MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_015214	CAATT	2	10	1407514	1407523	40 %	40 %	0 %	20 %	325957091
25002	NC_015214	TCA	2	6	1407566	1407571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957091
25003	NC_015214	TAT	2	6	1407691	1407696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957092
25004	NC_015214	TTGA	2	8	1407736	1407743	25 %	50 %	25 %	0 %	325957092
25005	NC_015214	ATC	2	6	1407748	1407753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957092
25006	NC_015214	TTC	2	6	1407870	1407875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25007	NC_015214	GTAAG	2	10	1407907	1407916	40 %	20 %	40 %	0 %	325957092
25008	NC_015214	GTA	2	6	1407975	1407980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957092
25009	NC_015214	CCA	2	6	1407981	1407986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957092
25010	NC_015214	TCAT	2	8	1407991	1407998	25 %	50 %	0 %	25 %	325957092
25011	NC_015214	GAATG	2	10	1408056	1408065	40 %	20 %	40 %	0 %	325957092
25012	NC_015214	ACC	2	6	1408083	1408088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957092
25013	NC_015214	TCT	2	6	1408117	1408122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25014	NC_015214	TTC	2	6	1408197	1408202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25015	NC_015214	TCT	2	6	1408283	1408288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25016	NC_015214	AGC	2	6	1408290	1408295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957092
25017	NC_015214	AAC	2	6	1408351	1408356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957092
25018	NC_015214	GTG	2	6	1408458	1408463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957092
25019	NC_015214	ATC	2	6	1408566	1408571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957092
25020	NC_015214	GTG	2	6	1408593	1408598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957092
25021	NC_015214	CAG	2	6	1408658	1408663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957092
25022	NC_015214	CAAT	2	8	1408679	1408686	50 %	25 %	0 %	25 %	325957092
25023	NC_015214	TCG	2	6	1408861	1408866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957092
25024	NC_015214	TCT	2	6	1408921	1408926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25025	NC_015214	CTT	2	6	1408968	1408973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957092
25026	NC_015214	AAT	2	6	1408995	1409000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957092
25027	NC_015214	ATC	2	6	1409031	1409036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957092
25028	NC_015214	CTA	2	6	1409081	1409086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957092
25029	NC_015214	TAG	2	6	1409090	1409095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957092
25030	NC_015214	ACTAG	2	10	1409162	1409171	40 %	20 %	20 %	20 %	325957093
25031	NC_015214	GCA	2	6	1409200	1409205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957093
25032	NC_015214	TCT	2	6	1409221	1409226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957093
25033	NC_015214	ACCA	2	8	1409241	1409248	50 %	0 %	0 %	50 %	325957093
25034	NC_015214	AAC	2	6	1409286	1409291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957093
25035	NC_015214	CTG	2	6	1409417	1409422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957093
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25038	NC_015214	TTC	2	6	1409482	1409487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957093
25039	NC_015214	CTG	2	6	1409504	1409509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957093
25040	NC_015214	ACA	2	6	1409602	1409607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957093
25041	NC_015214	TTC	2	6	1409631	1409636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957093
25042	NC_015214	GTA	2	6	1409731	1409736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957093
25043	NC_015214	ACC	2	6	1409823	1409828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957093
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25046	NC_015214	TCA	2	6	1409920	1409925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957093
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25048	NC_015214	ATC	2	6	1409982	1409987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957093
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25050	NC_015214	AAG	2	6	1410022	1410027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957093
25051	NC_015214	T	6	6	1410059	1410064	0 %	100 %	0 %	0 %	325957093
25052	NC_015214	TCT	2	6	1410097	1410102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957093
25053	NC_015214	TCA	2	6	1410103	1410108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957093
25054	NC_015214	TCA	2	6	1410121	1410126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957093
25055	NC_015214	CTG	2	6	1410137	1410142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957093
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25059	NC_015214	GGCT	2	8	1410189	1410196	0 %	25 %	50 %	25 %	325957093
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25066	NC_015214	TTC	3	9	1410369	1410377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957093
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25070	NC_015214	T	6	6	1410438	1410443	0 %	100 %	0 %	0 %	325957093
25071	NC_015214	AG	3	6	1410449	1410454	50 %	0 %	50 %	0 %	325957093
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25074	NC_015214	TAC	2	6	1410558	1410563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957094
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25081	NC_015214	TTG	2	6	1411026	1411031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957094
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25083	NC_015214	TTGAA	2	10	1411074	1411083	40 %	40 %	20 %	0 %	325957094
25084	NC_015214	TCA	2	6	1411162	1411167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957094
25085	NC_015214	ATC	2	6	1411215	1411220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957094
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25087	NC_015214	TGAT	2	8	1411345	1411352	25 %	50 %	25 %	0 %	325957094
