MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 74161

< Previous12...137138139140141142143144145146147148149Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_015638	CTT	2	6	3289835	3289840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174101
74002	NC_015638	TTTAA	2	10	3289858	3289867	40 %	60 %	0 %	0 %	336174101
74003	NC_015638	ATA	2	6	3289908	3289913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174101
74004	NC_015638	CT	3	6	3289926	3289931	0 %	50 %	0 %	50 %	336174101
74005	NC_015638	GTT	2	6	3289946	3289951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174101
74006	NC_015638	CTT	2	6	3289983	3289988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174102
74007	NC_015638	ATT	2	6	3290023	3290028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174102
74008	NC_015638	T	6	6	3290031	3290036	0 %	100 %	0 %	0 %	336174102
74009	NC_015638	TAA	2	6	3290038	3290043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174102
74010	NC_015638	T	6	6	3290102	3290107	0 %	100 %	0 %	0 %	336174102
74011	NC_015638	TAA	2	6	3290141	3290146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174102
74012	NC_015638	GT	3	6	3290177	3290182	0 %	50 %	50 %	0 %	336174102
74013	NC_015638	A	6	6	3290212	3290217	100 %	0 %	0 %	0 %	336174102
74014	NC_015638	AAT	2	6	3290245	3290250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174102
74015	NC_015638	T	6	6	3290265	3290270	0 %	100 %	0 %	0 %	336174102
74016	NC_015638	AAC	2	6	3290278	3290283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174102
74017	NC_015638	ATT	2	6	3290386	3290391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174102
74018	NC_015638	GCA	2	6	3290435	3290440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336174102
74019	NC_015638	ATT	2	6	3290501	3290506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174102
74020	NC_015638	A	6	6	3290535	3290540	100 %	0 %	0 %	0 %	336174102
74021	NC_015638	TTC	2	6	3290549	3290554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174102
74022	NC_015638	AT	3	6	3290623	3290628	50 %	50 %	0 %	0 %	336174103
74023	NC_015638	TAT	2	6	3290633	3290638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174103
74024	NC_015638	CTA	2	6	3290665	3290670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174103
74025	NC_015638	TCT	2	6	3290682	3290687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174103
74026	NC_015638	ATTT	2	8	3290699	3290706	25 %	75 %	0 %	0 %	336174103
74027	NC_015638	A	8	8	3290708	3290715	100 %	0 %	0 %	0 %	336174103
74028	NC_015638	T	7	7	3290735	3290741	0 %	100 %	0 %	0 %	336174103
74029	NC_015638	A	6	6	3290767	3290772	100 %	0 %	0 %	0 %	336174103
74030	NC_015638	GTC	2	6	3290783	3290788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336174103
74031	NC_015638	TTA	2	6	3290817	3290822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174103
74032	NC_015638	T	6	6	3290832	3290837	0 %	100 %	0 %	0 %	336174103
74033	NC_015638	TTTA	2	8	3290903	3290910	25 %	75 %	0 %	0 %	336174103
74034	NC_015638	TAA	2	6	3290944	3290949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174103
74035	NC_015638	ATT	2	6	3290963	3290968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174103
74036	NC_015638	T	7	7	3290990	3290996	0 %	100 %	0 %	0 %	336174103
74037	NC_015638	TTTTG	2	10	3291123	3291132	0 %	80 %	20 %	0 %	336174103
74038	NC_015638	TTC	2	6	3291158	3291163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174103
74039	NC_015638	GT	3	6	3291184	3291189	0 %	50 %	50 %	0 %	336174103
74040	NC_015638	TTA	2	6	3291192	3291197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174103
74041	NC_015638	T	6	6	3291258	3291263	0 %	100 %	0 %	0 %	336174103
74042	NC_015638	CTT	2	6	3291298	3291303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174103
74043	NC_015638	CTT	2	6	3291391	3291396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174103
74044	NC_015638	T	6	6	3291435	3291440	0 %	100 %	0 %	0 %	336174103
74045	NC_015638	TTAA	2	8	3291447	3291454	50 %	50 %	0 %	0 %	336174103
74046	NC_015638	TGC	2	6	3291573	3291578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336174104
74047	NC_015638	TA	3	6	3291600	3291605	50 %	50 %	0 %	0 %	336174104
74048	NC_015638	TTGT	2	8	3291609	3291616	0 %	75 %	25 %	0 %	336174104
74049	NC_015638	T	6	6	3291645	3291650	0 %	100 %	0 %	0 %	336174104
74050	NC_015638	GA	3	6	3291689	3291694	50 %	0 %	50 %	0 %	336174104
74051	NC_015638	T	6	6	3291701	3291706	0 %	100 %	0 %	0 %	336174104
74052	NC_015638	CCA	2	6	3291757	3291762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336174104
74053	NC_015638	TCTA	2	8	3291777	3291784	25 %	50 %	0 %	25 %	336174104
74054	NC_015638	ATA	2	6	3291789	3291794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174104
