MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_014554	TGATTT	2	12	2866733	2866744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	308181851
45502	NC_014554	TCAT	2	8	2866774	2866781	25 %	50 %	0 %	25 %	308181851
45503	NC_014554	CTA	2	6	2866821	2866826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181851
45504	NC_014554	GGT	2	6	2867031	2867036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181851
45505	NC_014554	CGA	2	6	2867073	2867078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181851
45506	NC_014554	GGC	2	6	2867120	2867125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181851
45507	NC_014554	TCAA	2	8	2867299	2867306	50 %	25 %	0 %	25 %	308181851
45508	NC_014554	CCTT	2	8	2867344	2867351	0 %	50 %	0 %	50 %	308181851
45509	NC_014554	GTC	2	6	2867463	2867468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181851
45510	NC_014554	GTC	2	6	2867502	2867507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181851
45511	NC_014554	TCT	2	6	2867515	2867520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181851
45512	NC_014554	GCC	2	6	2867556	2867561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181851
45513	NC_014554	CCA	2	6	2867720	2867725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181851
45514	NC_014554	GAC	2	6	2867863	2867868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181852
45515	NC_014554	CGT	2	6	2867923	2867928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181852
45516	NC_014554	CAT	2	6	2867996	2868001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181852
45517	NC_014554	CAT	2	6	2868122	2868127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181852
45518	NC_014554	CGG	2	6	2868146	2868151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181852
45519	NC_014554	AGT	2	6	2868252	2868257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181852
45520	NC_014554	CAT	2	6	2868299	2868304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181852
45521	NC_014554	CGC	2	6	2868309	2868314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181852
45522	NC_014554	TCA	2	6	2868383	2868388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181852
45523	NC_014554	AATT	2	8	2868453	2868460	50 %	50 %	0 %	0 %	308181852
45524	NC_014554	ACC	2	6	2868471	2868476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181852
45525	NC_014554	CGT	2	6	2868653	2868658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181853
45526	NC_014554	AGA	2	6	2868662	2868667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181853
45527	NC_014554	GCA	2	6	2868686	2868691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181853
45528	NC_014554	CGC	2	6	2868718	2868723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181853
45529	NC_014554	ATT	2	6	2868742	2868747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181853
45530	NC_014554	ATC	2	6	2868763	2868768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181853
45531	NC_014554	GAC	2	6	2868919	2868924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181853
45532	NC_014554	CGT	2	6	2868935	2868940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181853
45533	NC_014554	GGC	2	6	2869004	2869009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181853
45534	NC_014554	CT	3	6	2869014	2869019	0 %	50 %	0 %	50 %	308181853
45535	NC_014554	ACT	2	6	2869079	2869084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181853
45536	NC_014554	TGT	2	6	2869387	2869392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181854
45537	NC_014554	CTT	2	6	2869397	2869402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181854
45538	NC_014554	ATT	2	6	2869477	2869482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181854
45539	NC_014554	TCT	2	6	2869504	2869509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181854
45540	NC_014554	GTA	2	6	2869597	2869602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181854
45541	NC_014554	T	7	7	2869604	2869610	0 %	100 %	0 %	0 %	308181854
45542	NC_014554	AAT	2	6	2869632	2869637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181854
45543	NC_014554	ACC	2	6	2869664	2869669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181854
45544	NC_014554	TTG	2	6	2869710	2869715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181854
45545	NC_014554	TAA	2	6	2869991	2869996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181855
45546	NC_014554	GGC	2	6	2870081	2870086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181855
45547	NC_014554	AAC	2	6	2870094	2870099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181855
45548	NC_014554	GTG	2	6	2870125	2870130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181855
45549	NC_014554	TGA	2	6	2870142	2870147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181855
45550	NC_014554	ATT	2	6	2870178	2870183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181855
45551	NC_014554	TCA	2	6	2870277	2870282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181856
45552	NC_014554	TCGA	2	8	2870333	2870340	25 %	25 %	25 %	25 %	308181856
45553	NC_014554	ACT	2	6	2870357	2870362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181856
45554	NC_014554	ATG	3	9	2870378	2870386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181856
