MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015214	CAA	2	6	172448	172453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955888
3002	NC_015214	CAA	2	6	172455	172460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955888
3003	NC_015214	GTG	2	6	172478	172483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955888
3004	NC_015214	CAT	2	6	172526	172531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3005	NC_015214	TAC	2	6	172569	172574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3006	NC_015214	TAC	2	6	172593	172598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3007	NC_015214	CTG	2	6	172652	172657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955888
3008	NC_015214	CTG	2	6	172667	172672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955888
3009	NC_015214	AATC	2	8	172693	172700	50 %	25 %	0 %	25 %	325955888
3010	NC_015214	GGT	2	6	172903	172908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955888
3011	NC_015214	ACT	2	6	173095	173100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3012	NC_015214	TGC	2	6	173166	173171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955888
3013	NC_015214	ACT	3	9	173173	173181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3014	NC_015214	CTG	2	6	173231	173236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955888
3015	NC_015214	AGA	2	6	173286	173291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955888
3016	NC_015214	TGT	2	6	173349	173354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955888
3017	NC_015214	TAC	3	9	173389	173397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3018	NC_015214	ACT	2	6	173470	173475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3019	NC_015214	TAC	2	6	173491	173496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3020	NC_015214	AGT	2	6	173499	173504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955888
3021	NC_015214	TCA	2	6	173531	173536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3022	NC_015214	ACA	2	6	173543	173548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955888
3023	NC_015214	CAT	2	6	173594	173599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3024	NC_015214	AAG	2	6	173602	173607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955888
3025	NC_015214	GTT	2	6	173620	173625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955888
3026	NC_015214	AAG	2	6	173629	173634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955888
3027	NC_015214	ACT	2	6	173647	173652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3028	NC_015214	GGT	2	6	173656	173661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955888
3029	NC_015214	TAC	2	6	173689	173694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955888
3030	NC_015214	AAC	2	6	173704	173709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955888
3031	NC_015214	TTAA	2	8	173742	173749	50 %	50 %	0 %	0 %	325955888
3032	NC_015214	GAA	2	6	175106	175111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3033	NC_015214	GCA	2	6	175212	175217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955889
3034	NC_015214	T	6	6	175238	175243	0 %	100 %	0 %	0 %	325955889
3035	NC_015214	AGCA	2	8	175258	175265	50 %	0 %	25 %	25 %	325955889
3036	NC_015214	AAG	2	6	175278	175283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3037	NC_015214	TGA	2	6	175388	175393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955889
3038	NC_015214	GAA	2	6	175431	175436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3039	NC_015214	TAC	2	6	175455	175460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955889
3040	NC_015214	GAA	2	6	175494	175499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3041	NC_015214	GGC	2	6	175737	175742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955889
3042	NC_015214	ATG	2	6	175840	175845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955889
3043	NC_015214	GGCAAG	2	12	175899	175910	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325955889
3044	NC_015214	AGCAGT	2	12	175914	175925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325955889
3045	NC_015214	AAG	2	6	176010	176015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3046	NC_015214	ACG	2	6	176041	176046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955889
3047	NC_015214	AAG	2	6	176047	176052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3048	NC_015214	CTA	2	6	176102	176107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955889
3049	NC_015214	ACA	2	6	176209	176214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955889
3050	NC_015214	AAG	2	6	176226	176231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955889
3051	NC_015214	CTAC	2	8	176245	176252	25 %	25 %	0 %	50 %	325955889
3052	NC_015214	TAC	2	6	176283	176288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955889
3053	NC_015214	TAA	2	6	176331	176336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955889
3054	NC_015214	TAA	2	6	176413	176418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955890
3055	NC_015214	GAA	2	6	176420	176425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3056	NC_015214	TTAT	2	8	176482	176489	25 %	75 %	0 %	0 %	325955890
3057	NC_015214	ACA	2	6	176520	176525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955890
3058	NC_015214	GTT	2	6	176570	176575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955890
3059	NC_015214	TTG	2	6	176667	176672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955890
