MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_014554	CAT	2	6	2639356	2639361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181646
42003	NC_014554	ATT	2	6	2639438	2639443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181647
42004	NC_014554	CAA	2	6	2639490	2639495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181647
42005	NC_014554	CCAA	2	8	2639518	2639525	50 %	0 %	0 %	50 %	308181647
42006	NC_014554	TGC	2	6	2639597	2639602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181647
42007	NC_014554	TGC	2	6	2639613	2639618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181647
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42009	NC_014554	ACTA	2	8	2639661	2639668	50 %	25 %	0 %	25 %	308181647
42010	NC_014554	TAA	2	6	2639712	2639717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181647
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42012	NC_014554	TCG	2	6	2639888	2639893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181647
42013	NC_014554	AAT	2	6	2639910	2639915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181647
42014	NC_014554	ACT	2	6	2639938	2639943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181647
42015	NC_014554	CG	3	6	2639958	2639963	0 %	0 %	50 %	50 %	308181647
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42018	NC_014554	TCGTT	2	10	2640099	2640108	0 %	60 %	20 %	20 %	308181647
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42026	NC_014554	TCA	2	6	2640664	2640669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181649
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42115	NC_014554	ATA	2	6	2649583	2649588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181653
42116	NC_014554	ATT	2	6	2649606	2649611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181653
42117	NC_014554	ACA	2	6	2649771	2649776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181654
42118	NC_014554	TTGGC	2	10	2649845	2649854	0 %	40 %	40 %	20 %	308181654
42119	NC_014554	GCTA	2	8	2649894	2649901	25 %	25 %	25 %	25 %	308181654
42120	NC_014554	TGG	2	6	2650002	2650007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181654
42121	NC_014554	CTA	2	6	2650033	2650038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181654
42122	NC_014554	TTCT	2	8	2650076	2650083	0 %	75 %	0 %	25 %	308181654
42123	NC_014554	AAT	2	6	2650171	2650176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181654
42124	NC_014554	CAA	2	6	2650216	2650221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181654
42125	NC_014554	ATT	2	6	2650291	2650296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181654
42126	NC_014554	CGG	2	6	2650297	2650302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181654
42127	NC_014554	AAC	2	6	2650404	2650409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181654
42128	NC_014554	ATG	2	6	2650514	2650519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181654
42129	NC_014554	CAA	2	6	2650789	2650794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181655
42130	NC_014554	CTT	2	6	2650804	2650809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181655
42131	NC_014554	T	6	6	2650846	2650851	0 %	100 %	0 %	0 %	308181655
42132	NC_014554	ACC	2	6	2650878	2650883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181655
42133	NC_014554	TCC	2	6	2650896	2650901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181655
42134	NC_014554	CAG	2	6	2650909	2650914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181655
42135	NC_014554	GTG	2	6	2650939	2650944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181655
42136	NC_014554	ACCGT	2	10	2651017	2651026	20 %	20 %	20 %	40 %	308181655
42137	NC_014554	TGG	2	6	2651106	2651111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181655
42138	NC_014554	T	6	6	2651201	2651206	0 %	100 %	0 %	0 %	308181655
42139	NC_014554	GCT	2	6	2651705	2651710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181656
42140	NC_014554	TCA	2	6	2651730	2651735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181656
42141	NC_014554	TGA	2	6	2651754	2651759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181656
42142	NC_014554	TCT	3	9	2651787	2651795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181656
42143	NC_014554	TAA	2	6	2651830	2651835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181656
42144	NC_014554	ATA	2	6	2651987	2651992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181656
42145	NC_014554	T	6	6	2651994	2651999	0 %	100 %	0 %	0 %	308181656
42146	NC_014554	CAG	3	9	2652056	2652064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181657
42147	NC_014554	CTT	2	6	2652086	2652091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181657
42148	NC_014554	CTT	2	6	2652114	2652119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181657
42149	NC_014554	CCA	2	6	2652187	2652192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181657
42150	NC_014554	GTC	2	6	2652220	2652225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181657
42151	NC_014554	TGG	2	6	2652249	2652254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181657
42152	NC_014554	AAG	2	6	2652310	2652315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181657
