MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_015214	TTC	2	6	1520209	1520214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957208
27002	NC_015214	GAA	2	6	1520343	1520348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957208
27003	NC_015214	TAT	2	6	1520368	1520373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957208
27004	NC_015214	GTCT	2	8	1520391	1520398	0 %	50 %	25 %	25 %	325957208
27005	NC_015214	CTA	2	6	1520416	1520421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
27006	NC_015214	TTGCCA	2	12	1520503	1520514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325957208
27007	NC_015214	T	7	7	1520525	1520531	0 %	100 %	0 %	0 %	325957208
27008	NC_015214	ATC	2	6	1520609	1520614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
27009	NC_015214	TTC	2	6	1520687	1520692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957208
27010	NC_015214	GAC	2	6	1520773	1520778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957208
27011	NC_015214	TAAA	2	8	1520790	1520797	75 %	25 %	0 %	0 %	325957208
27012	NC_015214	ATTTG	2	10	1520817	1520826	20 %	60 %	20 %	0 %	325957208
27013	NC_015214	CTT	2	6	1520857	1520862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957208
27014	NC_015214	T	6	6	1520912	1520917	0 %	100 %	0 %	0 %	325957208
27015	NC_015214	ATT	2	6	1521044	1521049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957208
27016	NC_015214	CAGC	2	8	1521072	1521079	25 %	0 %	25 %	50 %	325957208
27017	NC_015214	TTG	2	6	1521089	1521094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957208
27018	NC_015214	TCAA	2	8	1521096	1521103	50 %	25 %	0 %	25 %	325957208
27019	NC_015214	GTC	2	6	1521163	1521168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957208
27020	NC_015214	CTC	2	6	1521176	1521181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957208
27021	NC_015214	TTG	2	6	1521388	1521393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957208
27022	NC_015214	ATC	2	6	1521404	1521409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
27023	NC_015214	AATCT	2	10	1521432	1521441	40 %	40 %	0 %	20 %	325957208
27024	NC_015214	TAC	2	6	1521458	1521463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957208
27025	NC_015214	AGC	2	6	1522078	1522083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957209
27026	NC_015214	TGA	2	6	1522125	1522130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957209
27027	NC_015214	AGA	2	6	1522234	1522239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957209
27028	NC_015214	ATG	2	6	1522279	1522284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957209
27029	NC_015214	AAAG	2	8	1522301	1522308	75 %	0 %	25 %	0 %	325957209
27030	NC_015214	CAAAG	2	10	1522405	1522414	60 %	0 %	20 %	20 %	325957209
27031	NC_015214	ACT	2	6	1522556	1522561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957209
27032	NC_015214	AAG	2	6	1522610	1522615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957209
27033	NC_015214	ATC	2	6	1522621	1522626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957209
27034	NC_015214	CTT	2	6	1522629	1522634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957209
27035	NC_015214	GC	3	6	1522662	1522667	0 %	0 %	50 %	50 %	325957209
27036	NC_015214	GCTC	2	8	1522821	1522828	0 %	25 %	25 %	50 %	325957209
27037	NC_015214	AAC	2	6	1522924	1522929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957209
27038	NC_015214	ATT	2	6	1523105	1523110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957209
27039	NC_015214	TCT	2	6	1523128	1523133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957209
27040	NC_015214	AAG	2	6	1523149	1523154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957209
27041	NC_015214	ATT	2	6	1523178	1523183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957209
27042	NC_015214	TTAA	2	8	1523200	1523207	50 %	50 %	0 %	0 %	325957209
27043	NC_015214	TA	3	6	1523219	1523224	50 %	50 %	0 %	0 %	325957209
27044	NC_015214	TAA	2	6	1523478	1523483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957210
27045	NC_015214	AAT	2	6	1523564	1523569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957210
27046	NC_015214	ATC	2	6	1523589	1523594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957210
27047	NC_015214	TCT	2	6	1523602	1523607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957210
27048	NC_015214	TC	3	6	1523612	1523617	0 %	50 %	0 %	50 %	325957210
27049	NC_015214	ACT	2	6	1523643	1523648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957210
27050	NC_015214	CTT	2	6	1523790	1523795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957210
27051	NC_015214	CCA	2	6	1523799	1523804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957210
27052	NC_015214	TTC	2	6	1523814	1523819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957210
27053	NC_015214	CAA	2	6	1523830	1523835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957210
27054	NC_015214	ATT	2	6	1523886	1523891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957210
27055	NC_015214	ATCT	2	8	1523918	1523925	25 %	50 %	0 %	25 %	325957210
27056	NC_015214	AAG	2	6	1524238	1524243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957211
27057	NC_015214	GAC	2	6	1524310	1524315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957211
27058	NC_015214	GCAAG	2	10	1524378	1524387	40 %	0 %	40 %	20 %	325957211
27059	NC_015214	ACA	2	6	1524495	1524500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957211
27060	NC_015214	AAG	2	6	1524520	1524525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957211
27061	NC_015214	AAG	2	6	1524532	1524537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957211
27062	NC_015214	TCG	2	6	1524548	1524553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957211
27063	NC_015214	CGG	2	6	1524621	1524626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325957211
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27066	NC_015214	CAT	2	6	1524690	1524695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957211
27067	NC_015214	ATTT	2	8	1524698	1524705	25 %	75 %	0 %	0 %	325957211
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27069	NC_015214	TCAA	2	8	1524822	1524829	50 %	25 %	0 %	25 %	325957211
27070	NC_015214	ATT	2	6	1524850	1524855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957211
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27073	NC_015214	GTTGAT	2	12	1524952	1524963	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325957211
27074	NC_015214	ACTTT	2	10	1525010	1525019	20 %	60 %	0 %	20 %	325957211
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27076	NC_015214	CCAAG	2	10	1525226	1525235	40 %	0 %	20 %	40 %	325957211
27077	NC_015214	TAAA	2	8	1525236	1525243	75 %	25 %	0 %	0 %	325957211
27078	NC_015214	A	6	6	1525307	1525312	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