3060	NC_015214	CAG	2	6	176729	176734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955890
3061	NC_015214	AAC	2	6	176738	176743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955890
3062	NC_015214	TG	3	6	176763	176768	0 %	50 %	50 %	0 %	325955890
3063	NC_015214	AAG	2	6	176769	176774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3064	NC_015214	TAG	2	6	176776	176781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955890
3065	NC_015214	TTA	2	6	176790	176795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955890
3066	NC_015214	TAA	2	6	176803	176808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955890
3067	NC_015214	GAT	2	6	176870	176875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955890
3068	NC_015214	CAC	2	6	176897	176902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955890
3069	NC_015214	TGG	2	6	176920	176925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955890
3070	NC_015214	TAT	2	6	177002	177007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955890
3071	NC_015214	AGA	2	6	177021	177026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3072	NC_015214	CTCAAT	2	12	177030	177041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955890
3073	NC_015214	AAGGAT	2	12	177056	177067	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325955890
3074	NC_015214	GAA	2	6	177083	177088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3075	NC_015214	GTT	2	6	177095	177100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955890
3076	NC_015214	ATG	2	6	177138	177143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955890
3077	NC_015214	AAG	2	6	177161	177166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3078	NC_015214	GAT	2	6	177208	177213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955890
3079	NC_015214	AAG	2	6	177221	177226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3080	NC_015214	TAC	2	6	177227	177232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955890
3081	NC_015214	TACT	2	8	177301	177308	25 %	50 %	0 %	25 %	325955890
3082	NC_015214	AAG	2	6	177350	177355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955890
3083	NC_015214	GCA	2	6	177378	177383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955890
3084	NC_015214	TAC	2	6	177407	177412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955890
3085	NC_015214	TAT	2	6	177576	177581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955891
3086	NC_015214	TTC	2	6	177694	177699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955891
3087	NC_015214	T	6	6	177715	177720	0 %	100 %	0 %	0 %	325955891
3088	NC_015214	AAAG	2	8	177786	177793	75 %	0 %	25 %	0 %	325955891
3089	NC_015214	AAT	2	6	177794	177799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955891
3090	NC_015214	TCG	2	6	177870	177875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955891
3091	NC_015214	TGGCCT	2	12	177885	177896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955891
3092	NC_015214	GCTG	2	8	177934	177941	0 %	25 %	50 %	25 %	325955891
3093	NC_015214	TGA	2	6	177951	177956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955891
3094	NC_015214	GTG	2	6	177971	177976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955891
3095	NC_015214	ATCA	2	8	178087	178094	50 %	25 %	0 %	25 %	325955891
3096	NC_015214	GGT	2	6	178097	178102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955891
3097	NC_015214	ACG	2	6	178208	178213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955891
3098	NC_015214	GCT	2	6	178324	178329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955891
3099	NC_015214	T	6	6	178379	178384	0 %	100 %	0 %	0 %	325955891
3100	NC_015214	TTC	2	6	178394	178399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955891
3101	NC_015214	TTGC	2	8	178487	178494	0 %	50 %	25 %	25 %	325955891
3102	NC_015214	GTT	2	6	178505	178510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955891
3103	NC_015214	CGG	2	6	178552	178557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955891
3104	NC_015214	CTT	2	6	178558	178563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955891
3105	NC_015214	GTAT	2	8	178670	178677	25 %	50 %	25 %	0 %	325955891
3106	NC_015214	AAG	2	6	178733	178738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955891
3107	NC_015214	TAA	2	6	178828	178833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955891
3108	NC_015214	TTA	2	6	178877	178882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955891
3109	NC_015214	TCAG	2	8	179025	179032	25 %	25 %	25 %	25 %	325955891
3110	NC_015214	TTG	2	6	179046	179051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955891
3111	NC_015214	TCA	2	6	179059	179064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955891
3112	NC_015214	TGCG	2	8	179112	179119	0 %	25 %	50 %	25 %	325955891
3113	NC_015214	TTGA	2	8	179120	179127	25 %	50 %	25 %	0 %	325955891
3114	NC_015214	GAA	2	6	179161	179166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955891
3115	NC_015214	TGGC	2	8	179276	179283	0 %	25 %	50 %	25 %	325955891
3116	NC_015214	TCT	2	6	179325	179330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955891
3117	NC_015214	AGT	2	6	179372	179377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955891
3118	NC_015214	TAAGA	2	10	179384	179393	60 %	20 %	20 %	0 %	325955891
3119	NC_015214	T	6	6	179556	179561	0 %	100 %	0 %	0 %	325955892
