MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_015214	TGCCA	2	10	1903478	1903487	20 %	20 %	20 %	40 %	325957598
34002	NC_015214	A	6	6	1903516	1903521	100 %	0 %	0 %	0 %	325957598
34003	NC_015214	ATT	2	6	1903541	1903546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957598
34004	NC_015214	AAGAT	2	10	1903566	1903575	60 %	20 %	20 %	0 %	325957598
34005	NC_015214	AAT	2	6	1903680	1903685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957598
34006	NC_015214	AAT	2	6	1903715	1903720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957598
34007	NC_015214	TA	3	6	1903760	1903765	50 %	50 %	0 %	0 %	325957598
34008	NC_015214	ATA	3	9	1903768	1903776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957598
34009	NC_015214	GAT	2	6	1903814	1903819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957598
34010	NC_015214	TTTC	2	8	1904030	1904037	0 %	75 %	0 %	25 %	325957599
34011	NC_015214	TTCAGT	2	12	1904181	1904192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325957599
34012	NC_015214	TCA	2	6	1904204	1904209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957599
34013	NC_015214	AGT	2	6	1904401	1904406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34014	NC_015214	TAC	2	6	1904411	1904416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957600
34015	NC_015214	ATG	2	6	1904468	1904473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34016	NC_015214	TGATCA	2	12	1904493	1904504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325957600
34017	NC_015214	TGC	2	6	1904581	1904586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957600
34018	NC_015214	TCA	2	6	1904625	1904630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957600
34019	NC_015214	T	6	6	1904672	1904677	0 %	100 %	0 %	0 %	325957600
34020	NC_015214	AATA	2	8	1904678	1904685	75 %	25 %	0 %	0 %	325957600
34021	NC_015214	TCA	2	6	1904943	1904948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957600
34022	NC_015214	GGTT	2	8	1905005	1905012	0 %	50 %	50 %	0 %	325957600
34023	NC_015214	TAA	2	6	1905104	1905109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957600
34024	NC_015214	CCA	2	6	1905135	1905140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957600
34025	NC_015214	ATC	3	9	1905195	1905203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957600
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34027	NC_015214	TCT	2	6	1905367	1905372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957600
34028	NC_015214	CTT	2	6	1905385	1905390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957600
34029	NC_015214	GTTC	2	8	1905442	1905449	0 %	50 %	25 %	25 %	325957600
34030	NC_015214	CAC	2	6	1905507	1905512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957600
34031	NC_015214	CTT	2	6	1905520	1905525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957600
34032	NC_015214	CCTT	2	8	1905621	1905628	0 %	50 %	0 %	50 %	325957600
34033	NC_015214	TCA	2	6	1905642	1905647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957600
34034	NC_015214	TCTT	2	8	1905648	1905655	0 %	75 %	0 %	25 %	325957600
34035	NC_015214	AAT	2	6	1905668	1905673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957600
34036	NC_015214	TGA	2	6	1905676	1905681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34037	NC_015214	CGA	2	6	1905709	1905714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957600
34038	NC_015214	TGA	2	6	1905722	1905727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34039	NC_015214	TCC	2	6	1905742	1905747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957600
34040	NC_015214	TCT	2	6	1905835	1905840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957600
34041	NC_015214	TTG	2	6	1905878	1905883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957600
34042	NC_015214	TAA	2	6	1905943	1905948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957600
34043	NC_015214	CCG	2	6	1905966	1905971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957600
34044	NC_015214	ATG	2	6	1905972	1905977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34045	NC_015214	TAG	2	6	1905978	1905983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34046	NC_015214	AGT	3	9	1906006	1906014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
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34049	NC_015214	GTA	2	6	1906268	1906273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957600
34050	NC_015214	CGAT	2	8	1906356	1906363	25 %	25 %	25 %	25 %	325957600
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34052	NC_015214	TCT	2	6	1906426	1906431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957600
34053	NC_015214	AGTC	2	8	1906504	1906511	25 %	25 %	25 %	25 %	325957600
34054	NC_015214	TTGA	2	8	1906512	1906519	25 %	50 %	25 %	0 %	325957600
34055	NC_015214	TTG	2	6	1906614	1906619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957600
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34062	NC_015214	ACT	2	6	1907373	1907378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957601
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34067	NC_015214	CTGC	2	8	1907531	1907538	0 %	25 %	25 %	50 %	325957601
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34071	NC_015214	AAGC	2	8	1907786	1907793	50 %	0 %	25 %	25 %	325957601
34072	NC_015214	T	6	6	1907951	1907956	0 %	100 %	0 %	0 %	325957601
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34084	NC_015214	GA	3	6	1908912	1908917	50 %	0 %	50 %	0 %	325957602
34085	NC_015214	AATT	2	8	1909034	1909041	50 %	50 %	0 %	0 %	325957603
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34089	NC_015214	TGG	2	6	1909137	1909142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957603
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34097	NC_015214	GC	3	6	1909585	1909590	0 %	0 %	50 %	50 %	325957604
34098	NC_015214	CAT	2	6	1909595	1909600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957604
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34100	NC_015214	GAC	2	6	1909712	1909717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957604
34101	NC_015214	CAA	2	6	1909724	1909729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957604
