MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 36973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_014724	CAT	2	6	1400803	1400808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038613
25003	NC_014724	CTT	2	6	1400861	1400866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25004	NC_014724	TAT	2	6	1400893	1400898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038613
25005	NC_014724	CTT	2	6	1400915	1400920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25006	NC_014724	CTT	2	6	1400999	1401004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25007	NC_014724	TCT	2	6	1401021	1401026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25008	NC_014724	GAC	2	6	1401145	1401150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038613
25009	NC_014724	CTT	3	9	1401220	1401228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25010	NC_014724	TGC	2	6	1401231	1401236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038613
25011	NC_014724	GCT	2	6	1401255	1401260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038613
25012	NC_014724	GTC	2	6	1401274	1401279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038613
25013	NC_014724	AAT	2	6	1401326	1401331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038613
25014	NC_014724	TTG	2	6	1401395	1401400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038613
25015	NC_014724	TTG	2	6	1401402	1401407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038613
25016	NC_014724	TTC	2	6	1401439	1401444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038613
25017	NC_014724	TAT	2	6	1401490	1401495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038613
25018	NC_014724	TTG	2	6	1401794	1401799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038614
25019	NC_014724	GCC	2	6	1401804	1401809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315038614
25020	NC_014724	TTA	2	6	1401813	1401818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038614
25021	NC_014724	CGC	2	6	1401826	1401831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315038614
25022	NC_014724	TCA	2	6	1401843	1401848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038614
25023	NC_014724	TGA	2	6	1401895	1401900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038614
25024	NC_014724	CAA	2	6	1401935	1401940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038614
25025	NC_014724	GTCT	2	8	1401950	1401957	0 %	50 %	25 %	25 %	315038614
25026	NC_014724	ATC	2	6	1401971	1401976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038614
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25028	NC_014724	CTG	2	6	1402030	1402035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038614
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25033	NC_014724	CTT	2	6	1402369	1402374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038614
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25041	NC_014724	CCTT	2	8	1402979	1402986	0 %	50 %	0 %	50 %	315038615
25042	NC_014724	TTG	2	6	1402993	1402998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038615
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25050	NC_014724	CTT	2	6	1403335	1403340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038615
25051	NC_014724	TACC	2	8	1403352	1403359	25 %	25 %	0 %	50 %	315038615
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25053	NC_014724	GTA	3	9	1403548	1403556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038615
25054	NC_014724	CTT	2	6	1403629	1403634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038615
25055	NC_014724	AGT	2	6	1403682	1403687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038615
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25099	NC_014724	ATT	2	6	1406525	1406530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038617
25100	NC_014724	TAG	2	6	1406615	1406620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038617
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25113	NC_014724	ACCAA	2	10	1407091	1407100	60 %	0 %	0 %	40 %	315038617
25114	NC_014724	ATG	2	6	1407157	1407162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038617
25115	NC_014724	ACC	2	6	1407183	1407188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038617
25116	NC_014724	ATC	2	6	1407189	1407194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038617
25117	NC_014724	AAG	2	6	1407201	1407206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038617
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25223	NC_014724	T	6	6	1411873	1411878	0 %	100 %	0 %	0 %	315038623
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25229	NC_014724	CAT	2	6	1412273	1412278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25230	NC_014724	CAC	2	6	1412341	1412346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038623
25231	NC_014724	T	6	6	1412372	1412377	0 %	100 %	0 %	0 %	315038623
25232	NC_014724	TTC	2	6	1412450	1412455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25233	NC_014724	GCT	2	6	1412567	1412572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25234	NC_014724	GAT	2	6	1412614	1412619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038623
25235	NC_014724	TCA	2	6	1412760	1412765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25236	NC_014724	ATG	2	6	1412766	1412771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038623
25237	NC_014724	GAC	2	6	1412828	1412833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25238	NC_014724	TCCG	2	8	1412843	1412850	0 %	25 %	25 %	50 %	315038623
25239	NC_014724	GTAA	2	8	1412898	1412905	50 %	25 %	25 %	0 %	315038623
25240	NC_014724	GCA	2	6	1412929	1412934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25241	NC_014724	TCA	2	6	1412937	1412942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25242	NC_014724	TGC	2	6	1412955	1412960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25243	NC_014724	TCT	2	6	1413077	1413082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25244	NC_014724	AAC	2	6	1413122	1413127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038623
25245	NC_014724	ATC	2	6	1413137	1413142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25246	NC_014724	CTG	2	6	1413212	1413217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25247	NC_014724	CAT	2	6	1413223	1413228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25248	NC_014724	GCAA	2	8	1413234	1413241	50 %	0 %	25 %	25 %	315038623
25249	NC_014724	GAA	2	6	1413263	1413268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038623
25250	NC_014724	CTT	2	6	1413285	1413290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25251	NC_014724	CAT	2	6	1413304	1413309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038623
25252	NC_014724	T	6	6	1413331	1413336	0 %	100 %	0 %	0 %	315038623
25253	NC_014724	AAT	2	6	1413338	1413343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038623
25254	NC_014724	ATTA	2	8	1413431	1413438	50 %	50 %	0 %	0 %	315038623
25255	NC_014724	CTT	2	6	1413449	1413454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25256	NC_014724	AGC	2	6	1413512	1413517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038623
25257	NC_014724	CTT	2	6	1413577	1413582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25258	NC_014724	A	7	7	1413620	1413626	100 %	0 %	0 %	0 %	315038623
25259	NC_014724	CTT	2	6	1413677	1413682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
