MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 36973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014724	AAC	2	6	1055208	1055213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038248
19002	NC_014724	TGA	2	6	1055240	1055245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038248
19003	NC_014724	ATTAAA	2	12	1055277	1055288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038248
19004	NC_014724	T	6	6	1055475	1055480	0 %	100 %	0 %	0 %	315038249
19005	NC_014724	TAC	2	6	1055493	1055498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038249
19006	NC_014724	TGCT	2	8	1055627	1055634	0 %	50 %	25 %	25 %	315038249
19007	NC_014724	ATG	2	6	1055656	1055661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038249
19008	NC_014724	TGG	2	6	1055697	1055702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038249
19009	NC_014724	GCTG	2	8	1055761	1055768	0 %	25 %	50 %	25 %	315038249
19010	NC_014724	TGT	2	6	1055811	1055816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038249
19011	NC_014724	TTGG	2	8	1055822	1055829	0 %	50 %	50 %	0 %	315038249
19012	NC_014724	AAGAT	2	10	1055855	1055864	60 %	20 %	20 %	0 %	315038249
19013	NC_014724	CTG	2	6	1055891	1055896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038249
19014	NC_014724	TTATCT	2	12	1055906	1055917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315038249
19015	NC_014724	TGG	3	9	1055964	1055972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038249
19016	NC_014724	TCA	3	9	1055981	1055989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038249
19017	NC_014724	CAT	3	9	1056000	1056008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038249
19018	NC_014724	GGT	2	6	1056031	1056036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038249
19019	NC_014724	TTC	2	6	1056094	1056099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038249
19020	NC_014724	GATG	2	8	1056126	1056133	25 %	25 %	50 %	0 %	315038249
19021	NC_014724	TGAAA	2	10	1056162	1056171	60 %	20 %	20 %	0 %	315038249
19022	NC_014724	TCT	2	6	1056260	1056265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038249
19023	NC_014724	CAC	2	6	1056274	1056279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038249
19024	NC_014724	CTA	2	6	1056309	1056314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038249
19025	NC_014724	TTC	2	6	1056355	1056360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038249
19026	NC_014724	GAA	2	6	1056456	1056461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038249
19027	NC_014724	AAG	2	6	1056484	1056489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038249
19028	NC_014724	AAC	2	6	1056525	1056530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038249
19029	NC_014724	TAT	2	6	1056615	1056620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038249
19030	NC_014724	CAC	2	6	1056630	1056635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038249
19031	NC_014724	TTCA	2	8	1056636	1056643	25 %	50 %	0 %	25 %	315038249
19032	NC_014724	AAG	2	6	1056679	1056684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038249
19033	NC_014724	TGG	2	6	1056739	1056744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038249
19034	NC_014724	TAT	2	6	1056817	1056822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038249
19035	NC_014724	TTA	2	6	1056859	1056864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038249
19036	NC_014724	TAG	2	6	1056922	1056927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038249
19037	NC_014724	GATA	2	8	1056994	1057001	50 %	25 %	25 %	0 %	315038250
19038	NC_014724	TGT	2	6	1057041	1057046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038250
19039	NC_014724	AATACT	2	12	1057079	1057090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315038250
19040	NC_014724	A	7	7	1057099	1057105	100 %	0 %	0 %	0 %	315038250
19041	NC_014724	CAT	2	6	1057269	1057274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038251
19042	NC_014724	GAT	2	6	1057330	1057335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038251
19043	NC_014724	TAG	2	6	1057470	1057475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038251
19044	NC_014724	TGA	2	6	1057553	1057558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038251
19045	NC_014724	ATC	2	6	1057616	1057621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038251
19046	NC_014724	TGA	2	6	1057706	1057711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038252
19047	NC_014724	GTT	2	6	1057724	1057729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038252
19048	NC_014724	GT	3	6	1057738	1057743	0 %	50 %	50 %	0 %	315038252
19049	NC_014724	ATG	2	6	1057785	1057790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038252
19050	NC_014724	TGA	2	6	1057843	1057848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038252
