MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015697	TAT	2	6	533538	533543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202899
10003	NC_015697	TCT	2	6	533555	533560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202899
10004	NC_015697	GCT	2	6	533747	533752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202899
10005	NC_015697	AGA	2	6	533820	533825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202899
10006	NC_015697	CAA	2	6	533857	533862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202899
10007	NC_015697	CGC	2	6	533886	533891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202899
10008	NC_015697	CAC	2	6	533916	533921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202899
10009	NC_015697	CAA	2	6	533947	533952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202899
10010	NC_015697	AGA	2	6	533955	533960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202899
10011	NC_015697	AAC	2	6	534041	534046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202899
10012	NC_015697	ACA	2	6	534060	534065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202899
10013	NC_015697	GAA	2	6	534099	534104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202899
10014	NC_015697	CTT	2	6	534114	534119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202899
10015	NC_015697	TGA	2	6	534150	534155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202899
10016	NC_015697	A	6	6	534179	534184	100 %	0 %	0 %	0 %	338202899
10017	NC_015697	ACTTT	2	10	534209	534218	20 %	60 %	0 %	20 %	338202899
10018	NC_015697	AGT	2	6	534322	534327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202900
10019	NC_015697	GAT	2	6	534338	534343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202900
10020	NC_015697	AATT	2	8	534405	534412	50 %	50 %	0 %	0 %	338202900
10021	NC_015697	AGT	2	6	534425	534430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202900
10022	NC_015697	TGC	2	6	534468	534473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202900
10023	NC_015697	TGT	2	6	534502	534507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202900
10024	NC_015697	CAT	2	6	534554	534559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202900
10025	NC_015697	TTC	2	6	534562	534567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202900
10026	NC_015697	TAA	2	6	534588	534593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202901
10027	NC_015697	ATC	2	6	534610	534615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202901
10028	NC_015697	CTTT	2	8	534635	534642	0 %	75 %	0 %	25 %	338202901
10029	NC_015697	CAC	2	6	534747	534752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202901
10030	NC_015697	A	6	6	534794	534799	100 %	0 %	0 %	0 %	338202901
10031	NC_015697	CGT	2	6	534924	534929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202902
10032	NC_015697	CTTT	2	8	535040	535047	0 %	75 %	0 %	25 %	338202902
10033	NC_015697	GTG	2	6	535097	535102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202902
10034	NC_015697	ACA	2	6	535114	535119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202902
10035	NC_015697	CTG	2	6	535133	535138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202902
10036	NC_015697	TTC	2	6	535158	535163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202902
10037	NC_015697	CAA	3	9	535172	535180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202902
10038	NC_015697	CGG	2	6	535235	535240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202902
10039	NC_015697	GTG	2	6	535412	535417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202902
10040	NC_015697	GAG	2	6	535437	535442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202902
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10042	NC_015697	GTTC	2	8	535500	535507	0 %	50 %	25 %	25 %	338202902
10043	NC_015697	CGA	2	6	535568	535573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202902
10044	NC_015697	TTCGTA	2	12	535597	535608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338202902
10045	NC_015697	CAT	2	6	535620	535625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202902
10046	NC_015697	TCA	2	6	535687	535692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202902
10047	NC_015697	TAA	2	6	535716	535721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202902
10048	NC_015697	TAC	2	6	535785	535790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202902
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10050	NC_015697	TTG	2	6	535895	535900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202902
10051	NC_015697	AAT	2	6	535936	535941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202902
10052	NC_015697	CAT	2	6	535976	535981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202902
10053	NC_015697	GCG	2	6	535997	536002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202902
10054	NC_015697	ATC	2	6	536163	536168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202902
10055	NC_015697	TTC	2	6	536223	536228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202902
10056	NC_015697	TCC	2	6	536265	536270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202902
10057	NC_015697	TAT	2	6	536298	536303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202902
10058	NC_015697	AACAA	2	10	536304	536313	80 %	0 %	0 %	20 %	338202902
10059	NC_015697	TCT	2	6	536401	536406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202903
10060	NC_015697	TCT	2	6	536443	536448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202903
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10064	NC_015697	ATC	2	6	536613	536618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202903
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10067	NC_015697	CAT	2	6	536705	536710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202903
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10069	NC_015697	TGC	2	6	536871	536876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202903
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10084	NC_015697	TCA	2	6	537400	537405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202904
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10090	NC_015697	CTT	2	6	537641	537646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202904
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10100	NC_015697	TCA	2	6	538056	538061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202904
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10109	NC_015697	ATTT	2	8	538475	538482	25 %	75 %	0 %	0 %	338202904
10110	NC_015697	AGT	2	6	538561	538566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202904
10111	NC_015697	ACGA	2	8	538634	538641	50 %	0 %	25 %	25 %	338202904
10112	NC_015697	TTG	2	6	538786	538791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202904
10113	NC_015697	CCT	2	6	538816	538821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202905
10114	NC_015697	TCT	2	6	538832	538837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202905
10115	NC_015697	TGTT	2	8	538884	538891	0 %	75 %	25 %	0 %	338202905
10116	NC_015697	GAT	2	6	538908	538913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202905
10117	NC_015697	CAG	2	6	538952	538957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202905
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10119	NC_015697	ATC	2	6	539031	539036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202905
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10352	NC_015697	GCA	2	6	550220	550225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202915
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10354	NC_015697	AG	3	6	550280	550285	50 %	0 %	50 %	0 %	338202915
10355	NC_015697	TG	3	6	550287	550292	0 %	50 %	50 %	0 %	338202915
10356	NC_015697	CAG	2	6	550353	550358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202915
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10358	NC_015697	GTA	2	6	550396	550401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202915
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10479	NC_015697	TTAC	2	8	556474	556481	25 %	50 %	0 %	25 %	338202924
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10483	NC_015697	GTG	2	6	557089	557094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202926
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