74055	NC_015638	CAT	2	6	3291797	3291802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174104
74056	NC_015638	CTG	2	6	3291924	3291929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336174104
74057	NC_015638	TTA	2	6	3291941	3291946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174104
74058	NC_015638	ATT	3	9	3291951	3291959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174104
74059	NC_015638	GAA	2	6	3292032	3292037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336174105
74060	NC_015638	CAA	2	6	3292052	3292057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174105
74061	NC_015638	TAA	2	6	3292137	3292142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174105
74062	NC_015638	TAT	2	6	3292149	3292154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174105
74063	NC_015638	T	7	7	3292170	3292176	0 %	100 %	0 %	0 %	336174105
74064	NC_015638	TGG	2	6	3292194	3292199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336174105
74065	NC_015638	GTT	3	9	3292225	3292233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174105
74066	NC_015638	A	7	7	3292284	3292290	100 %	0 %	0 %	0 %	336174105
74067	NC_015638	TTTAAA	2	12	3292335	3292346	50 %	50 %	0 %	0 %	336174105
74068	NC_015638	TAAA	2	8	3292376	3292383	75 %	25 %	0 %	0 %	336174105
74069	NC_015638	TC	3	6	3292433	3292438	0 %	50 %	0 %	50 %	336174105
74070	NC_015638	AAATT	2	10	3292472	3292481	60 %	40 %	0 %	0 %	336174105
74071	NC_015638	ACAT	2	8	3292504	3292511	50 %	25 %	0 %	25 %	336174106
74072	NC_015638	TAA	2	6	3292533	3292538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174106
74073	NC_015638	TGGT	2	8	3292568	3292575	0 %	50 %	50 %	0 %	336174106
74074	NC_015638	A	7	7	3292687	3292693	100 %	0 %	0 %	0 %	336174106
74075	NC_015638	ACC	2	6	3292740	3292745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336174106
74076	NC_015638	ATT	2	6	3292759	3292764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174106
74077	NC_015638	CAC	2	6	3292765	3292770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336174106
74078	NC_015638	TGT	2	6	3292782	3292787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174106
74079	NC_015638	GAT	2	6	3292801	3292806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174106
74080	NC_015638	A	6	6	3292833	3292838	100 %	0 %	0 %	0 %	336174106
74081	NC_015638	CAC	2	6	3292897	3292902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336174106
74082	NC_015638	T	7	7	3292908	3292914	0 %	100 %	0 %	0 %	336174106
74083	NC_015638	ATA	2	6	3292922	3292927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174106
74084	NC_015638	A	6	6	3292927	3292932	100 %	0 %	0 %	0 %	336174106
74085	NC_015638	TA	3	6	3292939	3292944	50 %	50 %	0 %	0 %	336174106
74086	NC_015638	CAGAA	2	10	3292992	3293001	60 %	0 %	20 %	20 %	336174106
74087	NC_015638	GC	3	6	3293055	3293060	0 %	0 %	50 %	50 %	336174106
74088	NC_015638	TAG	2	6	3293078	3293083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174106
74089	NC_015638	ACA	3	9	3293086	3293094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174106
74090	NC_015638	AAT	2	6	3293170	3293175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174106
74091	NC_015638	CT	3	6	3293179	3293184	0 %	50 %	0 %	50 %	336174106
74092	NC_015638	TAA	2	6	3293202	3293207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174106
74093	NC_015638	TTTA	2	8	3293262	3293269	25 %	75 %	0 %	0 %	336174106
74094	NC_015638	TTA	2	6	3293288	3293293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174106
74095	NC_015638	TTA	2	6	3293324	3293329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174106
74096	NC_015638	AGA	2	6	3293424	3293429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336174106
74097	NC_015638	TTA	2	6	3293449	3293454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174106
74098	NC_015638	TTA	2	6	3293544	3293549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174107
74099	NC_015638	AAG	2	6	3293559	3293564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336174107
74100	NC_015638	TGA	2	6	3293611	3293616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174107
74101	NC_015638	A	6	6	3293708	3293713	100 %	0 %	0 %	0 %	336174107
74102	NC_015638	TAT	2	6	3293737	3293742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174107
74103	NC_015638	A	8	8	3293793	3293800	100 %	0 %	0 %	0 %	336174107
74104	NC_015638	ACA	2	6	3293854	3293859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174107
74105	NC_015638	TAA	2	6	3293893	3293898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174107
74106	NC_015638	TC	4	8	3293905	3293912	0 %	50 %	0 %	50 %	336174107
74107	NC_015638	ATG	2	6	3293921	3293926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174107
74108	NC_015638	AAT	2	6	3293969	3293974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174107
