MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 40610

< Previous12...70717273747576777879808182Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_015428	AC	3	6	2500284	2500289	50 %	0 %	0 %	50 %	331702702
40502	NC_015428	TAG	2	6	2500303	2500308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702702
40503	NC_015428	TAT	3	9	2500380	2500388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702702
40504	NC_015428	GAT	2	6	2500416	2500421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702702
40505	NC_015428	ATT	2	6	2500428	2500433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702702
40506	NC_015428	TGA	2	6	2500442	2500447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702702
40507	NC_015428	CAA	2	6	2500455	2500460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702702
40508	NC_015428	CGA	2	6	2500491	2500496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702702
40509	NC_015428	ATCA	2	8	2500533	2500540	50 %	25 %	0 %	25 %	331702702
40510	NC_015428	CGA	2	6	2500662	2500667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702702
40511	NC_015428	TTTA	2	8	2500750	2500757	25 %	75 %	0 %	0 %	331702702
40512	NC_015428	ACC	2	6	2500810	2500815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702702
40513	NC_015428	AAG	2	6	2500846	2500851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702702
40514	NC_015428	CGC	2	6	2500997	2501002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331702702
40515	NC_015428	T	6	6	2501013	2501018	0 %	100 %	0 %	0 %	331702702
40516	NC_015428	ATC	2	6	2501107	2501112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702702
40517	NC_015428	CAAAA	2	10	2501120	2501129	80 %	0 %	0 %	20 %	331702702
40518	NC_015428	AGC	2	6	2501177	2501182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702702
40519	NC_015428	TAA	2	6	2501184	2501189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702702
40520	NC_015428	TAA	2	6	2501273	2501278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702703
40521	NC_015428	CCGG	2	8	2501295	2501302	0 %	0 %	50 %	50 %	331702703
40522	NC_015428	CAC	2	6	2501343	2501348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702703
40523	NC_015428	GTT	2	6	2501501	2501506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702703
40524	NC_015428	CTG	2	6	2501526	2501531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
40525	NC_015428	ACT	2	6	2501566	2501571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
40526	NC_015428	ACC	2	6	2501616	2501621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702703
40527	NC_015428	TGA	2	6	2501674	2501679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702703
40528	NC_015428	TGG	2	6	2501735	2501740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702703
40529	NC_015428	TGC	2	6	2501892	2501897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
40530	NC_015428	CCA	2	6	2501903	2501908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702703
40531	NC_015428	AAT	2	6	2501957	2501962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331702703
40532	NC_015428	TCCGA	2	10	2501973	2501982	20 %	20 %	20 %	40 %	331702703
40533	NC_015428	TTC	2	6	2501983	2501988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702703
40534	NC_015428	TCA	2	6	2502007	2502012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
40535	NC_015428	AAC	2	6	2502048	2502053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702703
40536	NC_015428	AATC	2	8	2502134	2502141	50 %	25 %	0 %	25 %	331702703
40537	NC_015428	GCA	2	6	2502157	2502162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702703
40538	NC_015428	TTG	2	6	2502191	2502196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702703
40539	NC_015428	TGC	3	9	2502223	2502231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702703
40540	NC_015428	TCA	2	6	2502257	2502262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
40541	NC_015428	TCA	2	6	2502269	2502274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702703
40542	NC_015428	CAG	2	6	2502479	2502484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702704
40543	NC_015428	GCAA	2	8	2502515	2502522	50 %	0 %	25 %	25 %	331702704
40544	NC_015428	CCA	2	6	2502614	2502619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702704
40545	NC_015428	CTA	2	6	2502680	2502685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702704
40546	NC_015428	TGA	2	6	2502710	2502715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702704
40547	NC_015428	TCAT	2	8	2502748	2502755	25 %	50 %	0 %	25 %	331702704
40548	NC_015428	A	6	6	2502776	2502781	100 %	0 %	0 %	0 %	331702704
40549	NC_015428	ATTG	2	8	2502784	2502791	25 %	50 %	25 %	0 %	331702705
40550	NC_015428	ACGA	2	8	2502821	2502828	50 %	0 %	25 %	25 %	331702705
40551	NC_015428	GGC	2	6	2502917	2502922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702705
40552	NC_015428	CGA	2	6	2503045	2503050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702705
40553	NC_015428	CTA	2	6	2503063	2503068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702705
40554	NC_015428	GGC	2	6	2503073	2503078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702705
40555	NC_015428	ATC	2	6	2503265	2503270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702705
