MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014554	CAC	2	6	2576152	2576157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181586
41002	NC_014554	GCC	2	6	2576166	2576171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181586
41003	NC_014554	ATG	2	6	2576181	2576186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181586
41004	NC_014554	CCG	2	6	2576275	2576280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181586
41005	NC_014554	CTG	2	6	2576342	2576347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181586
41006	NC_014554	TTGAT	2	10	2576385	2576394	20 %	60 %	20 %	0 %	308181586
41007	NC_014554	TCAA	2	8	2576454	2576461	50 %	25 %	0 %	25 %	308181586
41008	NC_014554	ATC	2	6	2576559	2576564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181586
41009	NC_014554	CTT	2	6	2576576	2576581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181586
41010	NC_014554	TGA	2	6	2576611	2576616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181586
41011	NC_014554	GCT	2	6	2576632	2576637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181586
41012	NC_014554	AAG	2	6	2576682	2576687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181586
41013	NC_014554	ACGAG	2	10	2576707	2576716	40 %	0 %	40 %	20 %	308181586
41014	NC_014554	TGC	2	6	2576773	2576778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181586
41015	NC_014554	A	6	6	2576796	2576801	100 %	0 %	0 %	0 %	308181586
41016	NC_014554	GCC	2	6	2576802	2576807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181586
41017	NC_014554	GTT	2	6	2576808	2576813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181586
41018	NC_014554	CTT	2	6	2576816	2576821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181586
41019	NC_014554	ATACCA	2	12	2576867	2576878	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	308181586
41020	NC_014554	TAT	2	6	2576911	2576916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181586
41021	NC_014554	TAA	2	6	2576950	2576955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181586
41022	NC_014554	ACC	2	6	2577017	2577022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181586
41023	NC_014554	TCA	2	6	2577025	2577030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181586
41024	NC_014554	AAT	2	6	2577256	2577261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181587
41025	NC_014554	ACC	2	6	2577289	2577294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181587
41026	NC_014554	GCTAAC	2	12	2577372	2577383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308181587
41027	NC_014554	AAAT	2	8	2577401	2577408	75 %	25 %	0 %	0 %	308181587
41028	NC_014554	TGT	2	6	2577429	2577434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181587
41029	NC_014554	ATTG	2	8	2577461	2577468	25 %	50 %	25 %	0 %	308181587
41030	NC_014554	CGC	2	6	2577578	2577583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181587
41031	NC_014554	GCA	2	6	2577639	2577644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181587
41032	NC_014554	GCC	2	6	2577728	2577733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181587
41033	NC_014554	AAT	2	6	2577752	2577757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181587
41034	NC_014554	CAAT	2	8	2577801	2577808	50 %	25 %	0 %	25 %	308181587
41035	NC_014554	TGC	2	6	2577822	2577827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181587
41036	NC_014554	AATT	2	8	2577860	2577867	50 %	50 %	0 %	0 %	308181587
41037	NC_014554	ACC	2	6	2577879	2577884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181587
41038	NC_014554	CGG	2	6	2577895	2577900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181587
41039	NC_014554	CAT	2	6	2577902	2577907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181587
41040	NC_014554	CTT	2	6	2577925	2577930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181587
41041	NC_014554	AAAC	2	8	2578267	2578274	75 %	0 %	0 %	25 %	308181588
41042	NC_014554	AATT	2	8	2578358	2578365	50 %	50 %	0 %	0 %	308181588
41043	NC_014554	GGT	2	6	2578455	2578460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181588
41044	NC_014554	AAT	2	6	2578507	2578512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181588
41045	NC_014554	CA	3	6	2578608	2578613	50 %	0 %	0 %	50 %	308181588
41046	NC_014554	A	8	8	2578768	2578775	100 %	0 %	0 %	0 %	308181588
41047	NC_014554	ATA	2	6	2578859	2578864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181588
41048	NC_014554	CGAA	2	8	2578943	2578950	50 %	0 %	25 %	25 %	308181588
41049	NC_014554	AATT	2	8	2578964	2578971	50 %	50 %	0 %	0 %	308181588
41050	NC_014554	CCG	2	6	2579378	2579383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181589
41051	NC_014554	GCA	2	6	2579394	2579399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181589
41052	NC_014554	GCA	2	6	2579409	2579414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181589
41053	NC_014554	ATC	2	6	2579457	2579462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181589
41054	NC_014554	TCA	2	6	2579475	2579480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181589
41055	NC_014554	CTA	2	6	2579554	2579559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181589
41056	NC_014554	TAT	2	6	2579566	2579571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181589
