MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_015214	TTCA	2	8	1240571	1240578	25 %	50 %	0 %	25 %	325956912
22003	NC_015214	CTG	2	6	1240579	1240584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956912
22004	NC_015214	AAG	2	6	1240585	1240590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956912
22005	NC_015214	CT	4	8	1241896	1241903	0 %	50 %	0 %	50 %	325956913
22006	NC_015214	AACA	2	8	1241939	1241946	75 %	0 %	0 %	25 %	325956913
22007	NC_015214	CTA	2	6	1241974	1241979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956913
22008	NC_015214	AGA	2	6	1241988	1241993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956913
22009	NC_015214	TTA	2	6	1242030	1242035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956913
22010	NC_015214	AAT	2	6	1242089	1242094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956913
22011	NC_015214	AAAT	2	8	1242195	1242202	75 %	25 %	0 %	0 %	325956913
22012	NC_015214	TAC	2	6	1242218	1242223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956913
22013	NC_015214	CA	3	6	1242311	1242316	50 %	0 %	0 %	50 %	325956913
22014	NC_015214	TAG	2	6	1242328	1242333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956913
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22021	NC_015214	AGC	2	6	1242527	1242532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956913
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22024	NC_015214	AAAT	2	8	1242660	1242667	75 %	25 %	0 %	0 %	325956913
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22031	NC_015214	GCAAT	2	10	1242919	1242928	40 %	20 %	20 %	20 %	325956914
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22052	NC_015214	CCG	2	6	1243923	1243928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956915
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22116	NC_015214	TTC	2	6	1246652	1246657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956918
22117	NC_015214	CAT	2	6	1246722	1246727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956918
22118	NC_015214	TG	3	6	1246782	1246787	0 %	50 %	50 %	0 %	325956918
22119	NC_015214	CGT	2	6	1246809	1246814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956918
22120	NC_015214	TTC	2	6	1246888	1246893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956918
22121	NC_015214	TCT	2	6	1246928	1246933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956918
22122	NC_015214	CAA	2	6	1247008	1247013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956918
22123	NC_015214	AAAT	2	8	1247051	1247058	75 %	25 %	0 %	0 %	325956919
22124	NC_015214	TTG	2	6	1247071	1247076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956919
22125	NC_015214	ATT	2	6	1247108	1247113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956919
22126	NC_015214	ACT	2	6	1247187	1247192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956919
22127	NC_015214	ATCAT	2	10	1247208	1247217	40 %	40 %	0 %	20 %	325956919
22128	NC_015214	ATA	2	6	1247228	1247233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956919
22129	NC_015214	TAA	2	6	1247245	1247250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956919
22130	NC_015214	ATC	2	6	1247264	1247269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956919
22131	NC_015214	ACC	2	6	1247291	1247296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956919
22132	NC_015214	CAC	2	6	1247299	1247304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956919
22133	NC_015214	TTTG	2	8	1247326	1247333	0 %	75 %	25 %	0 %	325956919
22134	NC_015214	ATA	2	6	1247387	1247392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956919
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22136	NC_015214	TTC	2	6	1247495	1247500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956919
22137	NC_015214	TG	3	6	1247543	1247548	0 %	50 %	50 %	0 %	325956919
22138	NC_015214	T	6	6	1247676	1247681	0 %	100 %	0 %	0 %	325956919
22139	NC_015214	CTT	2	6	1247686	1247691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956919
22140	NC_015214	GTC	2	6	1247718	1247723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956919
22141	NC_015214	CAA	2	6	1247821	1247826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956919
22142	NC_015214	CTC	2	6	1247853	1247858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325956920
22143	NC_015214	AATG	2	8	1248003	1248010	50 %	25 %	25 %	0 %	325956920
22144	NC_015214	TTA	2	6	1248046	1248051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956920
22145	NC_015214	TTAA	2	8	1248067	1248074	50 %	50 %	0 %	0 %	325956920
22146	NC_015214	CAT	2	6	1248132	1248137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956920
22147	NC_015214	ACGC	2	8	1248147	1248154	25 %	0 %	25 %	50 %	325956920
22148	NC_015214	TAC	2	6	1248261	1248266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956920
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22151	NC_015214	CTAA	2	8	1248424	1248431	50 %	25 %	0 %	25 %	325956920
22152	NC_015214	TAAC	2	8	1248652	1248659	50 %	25 %	0 %	25 %	325956921
22153	NC_015214	TGG	2	6	1248737	1248742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956921
22154	NC_015214	TGT	2	6	1248776	1248781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956921
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22163	NC_015214	A	6	6	1249187	1249192	100 %	0 %	0 %	0 %	325956922
22164	NC_015214	AGA	2	6	1249207	1249212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956922
