2	6	869469	869474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338203232
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16106	NC_015697	TGTAA	2	10	869551	869560	40 %	40 %	20 %	0 %	338203232
16107	NC_015697	T	6	6	869566	869571	0 %	100 %	0 %	0 %	338203232
16108	NC_015697	ATC	3	9	869683	869691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203232
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16111	NC_015697	TGAAC	2	10	869908	869917	40 %	20 %	20 %	20 %	338203233
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16115	NC_015697	TAA	2	6	870034	870039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203233
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16481	NC_015697	TCA	2	6	887016	887021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338203254
16482	NC_015697	AAGC	2	8	887085	887092	50 %	0 %	25 %	25 %	338203254
16483	NC_015697	CCAT	2	8	887128	887135	25 %	25 %	0 %	50 %	338203254
16484	NC_015697	CAA	2	6	887233	887238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338203254
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16486	NC_015697	AAT	2	6	887303	887308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338203254
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