MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015214	A	7	7	1005865	1005871	100 %	0 %	0 %	0 %	325956667
18003	NC_015214	ACCA	2	8	1005889	1005896	50 %	0 %	0 %	50 %	325956667
18004	NC_015214	CAAG	2	8	1005902	1005909	50 %	0 %	25 %	25 %	325956667
18005	NC_015214	GATT	2	8	1006025	1006032	25 %	50 %	25 %	0 %	325956667
18006	NC_015214	CAA	2	6	1006067	1006072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956667
18007	NC_015214	TGA	2	6	1006091	1006096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956667
18008	NC_015214	ATT	2	6	1006120	1006125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956667
18009	NC_015214	AAT	2	6	1006128	1006133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956667
18010	NC_015214	A	6	6	1006231	1006236	100 %	0 %	0 %	0 %	325956667
18011	NC_015214	AC	3	6	1006286	1006291	50 %	0 %	0 %	50 %	325956667
18012	NC_015214	ATT	2	6	1006343	1006348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956667
18013	NC_015214	CAG	2	6	1006355	1006360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956667
18014	NC_015214	TAA	2	6	1006436	1006441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956667
18015	NC_015214	TAA	2	6	1006456	1006461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956668
18016	NC_015214	ACA	2	6	1006464	1006469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956668
18017	NC_015214	AAGA	2	8	1006559	1006566	75 %	0 %	25 %	0 %	325956668
18018	NC_015214	TGG	2	6	1006607	1006612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956668
18019	NC_015214	CGT	2	6	1006680	1006685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956668
18020	NC_015214	GCT	2	6	1006686	1006691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956668
18021	NC_015214	AATGC	2	10	1006740	1006749	40 %	20 %	20 %	20 %	325956668
18022	NC_015214	GTA	2	6	1006821	1006826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956668
18023	NC_015214	GGT	2	6	1006839	1006844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956668
18024	NC_015214	GCT	3	9	1006857	1006865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956668
18025	NC_015214	TGA	2	6	1006901	1006906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956668
18026	NC_015214	TGA	2	6	1006955	1006960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956668
18027	NC_015214	ATT	2	6	1006965	1006970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956668
18028	NC_015214	AT	3	6	1007041	1007046	50 %	50 %	0 %	0 %	325956669
18029	NC_015214	AAG	2	6	1007066	1007071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956669
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18032	NC_015214	GAA	2	6	1007327	1007332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956669
18033	NC_015214	CTA	2	6	1007364	1007369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956669
18034	NC_015214	TCT	2	6	1007395	1007400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956669
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18037	NC_015214	CAA	2	6	1007479	1007484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956669
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18039	NC_015214	GAA	3	9	1007501	1007509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956669
18040	NC_015214	TGA	2	6	1007515	1007520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956669
18041	NC_015214	CTT	2	6	1007567	1007572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956669
18042	NC_015214	ATG	2	6	1007633	1007638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956669
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18049	NC_015214	TGATT	2	10	1008010	1008019	20 %	60 %	20 %	0 %	325956669
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18054	NC_015214	ATA	2	6	1008553	1008558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956670
18055	NC_015214	GAA	2	6	1008624	1008629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956670
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18059	NC_015214	TGA	2	6	1008883	1008888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956670
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18087	NC_015214	TAG	2	6	1010174	1010179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956671
18088	NC_015214	ACT	2	6	1010211	1010216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956671
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18101	NC_015214	TTGT	2	8	1010844	1010851	0 %	75 %	25 %	0 %	325956672
18102	NC_015214	GCG	2	6	1010902	1010907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956672
18103	NC_015214	A	6	6	1010982	1010987	100 %	0 %	0 %	0 %	325956672
18104	NC_015214	TCAA	2	8	1010988	1010995	50 %	25 %	0 %	25 %	325956672
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18107	NC_015214	TTG	2	6	1011096	1011101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956672
18108	NC_015214	AAT	2	6	1011113	1011118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956672