25088	NC_015214	TGC	2	6	1411417	1411422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957094
25089	NC_015214	CTT	2	6	1411440	1411445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957094
25090	NC_015214	TGAAC	2	10	1411462	1411471	40 %	20 %	20 %	20 %	325957094
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25092	NC_015214	CAG	2	6	1411514	1411519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957094
25093	NC_015214	ATT	2	6	1411530	1411535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957094
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25098	NC_015214	CTG	2	6	1411752	1411757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957094
25099	NC_015214	ATT	2	6	1411809	1411814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957094
25100	NC_015214	CTT	2	6	1411835	1411840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957094
25101	NC_015214	GAAA	2	8	1411854	1411861	75 %	0 %	25 %	0 %	325957094
25102	NC_015214	TCT	2	6	1411972	1411977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957094
25103	NC_015214	TGAT	2	8	1412017	1412024	25 %	50 %	25 %	0 %	325957094
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25106	NC_015214	AAT	2	6	1412178	1412183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957094
25107	NC_015214	ATTG	2	8	1412202	1412209	25 %	50 %	25 %	0 %	325957094
25108	NC_015214	GCTA	2	8	1412250	1412257	25 %	25 %	25 %	25 %	325957094
25109	NC_015214	GTA	2	6	1412287	1412292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957094
25110	NC_015214	TTGA	2	8	1412297	1412304	25 %	50 %	25 %	0 %	325957094
25111	NC_015214	CGC	2	6	1412426	1412431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957094
25112	NC_015214	GGAA	2	8	1412471	1412478	50 %	0 %	50 %	0 %	325957094
25113	NC_015214	TGT	2	6	1412522	1412527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957094
25114	NC_015214	TAA	2	6	1412551	1412556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957094
25115	NC_015214	T	6	6	1412606	1412611	0 %	100 %	0 %	0 %	325957094
25116	NC_015214	TTA	2	6	1412659	1412664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957094
25117	NC_015214	TTA	2	6	1412863	1412868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957094
25118	NC_015214	GTC	2	6	1412869	1412874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957094
25119	NC_015214	TTC	2	6	1412934	1412939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957094
25120	NC_015214	TCA	2	6	1412968	1412973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957094
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25216	NC_015214	CTAATG	2	12	1418541	1418552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325957097
25217	NC_015214	CTG	2	6	1418553	1418558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957097
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25220	NC_015214	TAG	2	6	1418906	1418911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957098
25221	NC_015214	TAA	2	6	1418936	1418941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957098
25222	NC_015214	TCA	2	6	1418953	1418958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957098
25223	NC_015214	AAGA	2	8	1419013	1419020	75 %	0 %	25 %	0 %	325957098
25224	NC_015214	AAC	2	6	1419060	1419065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957098
25225	NC_015214	GAT	2	6	1419069	1419074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957098
25226	NC_015214	GTCACG	2	12	1419159	1419170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325957098
25227	NC_015214	GAAT	2	8	1419179	1419186	50 %	25 %	25 %	0 %	325957098
25228	NC_015214	TAA	2	6	1419193	1419198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957098
25229	NC_015214	CGT	3	9	1419204	1419212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957098
25230	NC_015214	TGAA	2	8	1419310	1419317	50 %	25 %	25 %	0 %	325957098
25231	NC_015214	ATG	3	9	1419331	1419339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957098
25232	NC_015214	ACC	2	6	1419351	1419356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957098
25233	NC_015214	CCAAC	2	10	1419383	1419392	40 %	0 %	0 %	60 %	325957098
25234	NC_015214	ATG	2	6	1419448	1419453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957098
25235	NC_015214	ACC	2	6	1419474	1419479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957098
25236	NC_015214	ATC	2	6	1419480	1419485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957098
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25242	NC_015214	CTTT	2	8	1419716	1419723	0 %	75 %	0 %	25 %	325957098
25243	NC_015214	TCTT	2	8	1419733	1419740	0 %	75 %	0 %	25 %	325957098
25244	NC_015214	AAT	2	6	1419791	1419796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957099
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25250	NC_015214	AAT	2	6	1420002	1420007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957099
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25337	NC_015214	TCATCT	2	12	1423937	1423948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325957103
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25341	NC_015214	AATT	2	8	1424005	1424012	50 %	50 %	0 %	0 %	325957103
25342	NC_015214	CAATTG	2	12	1424127	1424138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325957103
25343	NC_015214	T	6	6	1424164	1424169	0 %	100 %	0 %	0 %	325957104
25344	NC_015214	ACT	2	6	1424283	1424288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957104
25345	NC_015214	ATT	2	6	1424300	1424305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957104
25346	NC_015214	CAC	2	6	1424368	1424373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957104
25347	NC_015214	TTG	2	6	1424409	1424414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957104
25348	NC_015214	AAT	2	6	1424423	1424428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957104
25349	NC_015214	TTC	2	6	1424506	1424511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957104
25350	NC_015214	CAT	2	6	1424564	1424569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957104