41057	NC_014554	TCAA	2	8	2579601	2579608	50 %	25 %	0 %	25 %	308181589
41058	NC_014554	CTT	2	6	2579653	2579658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41059	NC_014554	CTT	3	9	2579737	2579745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41060	NC_014554	TTC	3	9	2579813	2579821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41061	NC_014554	CTT	3	9	2579833	2579841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41062	NC_014554	CTT	4	12	2579908	2579919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41063	NC_014554	TTC	4	12	2579978	2579989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41064	NC_014554	TCGATA	2	12	2580006	2580017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308181589
41065	NC_014554	TTC	2	6	2580047	2580052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181589
41066	NC_014554	CCA	2	6	2580129	2580134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181589
41067	NC_014554	TTA	2	6	2580261	2580266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181589
41068	NC_014554	ATG	2	6	2580270	2580275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181589
41069	NC_014554	CCG	2	6	2580307	2580312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181589
41070	NC_014554	TAT	2	6	2580439	2580444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181589
41071	NC_014554	TCA	2	6	2580459	2580464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181589
41072	NC_014554	TAA	2	6	2580523	2580528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181589
41073	NC_014554	GCG	2	6	2580574	2580579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181589
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41075	NC_014554	TAA	2	6	2580980	2580985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181589
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41078	NC_014554	CGTC	2	8	2581135	2581142	0 %	25 %	25 %	50 %	308181589
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41082	NC_014554	GTC	2	6	2581278	2581283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181589
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41085	NC_014554	TTA	2	6	2581371	2581376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181589
41086	NC_014554	GTT	2	6	2581383	2581388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181589
41087	NC_014554	TGG	2	6	2581543	2581548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181589
41088	NC_014554	GCC	2	6	2581572	2581577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181589
41089	NC_014554	CAG	3	9	2581597	2581605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181589
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41091	NC_014554	CCA	2	6	2581780	2581785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181589
41092	NC_014554	GTT	2	6	2581788	2581793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181589
41093	NC_014554	ACG	2	6	2582291	2582296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181590
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41096	NC_014554	CAT	2	6	2582415	2582420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181590
41097	NC_014554	AATT	2	8	2583022	2583029	50 %	50 %	0 %	0 %	308181591
41098	NC_014554	GAT	2	6	2583059	2583064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181591
41099	NC_014554	TGC	2	6	2583126	2583131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181591
41100	NC_014554	CGAACA	2	12	2583145	2583156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308181591
41101	NC_014554	ACC	2	6	2583178	2583183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181591
41102	NC_014554	AGT	2	6	2583214	2583219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181591
41103	NC_014554	CAAC	2	8	2583230	2583237	50 %	0 %	0 %	50 %	308181591
41104	NC_014554	ACC	2	6	2583250	2583255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181591
41105	NC_014554	AGCC	2	8	2583325	2583332	25 %	0 %	25 %	50 %	308181591
41106	NC_014554	CAA	2	6	2583410	2583415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181591
41107	NC_014554	TGC	2	6	2583439	2583444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181591
41108	NC_014554	GTC	2	6	2583487	2583492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181591
41109	NC_014554	AATC	2	8	2584073	2584080	50 %	25 %	0 %	25 %	308181592
41110	NC_014554	AAC	2	6	2584155	2584160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181592
41111	NC_014554	GAT	2	6	2584163	2584168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181592
41112	NC_014554	TTC	2	6	2584242	2584247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181592
41113	NC_014554	ACC	2	6	2584248	2584253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181592
41114	NC_014554	GGC	2	6	2584284	2584289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181592
41115	NC_014554	GGC	2	6	2584308	2584313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181592
41116	NC_014554	CTT	2	6	2584316	2584321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181592
41117	NC_014554	CAT	3	9	2584389	2584397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181592
41118	NC_014554	ATC	2	6	2584425	2584430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181592
41119	NC_014554	AATA	2	8	2584432	2584439	75 %	25 %	0 %	0 %	308181592
