MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_014554	CTTA	2	8	2609001	2609008	25 %	50 %	0 %	25 %	308181615
41502	NC_014554	TGC	2	6	2609280	2609285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181616
41503	NC_014554	ACG	2	6	2609383	2609388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181616
41504	NC_014554	CCA	3	9	2609464	2609472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181616
41505	NC_014554	ACCA	2	8	2609483	2609490	50 %	0 %	0 %	50 %	308181616
41506	NC_014554	TAA	2	6	2609517	2609522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181616
41507	NC_014554	TTG	2	6	2609525	2609530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181616
41508	NC_014554	CAA	2	6	2609565	2609570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181616
41509	NC_014554	ATA	2	6	2609713	2609718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181616
41510	NC_014554	ATC	2	6	2609719	2609724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181616
41511	NC_014554	CGC	2	6	2609757	2609762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181616
41512	NC_014554	GCCA	2	8	2609802	2609809	25 %	0 %	25 %	50 %	308181616
41513	NC_014554	TGT	2	6	2609977	2609982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181616
41514	NC_014554	A	6	6	2610007	2610012	100 %	0 %	0 %	0 %	308181616
41515	NC_014554	TAA	2	6	2610027	2610032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181616
41516	NC_014554	TTGG	2	8	2610273	2610280	0 %	50 %	50 %	0 %	308181617
41517	NC_014554	GTC	2	6	2610295	2610300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181617
41518	NC_014554	TGG	2	6	2610306	2610311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181617
41519	NC_014554	ACCA	2	8	2610330	2610337	50 %	0 %	0 %	50 %	308181617
41520	NC_014554	AC	3	6	2610400	2610405	50 %	0 %	0 %	50 %	308181617
41521	NC_014554	CAC	2	6	2610513	2610518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181617
41522	NC_014554	TTAACG	2	12	2610548	2610559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308181617
41523	NC_014554	GCC	2	6	2610673	2610678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181617
41524	NC_014554	GCA	2	6	2610707	2610712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181617
41525	NC_014554	ACC	2	6	2610713	2610718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181617
41526	NC_014554	CAAT	2	8	2610771	2610778	50 %	25 %	0 %	25 %	308181617
41527	NC_014554	A	6	6	2610796	2610801	100 %	0 %	0 %	0 %	308181617
41528	NC_014554	ATTG	2	8	2610820	2610827	25 %	50 %	25 %	0 %	308181617
41529	NC_014554	GACAAC	2	12	2610844	2610855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308181617
41530	NC_014554	TCAG	2	8	2611126	2611133	25 %	25 %	25 %	25 %	308181618
41531	NC_014554	GTT	2	6	2611195	2611200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181618
41532	NC_014554	CATCA	2	10	2611347	2611356	40 %	20 %	0 %	40 %	308181618
41533	NC_014554	ATC	2	6	2611401	2611406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181618
41534	NC_014554	A	6	6	2611417	2611422	100 %	0 %	0 %	0 %	308181618
41535	NC_014554	AAG	2	6	2611468	2611473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181618
41536	NC_014554	TAA	2	6	2611490	2611495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181618
41537	NC_014554	A	6	6	2611515	2611520	100 %	0 %	0 %	0 %	308181618
41538	NC_014554	CAA	2	6	2611524	2611529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181618
41539	NC_014554	AAAGT	2	10	2611650	2611659	60 %	20 %	20 %	0 %	308181618
41540	NC_014554	GTTG	2	8	2611668	2611675	0 %	50 %	50 %	0 %	308181618
41541	NC_014554	TCG	2	6	2611810	2611815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181618
41542	NC_014554	GAT	2	6	2611873	2611878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181618
41543	NC_014554	GCCA	2	8	2611955	2611962	25 %	0 %	25 %	50 %	308181618
41544	NC_014554	ATG	2	6	2612145	2612150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181619
41545	NC_014554	AACT	2	8	2612153	2612160	50 %	25 %	0 %	25 %	308181619
41546	NC_014554	ACT	2	6	2612201	2612206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181619
41547	NC_014554	GTC	2	6	2612244	2612249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181619
41548	NC_014554	AGC	2	6	2612252	2612257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181619
41549	NC_014554	TTCA	2	8	2612307	2612314	25 %	50 %	0 %	25 %	308181619
41550	NC_014554	AAC	2	6	2612435	2612440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181619
41551	NC_014554	CTTG	2	8	2612474	2612481	0 %	50 %	25 %	25 %	308181619
41552	NC_014554	ACT	2	6	2612547	2612552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181619
41553	NC_014554	ATC	2	6	2612569	2612574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181619
41554	NC_014554	ATT	2	6	2612637	2612642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181619
41555	NC_014554	AGT	2	6	2612681	2612686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181619
41556	NC_014554	ATA	2	6	2612758	2612763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181619
41557	NC_014554	GTC	2	6	2612927	2612932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181620
41558	NC_014554	AGT	2	6	2612999	2613004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181620
41559	NC_014554	GCC	2	6	2613059	2613064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181620
41560	NC_014554	ATTG	2	8	2613397	2613404	25 %	50 %	25 %	0 %	308181621
41561	NC_014554	ATT	2	6	2613421	2613426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181621
41562	NC_014554	CCGCC	2	10	2613432	2613441	0 %	0 %	20 %	80 %	308181621
41563	NC_014554	TACC	2	8	2613633	2613640	25 %	25 %	0 %	50 %	308181621
41564	NC_014554	TCAT	2	8	2613659	2613666	25 %	50 %	0 %	25 %	308181621
41565	NC_014554	CAC	2	6	2613684	2613689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181621
41566	NC_014554	TGA	2	6	2613716	2613721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181621
