MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014554	CAGC	2	8	250273	250280	25 %	0 %	25 %	50 %	308179420
4002	NC_014554	TAAGA	2	10	250368	250377	60 %	20 %	20 %	0 %	308179420
4003	NC_014554	CTA	2	6	250411	250416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179420
4004	NC_014554	TGA	2	6	250462	250467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179420
4005	NC_014554	GTC	2	6	250491	250496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179420
4006	NC_014554	TGG	2	6	250510	250515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179420
4007	NC_014554	GTT	2	6	250534	250539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179420
4008	NC_014554	GTC	2	6	250551	250556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179420
4009	NC_014554	TCA	2	6	250615	250620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179420
4010	NC_014554	ATTG	2	8	250643	250650	25 %	50 %	25 %	0 %	308179420
4011	NC_014554	CAA	2	6	250691	250696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179420
4012	NC_014554	CGG	2	6	250716	250721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179420
4013	NC_014554	GTG	2	6	250755	250760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179420
4014	NC_014554	CGC	2	6	250805	250810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179421
4015	NC_014554	TTA	2	6	250852	250857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179421
4016	NC_014554	CAAG	2	8	250925	250932	50 %	0 %	25 %	25 %	308179421
4017	NC_014554	TCA	2	6	250933	250938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179421
4018	NC_014554	TCG	2	6	250951	250956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179421
4019	NC_014554	GAA	2	6	250968	250973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179421
4020	NC_014554	GCA	2	6	250976	250981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179421
4021	NC_014554	CTT	2	6	251009	251014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179421
4022	NC_014554	ATC	2	6	251058	251063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179421
4023	NC_014554	CGT	2	6	251104	251109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179421
4024	NC_014554	AAT	2	6	251131	251136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179421
4025	NC_014554	GTC	2	6	251166	251171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179421
4026	NC_014554	ATA	2	6	251224	251229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179421
4027	NC_014554	GCG	2	6	251259	251264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179421
4028	NC_014554	GAG	2	6	251313	251318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179421
4029	NC_014554	CAGA	2	8	251420	251427	50 %	0 %	25 %	25 %	308179421
4030	NC_014554	CAA	2	6	251441	251446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179421
4031	NC_014554	AGTG	2	8	251621	251628	25 %	25 %	50 %	0 %	308179422
4032	NC_014554	ACA	2	6	251686	251691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179422
4033	NC_014554	AAG	2	6	251700	251705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179422
4034	NC_014554	CCG	2	6	251713	251718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179422
4035	NC_014554	GAAG	2	8	251726	251733	50 %	0 %	50 %	0 %	308179422
4036	NC_014554	GCG	2	6	251745	251750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179422
4037	NC_014554	CAG	2	6	252020	252025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179423
4038	NC_014554	GAAATT	2	12	252038	252049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	308179423
4039	NC_014554	AAGT	2	8	252078	252085	50 %	25 %	25 %	0 %	308179423
4040	NC_014554	ATG	2	6	252165	252170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179423
4041	NC_014554	CA	3	6	252220	252225	50 %	0 %	0 %	50 %	308179423
4042	NC_014554	T	6	6	252260	252265	0 %	100 %	0 %	0 %	308179423
4043	NC_014554	TCA	2	6	252322	252327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179423
4044	NC_014554	CTGGC	2	10	252366	252375	0 %	20 %	40 %	40 %	308179423
4045	NC_014554	TA	3	6	252411	252416	50 %	50 %	0 %	0 %	308179423
4046	NC_014554	TGA	2	6	252420	252425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179423
4047	NC_014554	ATT	2	6	252518	252523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179423
4048	NC_014554	TAT	2	6	252536	252541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179423
4049	NC_014554	GGT	2	6	252559	252564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179423
4050	NC_014554	GTG	2	6	252611	252616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179423
4051	NC_014554	GTG	2	6	252651	252656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179423
4052	NC_014554	CGT	2	6	252679	252684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179423
4053	NC_014554	TTA	2	6	252685	252690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179423
4054	NC_014554	ATT	2	6	252710	252715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179423
4055	NC_014554	CTTT	2	8	253081	253088	0 %	75 %	0 %	25 %	308179424
4056	NC_014554	ATT	2	6	253155	253160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179424
4057	NC_014554	GGTC	2	8	253165	253172	0 %	25 %	50 %	25 %	308179424
4058	NC_014554	CGG	2	6	253450	253455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179424
4059	NC_014554	GTT	2	6	253481	253486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179424
4060	NC_014554	TTG	2	6	253698	253703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179424
4061	NC_014554	TGTA	2	8	253742	253749	25 %	50 %	25 %	0 %	308179424
4062	NC_014554	ACA	2	6	253877	253882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179424
4063	NC_014554	TTC	2	6	253884	253889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179424
4064	NC_014554	GGT	2	6	253908	253913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179424