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34103	NC_015214	GGT	2	6	1909805	1909810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957604
34104	NC_015214	CA	3	6	1909937	1909942	50 %	0 %	0 %	50 %	325957604
34105	NC_015214	CTT	2	6	1909977	1909982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957604
34106	NC_015214	TCT	2	6	1909996	1910001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957604
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34110	NC_015214	TGA	2	6	1910310	1910315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957604
34111	NC_015214	GCA	2	6	1910335	1910340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957604
34112	NC_015214	ATC	2	6	1910454	1910459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957604
34113	NC_015214	CATT	2	8	1910527	1910534	25 %	50 %	0 %	25 %	325957604
34114	NC_015214	GTA	2	6	1910553	1910558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957604
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34116	NC_015214	TAA	3	9	1910659	1910667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957604
34117	NC_015214	ATC	2	6	1910994	1910999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957605
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34230	NC_015214	ATC	2	6	1917661	1917666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957611
34231	NC_015214	GGAAA	2	10	1917834	1917843	60 %	0 %	40 %	0 %	325957611
34232	NC_015214	GCT	2	6	1917979	1917984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957611
34233	NC_015214	AATCAT	2	12	1917993	1918004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325957611
34234	NC_015214	AAGC	2	8	1918047	1918054	50 %	0 %	25 %	25 %	325957611
34235	NC_015214	TTC	2	6	1918137	1918142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957612
34236	NC_015214	TCA	2	6	1918181	1918186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957612
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34238	NC_015214	GAT	2	6	1918233	1918238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957612
34239	NC_015214	AAG	2	6	1918313	1918318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957612
34240	NC_015214	CAAGAT	2	12	1918368	1918379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325957612
34241	NC_015214	TTC	2	6	1918387	1918392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957612
34242	NC_015214	GTT	2	6	1918440	1918445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957612
34243	NC_015214	ACC	2	6	1918446	1918451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957612
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34250	NC_015214	TTC	2	6	1918908	1918913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957612
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34252	NC_015214	GGT	2	6	1918965	1918970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957612
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34258	NC_015214	CAT	2	6	1919427	1919432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957612
34259	NC_015214	GTT	2	6	1919481	1919486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957612
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34261	NC_015214	CAG	2	6	1919600	1919605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957612
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34264	NC_015214	ATA	2	6	1919764	1919769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957612
34265	NC_015214	T	6	6	1919808	1919813	0 %	100 %	0 %	0 %	325957612
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34333	NC_015214	GTA	3	9	1923750	1923758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957617
34334	NC_015214	CGC	2	6	1923769	1923774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957617
34335	NC_015214	TCCT	2	8	1923817	1923824	0 %	50 %	0 %	50 %	325957618
34336	NC_015214	TTCAA	2	10	1923833	1923842	40 %	40 %	0 %	20 %	325957618
34337	NC_015214	ATC	2	6	1923856	1923861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957618
34338	NC_015214	GTT	2	6	1923868	1923873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957618
34339	NC_015214	CCTTGA	2	12	1923876	1923887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325957618
34340	NC_015214	CTT	2	6	1923922	1923927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957618
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34342	NC_015214	TTTCCT	2	12	1923990	1924001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957618
34343	NC_015214	TTC	2	6	1924042	1924047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957618
34344	NC_015214	ATC	2	6	1924102	1924107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957618
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34346	NC_015214	TCAA	2	8	1924157	1924164	50 %	25 %	0 %	25 %	325957618
34347	NC_015214	CAT	2	6	1924176	1924181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957618
34348	NC_015214	TCA	2	6	1924275	1924280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957618
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34353	NC_015214	AAC	2	6	1924477	1924482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957618
34354	NC_015214	TTGA	2	8	1924529	1924536	25 %	50 %	25 %	0 %	325957618
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34358	NC_015214	CTT	2	6	1924623	1924628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957618
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34450	NC_015214	AGCAT	2	10	1929299	1929308	40 %	20 %	20 %	20 %	325957625
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34454	NC_015214	TCTTG	2	10	1929429	1929438	0 %	60 %	20 %	20 %	325957625
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34456	NC_015214	AT	3	6	1929578	1929583	50 %	50 %	0 %	0 %	325957625
34457	NC_015214	TCAA	2	8	1929596	1929603	50 %	25 %	0 %	25 %	325957625
34458	NC_015214	TTG	2	6	1929622	1929627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957625
34459	NC_015214	ATC	2	6	1929646	1929651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957625
34460	NC_015214	TGT	2	6	1929690	1929695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957625
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