MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015214	GCT	2	6	304666	304671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956002
5502	NC_015214	AGAA	2	8	304734	304741	75 %	0 %	25 %	0 %	325956002
5503	NC_015214	TTC	2	6	304754	304759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956002
5504	NC_015214	CAC	2	6	304763	304768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956002
5505	NC_015214	GCG	2	6	304883	304888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956002
5506	NC_015214	GAA	2	6	304957	304962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956003
5507	NC_015214	TGT	2	6	305015	305020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
5508	NC_015214	GTT	2	6	305037	305042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
5509	NC_015214	CAA	2	6	305120	305125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956003
5510	NC_015214	AAGG	2	8	305244	305251	50 %	0 %	50 %	0 %	325956003
5511	NC_015214	CAT	2	6	305381	305386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956003
5512	NC_015214	AAAG	2	8	305432	305439	75 %	0 %	25 %	0 %	325956003
5513	NC_015214	GTT	2	6	305469	305474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
5514	NC_015214	GTT	2	6	305535	305540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
5515	NC_015214	AGGA	2	8	305575	305582	50 %	0 %	50 %	0 %	325956003
5516	NC_015214	CGT	2	6	305683	305688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
5517	NC_015214	ATT	2	6	305699	305704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956004
5518	NC_015214	CTG	2	6	305754	305759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
5519	NC_015214	CGG	2	6	305764	305769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956004
5520	NC_015214	AAG	2	6	305774	305779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956004
5521	NC_015214	TGGCG	2	10	305837	305846	0 %	20 %	60 %	20 %	325956004
5522	NC_015214	CGT	2	6	305906	305911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
5523	NC_015214	TTGA	2	8	305942	305949	25 %	50 %	25 %	0 %	325956004
5524	NC_015214	TGA	2	6	306058	306063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956004
5525	NC_015214	AAG	2	6	306182	306187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956004
5526	NC_015214	GAG	2	6	306191	306196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956004
5527	NC_015214	GAT	2	6	306268	306273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956005
5528	NC_015214	AAG	2	6	306274	306279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956005
5529	NC_015214	GAA	2	6	306334	306339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956005
5530	NC_015214	TAAAG	2	10	306351	306360	60 %	20 %	20 %	0 %	325956005
5531	NC_015214	TCG	2	6	306426	306431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956005
5532	NC_015214	TTG	2	6	306443	306448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956005
5533	NC_015214	AGA	2	6	306498	306503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956005
5534	NC_015214	CAA	2	6	306504	306509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956005
5535	NC_015214	GTC	3	9	306563	306571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956006
5536	NC_015214	CTT	2	6	306578	306583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956006
5537	NC_015214	AATCAC	2	12	306632	306643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325956006
5538	NC_015214	AC	3	6	306642	306647	50 %	0 %	0 %	50 %	325956006
5539	NC_015214	GTG	3	9	306689	306697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956006
5540	NC_015214	CAAA	2	8	306702	306709	75 %	0 %	0 %	25 %	325956006
5541	NC_015214	ATC	2	6	306718	306723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956006
5542	NC_015214	CGA	2	6	306885	306890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956006
5543	NC_015214	GAA	2	6	306924	306929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956006
5544	NC_015214	ATTGA	2	10	306958	306967	40 %	40 %	20 %	0 %	325956006
5545	NC_015214	GGT	2	6	306979	306984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956006
5546	NC_015214	AAG	2	6	306993	306998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956006
5547	NC_015214	GATTA	2	10	307047	307056	40 %	40 %	20 %	0 %	325956006
5548	NC_015214	ATC	2	6	307083	307088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956006
5549	NC_015214	CTA	2	6	307097	307102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956006
5550	NC_015214	TGGT	2	8	307109	307116	0 %	50 %	50 %	0 %	325956006
5551	NC_015214	AAC	2	6	307121	307126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956006
5552	NC_015214	TGG	3	9	307224	307232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956006
5553	NC_015214	GTC	2	6	307253	307258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956006
5554	NC_015214	AAG	2	6	307282	307287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956006
5555	NC_015214	AAG	2	6	307315	307320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956006
5556	NC_015214	ATA	2	6	307362	307367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956006
5557	NC_015214	TTAA	2	8	307377	307384	50 %	50 %	0 %	0 %	325956007
5558	NC_015214	GTA	2	6	307391	307396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956007
5559	NC_015214	A	6	6	307399	307404	100 %	0 %	0 %	0 %	325956007
5560	NC_015214	TTA	2	6	307426	307431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956007
5561	NC_015214	AAG	2	6	307432	307437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956007
5562	NC_015214	GCAGAT	2	12	307450	307461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325956007
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5564	NC_015214	CGT	2	6	307489	307494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956007
5565	NC_015214	CCTT	2	8	307507	307514	0 %	50 %	0 %	50 %	325956007
5566	NC_015214	TGGT	2	8	307580	307587	0 %	50 %	50 %	0 %	325956007
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5569	NC_015214	CACAA	2	10	307653	307662	60 %	0 %	0 %	40 %	325956007
5570	NC_015214	GCT	2	6	307826	307831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956008
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5572	NC_015214	GGT	2	6	308289	308294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956009
5573	NC_015214	TTG	2	6	308359	308364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956009
5574	NC_015214	TAG	2	6	308395	308400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956009
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5577	NC_015214	ACT	2	6	308622	308627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956009
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5580	NC_015214	CGT	2	6	308759	308764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956010
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5585	NC_015214	TGG	2	6	309049	309054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956010
5586	NC_015214	TGA	2	6	309058	309063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956010
5587	NC_015214	TGA	2	6	309191	309196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956011
5588	NC_015214	AGAAAA	2	12	309203	309214	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325956011
5589	NC_015214	AGA	2	6	309224	309229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956011
5590	NC_015214	CAA	2	6	309249	309254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956011
5591	NC_015214	CGCT	2	8	309278	309285	0 %	25 %	25 %	50 %	325956011
5592	NC_015214	AAAC	2	8	309382	309389	75 %	0 %	0 %	25 %	325956012
5593	NC_015214	GAAA	2	8	309390	309397	75 %	0 %	25 %	0 %	325956012
5594	NC_015214	GTT	2	6	309459	309464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956012
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5597	NC_015214	TAC	2	6	309519	309524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956012
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5601	NC_015214	GTA	2	6	309787	309792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956013
5602	NC_015214	AAGC	2	8	309802	309809	50 %	0 %	25 %	25 %	325956013
5603	NC_015214	A	6	6	309829	309834	100 %	0 %	0 %	0 %	325956013
5604	NC_015214	CGT	2	6	309880	309885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956013
5605	NC_015214	CGA	2	6	309909	309914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956013
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5608	NC_015214	AAG	2	6	310116	310121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956014
5609	NC_015214	TTCT	2	8	310128	310135	0 %	75 %	0 %	25 %	325956014
5610	NC_015214	AAG	2	6	310145	310150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956014
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5613	NC_015214	TGG	2	6	310219	310224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956014
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5621	NC_015214	GTG	2	6	310655	310660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956015
5622	NC_015214	ACT	2	6	310783	310788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956015
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5625	NC_015214	TCG	2	6	310893	310898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956016
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5722	NC_015214	CTA	2	6	315729	315734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956025
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5735	NC_015214	CA	3	6	316456	316461	50 %	0 %	0 %	50 %	325956028
5736	NC_015214	TAA	2	6	316475	316480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956028
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5739	NC_015214	CGT	3	9	316770	316778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956028
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5742	NC_015214	TGT	2	6	316895	316900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956029
5743	NC_015214	TAC	2	6	316925	316930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956029
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