MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015214	CAT	2	6	727543	727548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956394
13002	NC_015214	ATG	2	6	727568	727573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956394
13003	NC_015214	GAA	2	6	727580	727585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956394
13004	NC_015214	CAG	2	6	727637	727642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956394
13005	NC_015214	AAG	2	6	727649	727654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956394
13006	NC_015214	ACC	2	6	727744	727749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956394
13007	NC_015214	AAC	2	6	727771	727776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956394
13008	NC_015214	GTA	2	6	727804	727809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956394
13009	NC_015214	ACCA	2	8	727888	727895	50 %	0 %	0 %	50 %	325956394
13010	NC_015214	AAC	2	6	727981	727986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956394
13011	NC_015214	CAT	2	6	728017	728022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956394
13012	NC_015214	GTC	2	6	728030	728035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956394
13013	NC_015214	CAT	2	6	728038	728043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956394
13014	NC_015214	TTA	2	6	728454	728459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956395
13015	NC_015214	TC	3	6	728484	728489	0 %	50 %	0 %	50 %	325956395
13016	NC_015214	GTT	2	6	728514	728519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956395
13017	NC_015214	CTT	2	6	728653	728658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956395
13018	NC_015214	GAA	2	6	728659	728664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956395
13019	NC_015214	GAC	2	6	728705	728710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956395
13020	NC_015214	ATGT	2	8	728721	728728	25 %	50 %	25 %	0 %	325956395
13021	NC_015214	GAA	2	6	728912	728917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956395
13022	NC_015214	GAT	2	6	728993	728998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956395
13023	NC_015214	CTG	2	6	729005	729010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956395
13024	NC_015214	CATG	2	8	729079	729086	25 %	25 %	25 %	25 %	325956395
13025	NC_015214	CAT	2	6	729141	729146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956395
13026	NC_015214	TTC	2	6	729733	729738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956396
13027	NC_015214	CGTAG	2	10	729792	729801	20 %	20 %	40 %	20 %	325956396
13028	NC_015214	GAAA	2	8	729822	729829	75 %	0 %	25 %	0 %	325956396
13029	NC_015214	TTGA	2	8	729867	729874	25 %	50 %	25 %	0 %	325956396
13030	NC_015214	ATTG	2	8	729938	729945	25 %	50 %	25 %	0 %	325956396
13031	NC_015214	GA	3	6	729964	729969	50 %	0 %	50 %	0 %	325956396
13032	NC_015214	GT	3	6	730045	730050	0 %	50 %	50 %	0 %	325956396
13033	NC_015214	AAGTT	2	10	730068	730077	40 %	40 %	20 %	0 %	325956396
13034	NC_015214	TAA	2	6	730178	730183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956396
13035	NC_015214	GCT	2	6	730266	730271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956396
13036	NC_015214	CAG	2	6	730318	730323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956396
13037	NC_015214	CT	3	6	730458	730463	0 %	50 %	0 %	50 %	325956396
13038	NC_015214	AAG	2	6	730476	730481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956396
13039	NC_015214	TTC	2	6	730506	730511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956396
13040	NC_015214	TTGC	2	8	730597	730604	0 %	50 %	25 %	25 %	325956396
13041	NC_015214	CAC	2	6	730648	730653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956396
13042	NC_015214	TGA	2	6	730673	730678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956396
13043	NC_015214	CGT	2	6	730820	730825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13044	NC_015214	GTT	2	6	730862	730867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956397
13045	NC_015214	ACT	2	6	730883	730888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13046	NC_015214	TGCT	2	8	730896	730903	0 %	50 %	25 %	25 %	325956397
13047	NC_015214	ACT	2	6	730922	730927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13048	NC_015214	TCA	2	6	730952	730957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13049	NC_015214	TGA	2	6	730960	730965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956397
13050	NC_015214	AAG	2	6	730985	730990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956397
13051	NC_015214	CAG	2	6	731145	731150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13052	NC_015214	CTG	2	6	731199	731204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13053	NC_015214	GCT	2	6	731222	731227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13054	NC_015214	TAC	2	6	731233	731238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13055	NC_015214	CTA	2	6	731295	731300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13056	NC_015214	TGC	3	9	731380	731388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13057	NC_015214	ATT	2	6	731396	731401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956397