27079	NC_015214	TGA	2	6	1525449	1525454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
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27081	NC_015214	GCTT	2	8	1525467	1525474	0 %	50 %	25 %	25 %	325957212
27082	NC_015214	GCT	2	6	1525535	1525540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957212
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27084	NC_015214	GCTC	2	8	1525579	1525586	0 %	25 %	25 %	50 %	325957212
27085	NC_015214	CAT	2	6	1525609	1525614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957212
27086	NC_015214	A	6	6	1525655	1525660	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
27087	NC_015214	TGA	2	6	1525714	1525719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
27088	NC_015214	CAA	3	9	1525745	1525753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957212
27089	NC_015214	TGA	2	6	1525804	1525809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957212
27090	NC_015214	ATT	2	6	1525889	1525894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
27091	NC_015214	AAG	2	6	1525985	1525990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957212
27092	NC_015214	CAA	2	6	1526000	1526005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957212
27093	NC_015214	TGGT	2	8	1526019	1526026	0 %	50 %	50 %	0 %	325957212
27094	NC_015214	GAAAT	2	10	1526036	1526045	60 %	20 %	20 %	0 %	325957212
27095	NC_015214	A	6	6	1526051	1526056	100 %	0 %	0 %	0 %	325957212
27096	NC_015214	AAAG	2	8	1526105	1526112	75 %	0 %	25 %	0 %	325957212
27097	NC_015214	ATT	2	6	1526255	1526260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
27098	NC_015214	AAAGAT	2	12	1526261	1526272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325957212
27099	NC_015214	CCA	2	6	1526286	1526291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957212
27100	NC_015214	CCG	2	6	1526325	1526330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957212
27101	NC_015214	CTA	2	6	1526392	1526397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957212
27102	NC_015214	ACC	2	6	1526486	1526491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957212
27103	NC_015214	GGT	2	6	1526522	1526527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957212
27104	NC_015214	ATT	2	6	1526543	1526548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
27105	NC_015214	GAAA	2	8	1526561	1526568	75 %	0 %	25 %	0 %	325957212
27106	NC_015214	ATC	2	6	1526579	1526584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957212
27107	NC_015214	ATT	2	6	1526641	1526646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957212
27108	NC_015214	CAT	2	6	1526735	1526740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957212
27109	NC_015214	ACC	2	6	1526774	1526779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957212
27110	NC_015214	GAA	2	6	1526812	1526817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957212
27111	NC_015214	AAT	2	6	1526909	1526914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957213
27112	NC_015214	CTT	2	6	1527021	1527026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957213
27113	NC_015214	TTC	2	6	1527066	1527071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957213
27114	NC_015214	CAAGCT	2	12	1527090	1527101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325957213
27115	NC_015214	GTTTG	2	10	1527117	1527126	0 %	60 %	40 %	0 %	325957213
27116	NC_015214	GCA	2	6	1527308	1527313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957213
27117	NC_015214	TAC	2	6	1527347	1527352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957213
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27232	NC_015214	AAC	2	6	1533935	1533940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957219
27233	NC_015214	ATT	2	6	1533944	1533949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957219
27234	NC_015214	TTTC	2	8	1533955	1533962	0 %	75 %	0 %	25 %	325957219
27235	NC_015214	ATT	2	6	1533965	1533970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957219
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27237	NC_015214	GCCT	2	8	1534085	1534092	0 %	25 %	25 %	50 %	325957219
27238	NC_015214	TCA	2	6	1534113	1534118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957219
27239	NC_015214	CAT	2	6	1534156	1534161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957219
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27251	NC_015214	AATA	2	8	1534879	1534886	75 %	25 %	0 %	0 %	325957221
27252	NC_015214	ATT	2	6	1534934	1534939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957221
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27254	NC_015214	TAA	2	6	1534952	1534957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957221
27255	NC_015214	AT	3	6	1534962	1534967	50 %	50 %	0 %	0 %	325957221
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27263	NC_015214	TCA	2	6	1535392	1535397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957221
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27273	NC_015214	CGTTT	2	10	1535965	1535974	0 %	60 %	20 %	20 %	325957222
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27320	NC_015214	TTA	2	6	1538172	1538177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957226
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27333	NC_015214	ATC	2	6	1538715	1538720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957226
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27335	NC_015214	TGC	2	6	1538807	1538812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957226
27336	NC_015214	GTG	2	6	1538887	1538892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957226
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27339	NC_015214	ATT	3	9	1539078	1539086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957226
27340	NC_015214	TGGT	2	8	1539103	1539110	0 %	50 %	50 %	0 %	325957226
27341	NC_015214	ATG	2	6	1539123	1539128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957226
27342	NC_015214	TAC	2	6	1539134	1539139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957226
27343	NC_015214	CCG	2	6	1539184	1539189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957226
27344	NC_015214	AAC	2	6	1539192	1539197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957226
27345	NC_015214	TAT	2	6	1539211	1539216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957226
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27347	NC_015214	AAC	2	6	1539264	1539269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957226
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27464	NC_015214	TGA	2	6	1547694	1547699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957233
27465	NC_015214	TGA	2	6	1547739	1547744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957233
27466	NC_015214	TAC	2	6	1547749	1547754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957233
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