41120	NC_014554	TCTCAG	2	12	2584469	2584480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181592
41121	NC_014554	CGT	2	6	2584487	2584492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181592
41122	NC_014554	AAT	2	6	2584561	2584566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181592
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41127	NC_014554	A	8	8	2584858	2584865	100 %	0 %	0 %	0 %	308181592
41128	NC_014554	ACG	2	6	2584876	2584881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181592
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41131	NC_014554	CGT	2	6	2585031	2585036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181592
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41139	NC_014554	TTAAT	2	10	2585459	2585468	40 %	60 %	0 %	0 %	308181593
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41142	NC_014554	GTC	2	6	2585595	2585600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181593
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41151	NC_014554	ATCTT	2	10	2586145	2586154	20 %	60 %	0 %	20 %	308181594
41152	NC_014554	TTG	2	6	2586219	2586224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181594
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41184	NC_014554	GCA	2	6	2588348	2588353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181595
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41202	NC_014554	ATC	2	6	2589423	2589428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181596
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41208	NC_014554	CGC	2	6	2589941	2589946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181597
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41218	NC_014554	CAG	2	6	2590380	2590385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181598
41219	NC_014554	TCA	2	6	2590400	2590405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181598
41220	NC_014554	TAGTGA	2	12	2590442	2590453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181598
41221	NC_014554	GCT	2	6	2590467	2590472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181598
41222	NC_014554	GGC	2	6	2590547	2590552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181598
41223	NC_014554	GCC	2	6	2590578	2590583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181598
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41225	NC_014554	AACG	2	8	2590716	2590723	50 %	0 %	25 %	25 %	308181598
41226	NC_014554	GGT	2	6	2590896	2590901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181598
41227	NC_014554	TGG	2	6	2590912	2590917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181598
41228	NC_014554	CAC	2	6	2590970	2590975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181598
41229	NC_014554	ACC	2	6	2591074	2591079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181598
41230	NC_014554	ACG	2	6	2591172	2591177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181598
41231	NC_014554	CTT	2	6	2591183	2591188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181598
41232	NC_014554	AAC	2	6	2591257	2591262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181598
41233	NC_014554	AAT	2	6	2591324	2591329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181598
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41235	NC_014554	CAT	2	6	2591569	2591574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181599
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41237	NC_014554	CTG	2	6	2592005	2592010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181599
41238	NC_014554	CAA	2	6	2592014	2592019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181599
41239	NC_014554	CTT	2	6	2592115	2592120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181599
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41243	NC_014554	GTC	2	6	2592316	2592321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181599
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41250	NC_014554	CAT	2	6	2592876	2592881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181600
41251	NC_014554	TCA	4	12	2592887	2592898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181600
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41257	NC_014554	TCG	3	9	2593397	2593405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181601
41258	NC_014554	CGT	2	6	2593437	2593442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181601
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41331	NC_014554	GAT	2	6	2597557	2597562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181605
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41346	NC_014554	TAATTG	2	12	2598241	2598252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308181605
41347	NC_014554	CTTATC	2	12	2598332	2598343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	308181605
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41352	NC_014554	GTT	2	6	2598680	2598685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181605
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41457	NC_014554	AAAT	2	8	2605756	2605763	75 %	25 %	0 %	0 %	308181613
41458	NC_014554	GAT	2	6	2605931	2605936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181613
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