MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015697	ATGA	2	8	293451	293458	50 %	25 %	25 %	0 %	338202663
5503	NC_015697	ATT	2	6	293566	293571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202664
5504	NC_015697	AGAGAT	2	12	293627	293638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338202664
5505	NC_015697	GAA	2	6	293676	293681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202664
5506	NC_015697	GGA	2	6	293921	293926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202664
5507	NC_015697	CAT	3	9	293958	293966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5508	NC_015697	CTT	2	6	293967	293972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202664
5509	NC_015697	CAT	2	6	293991	293996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5510	NC_015697	TGC	2	6	293997	294002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202664
5511	NC_015697	TAC	2	6	294054	294059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5512	NC_015697	CAT	2	6	294071	294076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5513	NC_015697	ATC	2	6	294136	294141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5514	NC_015697	GCAA	2	8	294217	294224	50 %	0 %	25 %	25 %	338202664
5515	NC_015697	CATC	2	8	294314	294321	25 %	25 %	0 %	50 %	338202664
5516	NC_015697	CAT	2	6	294351	294356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5517	NC_015697	AATT	2	8	294378	294385	50 %	50 %	0 %	0 %	338202664
5518	NC_015697	AAT	2	6	294408	294413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202664
5519	NC_015697	ATAA	2	8	294432	294439	75 %	25 %	0 %	0 %	338202664
5520	NC_015697	TCAT	2	8	294499	294506	25 %	50 %	0 %	25 %	338202664
5521	NC_015697	ATAA	2	8	294651	294658	75 %	25 %	0 %	0 %	338202664
5522	NC_015697	CAA	2	6	294674	294679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202664
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5524	NC_015697	CAT	2	6	294831	294836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202664
5525	NC_015697	CATTGC	2	12	294858	294869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338202664
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5530	NC_015697	TGC	2	6	295166	295171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202664
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5553	NC_015697	ATC	2	6	296351	296356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202666
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5603	NC_015697	CTTCAC	2	12	299217	299228	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338202667
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5985	NC_015697	ACC	2	6	319038	319043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202687
5986	NC_015697	TAA	2	6	319051	319056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202687
5987	NC_015697	TCG	2	6	319087	319092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202687
5988	NC_015697	CCA	2	6	319174	319179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202687
5989	NC_015697	GTC	2	6	319188	319193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202687
5990	NC_015697	T	6	6	319219	319224	0 %	100 %	0 %	0 %	338202687
5991	NC_015697	TGA	2	6	319258	319263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202687
5992	NC_015697	CTC	2	6	319275	319280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202687
5993	NC_015697	AGC	2	6	319282	319287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202687
5994	NC_015697	TGA	2	6	319308	319313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202687
5995	NC_015697	TGA	2	6	319315	319320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202687
5996	NC_015697	TGT	2	6	319339	319344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202687
5997	NC_015697	ATG	2	6	319365	319370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202687
5998	NC_015697	TACG	2	8	319377	319384	25 %	25 %	25 %	25 %	338202687
5999	NC_015697	GTT	2	6	319559	319564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202687
6000	NC_015697	T	7	7	319642	319648	0 %	100 %	0 %	0 %	338202687

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