MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 40610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015428	CAT	2	6	1339234	1339239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21502	NC_015428	ATC	2	6	1339276	1339281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21503	NC_015428	CGT	2	6	1339326	1339331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21504	NC_015428	GTG	2	6	1339337	1339342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701630
21505	NC_015428	GTT	2	6	1339360	1339365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331701630
21506	NC_015428	TCG	2	6	1339367	1339372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21507	NC_015428	GCA	2	6	1339442	1339447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21508	NC_015428	TCA	2	6	1339499	1339504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21509	NC_015428	ATC	2	6	1339510	1339515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21510	NC_015428	TGGT	2	8	1339556	1339563	0 %	50 %	50 %	0 %	331701630
21511	NC_015428	ATC	2	6	1339571	1339576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21512	NC_015428	TTGG	2	8	1339607	1339614	0 %	50 %	50 %	0 %	331701630
21513	NC_015428	CCG	2	6	1339688	1339693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331701630
21514	NC_015428	CCA	2	6	1339895	1339900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701630
21515	NC_015428	CGT	2	6	1339960	1339965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21516	NC_015428	CCAT	2	8	1340123	1340130	25 %	25 %	0 %	50 %	331701630
21517	NC_015428	TCG	2	6	1340174	1340179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21518	NC_015428	ACC	2	6	1340185	1340190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701630
21519	NC_015428	ATC	2	6	1340245	1340250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21520	NC_015428	ATG	2	6	1340267	1340272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331701630
21521	NC_015428	CTT	2	6	1340322	1340327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701630
21522	NC_015428	GTTC	2	8	1340393	1340400	0 %	50 %	25 %	25 %	331701630
21523	NC_015428	CTT	3	9	1340421	1340429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701630
21524	NC_015428	GCT	2	6	1340447	1340452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21525	NC_015428	GGT	2	6	1340461	1340466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701630
21526	NC_015428	GTG	2	6	1340537	1340542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701630
21527	NC_015428	TCA	2	6	1340558	1340563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21528	NC_015428	CAC	2	6	1340595	1340600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701630
21529	NC_015428	GTT	3	9	1340622	1340630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331701630
21530	NC_015428	GTC	2	6	1340656	1340661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21531	NC_015428	TCA	2	6	1340666	1340671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701630
21532	NC_015428	GCC	2	6	1340740	1340745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331701630
21533	NC_015428	CAA	2	6	1340781	1340786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331701630
21534	NC_015428	CCCA	2	8	1340791	1340798	25 %	0 %	0 %	75 %	331701630
21535	NC_015428	TTC	2	6	1340860	1340865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701630
21536	NC_015428	TAA	2	6	1340888	1340893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701630
21537	NC_015428	GGT	2	6	1340902	1340907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701630
21538	NC_015428	CATCC	2	10	1341045	1341054	20 %	20 %	0 %	60 %	331701630
21539	NC_015428	GAA	2	6	1341063	1341068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331701630
21540	NC_015428	ATA	2	6	1341101	1341106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701630
21541	NC_015428	TTTGTC	2	12	1341187	1341198	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	331701630
21542	NC_015428	CTT	2	6	1341204	1341209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701630
21543	NC_015428	TGC	2	6	1341242	1341247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701630
21544	NC_015428	A	6	6	1341647	1341652	100 %	0 %	0 %	0 %	331701631
21545	NC_015428	A	6	6	1341660	1341665	100 %	0 %	0 %	0 %	331701631
21546	NC_015428	CGT	2	6	1341721	1341726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701631
21547	NC_015428	ATTTT	2	10	1341878	1341887	20 %	80 %	0 %	0 %	331701631
21548	NC_015428	CGT	2	6	1341931	1341936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701631
21549	NC_015428	TGG	2	6	1342005	1342010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701631
21550	NC_015428	CAG	2	6	1342018	1342023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701631
21551	NC_015428	TGG	2	6	1342056	1342061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701631
21552	NC_015428	ATC	2	6	1342139	1342144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701631
21553	NC_015428	TCGGTA	2	12	1342152	1342163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331701631
21554	NC_015428	AT	3	6	1342172	1342177	50 %	50 %	0 %	0 %	331701631
21555	NC_015428	AGG	2	6	1342270	1342275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331701631
21556	NC_015428	T	6	6	1342825	1342830	0 %	100 %	0 %	0 %	331701632
21557	NC_015428	CAAA	2	8	1342842	1342849	75 %	0 %	0 %	25 %	331701632
21558	NC_015428	AATCAG	2	12	1342870	1342881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331701632
21559	NC_015428	CAT	2	6	1342987	1342992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701632
21560	NC_015428	GCA	2	6	1343028	1343033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701632
21561	NC_015428	TGG	2	6	1343034	1343039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701632
21562	NC_015428	ATC	2	6	1343066	1343071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701632
21563	NC_015428	TAA	2	6	1343154	1343159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701632
21564	NC_015428	AAG	2	6	1343213	1343218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331701632
21565	NC_015428	ATA	2	6	1343252	1343257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701632
21566	NC_015428	CCAA	2	8	1343264	1343271	50 %	0 %	0 %	50 %	331701632
21567	NC_015428	AGA	2	6	1343277	1343282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331701632
21568	NC_015428	TAA	2	6	1343292	1343297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701632
21569	NC_015428	A	7	7	1343468	1343474	100 %	0 %	0 %	0 %	331701632
21570	NC_015428	ACG	2	6	1343489	1343494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701632
