MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014554	ATG	2	6	3066216	3066221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182035
48502	NC_014554	GTTGC	2	10	3066225	3066234	0 %	40 %	40 %	20 %	308182035
48503	NC_014554	AAT	2	6	3066239	3066244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182035
48504	NC_014554	ATC	3	9	3066309	3066317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182035
48505	NC_014554	ATT	2	6	3066423	3066428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182035
48506	NC_014554	ACG	2	6	3066468	3066473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182035
48507	NC_014554	ATA	2	6	3066498	3066503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182035
48508	NC_014554	ATC	2	6	3066507	3066512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182035
48509	NC_014554	CGT	2	6	3066564	3066569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182035
48510	NC_014554	T	6	6	3066586	3066591	0 %	100 %	0 %	0 %	308182035
48511	NC_014554	CTG	2	6	3066608	3066613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182035
48512	NC_014554	CG	3	6	3066674	3066679	0 %	0 %	50 %	50 %	308182035
48513	NC_014554	CGC	2	6	3066729	3066734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182035
48514	NC_014554	CAAT	2	8	3067084	3067091	50 %	25 %	0 %	25 %	308182036
48515	NC_014554	GTT	2	6	3067097	3067102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182036
48516	NC_014554	GCA	2	6	3067162	3067167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182036
48517	NC_014554	TTA	2	6	3067171	3067176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182036
48518	NC_014554	ACC	2	6	3067177	3067182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182036
48519	NC_014554	GGCT	2	8	3067221	3067228	0 %	25 %	50 %	25 %	308182036
48520	NC_014554	AAGCCA	2	12	3067241	3067252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308182036
48521	NC_014554	GTT	2	6	3067274	3067279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182036
48522	NC_014554	CTGGA	2	10	3067326	3067335	20 %	20 %	40 %	20 %	308182036
48523	NC_014554	CCG	2	6	3067436	3067441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182036
48524	NC_014554	TGGT	2	8	3067509	3067516	0 %	50 %	50 %	0 %	308182036
48525	NC_014554	AAT	2	6	3067518	3067523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182036
48526	NC_014554	AGC	2	6	3067560	3067565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182036
48527	NC_014554	TACA	2	8	3067596	3067603	50 %	25 %	0 %	25 %	308182036
48528	NC_014554	TCC	2	6	3067648	3067653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308182036
48529	NC_014554	TCAGGA	2	12	3067663	3067674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308182036
48530	NC_014554	A	6	6	3067685	3067690	100 %	0 %	0 %	0 %	308182036
48531	NC_014554	AGT	2	6	3067697	3067702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182036
48532	NC_014554	AAT	2	6	3067740	3067745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182036
48533	NC_014554	CACAT	2	10	3067783	3067792	40 %	20 %	0 %	40 %	308182036
48534	NC_014554	ATA	2	6	3067849	3067854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182036
48535	NC_014554	GTA	2	6	3067911	3067916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182036
48536	NC_014554	TGA	2	6	3067939	3067944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182036
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48538	NC_014554	GCTT	2	8	3068073	3068080	0 %	50 %	25 %	25 %	308182036
48539	NC_014554	TTA	2	6	3068268	3068273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182037
48540	NC_014554	CGC	2	6	3068335	3068340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182037
48541	NC_014554	CGT	2	6	3068350	3068355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182037
48542	NC_014554	TGA	2	6	3068386	3068391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182037
48543	NC_014554	CG	3	6	3068594	3068599	0 %	0 %	50 %	50 %	308182037
48544	NC_014554	CGA	2	6	3068617	3068622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182037
48545	NC_014554	AAC	2	6	3068640	3068645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182037
48546	NC_014554	AGT	2	6	3068701	3068706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182038
48547	NC_014554	TCT	2	6	3068720	3068725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182038
48548	NC_014554	TCA	2	6	3068791	3068796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182038
48549	NC_014554	GAT	2	6	3068801	3068806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182038
48550	NC_014554	TCA	2	6	3068812	3068817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182038
48551	NC_014554	CGTAC	2	10	3068917	3068926	20 %	20 %	20 %	40 %	308182038
48552	NC_014554	CAA	2	6	3068948	3068953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182038
48553	NC_014554	TCA	2	6	3068954	3068959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182038
48554	NC_014554	GAC	2	6	3069057	3069062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182038
48555	NC_014554	ATC	2	6	3069123	3069128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182038
48556	NC_014554	AAT	2	6	3069187	3069192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182038
48557	NC_014554	ACA	2	6	3069206	3069211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182038
48558	NC_014554	TGCC	2	8	3069285	3069292	0 %	25 %	25 %	50 %	308182038
48559	NC_014554	CGA	2	6	3069333	3069338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182038
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48564	NC_014554	GTT	2	6	3069506	3069511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182038
48565	NC_014554	ATG	2	6	3069514	3069519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182038
48566	NC_014554	TCA	2	6	3069628	3069633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182038
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48568	NC_014554	AAG	2	6	3069709	3069714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182038
48569	NC_014554	TCT	2	6	3069724	3069729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182038
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48584	NC_014554	TCG	2	6	3070565	3070570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182038
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48587	NC_014554	CCA	2	6	3070660	3070665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182038
48588	NC_014554	T	6	6	3070707	3070712	0 %	100 %	0 %	0 %	308182038
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48599	NC_014554	CTG	2	6	3071449	3071454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182039
48600	NC_014554	TAA	2	6	3071578	3071583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182039
48601	NC_014554	CCA	2	6	3071627	3071632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182039
48602	NC_014554	ATTG	2	8	3071769	3071776	25 %	50 %	25 %	0 %	308182039
48603	NC_014554	CCAT	2	8	3071819	3071826	25 %	25 %	0 %	50 %	308182039
48604	NC_014554	AAT	2	6	3071876	3071881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182039
48605	NC_014554	CAT	2	6	3071902	3071907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182039
48606	NC_014554	T	7	7	3071927	3071933	0 %	100 %	0 %	0 %	308182039
48607	NC_014554	ATC	2	6	3071942	3071947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182039
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48610	NC_014554	CCG	2	6	3072285	3072290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182040
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48613	NC_014554	CAA	2	6	3072351	3072356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182040
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48615	NC_014554	CA	3	6	3072432	3072437	50 %	0 %	0 %	50 %	308182040
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48833	NC_014554	ACT	2	6	3085816	3085821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182052
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48842	NC_014554	GCGT	2	8	3086272	3086279	0 %	25 %	50 %	25 %	308182052
48843	NC_014554	GCG	2	6	3086284	3086289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182052
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48959	NC_014554	CAT	2	6	3092742	3092747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182056
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48962	NC_014554	TAA	2	6	3092925	3092930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182056
48963	NC_014554	TAA	2	6	3092933	3092938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182056
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48993	NC_014554	T	6	6	3094376	3094381	0 %	100 %	0 %	0 %	308182057
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