19051	NC_014724	GTT	2	6	1057911	1057916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038252
19052	NC_014724	GGTT	2	8	1057947	1057954	0 %	50 %	50 %	0 %	315038252
19053	NC_014724	ATC	2	6	1057969	1057974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038252
19054	NC_014724	AG	3	6	1058126	1058131	50 %	0 %	50 %	0 %	315038252
19055	NC_014724	TGC	2	6	1058263	1058268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038253
19056	NC_014724	AATC	2	8	1058303	1058310	50 %	25 %	0 %	25 %	315038253
19057	NC_014724	CAG	2	6	1058336	1058341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038253
19058	NC_014724	TTG	2	6	1058350	1058355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038253
19059	NC_014724	AGA	2	6	1058379	1058384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038253
19060	NC_014724	TTG	2	6	1058655	1058660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038253
19061	NC_014724	CTT	3	9	1058714	1058722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038253
19062	NC_014724	TG	3	6	1058723	1058728	0 %	50 %	50 %	0 %	315038253
19063	NC_014724	TGT	2	6	1058791	1058796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038253
19064	NC_014724	GAA	2	6	1058865	1058870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038253
19065	NC_014724	TGT	2	6	1058897	1058902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038253
19066	NC_014724	T	6	6	1058973	1058978	0 %	100 %	0 %	0 %	315038253
19067	NC_014724	TGC	2	6	1058988	1058993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038253
19068	NC_014724	T	7	7	1059051	1059057	0 %	100 %	0 %	0 %	315038253
19069	NC_014724	TTG	2	6	1059064	1059069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038253
19070	NC_014724	ATA	2	6	1059115	1059120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038253
19071	NC_014724	TTGA	2	8	1059249	1059256	25 %	50 %	25 %	0 %	315038253
19072	NC_014724	AAT	2	6	1059257	1059262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038253
19073	NC_014724	CAATTA	2	12	1059266	1059277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315038253
19074	NC_014724	A	6	6	1059350	1059355	100 %	0 %	0 %	0 %	315038254
19075	NC_014724	AAT	2	6	1059472	1059477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038254
19076	NC_014724	TAAA	2	8	1059482	1059489	75 %	25 %	0 %	0 %	315038254
19077	NC_014724	TCA	2	6	1059505	1059510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038254
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19082	NC_014724	ATT	2	6	1059800	1059805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038254
19083	NC_014724	A	6	6	1059915	1059920	100 %	0 %	0 %	0 %	315038254
19084	NC_014724	ATT	2	6	1059958	1059963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038254
19085	NC_014724	AAG	2	6	1060126	1060131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038254
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19087	NC_014724	ATG	2	6	1060181	1060186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038254
19088	NC_014724	GAA	2	6	1060206	1060211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038254
19089	NC_014724	CAT	2	6	1060336	1060341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038255
19090	NC_014724	ATGT	2	8	1060416	1060423	25 %	50 %	25 %	0 %	315038255
19091	NC_014724	T	7	7	1060423	1060429	0 %	100 %	0 %	0 %	315038255
19092	NC_014724	TGT	2	6	1060444	1060449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038255
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19094	NC_014724	AAAC	2	8	1060505	1060512	75 %	0 %	0 %	25 %	315038255
19095	NC_014724	GTA	2	6	1060520	1060525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038255
19096	NC_014724	GGA	2	6	1060541	1060546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315038255
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19098	NC_014724	TGA	2	6	1060629	1060634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038256
19099	NC_014724	AAAG	2	8	1060719	1060726	75 %	0 %	25 %	0 %	315038256
19100	NC_014724	CAT	2	6	1060739	1060744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038256
19101	NC_014724	ATG	3	9	1060790	1060798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038256
19102	NC_014724	AAG	2	6	1060813	1060818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038256
19103	NC_014724	TCA	2	6	1060830	1060835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038256
19104	NC_014724	AGG	2	6	1060902	1060907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315038257
19105	NC_014724	CTG	2	6	1060933	1060938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038257
19106	NC_014724	ATG	2	6	1060954	1060959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038257
19107	NC_014724	ATT	2	6	1060969	1060974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038257
19108	NC_014724	TGA	2	6	1061045	1061050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038257
