MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_014554	GC	3	6	2900687	2900692	0 %	0 %	50 %	50 %	308181883
46003	NC_014554	CCA	2	6	2900729	2900734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181883
46004	NC_014554	AAT	2	6	2900735	2900740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181883
46005	NC_014554	AAAT	2	8	2901116	2901123	75 %	25 %	0 %	0 %	308181884
46006	NC_014554	CCA	2	6	2901147	2901152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181884
46007	NC_014554	TA	3	6	2901201	2901206	50 %	50 %	0 %	0 %	308181884
46008	NC_014554	AACGC	2	10	2901224	2901233	40 %	0 %	20 %	40 %	308181884
46009	NC_014554	TAA	2	6	2901244	2901249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181884
46010	NC_014554	ACC	2	6	2901289	2901294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181884
46011	NC_014554	TAA	2	6	2901406	2901411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181884
46012	NC_014554	CAAC	2	8	2901424	2901431	50 %	0 %	0 %	50 %	308181884
46013	NC_014554	GC	3	6	2901521	2901526	0 %	0 %	50 %	50 %	308181884
46014	NC_014554	TA	3	6	2901561	2901566	50 %	50 %	0 %	0 %	308181884
46015	NC_014554	ACAA	2	8	2901569	2901576	75 %	0 %	0 %	25 %	308181884
46016	NC_014554	AAC	2	6	2901579	2901584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181884
46017	NC_014554	AT	3	6	2901586	2901591	50 %	50 %	0 %	0 %	308181884
46018	NC_014554	CGC	2	6	2901598	2901603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181884
46019	NC_014554	A	7	7	2901644	2901650	100 %	0 %	0 %	0 %	308181884
46020	NC_014554	AATCCC	2	12	2901673	2901684	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308181884
46021	NC_014554	CTT	2	6	2902032	2902037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181885
46022	NC_014554	CTG	2	6	2902054	2902059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181885
46023	NC_014554	TGA	2	6	2902157	2902162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181885
46024	NC_014554	ACTCA	2	10	2902291	2902300	40 %	20 %	0 %	40 %	308181885
46025	NC_014554	CGG	2	6	2902306	2902311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181885
46026	NC_014554	CATTT	2	10	2902351	2902360	20 %	60 %	0 %	20 %	308181885
46027	NC_014554	CAT	2	6	2902363	2902368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181885
46028	NC_014554	CA	3	6	2902508	2902513	50 %	0 %	0 %	50 %	308181886
46029	NC_014554	ACA	3	9	2902524	2902532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181886
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46036	NC_014554	GCC	2	6	2902960	2902965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181886
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46043	NC_014554	TAC	2	6	2903220	2903225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181886
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46093	NC_014554	ACTG	2	8	2907528	2907535	25 %	25 %	25 %	25 %	308181892
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46101	NC_014554	TCG	2	6	2907937	2907942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181893
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46116	NC_014554	GCC	2	6	2908721	2908726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181893
46117	NC_014554	CATTG	2	10	2908900	2908909	20 %	40 %	20 %	20 %	308181893
46118	NC_014554	GTT	2	6	2908912	2908917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181893
46119	NC_014554	CAT	2	6	2908924	2908929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181893
46120	NC_014554	GCT	2	6	2908940	2908945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181893
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46122	NC_014554	ATG	2	6	2909073	2909078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181893
46123	NC_014554	TAA	2	6	2909084	2909089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181893
46124	NC_014554	TGA	2	6	2909100	2909105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181893
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46128	NC_014554	TGC	2	6	2909465	2909470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181894
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46143	NC_014554	AATC	2	8	2909965	2909972	50 %	25 %	0 %	25 %	308181895
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46219	NC_014554	ATC	2	6	2914574	2914579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181901
46220	NC_014554	T	6	6	2914627	2914632	0 %	100 %	0 %	0 %	308181901
46221	NC_014554	TCAAC	2	10	2915079	2915088	40 %	20 %	0 %	40 %	308181902
46222	NC_014554	TGA	2	6	2915177	2915182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181902
46223	NC_014554	TAA	2	6	2915196	2915201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181902
46224	NC_014554	CCG	2	6	2915208	2915213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181902
46225	NC_014554	CTA	2	6	2920700	2920705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181903
46226	NC_014554	GC	3	6	2920724	2920729	0 %	0 %	50 %	50 %	308181903
46227	NC_014554	AT	3	6	2920840	2920845	50 %	50 %	0 %	0 %	308181903
46228	NC_014554	CAA	2	6	2920883	2920888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181903
46229	NC_014554	CGT	2	6	2920973	2920978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181903
46230	NC_014554	TTGG	2	8	2920984	2920991	0 %	50 %	50 %	0 %	308181903
46231	NC_014554	TGGT	2	8	2921039	2921046	0 %	50 %	50 %	0 %	308181903
46232	NC_014554	GAT	2	6	2921072	2921077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181903
46233	NC_014554	TCA	2	6	2921079	2921084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181903
46234	NC_014554	CAT	2	6	2921330	2921335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181904
46235	NC_014554	A	6	6	2921344	2921349	100 %	0 %	0 %	0 %	308181904
46236	NC_014554	GTC	2	6	2921496	2921501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181904
46237	NC_014554	CGT	2	6	2921507	2921512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181904
46238	NC_014554	CAT	2	6	2921611	2921616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181904
46239	NC_014554	AATA	2	8	2921620	2921627	75 %	25 %	0 %	0 %	308181904
46240	NC_014554	CAA	2	6	2921680	2921685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181904
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46243	NC_014554	AATAA	2	10	2921870	2921879	80 %	20 %	0 %	0 %	308181904