42153	NC_014554	TCA	2	6	2652338	2652343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181657
42154	NC_014554	AAT	2	6	2652382	2652387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181657
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42157	NC_014554	AGTTA	2	10	2652483	2652492	40 %	40 %	20 %	0 %	308181657
42158	NC_014554	TA	3	6	2652560	2652565	50 %	50 %	0 %	0 %	308181657
42159	NC_014554	CCA	2	6	2652628	2652633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181657
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42161	NC_014554	CAC	2	6	2652683	2652688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181657
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42164	NC_014554	CAA	2	6	2652794	2652799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181657
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42166	NC_014554	CTGG	2	8	2652847	2652854	0 %	25 %	50 %	25 %	308181657
42167	NC_014554	CAAC	2	8	2652910	2652917	50 %	0 %	0 %	50 %	308181657
42168	NC_014554	AAT	2	6	2652930	2652935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181657
42169	NC_014554	GCA	2	6	2652937	2652942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181657
42170	NC_014554	ATC	2	6	2652943	2652948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181657
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42178	NC_014554	TAA	2	6	2653307	2653312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181657
42179	NC_014554	CAG	2	6	2653313	2653318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181657
42180	NC_014554	TGGAAT	2	12	2653326	2653337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181657
42181	NC_014554	ATA	2	6	2653369	2653374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181657
42182	NC_014554	ATT	2	6	2653438	2653443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181657
42183	NC_014554	TTA	2	6	2653459	2653464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181657
42184	NC_014554	TAC	2	6	2653487	2653492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181657
42185	NC_014554	T	6	6	2653518	2653523	0 %	100 %	0 %	0 %	308181658
42186	NC_014554	AAT	2	6	2653543	2653548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181658
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42189	NC_014554	ATCA	2	8	2653652	2653659	50 %	25 %	0 %	25 %	308181658
42190	NC_014554	TTC	2	6	2653730	2653735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181658
42191	NC_014554	TCA	2	6	2653752	2653757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42192	NC_014554	CATT	2	8	2653893	2653900	25 %	50 %	0 %	25 %	308181658
42193	NC_014554	AAT	2	6	2653930	2653935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181658
42194	NC_014554	ATA	2	6	2653997	2654002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181658
42195	NC_014554	A	6	6	2654013	2654018	100 %	0 %	0 %	0 %	308181658
42196	NC_014554	TCA	2	6	2654046	2654051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42197	NC_014554	TGT	2	6	2654079	2654084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181658
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42200	NC_014554	ATA	2	6	2654178	2654183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181658
42201	NC_014554	ACC	2	6	2654231	2654236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181658
42202	NC_014554	TGA	2	6	2654259	2654264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181658
42203	NC_014554	GC	3	6	2654279	2654284	0 %	0 %	50 %	50 %	308181658
42204	NC_014554	TGG	2	6	2654301	2654306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181658
42205	NC_014554	TCG	2	6	2654370	2654375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181658
42206	NC_014554	ATC	2	6	2654439	2654444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42207	NC_014554	TTTTCA	2	12	2654496	2654507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	308181658
42208	NC_014554	ATC	2	6	2654544	2654549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42209	NC_014554	GCATC	2	10	2654569	2654578	20 %	20 %	20 %	40 %	308181658
42210	NC_014554	ACT	2	6	2654637	2654642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
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42212	NC_014554	GAT	2	6	2654716	2654721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181658
42213	NC_014554	TCA	2	6	2654724	2654729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42214	NC_014554	CAT	2	6	2654734	2654739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42215	NC_014554	CAT	2	6	2654773	2654778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181658
42216	NC_014554	A	6	6	2654850	2654855	100 %	0 %	0 %	0 %	308181658
42217	NC_014554	TATT	2	8	2655082	2655089	25 %	75 %	0 %	0 %	308181659
42218	NC_014554	GC	3	6	2655144	2655149	0 %	0 %	50 %	50 %	308181659
42219	NC_014554	TGAT	2	8	2655193	2655200	25 %	50 %	25 %	0 %	308181659
42220	NC_014554	ATC	2	6	2655205	2655210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181659
42221	NC_014554	GTT	2	6	2655308	2655313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181659
42222	NC_014554	GGC	2	6	2655354	2655359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181659