21571	NC_015428	GCC	2	6	1343537	1343542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331701632
21572	NC_015428	AAG	2	6	1343588	1343593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331701632
21573	NC_015428	CATA	2	8	1343646	1343653	50 %	25 %	0 %	25 %	331701632
21574	NC_015428	CAT	2	6	1343665	1343670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701632
21575	NC_015428	GTC	2	6	1343681	1343686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701632
21576	NC_015428	CAA	2	6	1343811	1343816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331701632
21577	NC_015428	ACC	2	6	1343821	1343826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701632
21578	NC_015428	GC	3	6	1343888	1343893	0 %	0 %	50 %	50 %	331701632
21579	NC_015428	ATG	2	6	1343939	1343944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331701632
21580	NC_015428	CCGC	2	8	1343967	1343974	0 %	0 %	25 %	75 %	331701632
21581	NC_015428	ACC	2	6	1343987	1343992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701632
21582	NC_015428	CAAAGA	2	12	1344024	1344035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331701632
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21584	NC_015428	TTC	2	6	1344432	1344437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701633
21585	NC_015428	AAT	2	6	1344521	1344526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331701633
21586	NC_015428	ATCA	2	8	1344538	1344545	50 %	25 %	0 %	25 %	331701633
21587	NC_015428	CGG	2	6	1344654	1344659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331701633
21588	NC_015428	CAA	2	6	1344660	1344665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331701633
21589	NC_015428	CGC	2	6	1344685	1344690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331701633
21590	NC_015428	CCA	2	6	1344743	1344748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701633
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21592	NC_015428	ACC	2	6	1344760	1344765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701633
21593	NC_015428	ACC	2	6	1344817	1344822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331701633
21594	NC_015428	CCGG	2	8	1344832	1344839	0 %	0 %	50 %	50 %	331701633
21595	NC_015428	GTC	2	6	1344865	1344870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701633
21596	NC_015428	TGA	2	6	1344897	1344902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331701633
21597	NC_015428	GAC	2	6	1344967	1344972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701633
21598	NC_015428	TCA	2	6	1345001	1345006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701633
21599	NC_015428	CTGC	2	8	1345074	1345081	0 %	25 %	25 %	50 %	331701633
21600	NC_015428	TCA	2	6	1345086	1345091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701633
21601	NC_015428	TCA	2	6	1345136	1345141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701633
21602	NC_015428	TCA	2	6	1345226	1345231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701633
21603	NC_015428	AAAC	2	8	1345392	1345399	75 %	0 %	0 %	25 %	331701633
21604	NC_015428	GGT	2	6	1345408	1345413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701633
21605	NC_015428	TAAA	2	8	1345533	1345540	75 %	25 %	0 %	0 %	331701633
21606	NC_015428	GC	3	6	1345799	1345804	0 %	0 %	50 %	50 %	331701634
21607	NC_015428	TCT	2	6	1345874	1345879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331701634
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21611	NC_015428	ATT	2	6	1346106	1346111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331701634
21612	NC_015428	CCGGAA	2	12	1346125	1346136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331701634
21613	NC_015428	TTG	2	6	1346142	1346147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331701634
21614	NC_015428	TGA	2	6	1346203	1346208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331701634
21615	NC_015428	TTTTC	2	10	1346221	1346230	0 %	80 %	0 %	20 %	331701634
21616	NC_015428	CTA	2	6	1346231	1346236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701634
21617	NC_015428	TGT	2	6	1346296	1346301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331701634
21618	NC_015428	TCCT	2	8	1346427	1346434	0 %	50 %	0 %	50 %	331701634
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21832	NC_015428	ATTTA	2	10	1358923	1358932	40 %	60 %	0 %	0 %	331701652
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21844	NC_015428	ACAAA	2	10	1359374	1359383	80 %	0 %	0 %	20 %	331701652
21845	NC_015428	TCA	2	6	1359417	1359422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701652
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21848	NC_015428	TAC	2	6	1359781	1359786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701653
21849	NC_015428	TGG	2	6	1359852	1359857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331701653
21850	NC_015428	GGC	2	6	1359898	1359903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331701653
21851	NC_015428	TTTGGC	2	12	1360066	1360077	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331701653
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21855	NC_015428	GTA	2	6	1360285	1360290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331701653
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21949	NC_015428	AT	3	6	1366188	1366193	50 %	50 %	0 %	0 %	331701657
21950	NC_015428	AT	3	6	1366251	1366256	50 %	50 %	0 %	0 %	331701657
21951	NC_015428	ATC	2	6	1366281	1366286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701657
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21955	NC_015428	ATCA	2	8	1366565	1366572	50 %	25 %	0 %	25 %	331701657
21956	NC_015428	TCTGG	2	10	1366833	1366842	0 %	40 %	40 %	20 %	331701658
21957	NC_015428	CTA	2	6	1366849	1366854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701658
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21960	NC_015428	ATC	2	6	1366984	1366989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701658
21961	NC_015428	TGT	2	6	1366997	1367002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331701658
21962	NC_015428	CTG	2	6	1367023	1367028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701658
21963	NC_015428	GATGT	2	10	1367092	1367101	20 %	40 %	40 %	0 %	331701658
21964	NC_015428	GCT	2	6	1367115	1367120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331701658
21965	NC_015428	GCGAT	2	10	1367177	1367186	20 %	20 %	40 %	20 %	331701658
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21967	NC_015428	TTA	2	6	1367380	1367385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331701658
21968	NC_015428	CTA	2	6	1367406	1367411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331701658
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