13058	NC_015214	TAC	2	6	731407	731412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13059	NC_015214	GTTCCA	2	12	731483	731494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325956397
13060	NC_015214	GAA	3	9	731527	731535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956397
13061	NC_015214	CTG	2	6	731541	731546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13062	NC_015214	GAA	2	6	731566	731571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956397
13063	NC_015214	CAT	2	6	731583	731588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
13064	NC_015214	CTG	2	6	731637	731642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956397
13065	NC_015214	ACT	2	6	731675	731680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956397
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13068	NC_015214	TGC	2	6	732009	732014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956398
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13074	NC_015214	AAG	2	6	732188	732193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956398
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13089	NC_015214	CTA	3	9	732953	732961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956398
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13101	NC_015214	AAG	2	6	733466	733471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956399
13102	NC_015214	ATT	2	6	733505	733510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956399
13103	NC_015214	CAAG	2	8	733546	733553	50 %	0 %	25 %	25 %	325956399
13104	NC_015214	GCT	2	6	733580	733585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956399
13105	NC_015214	CTG	2	6	733599	733604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956399
13106	NC_015214	TCA	2	6	733670	733675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956399
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13108	NC_015214	GAA	2	6	733733	733738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956399
13109	NC_015214	GGT	2	6	733766	733771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956399
13110	NC_015214	TGG	2	6	733834	733839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956399
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13112	NC_015214	T	6	6	734876	734881	0 %	100 %	0 %	0 %	325956400
13113	NC_015214	ATA	2	6	734888	734893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956400
13114	NC_015214	TGAT	2	8	735017	735024	25 %	50 %	25 %	0 %	325956400
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13116	NC_015214	CAG	2	6	735112	735117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956400
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13118	NC_015214	TTGC	2	8	735169	735176	0 %	50 %	25 %	25 %	325956400
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13350	NC_015214	AT	3	6	748527	748532	50 %	50 %	0 %	0 %	325956415
13351	NC_015214	CTTG	2	8	748557	748564	0 %	50 %	25 %	25 %	325956415
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13353	NC_015214	AT	3	6	748599	748604	50 %	50 %	0 %	0 %	325956415
13354	NC_015214	A	6	6	748705	748710	100 %	0 %	0 %	0 %	325956415
13355	NC_015214	TCA	2	6	748755	748760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956415
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13359	NC_015214	GTT	2	6	749053	749058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956415
13360	NC_015214	TAAAAA	2	12	749070	749081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325956415
13361	NC_015214	TTA	2	6	749096	749101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956415
13362	NC_015214	GCA	2	6	749125	749130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956415
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13364	NC_015214	TTG	2	6	749182	749187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956415
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13378	NC_015214	ATG	2	6	749881	749886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956416
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13471	NC_015214	GAA	2	6	754653	754658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956421
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13473	NC_015214	AT	3	6	754670	754675	50 %	50 %	0 %	0 %	325956421
13474	NC_015214	CGA	2	6	754712	754717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956421
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13478	NC_015214	AAG	2	6	755008	755013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956421
13479	NC_015214	A	7	7	755030	755036	100 %	0 %	0 %	0 %	325956421
13480	NC_015214	TTTG	2	8	755042	755049	0 %	75 %	25 %	0 %	325956422
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13482	NC_015214	CGA	2	6	755148	755153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956422
13483	NC_015214	AGAAT	2	10	755208	755217	60 %	20 %	20 %	0 %	325956422
13484	NC_015214	ATGAAT	2	12	755268	755279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325956422
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13487	NC_015214	TGA	2	6	755392	755397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956422
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13491	NC_015214	ACGA	2	8	755530	755537	50 %	0 %	25 %	25 %	325956423
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