25260	NC_014724	CCAT	2	8	1413744	1413751	25 %	25 %	0 %	50 %	315038623
25261	NC_014724	AAT	2	6	1413894	1413899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038623
25262	NC_014724	CAT	2	6	1413956	1413961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
25263	NC_014724	ATC	2	6	1413978	1413983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
25264	NC_014724	TTC	2	6	1413990	1413995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25265	NC_014724	CTT	2	6	1414010	1414015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25266	NC_014724	CTT	3	9	1414019	1414027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25267	NC_014724	ATG	2	6	1414048	1414053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038624
25268	NC_014724	TCA	2	6	1414072	1414077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
25269	NC_014724	GTA	2	6	1414099	1414104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038624
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25271	NC_014724	CGT	2	6	1414181	1414186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038624
25272	NC_014724	TCT	2	6	1414243	1414248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25273	NC_014724	ATC	2	6	1414266	1414271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
25274	NC_014724	CTTG	2	8	1414326	1414333	0 %	50 %	25 %	25 %	315038624
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25283	NC_014724	TTC	2	6	1414584	1414589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25284	NC_014724	TGT	2	6	1414625	1414630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038624
25285	NC_014724	GATCTT	2	12	1414632	1414643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315038624
25286	NC_014724	GTGAAC	2	12	1414698	1414709	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315038624
25287	NC_014724	TTC	2	6	1414776	1414781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25288	NC_014724	TCT	2	6	1414793	1414798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25289	NC_014724	CAGTA	2	10	1414835	1414844	40 %	20 %	20 %	20 %	315038624
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25292	NC_014724	AAG	2	6	1414965	1414970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038624
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25297	NC_014724	CAT	2	6	1415117	1415122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
25298	NC_014724	CTT	2	6	1415147	1415152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
25299	NC_014724	AGC	2	6	1415154	1415159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038624
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25303	NC_014724	TGC	2	6	1415387	1415392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038624
25304	NC_014724	CTAT	2	8	1415554	1415561	25 %	50 %	0 %	25 %	315038624
25305	NC_014724	CTTA	2	8	1415700	1415707	25 %	50 %	0 %	25 %	315038625
25306	NC_014724	CAA	2	6	1415732	1415737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038625
25307	NC_014724	TCT	2	6	1415767	1415772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038625
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25310	NC_014724	ACA	2	6	1415893	1415898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038625
25311	NC_014724	ATCA	2	8	1415922	1415929	50 %	25 %	0 %	25 %	315038625
25312	NC_014724	AAG	2	6	1416152	1416157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038626
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25316	NC_014724	TGT	2	6	1416423	1416428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038627
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25320	NC_014724	ATA	2	6	1416716	1416721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038627
25321	NC_014724	TGA	2	6	1416864	1416869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038628
25322	NC_014724	A	6	6	1416869	1416874	100 %	0 %	0 %	0 %	315038628
25323	NC_014724	AAT	2	6	1416893	1416898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038628
25324	NC_014724	AG	3	6	1416945	1416950	50 %	0 %	50 %	0 %	315038628
25325	NC_014724	TTC	2	6	1416975	1416980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038628
25326	NC_014724	TC	3	6	1416984	1416989	0 %	50 %	0 %	50 %	315038628
25327	NC_014724	TGTTT	2	10	1417025	1417034	0 %	80 %	20 %	0 %	315038628
25328	NC_014724	AAG	2	6	1417080	1417085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038628
25329	NC_014724	GCA	2	6	1417178	1417183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038628
25330	NC_014724	TTC	2	6	1417317	1417322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038628
25331	NC_014724	CAC	2	6	1417334	1417339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038628
25332	NC_014724	GCT	2	6	1417385	1417390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038628
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25334	NC_014724	ATT	2	6	1417447	1417452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038628
25335	NC_014724	TA	3	6	1417501	1417506	50 %	50 %	0 %	0 %	315038629
25336	NC_014724	CAA	2	6	1417606	1417611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038629
25337	NC_014724	CAG	2	6	1417636	1417641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038629
25338	NC_014724	ACA	2	6	1417725	1417730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038629
25339	NC_014724	AAG	2	6	1417759	1417764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038629
25340	NC_014724	CAT	2	6	1417771	1417776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038629
25341	NC_014724	AAT	2	6	1417798	1417803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038629
25342	NC_014724	TCT	2	6	1417810	1417815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038629
25343	NC_014724	ATCAG	2	10	1417842	1417851	40 %	20 %	20 %	20 %	315038629
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25345	NC_014724	AAAG	2	8	1417965	1417972	75 %	0 %	25 %	0 %	315038629
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25353	NC_014724	TAG	2	6	1418397	1418402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038630
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25462	NC_014724	CTT	2	6	1424099	1424104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038635
25463	NC_014724	T	6	6	1424159	1424164	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
25464	NC_014724	TAA	2	6	1424184	1424189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038635
25465	NC_014724	T	6	6	1424196	1424201	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
25466	NC_014724	AAT	2	6	1424234	1424239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038635
25467	NC_014724	T	6	6	1424309	1424314	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
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25490	NC_014724	TCA	2	6	1425654	1425659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
25491	NC_014724	TCA	2	6	1425684	1425689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
25492	NC_014724	AGCC	2	8	1425741	1425748	25 %	0 %	25 %	50 %	315038635
25493	NC_014724	T	6	6	1425749	1425754	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
25494	NC_014724	GCT	2	6	1425856	1425861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038635
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25500	NC_014724	T	6	6	1425996	1426001	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635

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