19109	NC_014724	TGG	2	6	1061069	1061074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038257
19110	NC_014724	A	7	7	1061109	1061115	100 %	0 %	0 %	0 %	315038257
19111	NC_014724	TAT	2	6	1061154	1061159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038257
19112	NC_014724	ATG	2	6	1061164	1061169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038257
19113	NC_014724	A	6	6	1061179	1061184	100 %	0 %	0 %	0 %	315038257
19114	NC_014724	TTAA	2	8	1061199	1061206	50 %	50 %	0 %	0 %	315038257
19115	NC_014724	AGC	2	6	1061242	1061247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038257
19116	NC_014724	GAC	2	6	1061250	1061255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038257
19117	NC_014724	AGATA	2	10	1061288	1061297	60 %	20 %	20 %	0 %	315038257
19118	NC_014724	TGT	2	6	1061339	1061344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038257
19119	NC_014724	AAT	2	6	1061439	1061444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038257
19120	NC_014724	AGC	2	6	1061473	1061478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038257
19121	NC_014724	AGC	2	6	1061482	1061487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038257
19122	NC_014724	TTG	2	6	1061559	1061564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038257
19123	NC_014724	CGG	2	6	1061573	1061578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315038257
19124	NC_014724	GCTT	2	8	1061596	1061603	0 %	50 %	25 %	25 %	315038257
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19127	NC_014724	TTA	2	6	1061701	1061706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038258
19128	NC_014724	TGA	2	6	1061748	1061753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038258
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19130	NC_014724	TTGC	2	8	1062010	1062017	0 %	50 %	25 %	25 %	315038258
19131	NC_014724	AAGCA	2	10	1062028	1062037	60 %	0 %	20 %	20 %	315038258
19132	NC_014724	CGTCT	2	10	1062151	1062160	0 %	40 %	20 %	40 %	315038258
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19136	NC_014724	AAGC	2	8	1062322	1062329	50 %	0 %	25 %	25 %	315038258
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19147	NC_014724	ATG	2	6	1062795	1062800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038259
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19152	NC_014724	TGC	2	6	1063198	1063203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038259
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19193	NC_014724	CTG	2	6	1065651	1065656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038262
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19203	NC_014724	GAT	2	6	1066252	1066257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038263
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19212	NC_014724	ACT	2	6	1066692	1066697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038264
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19220	NC_014724	AAG	2	6	1067398	1067403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038264
19221	NC_014724	TACT	2	8	1067441	1067448	25 %	50 %	0 %	25 %	315038264
19222	NC_014724	TAT	2	6	1067505	1067510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038264
19223	NC_014724	AT	3	6	1067534	1067539	50 %	50 %	0 %	0 %	315038264
19224	NC_014724	CTT	2	6	1067621	1067626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038264
19225	NC_014724	AGC	2	6	1067640	1067645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038264
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19227	NC_014724	AAG	2	6	1067688	1067693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038264
19228	NC_014724	CTT	2	6	1068016	1068021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038265
19229	NC_014724	TGG	2	6	1068024	1068029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038265
19230	NC_014724	TA	3	6	1068099	1068104	50 %	50 %	0 %	0 %	315038265
19231	NC_014724	GAT	2	6	1068142	1068147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038265
19232	NC_014724	CT	3	6	1068152	1068157	0 %	50 %	0 %	50 %	315038265
19233	NC_014724	TGA	2	6	1068177	1068182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038265
19234	NC_014724	GGA	2	6	1068244	1068249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315038265
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19238	NC_014724	AATA	2	8	1068352	1068359	75 %	25 %	0 %	0 %	315038265
19239	NC_014724	TGA	2	6	1068378	1068383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038265
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19245	NC_014724	ATC	2	6	1068461	1068466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038265
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19467	NC_014724	TTA	2	6	1079121	1079126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038273
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