18109	NC_015214	ATG	2	6	1011120	1011125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956672
18110	NC_015214	AAG	2	6	1011140	1011145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956672
18111	NC_015214	GCG	2	6	1011184	1011189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956672
18112	NC_015214	TGG	2	6	1011229	1011234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956672
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18116	NC_015214	GAA	2	6	1011433	1011438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956672
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18232	NC_015214	AGT	2	6	1017687	1017692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956681
18233	NC_015214	ATG	2	6	1017713	1017718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956681
18234	NC_015214	ATG	2	6	1017808	1017813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956681
18235	NC_015214	CAC	3	9	1017821	1017829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956681
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18238	NC_015214	CTA	2	6	1018001	1018006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956681
18239	NC_015214	ACC	2	6	1018092	1018097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956681
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18243	NC_015214	TCT	2	6	1018321	1018326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956681
18244	NC_015214	T	6	6	1018574	1018579	0 %	100 %	0 %	0 %	325956682
18245	NC_015214	ACA	2	6	1018654	1018659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956682
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18251	NC_015214	TTC	2	6	1018959	1018964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956682
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18259	NC_015214	GAA	2	6	1019484	1019489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956682
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18261	NC_015214	CAA	2	6	1019580	1019585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956682
18262	NC_015214	GAA	2	6	1019615	1019620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956682
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18293	NC_015214	GAA	2	6	1020837	1020842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956683
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18325	NC_015214	TAGC	2	8	1022454	1022461	25 %	25 %	25 %	25 %	325956684
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18329	NC_015214	GATAAC	2	12	1022740	1022751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325956685
18330	NC_015214	TTTGT	2	10	1022752	1022761	0 %	80 %	20 %	0 %	325956685
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18332	NC_015214	AAAT	2	8	1022846	1022853	75 %	25 %	0 %	0 %	325956685
18333	NC_015214	GGTGT	2	10	1022857	1022866	0 %	40 %	60 %	0 %	325956685
18334	NC_015214	TTGG	2	8	1022947	1022954	0 %	50 %	50 %	0 %	325956685
18335	NC_015214	TAA	2	6	1022963	1022968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956685
18336	NC_015214	TAA	2	6	1022987	1022992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956685
18337	NC_015214	GCG	2	6	1023044	1023049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956685
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18340	NC_015214	TAATGG	2	12	1023172	1023183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956685
18341	NC_015214	GAT	2	6	1023335	1023340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956685
18342	NC_015214	AACC	2	8	1023361	1023368	50 %	0 %	0 %	50 %	325956685
18343	NC_015214	TAA	2	6	1023419	1023424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956685
18344	NC_015214	ATT	3	9	1023494	1023502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956685
18345	NC_015214	AGC	2	6	1023551	1023556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956685
18346	NC_015214	GCCAAG	2	12	1023590	1023601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956685
18347	NC_015214	AAT	2	6	1023665	1023670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956685
18348	NC_015214	AAC	2	6	1023677	1023682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956685
18349	NC_015214	GGT	2	6	1023697	1023702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956685
18350	NC_015214	A	6	6	1023839	1023844	100 %	0 %	0 %	0 %	325956685
18351	NC_015214	TGC	2	6	1023973	1023978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956685
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18354	NC_015214	TAAA	2	8	1024248	1024255	75 %	25 %	0 %	0 %	325956686
18355	NC_015214	TGA	2	6	1024320	1024325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956686
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18359	NC_015214	TGA	2	6	1024570	1024575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956686
18360	NC_015214	GCT	2	6	1024627	1024632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956686
18361	NC_015214	AACTGC	2	12	1024678	1024689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325956686