22165	NC_015214	A	6	6	1249212	1249217	100 %	0 %	0 %	0 %	325956922
22166	NC_015214	GAAAA	2	10	1249263	1249272	80 %	0 %	20 %	0 %	325956922
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22169	NC_015214	TGA	2	6	1249469	1249474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956922
22170	NC_015214	AAG	2	6	1249495	1249500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956922
22171	NC_015214	AAG	2	6	1249530	1249535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956922
22172	NC_015214	AGAC	2	8	1249606	1249613	50 %	0 %	25 %	25 %	325956922
22173	NC_015214	CTA	2	6	1249649	1249654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956922
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22177	NC_015214	AGTACG	2	12	1249917	1249928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325956923
22178	NC_015214	CAT	2	6	1249931	1249936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956923
22179	NC_015214	TTC	2	6	1249965	1249970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956923
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22182	NC_015214	ATC	2	6	1250085	1250090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956923
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22185	NC_015214	TTG	2	6	1250248	1250253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956923
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22189	NC_015214	TCAAG	2	10	1250420	1250429	40 %	20 %	20 %	20 %	325956923
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22201	NC_015214	CTA	2	6	1251122	1251127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956924
22202	NC_015214	GT	3	6	1251186	1251191	0 %	50 %	50 %	0 %	325956924
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22213	NC_015214	CTG	2	6	1251423	1251428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956924
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22215	NC_015214	TGCGT	2	10	1251507	1251516	0 %	40 %	40 %	20 %	325956924
22216	NC_015214	T	6	6	1251708	1251713	0 %	100 %	0 %	0 %	325956924
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22220	NC_015214	ATA	3	9	1251841	1251849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956924
22221	NC_015214	CCG	2	6	1251861	1251866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956924
22222	NC_015214	AAAT	2	8	1251871	1251878	75 %	25 %	0 %	0 %	325956924
22223	NC_015214	ATC	2	6	1251882	1251887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956924
22224	NC_015214	TGCC	2	8	1251926	1251933	0 %	25 %	25 %	50 %	325956924
22225	NC_015214	AGC	2	6	1251939	1251944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956924
22226	NC_015214	TGC	2	6	1251979	1251984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956924
22227	NC_015214	CTT	2	6	1251988	1251993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956924
22228	NC_015214	GCT	2	6	1251994	1251999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956924
22229	NC_015214	AT	3	6	1252066	1252071	50 %	50 %	0 %	0 %	325956924
22230	NC_015214	T	6	6	1252211	1252216	0 %	100 %	0 %	0 %	325956924
22231	NC_015214	TCA	2	6	1252222	1252227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956924
22232	NC_015214	TCT	2	6	1252270	1252275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956924
22233	NC_015214	CTG	2	6	1252394	1252399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956924
22234	NC_015214	CAT	2	6	1252439	1252444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956924
22235	NC_015214	GCC	2	6	1252551	1252556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956924
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22237	NC_015214	TTC	2	6	1252590	1252595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956924
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22240	NC_015214	TGA	2	6	1252624	1252629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956924
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22242	NC_015214	TGA	2	6	1252685	1252690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956924
22243	NC_015214	TGA	2	6	1252724	1252729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956924
22244	NC_015214	TTC	2	6	1252731	1252736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956924
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22250	NC_015214	TTC	2	6	1253062	1253067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956925
22251	NC_015214	TGT	2	6	1253072	1253077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956925
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22292	NC_015214	TCT	2	6	1254866	1254871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956926
22293	NC_015214	TTC	2	6	1254907	1254912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956926
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22332	NC_015214	ATA	2	6	1256733	1256738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956927
22333	NC_015214	CTT	2	6	1256746	1256751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956927
22334	NC_015214	CTT	2	6	1256779	1256784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956928
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22339	NC_015214	CGA	2	6	1257096	1257101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956928
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22342	NC_015214	CAA	2	6	1257271	1257276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956928