25351	NC_015214	CAC	2	6	1424632	1424637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957104
25352	NC_015214	T	6	6	1424663	1424668	0 %	100 %	0 %	0 %	325957104
25353	NC_015214	TTC	2	6	1424741	1424746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957104
25354	NC_015214	GCT	2	6	1424858	1424863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957104
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25357	NC_015214	TCCG	2	8	1425134	1425141	0 %	25 %	25 %	50 %	325957104
25358	NC_015214	GTAA	2	8	1425189	1425196	50 %	25 %	25 %	0 %	325957104
25359	NC_015214	GCA	2	6	1425220	1425225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957104
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25361	NC_015214	TGC	2	6	1425246	1425251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957104
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25368	NC_015214	GAA	2	6	1425554	1425559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957104
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25373	NC_015214	ATTA	2	8	1425722	1425729	50 %	50 %	0 %	0 %	325957104
25374	NC_015214	CTT	2	6	1425740	1425745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957104
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25382	NC_015214	ATC	2	6	1426269	1426274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957105
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25384	NC_015214	CTT	2	6	1426301	1426306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957105
25385	NC_015214	CTT	3	9	1426310	1426318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957105
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25446	NC_015214	TGTTT	2	10	1429316	1429325	0 %	80 %	20 %	0 %	325957109
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25453	NC_015214	ATT	2	6	1429738	1429743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957109
25454	NC_015214	TA	3	6	1429792	1429797	50 %	50 %	0 %	0 %	325957110
25455	NC_015214	CAA	2	6	1429897	1429902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957110
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25459	NC_015214	CAT	2	6	1430062	1430067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957110
25460	NC_015214	AAT	2	6	1430089	1430094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957110
25461	NC_015214	TCT	2	6	1430101	1430106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957110
25462	NC_015214	ATCAG	2	10	1430133	1430142	40 %	20 %	20 %	20 %	325957110
25463	NC_015214	ATC	2	6	1430171	1430176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957110
25464	NC_015214	AAAG	2	8	1430256	1430263	75 %	0 %	25 %	0 %	325957110
25465	NC_015214	TCCA	2	8	1430279	1430286	25 %	25 %	0 %	50 %	325957110
25466	NC_015214	GCA	2	6	1430316	1430321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957110
25467	NC_015214	CAT	2	6	1430335	1430340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957110
25468	NC_015214	CTT	2	6	1430487	1430492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957111
25469	NC_015214	AGC	2	6	1430495	1430500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957111
25470	NC_015214	GAA	2	6	1430627	1430632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957111
25471	NC_015214	TAG	2	6	1430688	1430693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957111
25472	NC_015214	TGA	2	6	1430738	1430743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957111
25473	NC_015214	TCT	2	6	1430747	1430752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957111
25474	NC_015214	CAT	2	6	1430850	1430855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957111
25475	NC_015214	T	7	7	1430905	1430911	0 %	100 %	0 %	0 %	325957111
25476	NC_015214	ATC	2	6	1430926	1430931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957111
25477	NC_015214	GATCA	2	10	1430935	1430944	40 %	20 %	20 %	20 %	325957111
25478	NC_015214	AAAT	2	8	1430954	1430961	75 %	25 %	0 %	0 %	325957111
25479	NC_015214	AAGAA	2	10	1430982	1430991	80 %	0 %	20 %	0 %	325957111
25480	NC_015214	TAA	2	6	1431007	1431012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957111
25481	NC_015214	AAT	2	6	1431050	1431055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957111
25482	NC_015214	CTG	2	6	1431168	1431173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957111
25483	NC_015214	T	7	7	1431182	1431188	0 %	100 %	0 %	0 %	325957111
25484	NC_015214	ATA	2	6	1431244	1431249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957111
25485	NC_015214	ATTT	2	8	1431290	1431297	25 %	75 %	0 %	0 %	325957111
25486	NC_015214	TTCA	2	8	1431307	1431314	25 %	50 %	0 %	25 %	325957112
25487	NC_015214	ACT	2	6	1431335	1431340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957112
25488	NC_015214	AGT	2	6	1431429	1431434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957112
25489	NC_015214	TCG	2	6	1431437	1431442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957112
25490	NC_015214	TAG	2	6	1431474	1431479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957112
25491	NC_015214	ACTTG	2	10	1431481	1431490	20 %	40 %	20 %	20 %	325957112
25492	NC_015214	TAT	3	9	1431513	1431521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957112
25493	NC_015214	GTC	2	6	1431538	1431543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957112
25494	NC_015214	TTC	2	6	1431595	1431600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957112
25495	NC_015214	CAT	2	6	1431696	1431701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957112
25496	NC_015214	CTT	2	6	1431806	1431811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957112
25497	NC_015214	GCA	2	6	1431881	1431886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957112
25498	NC_015214	ATG	2	6	1431899	1431904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957112
25499	NC_015214	CTTG	2	8	1431919	1431926	0 %	50 %	25 %	25 %	325957112
25500	NC_015214	TCT	2	6	1431935	1431940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957112

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