18362	NC_015214	GAT	2	6	1024706	1024711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956686
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18364	NC_015214	ATC	2	6	1024859	1024864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956686
18365	NC_015214	AG	3	6	1024888	1024893	50 %	0 %	50 %	0 %	325956686
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18367	NC_015214	A	6	6	1024913	1024918	100 %	0 %	0 %	0 %	325956686
18368	NC_015214	AAAG	2	8	1024958	1024965	75 %	0 %	25 %	0 %	325956686
18369	NC_015214	AAG	2	6	1024977	1024982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956686
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18373	NC_015214	AAG	2	6	1025106	1025111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956686
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18457	NC_015214	A	8	8	1030485	1030492	100 %	0 %	0 %	0 %	325956692
18458	NC_015214	CTT	2	6	1030504	1030509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956692
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18460	NC_015214	CAA	2	6	1030561	1030566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956692
18461	NC_015214	A	6	6	1030572	1030577	100 %	0 %	0 %	0 %	325956692
18462	NC_015214	ATTAG	2	10	1030601	1030610	40 %	40 %	20 %	0 %	325956692
18463	NC_015214	ATT	2	6	1030763	1030768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956693
18464	NC_015214	GTC	2	6	1030815	1030820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956693
18465	NC_015214	CTG	2	6	1030848	1030853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956693
18466	NC_015214	TTTA	2	8	1030863	1030870	25 %	75 %	0 %	0 %	325956693
18467	NC_015214	AAG	2	6	1031027	1031032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956693
18468	NC_015214	CAT	2	6	1031035	1031040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956693
18469	NC_015214	TAC	2	6	1031077	1031082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956693
18470	NC_015214	TGG	2	6	1031112	1031117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956693
18471	NC_015214	TCA	2	6	1031172	1031177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956693
18472	NC_015214	AAT	2	6	1031372	1031377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956694
18473	NC_015214	ATC	2	6	1031381	1031386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956694
18474	NC_015214	ATC	2	6	1031408	1031413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956694
18475	NC_015214	AAG	2	6	1031543	1031548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956694
18476	NC_015214	TAA	2	6	1031563	1031568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956694
18477	NC_015214	ACA	2	6	1031598	1031603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956694
18478	NC_015214	TACAGC	2	12	1031612	1031623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325956694
18479	NC_015214	ACT	2	6	1031624	1031629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956694
18480	NC_015214	TGA	2	6	1031641	1031646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956694
18481	NC_015214	AC	3	6	1031677	1031682	50 %	0 %	0 %	50 %	325956694
18482	NC_015214	ATG	2	6	1031826	1031831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956694
18483	NC_015214	TGAC	2	8	1031877	1031884	25 %	25 %	25 %	25 %	325956694
18484	NC_015214	AAG	2	6	1031904	1031909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956694
18485	NC_015214	TAAAG	2	10	1031956	1031965	60 %	20 %	20 %	0 %	325956694
18486	NC_015214	TTGGGG	2	12	1031995	1032006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956694
18487	NC_015214	CGT	2	6	1032026	1032031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956694
18488	NC_015214	CTTG	2	8	1032034	1032041	0 %	50 %	25 %	25 %	325956694
18489	NC_015214	ACT	2	6	1032062	1032067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956694
18490	NC_015214	GTT	2	6	1032161	1032166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956694
18491	NC_015214	GAA	2	6	1032172	1032177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956694
18492	NC_015214	AAG	2	6	1032180	1032185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956694
18493	NC_015214	CTC	2	6	1032270	1032275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325956694
18494	NC_015214	ACAA	2	8	1032297	1032304	75 %	0 %	0 %	25 %	325956694
18495	NC_015214	GTA	2	6	1032324	1032329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956694
18496	NC_015214	GAT	2	6	1032332	1032337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956694
18497	NC_015214	AGTT	2	8	1032358	1032365	25 %	50 %	25 %	0 %	325956694
18498	NC_015214	ACG	2	6	1032402	1032407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956694
18499	NC_015214	ACTG	2	8	1032419	1032426	25 %	25 %	25 %	25 %	325956694
18500	NC_015214	GGT	2	6	1032449	1032454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956694

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