45555	NC_014554	ATCG	2	8	2870399	2870406	25 %	25 %	25 %	25 %	308181856
45556	NC_014554	CCA	2	6	2870425	2870430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181856
45557	NC_014554	CGC	2	6	2870491	2870496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181856
45558	NC_014554	TCG	2	6	2870569	2870574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181856
45559	NC_014554	TGT	2	6	2870655	2870660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181856
45560	NC_014554	GCCT	2	8	2870672	2870679	0 %	25 %	25 %	50 %	308181856
45561	NC_014554	A	6	6	2870703	2870708	100 %	0 %	0 %	0 %	308181856
45562	NC_014554	GTT	2	6	2870717	2870722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181856
45563	NC_014554	GTA	2	6	2870744	2870749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181856
45564	NC_014554	CGC	2	6	2870786	2870791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181856
45565	NC_014554	GAT	2	6	2870855	2870860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181856
45566	NC_014554	TGGT	2	8	2870935	2870942	0 %	50 %	50 %	0 %	308181856
45567	NC_014554	ATC	2	6	2870954	2870959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181856
45568	NC_014554	AAT	2	6	2870960	2870965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181856
45569	NC_014554	CTG	2	6	2870993	2870998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181856
45570	NC_014554	G	6	6	2871022	2871027	0 %	0 %	100 %	0 %	308181856
45571	NC_014554	TCC	2	6	2871076	2871081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181856
45572	NC_014554	AGA	2	6	2871562	2871567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181857
45573	NC_014554	TGA	2	6	2871571	2871576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181857
45574	NC_014554	GCC	2	6	2871629	2871634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181857
45575	NC_014554	GAA	2	6	2871650	2871655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181857
45576	NC_014554	CGAA	2	8	2871658	2871665	50 %	0 %	25 %	25 %	308181857
45577	NC_014554	TAC	2	6	2871695	2871700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181857
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45581	NC_014554	CAA	2	6	2871909	2871914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181857
45582	NC_014554	CGC	2	6	2871919	2871924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181857
45583	NC_014554	TAAT	2	8	2872061	2872068	50 %	50 %	0 %	0 %	308181857
45584	NC_014554	TCT	2	6	2872479	2872484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181858
45585	NC_014554	GTTC	2	8	2872502	2872509	0 %	50 %	25 %	25 %	308181858
45586	NC_014554	CTTGA	2	10	2872529	2872538	20 %	40 %	20 %	20 %	308181858
45587	NC_014554	CAA	2	6	2872571	2872576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181858
45588	NC_014554	AAT	2	6	2872592	2872597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181858
45589	NC_014554	TAG	2	6	2872757	2872762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181858
45590	NC_014554	ATC	2	6	2872764	2872769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181858
45591	NC_014554	ACT	2	6	2872832	2872837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181858
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45594	NC_014554	CGC	2	6	2873163	2873168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181859
45595	NC_014554	CCAC	2	8	2873182	2873189	25 %	0 %	0 %	75 %	308181859
45596	NC_014554	TGC	2	6	2873223	2873228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181859
45597	NC_014554	AAT	2	6	2873296	2873301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181859
45598	NC_014554	TA	3	6	2873372	2873377	50 %	50 %	0 %	0 %	308181859
45599	NC_014554	GGCG	2	8	2873400	2873407	0 %	0 %	75 %	25 %	308181859
45600	NC_014554	CCA	2	6	2873431	2873436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181859
45601	NC_014554	CAAT	2	8	2873486	2873493	50 %	25 %	0 %	25 %	308181859
45602	NC_014554	AGC	2	6	2873512	2873517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181859
45603	NC_014554	A	6	6	2873523	2873528	100 %	0 %	0 %	0 %	308181859
45604	NC_014554	TTTGT	2	10	2873554	2873563	0 %	80 %	20 %	0 %	308181859
45605	NC_014554	ATT	2	6	2873622	2873627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181859
45606	NC_014554	AAT	2	6	2873871	2873876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181860
45607	NC_014554	TTG	2	6	2873919	2873924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181860
45608	NC_014554	TTTAA	2	10	2874106	2874115	40 %	60 %	0 %	0 %	308181860
45609	NC_014554	GCCA	2	8	2874132	2874139	25 %	0 %	25 %	50 %	308181860
45610	NC_014554	TGC	2	6	2874205	2874210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181860
45611	NC_014554	TGC	2	6	2874270	2874275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181860
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45613	NC_014554	AGC	2	6	2874363	2874368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181860
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45615	NC_014554	GGC	2	6	2874466	2874471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181860
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45844	NC_014554	TGAT	2	8	2888874	2888881	25 %	50 %	25 %	0 %	308181873
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