74109	NC_015638	GAT	2	6	3294002	3294007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174107
74110	NC_015638	AAC	2	6	3294059	3294064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174107
74111	NC_015638	ATTT	2	8	3294087	3294094	25 %	75 %	0 %	0 %	336174107
74112	NC_015638	ATTT	2	8	3294108	3294115	25 %	75 %	0 %	0 %	336174107
74113	NC_015638	TCT	2	6	3294123	3294128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336174108
74114	NC_015638	TTA	2	6	3294172	3294177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74115	NC_015638	TAA	2	6	3294212	3294217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174108
74116	NC_015638	ATT	2	6	3294218	3294223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74117	NC_015638	TAC	2	6	3294234	3294239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174108
74118	NC_015638	TGT	2	6	3294267	3294272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174108
74119	NC_015638	CATA	2	8	3294282	3294289	50 %	25 %	0 %	25 %	336174108
74120	NC_015638	T	7	7	3294311	3294317	0 %	100 %	0 %	0 %	336174108
74121	NC_015638	TATT	2	8	3294326	3294333	25 %	75 %	0 %	0 %	336174108
74122	NC_015638	A	6	6	3294464	3294469	100 %	0 %	0 %	0 %	336174108
74123	NC_015638	ATT	2	6	3294478	3294483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74124	NC_015638	ATAAAA	2	12	3294535	3294546	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	336174108
74125	NC_015638	A	6	6	3294543	3294548	100 %	0 %	0 %	0 %	336174108
74126	NC_015638	TAT	2	6	3294566	3294571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74127	NC_015638	ACT	2	6	3294595	3294600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174108
74128	NC_015638	T	6	6	3294647	3294652	0 %	100 %	0 %	0 %	336174108
74129	NC_015638	ATT	2	6	3294679	3294684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74130	NC_015638	AAATTT	2	12	3294721	3294732	50 %	50 %	0 %	0 %	336174108
74131	NC_015638	TGG	2	6	3294750	3294755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336174108
74132	NC_015638	AGT	2	6	3294768	3294773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174108
74133	NC_015638	ACT	3	9	3294776	3294784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174108
74134	NC_015638	TATT	2	8	3294786	3294793	25 %	75 %	0 %	0 %	336174108
74135	NC_015638	TTA	2	6	3294889	3294894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336174108
74136	NC_015638	T	6	6	3294895	3294900	0 %	100 %	0 %	0 %	336174108
74137	NC_015638	A	6	6	3294918	3294923	100 %	0 %	0 %	0 %	336174108
74138	NC_015638	ATA	2	6	3294985	3294990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174109
74139	NC_015638	GAA	2	6	3295023	3295028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336174109
74140	NC_015638	TTTA	2	8	3295031	3295038	25 %	75 %	0 %	0 %	336174109
74141	NC_015638	T	6	6	3295056	3295061	0 %	100 %	0 %	0 %	336174109
74142	NC_015638	A	6	6	3295097	3295102	100 %	0 %	0 %	0 %	336174109
74143	NC_015638	A	7	7	3295118	3295124	100 %	0 %	0 %	0 %	336174109
74144	NC_015638	CAAG	2	8	3295134	3295141	50 %	0 %	25 %	25 %	336174109
74145	NC_015638	ATG	3	9	3295195	3295203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174109
74146	NC_015638	TAA	2	6	3295211	3295216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174109
74147	NC_015638	GTT	3	9	3295278	3295286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174109
74148	NC_015638	TGG	2	6	3295316	3295321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336174109
74149	NC_015638	TAA	2	6	3295324	3295329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336174109
74150	NC_015638	TTAA	2	8	3295404	3295411	50 %	50 %	0 %	0 %	336174109
74151	NC_015638	AAAAG	2	10	3295451	3295460	80 %	0 %	20 %	0 %	336174109
74152	NC_015638	CAA	2	6	3295513	3295518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336174109
74153	NC_015638	TA	4	8	3295559	3295566	50 %	50 %	0 %	0 %	336174109
74154	NC_015638	AATT	2	8	3295590	3295597	50 %	50 %	0 %	0 %	336174109
74155	NC_015638	T	6	6	3295596	3295601	0 %	100 %	0 %	0 %	336174110
74156	NC_015638	GGT	2	6	3295623	3295628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336174110
74157	NC_015638	T	6	6	3295745	3295750	0 %	100 %	0 %	0 %	336174110
74158	NC_015638	GTT	2	6	3295755	3295760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336174110
74159	NC_015638	CAT	3	9	3295774	3295782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174110
74160	NC_015638	CAT	2	6	3295837	3295842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336174110
74161	NC_015638	TGA	2	6	3295923	3295928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336174110

< Previous12...137138139140141142143144145146147148149Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.