22343	NC_015214	CAT	2	6	1257411	1257416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956928
22344	NC_015214	GTC	2	6	1257448	1257453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956928
22345	NC_015214	ATC	2	6	1257508	1257513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956928
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22347	NC_015214	TCA	2	6	1257597	1257602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956928
22348	NC_015214	CAA	2	6	1257639	1257644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956928
22349	NC_015214	T	7	7	1257659	1257665	0 %	100 %	0 %	0 %	325956928
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22354	NC_015214	ATC	2	6	1257924	1257929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956929
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22446	NC_015214	CTTTT	2	10	1264295	1264304	0 %	80 %	0 %	20 %	325956935
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22451	NC_015214	TTTC	2	8	1264718	1264725	0 %	75 %	0 %	25 %	325956936
22452	NC_015214	TCA	2	6	1264910	1264915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956936
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22455	NC_015214	TTG	2	6	1264975	1264980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956936
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22458	NC_015214	ATTA	2	8	1265098	1265105	50 %	50 %	0 %	0 %	325956936
22459	NC_015214	TCAT	2	8	1265219	1265226	25 %	50 %	0 %	25 %	325956936
22460	NC_015214	CATTC	2	10	1265235	1265244	20 %	40 %	0 %	40 %	325956936
22461	NC_015214	GCG	2	6	1265272	1265277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956936
22462	NC_015214	GTA	2	6	1265291	1265296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956936
22463	NC_015214	TTC	2	6	1265299	1265304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956936
22464	NC_015214	TCA	2	6	1265309	1265314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956936
22465	NC_015214	GAA	2	6	1265318	1265323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956936
22466	NC_015214	CAA	2	6	1265358	1265363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956936
22467	NC_015214	TG	3	6	1265451	1265456	0 %	50 %	50 %	0 %	325956936
22468	NC_015214	TTCAAT	2	12	1265494	1265505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325956936
22469	NC_015214	AT	3	6	1265534	1265539	50 %	50 %	0 %	0 %	325956936
22470	NC_015214	GTT	2	6	1265551	1265556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956936
22471	NC_015214	AT	3	6	1265658	1265663	50 %	50 %	0 %	0 %	325956936
22472	NC_015214	TCT	2	6	1265684	1265689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956936
22473	NC_015214	TGC	2	6	1265777	1265782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956936
22474	NC_015214	GTA	2	6	1265790	1265795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956936
22475	NC_015214	AATTA	2	10	1265806	1265815	60 %	40 %	0 %	0 %	325956936
22476	NC_015214	TAA	2	6	1265835	1265840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956936
22477	NC_015214	AGT	2	6	1265881	1265886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956936
22478	NC_015214	TCA	2	6	1265915	1265920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956937
22479	NC_015214	TCA	2	6	1265945	1265950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956937
22480	NC_015214	CTT	2	6	1265967	1265972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956937
22481	NC_015214	GCC	2	6	1265998	1266003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956937
22482	NC_015214	CAT	2	6	1266025	1266030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956937
22483	NC_015214	TAA	2	6	1266061	1266066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956937
22484	NC_015214	GAC	2	6	1266133	1266138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956937
22485	NC_015214	TCA	2	6	1266173	1266178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956937
22486	NC_015214	CAC	2	6	1266237	1266242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956937
22487	NC_015214	TCAT	2	8	1266281	1266288	25 %	50 %	0 %	25 %	325956937
22488	NC_015214	TTA	2	6	1266308	1266313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956937
22489	NC_015214	ATC	2	6	1266346	1266351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956937
22490	NC_015214	TGC	2	6	1266373	1266378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956937
22491	NC_015214	ATTGC	2	10	1266423	1266432	20 %	40 %	20 %	20 %	325956937
22492	NC_015214	ATT	2	6	1266955	1266960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956938
22493	NC_015214	AAT	2	6	1266961	1266966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956938
22494	NC_015214	CTT	2	6	1267059	1267064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956938
22495	NC_015214	ACG	2	6	1267082	1267087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956938
22496	NC_015214	CAT	2	6	1267093	1267098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956938
22497	NC_015214	TG	3	6	1267135	1267140	0 %	50 %	50 %	0 %	325956938
22498	NC_015214	CATTAT	2	12	1267344	1267355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325956939
22499	NC_015214	TGC	2	6	1267362	1267367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956939
22500	NC_015214	GCT	3	9	1267399	1267407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956939

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