3120	NC_015214	GCA	2	6	179579	179584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955892
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3242	NC_015214	A	6	6	185839	185844	100 %	0 %	0 %	0 %	325955899
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3364	NC_015214	GAC	2	6	192872	192877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955903
3365	NC_015214	TGC	2	6	192882	192887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
3366	NC_015214	ATT	2	6	192923	192928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955903
3367	NC_015214	GCT	2	6	192947	192952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955903
3368	NC_015214	AATG	2	8	192958	192965	50 %	25 %	25 %	0 %	325955903
3369	NC_015214	GCAA	2	8	192981	192988	50 %	0 %	25 %	25 %	325955903
3370	NC_015214	ATCT	2	8	193053	193060	25 %	50 %	0 %	25 %	325955903
3371	NC_015214	TAT	2	6	193091	193096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955903
3372	NC_015214	CTT	2	6	193110	193115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955903
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3374	NC_015214	ATTC	2	8	193159	193166	25 %	50 %	0 %	25 %	325955903
3375	NC_015214	ACT	2	6	193188	193193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955903
3376	NC_015214	CT	3	6	193192	193197	0 %	50 %	0 %	50 %	325955903
3377	NC_015214	CAA	2	6	193199	193204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955903
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3380	NC_015214	TGTCGG	2	12	193485	193496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325955904
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3382	NC_015214	TTCA	2	8	193518	193525	25 %	50 %	0 %	25 %	325955904
3383	NC_015214	GTT	2	6	193552	193557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955904
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3385	NC_015214	AAG	2	6	193705	193710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955904
3386	NC_015214	AAG	2	6	193720	193725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955904
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3392	NC_015214	GTT	2	6	194278	194283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955905
3393	NC_015214	GAA	2	6	194332	194337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955905
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3395	NC_015214	T	7	7	194363	194369	0 %	100 %	0 %	0 %	325955905
3396	NC_015214	ATA	2	6	194403	194408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955905
3397	NC_015214	CTG	2	6	194418	194423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955905
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3399	NC_015214	TGG	2	6	194479	194484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955905
3400	NC_015214	CAA	2	6	194563	194568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955905
3401	NC_015214	TGGTT	2	10	194614	194623	0 %	60 %	40 %	0 %	325955905
3402	NC_015214	AAGAA	2	10	194640	194649	80 %	0 %	20 %	0 %	325955905
3403	NC_015214	TTC	2	6	194804	194809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955905
3404	NC_015214	TGA	2	6	194824	194829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955905
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3422	NC_015214	A	6	6	196032	196037	100 %	0 %	0 %	0 %	325955906
3423	NC_015214	ATT	2	6	196217	196222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955907
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3441	NC_015214	TCAA	2	8	197154	197161	50 %	25 %	0 %	25 %	325955907
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3471	NC_015214	AAC	2	6	198817	198822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955908
3472	NC_015214	CTTT	2	8	198841	198848	0 %	75 %	0 %	25 %	325955908
3473	NC_015214	CAAT	2	8	198851	198858	50 %	25 %	0 %	25 %	325955908
3474	NC_015214	TGG	2	6	198882	198887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955908
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3477	NC_015214	GAA	2	6	199023	199028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955908
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3479	NC_015214	ACGATG	2	12	199079	199090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325955908
3480	NC_015214	GCG	2	6	199103	199108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955908
3481	NC_015214	AAG	2	6	199174	199179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955908
3482	NC_015214	TCT	2	6	199217	199222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955908
3483	NC_015214	ACC	2	6	199433	199438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955908
3484	NC_015214	AGA	2	6	199440	199445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955908
3485	NC_015214	GTTC	2	8	199456	199463	0 %	50 %	25 %	25 %	325955908
3486	NC_015214	CGGTGC	2	12	199488	199499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325955908
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3488	NC_015214	TGA	2	6	199728	199733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955909
3489	NC_015214	CAG	2	6	199748	199753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955909
3490	NC_015214	CA	3	6	199788	199793	50 %	0 %	0 %	50 %	325955909
3491	NC_015214	ATA	2	6	199802	199807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955909
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3493	NC_015214	GAC	2	6	199996	200001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955909
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