MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_015214	TCA	2	6	1721434	1721439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957397
30502	NC_015214	TGG	2	6	1721474	1721479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957397
30503	NC_015214	GAA	2	6	1721483	1721488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957397
30504	NC_015214	ATG	2	6	1721523	1721528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957397
30505	NC_015214	AAT	2	6	1721568	1721573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957397
30506	NC_015214	T	6	6	1721629	1721634	0 %	100 %	0 %	0 %	325957398
30507	NC_015214	TAC	2	6	1721651	1721656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957398
30508	NC_015214	GTC	2	6	1721657	1721662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957398
30509	NC_015214	CTCG	2	8	1721743	1721750	0 %	25 %	25 %	50 %	325957398
30510	NC_015214	CGT	2	6	1721782	1721787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957398
30511	NC_015214	TCA	2	6	1721953	1721958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957398
30512	NC_015214	GGC	2	6	1721966	1721971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325957398
30513	NC_015214	ATT	2	6	1722074	1722079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957398
30514	NC_015214	AACC	2	8	1722151	1722158	50 %	0 %	0 %	50 %	325957398
30515	NC_015214	CTT	2	6	1722175	1722180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957398
30516	NC_015214	GCA	2	6	1722246	1722251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957398
30517	NC_015214	AAGT	2	8	1722414	1722421	50 %	25 %	25 %	0 %	325957398
30518	NC_015214	TAA	2	6	1722578	1722583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957398
30519	NC_015214	ATC	2	6	1722633	1722638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957398
30520	NC_015214	GTG	2	6	1722660	1722665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957398
30521	NC_015214	GCC	2	6	1722683	1722688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957398
30522	NC_015214	TTC	2	6	1722812	1722817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957398
30523	NC_015214	GC	3	6	1722918	1722923	0 %	0 %	50 %	50 %	325957398
30524	NC_015214	AAT	2	6	1722951	1722956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957398
30525	NC_015214	AATT	2	8	1722961	1722968	50 %	50 %	0 %	0 %	325957398
30526	NC_015214	ATG	3	9	1722970	1722978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957398
30527	NC_015214	CAG	2	6	1723249	1723254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957399
30528	NC_015214	TTC	2	6	1723257	1723262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957399
30529	NC_015214	AGCC	2	8	1723269	1723276	25 %	0 %	25 %	50 %	325957399
30530	NC_015214	CGC	2	6	1723342	1723347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957399
30531	NC_015214	GCA	2	6	1723368	1723373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957399
30532	NC_015214	G	6	6	1723442	1723447	0 %	0 %	100 %	0 %	325957400
30533	NC_015214	TTTA	2	8	1723469	1723476	25 %	75 %	0 %	0 %	325957400
30534	NC_015214	GCT	2	6	1723590	1723595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957400
30535	NC_015214	CAA	2	6	1723614	1723619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957400
30536	NC_015214	CAGC	2	8	1723671	1723678	25 %	0 %	25 %	50 %	325957400
30537	NC_015214	CAC	2	6	1723684	1723689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957400
30538	NC_015214	TGCACG	2	12	1723703	1723714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30539	NC_015214	ATG	2	6	1723789	1723794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957401
30540	NC_015214	TACCAG	2	12	1723795	1723806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325957401
30541	NC_015214	ACG	2	6	1723835	1723840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30542	NC_015214	CCTTG	2	10	1723843	1723852	0 %	40 %	20 %	40 %	325957401
30543	NC_015214	AAG	2	6	1723879	1723884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957401
30544	NC_015214	ATA	2	6	1723909	1723914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957401
30545	NC_015214	ACT	2	6	1723919	1723924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957401
30546	NC_015214	TGA	2	6	1724039	1724044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957401
30547	NC_015214	TGA	2	6	1724058	1724063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957401
30548	NC_015214	TTA	2	6	1724070	1724075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957401
30549	NC_015214	TGC	2	6	1724114	1724119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30550	NC_015214	CAT	2	6	1724146	1724151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957401
30551	NC_015214	TGAA	2	8	1724182	1724189	50 %	25 %	25 %	0 %	325957401
30552	NC_015214	ATT	2	6	1724219	1724224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957401
30553	NC_015214	GTC	2	6	1724225	1724230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30554	NC_015214	ATC	2	6	1724477	1724482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957401
30555	NC_015214	TTA	2	6	1724532	1724537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957401
30556	NC_015214	CAT	2	6	1724578	1724583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957401
30557	NC_015214	GTA	2	6	1724589	1724594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957401
30558	NC_015214	CAG	2	6	1724596	1724601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30559	NC_015214	TGC	2	6	1724657	1724662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957401
30560	NC_015214	TCTT	2	8	1724720	1724727	0 %	75 %	0 %	25 %	325957401
30561	NC_015214	ATT	2	6	1724732	1724737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957401
30562	NC_015214	TAT	2	6	1725087	1725092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957402
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30566	NC_015214	AAG	2	6	1725276	1725281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957402
30567	NC_015214	AAAT	2	8	1725301	1725308	75 %	25 %	0 %	0 %	325957402
30568	NC_015214	ACT	2	6	1725320	1725325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957402
30569	NC_015214	TTC	2	6	1725333	1725338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957402
30570	NC_015214	ATG	2	6	1725351	1725356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957402
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30572	NC_015214	TC	3	6	1725598	1725603	0 %	50 %	0 %	50 %	325957402
30573	NC_015214	TCA	2	6	1725675	1725680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957402
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30575	NC_015214	ACCT	2	8	1725701	1725708	25 %	25 %	0 %	50 %	325957402
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30585	NC_015214	TACT	2	8	1726265	1726272	25 %	50 %	0 %	25 %	325957403
30586	NC_015214	TTAAC	2	10	1726293	1726302	40 %	40 %	0 %	20 %	325957403
30587	NC_015214	ACC	2	6	1726417	1726422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30588	NC_015214	GAT	2	6	1726426	1726431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30589	NC_015214	AAC	2	6	1726444	1726449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957403
30590	NC_015214	ATG	2	6	1726457	1726462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30591	NC_015214	AGT	2	6	1726492	1726497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
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30595	NC_015214	GAA	2	6	1726701	1726706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957403
30596	NC_015214	TGA	2	6	1726767	1726772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30597	NC_015214	ACC	2	6	1726819	1726824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30598	NC_015214	TTC	2	6	1726841	1726846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957403
30599	NC_015214	GTA	2	6	1726850	1726855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30600	NC_015214	TCT	2	6	1726866	1726871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957403
30601	NC_015214	CTT	2	6	1726957	1726962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957403
30602	NC_015214	CAG	2	6	1727040	1727045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957403
30603	NC_015214	TGA	2	6	1727050	1727055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30604	NC_015214	AGT	2	6	1727116	1727121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957403
30605	NC_015214	CAC	2	6	1727154	1727159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30606	NC_015214	GCTA	2	8	1727221	1727228	25 %	25 %	25 %	25 %	325957403
30607	NC_015214	GTT	2	6	1727242	1727247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957403
30608	NC_015214	CAC	2	6	1727343	1727348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30609	NC_015214	GAC	2	6	1727376	1727381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957403
30610	NC_015214	CAC	2	6	1727385	1727390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30611	NC_015214	CAC	2	6	1727427	1727432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957403
30612	NC_015214	AGC	3	9	1727440	1727448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957403
30613	NC_015214	AGC	2	6	1727488	1727493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957403
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30615	NC_015214	TTGCA	2	10	1727629	1727638	20 %	40 %	20 %	20 %	325957403
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