42223	NC_014554	CAT	2	6	2655462	2655467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181659
42224	NC_014554	ACTA	2	8	2655486	2655493	50 %	25 %	0 %	25 %	308181659
42225	NC_014554	CGT	2	6	2655555	2655560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181659
42226	NC_014554	CAGC	2	8	2655598	2655605	25 %	0 %	25 %	50 %	308181659
42227	NC_014554	CAAC	2	8	2655614	2655621	50 %	0 %	0 %	50 %	308181659
42228	NC_014554	GTCCA	2	10	2655664	2655673	20 %	20 %	20 %	40 %	308181659
42229	NC_014554	GAT	2	6	2655686	2655691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181659
42230	NC_014554	GAC	2	6	2655738	2655743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181659
42231	NC_014554	GCC	2	6	2655757	2655762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181659
42232	NC_014554	TCA	2	6	2655814	2655819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181659
42233	NC_014554	TCA	2	6	2655860	2655865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181659
42234	NC_014554	ACGTC	2	10	2655869	2655878	20 %	20 %	20 %	40 %	308181659
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42243	NC_014554	ACG	2	6	2656448	2656453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181660
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42247	NC_014554	TA	3	6	2656543	2656548	50 %	50 %	0 %	0 %	308181660
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42249	NC_014554	A	6	6	2657036	2657041	100 %	0 %	0 %	0 %	308181661
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42252	NC_014554	TAA	2	6	2657203	2657208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181661
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42262	NC_014554	GCT	2	6	2657630	2657635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181661
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42310	NC_014554	CAGT	2	8	2661427	2661434	25 %	25 %	25 %	25 %	308181666
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42315	NC_014554	CGT	2	6	2661822	2661827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181667
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42319	NC_014554	CGT	2	6	2661946	2661951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181667
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42321	NC_014554	CA	3	6	2662002	2662007	50 %	0 %	0 %	50 %	308181667
42322	NC_014554	CAA	2	6	2662030	2662035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181667
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42326	NC_014554	ATCGC	2	10	2662106	2662115	20 %	20 %	20 %	40 %	308181667
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42329	NC_014554	TTA	2	6	2662190	2662195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181667
42330	NC_014554	ATT	2	6	2662219	2662224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181667
42331	NC_014554	ACG	2	6	2662225	2662230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181667
42332	NC_014554	TGC	2	6	2662253	2662258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181667
42333	NC_014554	TTA	2	6	2662529	2662534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181668
42334	NC_014554	T	7	7	2662541	2662547	0 %	100 %	0 %	0 %	308181668
42335	NC_014554	T	6	6	2662568	2662573	0 %	100 %	0 %	0 %	308181668
42336	NC_014554	CTT	2	6	2662599	2662604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181668
42337	NC_014554	TCA	2	6	2662611	2662616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181668
42338	NC_014554	TTA	2	6	2662637	2662642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181668
42339	NC_014554	ATG	2	6	2662666	2662671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181668
42340	NC_014554	ACG	2	6	2662712	2662717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181668
42341	NC_014554	TAC	2	6	2662792	2662797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181668
42342	NC_014554	TCTTTA	2	12	2662811	2662822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	308181668
42343	NC_014554	CTT	2	6	2662884	2662889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181668
42344	NC_014554	TTTA	2	8	2662952	2662959	25 %	75 %	0 %	0 %	308181668
42345	NC_014554	TGG	2	6	2662990	2662995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181668
42346	NC_014554	ACCT	2	8	2663047	2663054	25 %	25 %	0 %	50 %	308181668
42347	NC_014554	TGT	2	6	2663093	2663098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181668
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42455	NC_014554	TCAGC	2	10	2669573	2669582	20 %	20 %	20 %	40 %	308181674
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42458	NC_014554	A	6	6	2669693	2669698	100 %	0 %	0 %	0 %	308181675
42459	NC_014554	TTATT	2	10	2669700	2669709	20 %	80 %	0 %	0 %	308181675
42460	NC_014554	A	6	6	2669758	2669763	100 %	0 %	0 %	0 %	308181675
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42462	NC_014554	CGC	2	6	2669818	2669823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181675
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42464	NC_014554	CGG	2	6	2669877	2669882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181675
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