MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015214	CAAG	2	8	570065	570072	50 %	0 %	25 %	25 %	325956252
10003	NC_015214	ATG	2	6	570102	570107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956252
10004	NC_015214	AGA	2	6	570176	570181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956252
10005	NC_015214	A	6	6	570285	570290	100 %	0 %	0 %	0 %	325956252
10006	NC_015214	AAG	2	6	570315	570320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956252
10007	NC_015214	GTA	2	6	570369	570374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956252
10008	NC_015214	AAG	2	6	570468	570473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956252
10009	NC_015214	TGA	2	6	570532	570537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956253
10010	NC_015214	A	6	6	570542	570547	100 %	0 %	0 %	0 %	325956253
10011	NC_015214	GCT	2	6	570551	570556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956253
10012	NC_015214	TGAA	2	8	570573	570580	50 %	25 %	25 %	0 %	325956253
10013	NC_015214	TAC	2	6	570593	570598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956253
10014	NC_015214	TGG	2	6	570715	570720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956253
10015	NC_015214	AGA	2	6	570793	570798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10016	NC_015214	TTGG	2	8	570830	570837	0 %	50 %	50 %	0 %	325956253
10017	NC_015214	GAA	2	6	571079	571084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10018	NC_015214	CGC	2	6	571117	571122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956253
10019	NC_015214	GAA	2	6	571159	571164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10020	NC_015214	CCA	2	6	571202	571207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956253
10021	NC_015214	TGA	2	6	571297	571302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956253
10022	NC_015214	TGA	2	6	571318	571323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956253
10023	NC_015214	TGA	2	6	571381	571386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956253
10024	NC_015214	AGA	2	6	571459	571464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10025	NC_015214	CTG	2	6	571527	571532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956253
10026	NC_015214	CAT	2	6	571654	571659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956253
10027	NC_015214	GTT	2	6	571676	571681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956253
10028	NC_015214	CAG	2	6	571695	571700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956253
10029	NC_015214	CAT	2	6	571734	571739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956253
10030	NC_015214	AGA	2	6	571762	571767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10031	NC_015214	AGA	2	6	571813	571818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10032	NC_015214	GAT	2	6	571943	571948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956253
10033	NC_015214	AAT	2	6	571985	571990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956253
10034	NC_015214	AGC	2	6	572074	572079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956253
10035	NC_015214	GAA	2	6	572225	572230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10036	NC_015214	TGAAGA	2	12	572266	572277	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325956253
10037	NC_015214	AAG	2	6	572344	572349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
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10039	NC_015214	AAG	2	6	572405	572410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10040	NC_015214	GAA	3	9	572489	572497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956253
10041	NC_015214	ATT	2	6	572526	572531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956254
10042	NC_015214	A	6	6	572535	572540	100 %	0 %	0 %	0 %	325956254
10043	NC_015214	TGA	2	6	572569	572574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956254
10044	NC_015214	CAA	2	6	572618	572623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956254
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10047	NC_015214	AAG	2	6	572842	572847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956254
10048	NC_015214	TTC	2	6	572861	572866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956254
10049	NC_015214	AAAATC	2	12	572891	572902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325956254
10050	NC_015214	TAA	2	6	572927	572932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956254
10051	NC_015214	ATTT	2	8	572964	572971	25 %	75 %	0 %	0 %	325956254
10052	NC_015214	GAA	2	6	572973	572978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956254
10053	NC_015214	ATT	2	6	572979	572984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956254
10054	NC_015214	CCGGTT	2	12	573001	573012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956254
10055	NC_015214	ACT	2	6	573064	573069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956254
10056	NC_015214	AAG	2	6	573075	573080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956254
10057	NC_015214	AAC	2	6	573121	573126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956254
10058	NC_015214	TCG	2	6	573157	573162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956254
10059	NC_015214	AAG	2	6	573177	573182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956254
10060	NC_015214	GAA	2	6	573188	573193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956254
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10062	NC_015214	GCG	2	6	573273	573278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956254
10063	NC_015214	TAG	2	6	573284	573289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956254
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10068	NC_015214	GGC	2	6	573669	573674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956254
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10071	NC_015214	GAA	2	6	573755	573760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956255
10072	NC_015214	ATCA	2	8	573787	573794	50 %	25 %	0 %	25 %	325956255
10073	NC_015214	TGA	2	6	573838	573843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956255
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10084	NC_015214	ACG	2	6	574283	574288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10085	NC_015214	AAG	2	6	574309	574314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956256
10086	NC_015214	GGTA	2	8	574329	574336	25 %	25 %	50 %	0 %	325956256
10087	NC_015214	TCA	2	6	574366	574371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10088	NC_015214	TAC	2	6	574384	574389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10089	NC_015214	TGG	2	6	574428	574433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956256
10090	NC_015214	GGT	2	6	574441	574446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956256
10091	NC_015214	CTGCAG	2	12	574448	574459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10092	NC_015214	GGT	2	6	574465	574470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956256
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10099	NC_015214	CA	3	6	574871	574876	50 %	0 %	0 %	50 %	325956256
10100	NC_015214	GTT	2	6	574885	574890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956256
10101	NC_015214	ACT	2	6	574895	574900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10102	NC_015214	CAT	2	6	574902	574907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10103	NC_015214	TCA	2	6	574924	574929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10104	NC_015214	CTTG	2	8	574986	574993	0 %	50 %	25 %	25 %	325956256
10105	NC_015214	CGT	2	6	575041	575046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10106	NC_015214	TTC	2	6	575092	575097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956256
10107	NC_015214	GCT	2	6	575104	575109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10108	NC_015214	CTA	3	9	575177	575185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956256
10109	NC_015214	GAA	2	6	575209	575214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956256
10110	NC_015214	ACA	2	6	575237	575242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956256
10111	NC_015214	TGA	2	6	575352	575357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956256
10112	NC_015214	CTG	2	6	575375	575380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10113	NC_015214	GCA	2	6	575393	575398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956256
10114	NC_015214	A	6	6	575411	575416	100 %	0 %	0 %	0 %	325956256
10115	NC_015214	GGA	2	6	575430	575435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956256
10116	NC_015214	TGAA	2	8	575441	575448	50 %	25 %	25 %	0 %	325956257
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10118	NC_015214	TAT	2	6	575620	575625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956257
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10347	NC_015214	AT	3	6	589223	589228	50 %	50 %	0 %	0 %	325956269
10348	NC_015214	AGCA	2	8	589232	589239	50 %	0 %	25 %	25 %	325956269
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10476	NC_015214	GCT	2	6	596045	596050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956276
10477	NC_015214	AAT	2	6	596053	596058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956276
10478	NC_015214	CGAA	2	8	596095	596102	50 %	0 %	25 %	25 %	325956276
10479	NC_015214	CGC	2	6	596115	596120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325956276
10480	NC_015214	T	6	6	596134	596139	0 %	100 %	0 %	0 %	325956276
10481	NC_015214	GTC	2	6	596158	596163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956276
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10484	NC_015214	CCA	2	6	596210	596215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956276
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10486	NC_015214	CAC	2	6	596259	596264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956276
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10492	NC_015214	CCA	2	6	596527	596532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956276
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10499	NC_015214	GAA	3	9	596891	596899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956277
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