41567	NC_014554	GACC	2	8	2613730	2613737	25 %	0 %	25 %	50 %	308181621
41568	NC_014554	AAG	2	6	2613761	2613766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181621
41569	NC_014554	CGC	2	6	2613814	2613819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181621
41570	NC_014554	AAT	2	6	2613922	2613927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181621
41571	NC_014554	TTG	2	6	2613938	2613943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181621
41572	NC_014554	CGT	2	6	2614048	2614053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181621
41573	NC_014554	CA	3	6	2614088	2614093	50 %	0 %	0 %	50 %	308181621
41574	NC_014554	CCA	2	6	2614112	2614117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181621
41575	NC_014554	GTC	2	6	2614490	2614495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181622
41576	NC_014554	TTG	2	6	2614522	2614527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181622
41577	NC_014554	CCGTTG	2	12	2614621	2614632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181622
41578	NC_014554	ACC	2	6	2614633	2614638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181622
41579	NC_014554	TGAC	2	8	2614814	2614821	25 %	25 %	25 %	25 %	308181622
41580	NC_014554	GGTT	2	8	2614897	2614904	0 %	50 %	50 %	0 %	308181622
41581	NC_014554	ATA	2	6	2614906	2614911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181622
41582	NC_014554	ACC	3	9	2614942	2614950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181622
41583	NC_014554	CCA	2	6	2614968	2614973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181622
41584	NC_014554	ATC	3	9	2615020	2615028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181622
41585	NC_014554	TTC	2	6	2615101	2615106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181622
41586	NC_014554	TTCA	2	8	2615110	2615117	25 %	50 %	0 %	25 %	308181622
41587	NC_014554	GTG	2	6	2615162	2615167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181622
41588	NC_014554	CATCGT	2	12	2615239	2615250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181622
41589	NC_014554	CAT	2	6	2615302	2615307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181622
41590	NC_014554	TCA	2	6	2615316	2615321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181622
41591	NC_014554	GTT	2	6	2615399	2615404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181622
41592	NC_014554	TCT	2	6	2615456	2615461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181622
41593	NC_014554	TAA	2	6	2615542	2615547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181622
41594	NC_014554	AAC	2	6	2615548	2615553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181622
41595	NC_014554	CCAA	2	8	2615618	2615625	50 %	0 %	0 %	50 %	308181622
41596	NC_014554	ACA	2	6	2615792	2615797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181622
41597	NC_014554	ACC	2	6	2616052	2616057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181622
41598	NC_014554	TGC	2	6	2616073	2616078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181622
41599	NC_014554	TTAA	2	8	2616122	2616129	50 %	50 %	0 %	0 %	308181623
41600	NC_014554	ATG	2	6	2616134	2616139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181623
41601	NC_014554	GTT	2	6	2616175	2616180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181623
41602	NC_014554	TAA	2	6	2616239	2616244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181623
41603	NC_014554	TGT	2	6	2616246	2616251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181623
41604	NC_014554	TCA	2	6	2616264	2616269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181623
41605	NC_014554	GC	3	6	2616316	2616321	0 %	0 %	50 %	50 %	308181623
41606	NC_014554	GCC	2	6	2616407	2616412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181623
41607	NC_014554	CTGA	2	8	2616438	2616445	25 %	25 %	25 %	25 %	308181623
41608	NC_014554	TTG	2	6	2616575	2616580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181623
41609	NC_014554	ACT	2	6	2616626	2616631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181623
41610	NC_014554	AAAT	2	8	2616632	2616639	75 %	25 %	0 %	0 %	308181623
41611	NC_014554	ATT	2	6	2616644	2616649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181623
41612	NC_014554	GTC	2	6	2616928	2616933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181624
41613	NC_014554	CAT	2	6	2616971	2616976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181624
41614	NC_014554	CAAT	2	8	2616992	2616999	50 %	25 %	0 %	25 %	308181624
41615	NC_014554	ATTGC	2	10	2617004	2617013	20 %	40 %	20 %	20 %	308181624
41616	NC_014554	TAC	2	6	2617019	2617024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181624
41617	NC_014554	ATCA	2	8	2617026	2617033	50 %	25 %	0 %	25 %	308181624
41618	NC_014554	CTT	2	6	2617127	2617132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181624
41619	NC_014554	TCA	2	6	2617333	2617338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181624
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41621	NC_014554	ATT	2	6	2617428	2617433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181624
41622	NC_014554	TAG	2	6	2617442	2617447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181624
41623	NC_014554	GTT	2	6	2617453	2617458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181624
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41625	NC_014554	GCA	2	6	2617875	2617880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181625
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41628	NC_014554	CTT	2	6	2617940	2617945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181625
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41643	NC_014554	TGC	2	6	2618765	2618770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181625
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41651	NC_014554	CAAGC	2	10	2619027	2619036	40 %	0 %	20 %	40 %	308181625
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41720	NC_014554	TTAT	2	8	2623439	2623446	25 %	75 %	0 %	0 %	308181629