46244	NC_014554	CAT	2	6	2921931	2921936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181904
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46261	NC_014554	TGG	2	6	2923083	2923088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181905
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46339	NC_014554	TCA	2	6	2929601	2929606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181911
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46343	NC_014554	ATGG	2	8	2929908	2929915	25 %	25 %	50 %	0 %	308181911
46344	NC_014554	TGC	2	6	2929952	2929957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181911
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46347	NC_014554	CTGA	2	8	2930304	2930311	25 %	25 %	25 %	25 %	308181912
46348	NC_014554	AAAT	2	8	2930379	2930386	75 %	25 %	0 %	0 %	308181912
46349	NC_014554	CAT	2	6	2930431	2930436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181912
46350	NC_014554	GTC	2	6	2930453	2930458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181912
46351	NC_014554	CATCGC	2	12	2930563	2930574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308181912
46352	NC_014554	CGCTC	2	10	2930619	2930628	0 %	20 %	20 %	60 %	308181912
46353	NC_014554	GCC	2	6	2930642	2930647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181912
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46355	NC_014554	GCCG	2	8	2930711	2930718	0 %	0 %	50 %	50 %	308181912
46356	NC_014554	TCC	2	6	2930758	2930763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181912
46357	NC_014554	ATC	2	6	2930771	2930776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181912
46358	NC_014554	GCT	2	6	2931876	2931881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181913
46359	NC_014554	ACCG	2	8	2932016	2932023	25 %	0 %	25 %	50 %	308181913
46360	NC_014554	GTT	2	6	2932087	2932092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181913
46361	NC_014554	CGT	2	6	2932151	2932156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181913
46362	NC_014554	ATC	2	6	2932200	2932205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181913
46363	NC_014554	CTG	2	6	2932228	2932233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181913
46364	NC_014554	ACC	2	6	2932313	2932318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181913
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46366	NC_014554	ACC	2	6	2932444	2932449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181913
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46370	NC_014554	CAA	2	6	2932588	2932593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181913
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46377	NC_014554	AAT	2	6	2932823	2932828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181913
46378	NC_014554	AATC	2	8	2932837	2932844	50 %	25 %	0 %	25 %	308181913
46379	NC_014554	CTTACC	2	12	2932862	2932873	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	308181913
46380	NC_014554	GTA	2	6	2932882	2932887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181913
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46382	NC_014554	TGGC	2	8	2932957	2932964	0 %	25 %	50 %	25 %	308181913
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46417	NC_014554	CCTT	2	8	2935692	2935699	0 %	50 %	0 %	50 %	308181914
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46448	NC_014554	TCG	2	6	2938098	2938103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181916
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46454	NC_014554	CA	3	6	2938296	2938301	50 %	0 %	0 %	50 %	308181916
46455	NC_014554	ACC	2	6	2938302	2938307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181916
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46459	NC_014554	TCAGAA	2	12	2938517	2938528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308181916
46460	NC_014554	GGC	2	6	2938599	2938604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181916
46461	NC_014554	GCA	2	6	2938610	2938615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181916
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46463	NC_014554	CGCT	2	8	2939027	2939034	0 %	25 %	25 %	50 %	308181917
46464	NC_014554	GCA	2	6	2939207	2939212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181917
46465	NC_014554	CAA	2	6	2939229	2939234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181917
46466	NC_014554	TAT	2	6	2939235	2939240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181917
46467	NC_014554	CAT	2	6	2939244	2939249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181917
46468	NC_014554	ATG	2	6	2939326	2939331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181917
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46471	NC_014554	ATC	2	6	2939788	2939793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181917
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46475	NC_014554	ATC	2	6	2940166	2940171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181917
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46482	NC_014554	TAA	2	6	2940462	2940467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181917
46483	NC_014554	GATC	2	8	2940477	2940484	25 %	25 %	25 %	25 %	308181917
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46486	NC_014554	TGA	4	12	2941197	2941208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181918
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46490	NC_014554	ATC	2	6	2941314	2941319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181918
46491	NC_014554	CGC	2	6	2941360	2941365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181918
46492	NC_014554	GCC	2	6	2941397	2941402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181918
46493	NC_014554	TGC	2	6	2941417	2941422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181918
46494	NC_014554	TGT	2	6	2941468	2941473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181918
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46497	NC_014554	TGC	2	6	2941702	2941707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181918
46498	NC_014554	CAAT	2	8	2941734	2941741	50 %	25 %	0 %	25 %	308181918
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46500	NC_014554	ATG	2	6	2942124	2942129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181918

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