40556	NC_015428	A	6	6	2503277	2503282	100 %	0 %	0 %	0 %	331702705
40557	NC_015428	AAGC	2	8	2503304	2503311	50 %	0 %	25 %	25 %	331702705
40558	NC_015428	GGT	2	6	2503325	2503330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702705
40559	NC_015428	AAG	2	6	2503340	2503345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702705
40560	NC_015428	CAC	2	6	2503407	2503412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702705
40561	NC_015428	AATA	3	12	2503446	2503457	75 %	25 %	0 %	0 %	331702705
40562	NC_015428	TGA	2	6	2503552	2503557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702706
40563	NC_015428	TCAA	2	8	2503593	2503600	50 %	25 %	0 %	25 %	331702706
40564	NC_015428	GAG	2	6	2503603	2503608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331702706
40565	NC_015428	CTT	2	6	2503621	2503626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702706
40566	NC_015428	GTG	2	6	2503647	2503652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331702706
40567	NC_015428	CGG	2	6	2503696	2503701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331702706
40568	NC_015428	CGGCAA	2	12	2503711	2503722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702706
40569	NC_015428	CCA	2	6	2503852	2503857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702706
40570	NC_015428	TCA	2	6	2503869	2503874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702706
40571	NC_015428	GCT	2	6	2503932	2503937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331702706
40572	NC_015428	AGC	2	6	2503976	2503981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702706
40573	NC_015428	AGTC	2	8	2503982	2503989	25 %	25 %	25 %	25 %	331702706
40574	NC_015428	ACC	2	6	2504228	2504233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702706
40575	NC_015428	CCA	2	6	2504256	2504261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702706
40576	NC_015428	GTTG	2	8	2504264	2504271	0 %	50 %	50 %	0 %	331702706
40577	NC_015428	ACC	2	6	2504276	2504281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331702706
40578	NC_015428	CAGC	2	8	2504545	2504552	25 %	0 %	25 %	50 %	331702706
40579	NC_015428	T	6	6	2504558	2504563	0 %	100 %	0 %	0 %	331702706
40580	NC_015428	GCC	2	6	2504583	2504588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331702706
40581	NC_015428	ATT	2	6	2504771	2504776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331702707
40582	NC_015428	CTT	2	6	2504787	2504792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702707
40583	NC_015428	T	6	6	2504808	2504813	0 %	100 %	0 %	0 %	331702707
40584	NC_015428	GTT	2	6	2504822	2504827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702707
40585	NC_015428	GTT	2	6	2504843	2504848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331702707
40586	NC_015428	GAA	2	6	2504976	2504981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702707
40587	NC_015428	TCA	2	6	2504996	2505001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702707
40588	NC_015428	GCCA	2	8	2505040	2505047	25 %	0 %	25 %	50 %	331702707
40589	NC_015428	GAA	2	6	2505049	2505054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702707
40590	NC_015428	AGA	2	6	2505122	2505127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331702707
40591	NC_015428	GGCA	2	8	2505205	2505212	25 %	0 %	50 %	25 %	331702707
40592	NC_015428	CTT	2	6	2505249	2505254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702707
40593	NC_015428	TGA	2	6	2505294	2505299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702707
40594	NC_015428	T	6	6	2505303	2505308	0 %	100 %	0 %	0 %	331702707
40595	NC_015428	CTT	2	6	2505335	2505340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702707
40596	NC_015428	ATC	2	6	2505370	2505375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702707
40597	NC_015428	GAT	2	6	2505459	2505464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331702707
40598	NC_015428	AAC	2	6	2505483	2505488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702707
40599	NC_015428	TAC	2	6	2505533	2505538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702707
40600	NC_015428	TAC	2	6	2505549	2505554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331702707
40601	NC_015428	T	6	6	2505610	2505615	0 %	100 %	0 %	0 %	331702708
40602	NC_015428	CAG	2	6	2505703	2505708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331702708
40603	NC_015428	CAA	2	6	2505764	2505769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702708
40604	NC_015428	TTC	2	6	2505781	2505786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702708
40605	NC_015428	TCT	2	6	2505820	2505825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702708
40606	NC_015428	ATTG	2	8	2505856	2505863	25 %	50 %	25 %	0 %	331702708
40607	NC_015428	ACA	2	6	2505882	2505887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331702708
40608	NC_015428	CTT	2	6	2505925	2505930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331702708
40609	NC_015428	CT	3	6	2505939	2505944	0 %	50 %	0 %	50 %	331702708
40610	NC_015428	T	7	7	2505944	2505950	0 %	100 %	0 %	0 %	331702708

< Previous12...70717273747576777879808182Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.