4065	NC_014554	TTG	2	6	253951	253956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179424
4066	NC_014554	CCGTT	2	10	254068	254077	0 %	40 %	20 %	40 %	308179424
4067	NC_014554	GTTA	2	8	254090	254097	25 %	50 %	25 %	0 %	308179424
4068	NC_014554	ACG	2	6	254103	254108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179424
4069	NC_014554	GAC	2	6	254168	254173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179424
4070	NC_014554	GCC	2	6	254174	254179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179424
4071	NC_014554	CTA	2	6	254261	254266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179424
4072	NC_014554	CTT	3	9	254267	254275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179424
4073	NC_014554	GAA	2	6	254304	254309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179424
4074	NC_014554	TGC	2	6	254318	254323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179424
4075	NC_014554	GCT	2	6	254331	254336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179424
4076	NC_014554	TTA	2	6	254507	254512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179425
4077	NC_014554	GCT	2	6	254685	254690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179425
4078	NC_014554	TAG	2	6	254725	254730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179425
4079	NC_014554	CAGT	2	8	254764	254771	25 %	25 %	25 %	25 %	308179425
4080	NC_014554	GTA	2	6	254777	254782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179425
4081	NC_014554	ATG	2	6	254820	254825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179425
4082	NC_014554	GATT	2	8	255073	255080	25 %	50 %	25 %	0 %	308179426
4083	NC_014554	AAC	2	6	255082	255087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179426
4084	NC_014554	AACGG	2	10	255091	255100	40 %	0 %	40 %	20 %	308179426
4085	NC_014554	TTC	2	6	255104	255109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179426
4086	NC_014554	GTGA	2	8	255188	255195	25 %	25 %	50 %	0 %	308179426
4087	NC_014554	ACG	2	6	255255	255260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179426
4088	NC_014554	GCTG	2	8	255287	255294	0 %	25 %	50 %	25 %	308179426
4089	NC_014554	TAT	2	6	255467	255472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179427
4090	NC_014554	TTG	2	6	255621	255626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179427
4091	NC_014554	CAA	2	6	255740	255745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179427
4092	NC_014554	AGTGA	2	10	255784	255793	40 %	20 %	40 %	0 %	308179427
4093	NC_014554	ATTG	2	8	255797	255804	25 %	50 %	25 %	0 %	308179427
4094	NC_014554	CCGC	2	8	255845	255852	0 %	0 %	25 %	75 %	308179427
4095	NC_014554	TTG	3	9	255858	255866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179427
4096	NC_014554	TTTG	2	8	256031	256038	0 %	75 %	25 %	0 %	308179427
4097	NC_014554	CCA	2	6	256120	256125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179427
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4099	NC_014554	TAG	2	6	256305	256310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179427
4100	NC_014554	CTG	2	6	256348	256353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179427
4101	NC_014554	TCG	2	6	256367	256372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179427
4102	NC_014554	GC	3	6	256380	256385	0 %	0 %	50 %	50 %	308179427
4103	NC_014554	AAT	2	6	256398	256403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179427
4104	NC_014554	CGATAA	2	12	256424	256435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308179427
4105	NC_014554	AAG	2	6	256791	256796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179428
4106	NC_014554	ATT	2	6	256803	256808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179428
4107	NC_014554	GAG	2	6	256847	256852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179428
4108	NC_014554	A	6	6	256859	256864	100 %	0 %	0 %	0 %	308179428
4109	NC_014554	GCCTT	2	10	256902	256911	0 %	40 %	20 %	40 %	308179428
4110	NC_014554	AAC	2	6	257002	257007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179428
4111	NC_014554	ATC	2	6	257075	257080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179428
4112	NC_014554	CGT	2	6	257122	257127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179428
4113	NC_014554	AAG	2	6	257145	257150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179428
4114	NC_014554	CTA	2	6	257262	257267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179428
4115	NC_014554	AAGTT	2	10	257313	257322	40 %	40 %	20 %	0 %	308179428
4116	NC_014554	TGA	2	6	257370	257375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179428
4117	NC_014554	ATA	2	6	257472	257477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179428
4118	NC_014554	TCGA	2	8	257571	257578	25 %	25 %	25 %	25 %	308179428
4119	NC_014554	GCG	2	6	257609	257614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179428
4120	NC_014554	TGG	2	6	257638	257643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179428
4121	NC_014554	AAG	2	6	257666	257671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179428
4122	NC_014554	TGC	2	6	257757	257762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179428
4123	NC_014554	A	6	6	257955	257960	100 %	0 %	0 %	0 %	308179428
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4230	NC_014554	TTCG	2	8	263760	263767	0 %	50 %	25 %	25 %	308179432
4231	NC_014554	AC	3	6	263938	263943	50 %	0 %	0 %	50 %	308179432
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4242	NC_014554	TCA	2	6	264512	264517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179433
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4360	NC_014554	AATT	2	8	270639	270646	50 %	50 %	0 %	0 %	308179437
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4486	NC_014554	GTA	2	6	280049	280054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179445
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