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41723	NC_014554	CGTC	2	8	2623664	2623671	0 %	25 %	25 %	50 %	308181629
41724	NC_014554	GCG	2	6	2623693	2623698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181629
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41727	NC_014554	CGC	2	6	2624084	2624089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181629
41728	NC_014554	TCAC	2	8	2624094	2624101	25 %	25 %	0 %	50 %	308181629
41729	NC_014554	TGC	2	6	2624119	2624124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181629
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41731	NC_014554	CAT	2	6	2624236	2624241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181629
41732	NC_014554	CGT	2	6	2624354	2624359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181629
41733	NC_014554	CGT	2	6	2624375	2624380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181629
41734	NC_014554	AT	3	6	2624457	2624462	50 %	50 %	0 %	0 %	308181629
41735	NC_014554	TTC	2	6	2624585	2624590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181629
41736	NC_014554	TTGC	2	8	2624593	2624600	0 %	50 %	25 %	25 %	308181629
41737	NC_014554	AAC	2	6	2624649	2624654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181629
41738	NC_014554	AT	3	6	2624744	2624749	50 %	50 %	0 %	0 %	308181629
41739	NC_014554	GTA	2	6	2624804	2624809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181629
41740	NC_014554	TTA	2	6	2624811	2624816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181629
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41744	NC_014554	TAA	2	6	2624992	2624997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181630
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41747	NC_014554	CGT	2	6	2625172	2625177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181630
41748	NC_014554	GTTT	2	8	2625182	2625189	0 %	75 %	25 %	0 %	308181630
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41750	NC_014554	AGC	2	6	2625247	2625252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181630
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41752	NC_014554	TAA	2	6	2625280	2625285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181630
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41756	NC_014554	ACC	2	6	2625498	2625503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181631
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41759	NC_014554	TGTT	2	8	2625650	2625657	0 %	75 %	25 %	0 %	308181631
41760	NC_014554	CGT	2	6	2625679	2625684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181631
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41770	NC_014554	CGT	2	6	2626075	2626080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181631
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41842	NC_014554	AATA	2	8	2630177	2630184	75 %	25 %	0 %	0 %	308181636
41843	NC_014554	AAT	2	6	2630289	2630294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181636
41844	NC_014554	CGC	2	6	2630376	2630381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181636
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41963	NC_014554	CGAC	2	8	2637336	2637343	25 %	0 %	25 %	50 %	308181644
41964	NC_014554	TGC	2	6	2637361	2637366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181644
41965	NC_014554	TATT	2	8	2637377	2637384	25 %	75 %	0 %	0 %	308181644
41966	NC_014554	TTA	2	6	2637414	2637419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181644
41967	NC_014554	TAT	2	6	2637444	2637449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181644
41968	NC_014554	GTTT	2	8	2637488	2637495	0 %	75 %	25 %	0 %	308181644
41969	NC_014554	TATTCG	2	12	2637510	2637521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308181644
41970	NC_014554	CA	3	6	2637669	2637674	50 %	0 %	0 %	50 %	308181644
41971	NC_014554	CG	3	6	2637739	2637744	0 %	0 %	50 %	50 %	308181644
41972	NC_014554	GCT	2	6	2637758	2637763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181644
41973	NC_014554	TAT	2	6	2637810	2637815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181644
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41975	NC_014554	TCA	2	6	2638023	2638028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181644
41976	NC_014554	CGG	2	6	2638067	2638072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181644
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41978	NC_014554	AAT	2	6	2638163	2638168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181644
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41981	NC_014554	GGTT	2	8	2638298	2638305	0 %	50 %	50 %	0 %	308181644
41982	NC_014554	CTT	2	6	2638363	2638368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181644
41983	NC_014554	ACGTT	2	10	2638486	2638495	20 %	40 %	20 %	20 %	308181644
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41987	NC_014554	CAA	2	6	2638528	2638533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181644
41988	NC_014554	TGA	2	6	2638572	2638577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181645
41989	NC_014554	CCA	2	6	2638614	2638619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181645
41990	NC_014554	ATG	2	6	2638667	2638672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181645
41991	NC_014554	AT	3	6	2638739	2638744	50 %	50 %	0 %	0 %	308181645
41992	NC_014554	AAGC	2	8	2638756	2638763	50 %	0 %	25 %	25 %	308181645
41993	NC_014554	GCT	2	6	2638768	2638773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181645
41994	NC_014554	ATT	2	6	2638867	2638872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181645
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41998	NC_014554	GGC	2	6	2639158	2639163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181646
41999	NC_014554	ACCGCT	2	12	2639169	2639180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308181646
42000	NC_014554	GAC	2	6	2639232	2639237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181646

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