MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_014554	GT	3	6	2517575	2517580	0 %	50 %	50 %	0 %	308181528
40002	NC_014554	GTT	2	6	2517598	2517603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181528
40003	NC_014554	ATG	2	6	2517660	2517665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181528
40004	NC_014554	TTC	2	6	2517698	2517703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181528
40005	NC_014554	GC	3	6	2517713	2517718	0 %	0 %	50 %	50 %	308181528
40006	NC_014554	ATG	2	6	2517726	2517731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181528
40007	NC_014554	TTA	2	6	2517741	2517746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181528
40008	NC_014554	AAT	2	6	2517750	2517755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181528
40009	NC_014554	GTCG	2	8	2517863	2517870	0 %	25 %	50 %	25 %	308181528
40010	NC_014554	ATC	2	6	2517983	2517988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181528
40011	NC_014554	ATCA	2	8	2518135	2518142	50 %	25 %	0 %	25 %	308181529
40012	NC_014554	TCA	3	9	2518140	2518148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181529
40013	NC_014554	GGC	2	6	2518163	2518168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181529
40014	NC_014554	CGG	2	6	2518195	2518200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181529
40015	NC_014554	ACG	2	6	2518290	2518295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181529
40016	NC_014554	CAAAC	2	10	2518339	2518348	60 %	0 %	0 %	40 %	308181529
40017	NC_014554	GTT	2	6	2518384	2518389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181529
40018	NC_014554	GGC	2	6	2518400	2518405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181529
40019	NC_014554	TA	3	6	2518426	2518431	50 %	50 %	0 %	0 %	308181529
40020	NC_014554	TTG	2	6	2518590	2518595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181529
40021	NC_014554	TTC	2	6	2518622	2518627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181529
40022	NC_014554	GTT	2	6	2518641	2518646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181529
40023	NC_014554	GAT	2	6	2518678	2518683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181529
40024	NC_014554	ATC	2	6	2518703	2518708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181529
40025	NC_014554	TTCT	2	8	2518739	2518746	0 %	75 %	0 %	25 %	308181529
40026	NC_014554	CGATTG	2	12	2518986	2518997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308181530
40027	NC_014554	ATC	2	6	2519003	2519008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181530
40028	NC_014554	AACG	2	8	2519084	2519091	50 %	0 %	25 %	25 %	308181530
40029	NC_014554	CGT	2	6	2519092	2519097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181530
40030	NC_014554	CGT	3	9	2519131	2519139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181530
40031	NC_014554	AAC	2	6	2519258	2519263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181530
40032	NC_014554	ACCT	2	8	2519279	2519286	25 %	25 %	0 %	50 %	308181530
40033	NC_014554	CAA	2	6	2519300	2519305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181530
40034	NC_014554	CAA	2	6	2519401	2519406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181530
40035	NC_014554	TAC	2	6	2519423	2519428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181530
40036	NC_014554	GAT	2	6	2519497	2519502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181530
40037	NC_014554	GTC	2	6	2519507	2519512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181530
40038	NC_014554	CATGGC	2	12	2519517	2519528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308181530
40039	NC_014554	AT	3	6	2519542	2519547	50 %	50 %	0 %	0 %	308181530
40040	NC_014554	TAA	2	6	2519548	2519553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181530
40041	NC_014554	AAT	2	6	2519929	2519934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181531
40042	NC_014554	AAG	2	6	2519978	2519983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181531
40043	NC_014554	CCAT	2	8	2519993	2520000	25 %	25 %	0 %	50 %	308181531
40044	NC_014554	GCG	2	6	2520024	2520029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181531
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40051	NC_014554	A	6	6	2520446	2520451	100 %	0 %	0 %	0 %	308181532
40052	NC_014554	ATC	2	6	2520468	2520473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181532
40053	NC_014554	TCA	2	6	2520540	2520545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181532
40054	NC_014554	GCT	2	6	2520555	2520560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181532
40055	NC_014554	GGCG	2	8	2520617	2520624	0 %	0 %	75 %	25 %	308181532
40056	NC_014554	ACA	2	6	2520678	2520683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181532
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40062	NC_014554	AAT	2	6	2520883	2520888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181533
40063	NC_014554	A	6	6	2520947	2520952	100 %	0 %	0 %	0 %	308181533
40064	NC_014554	CCG	2	6	2520977	2520982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181533
40065	NC_014554	AAGATA	2	12	2521022	2521033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308181533
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40070	NC_014554	GGC	2	6	2521328	2521333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181534
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40083	NC_014554	GCC	2	6	2521869	2521874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181535
40084	NC_014554	GC	3	6	2521944	2521949	0 %	0 %	50 %	50 %	308181535
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40087	NC_014554	TAG	2	6	2522680	2522685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181536
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40089	NC_014554	CATCTG	2	12	2522739	2522750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181536
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40097	NC_014554	GTTT	2	8	2523153	2523160	0 %	75 %	25 %	0 %	308181537
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40101	NC_014554	TGAT	2	8	2523303	2523310	25 %	50 %	25 %	0 %	308181537
40102	NC_014554	ATA	2	6	2523404	2523409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
40103	NC_014554	CTC	2	6	2523410	2523415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181537
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40105	NC_014554	T	6	6	2523484	2523489	0 %	100 %	0 %	0 %	308181537
40106	NC_014554	CCG	2	6	2523575	2523580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181537
40107	NC_014554	CTGT	2	8	2523610	2523617	0 %	50 %	25 %	25 %	308181537
40108	NC_014554	AAT	2	6	2523618	2523623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
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40116	NC_014554	ATT	2	6	2524201	2524206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181538
40117	NC_014554	ATA	2	6	2524235	2524240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181538
40118	NC_014554	AATTG	2	10	2524277	2524286	40 %	40 %	20 %	0 %	308181538
40119	NC_014554	CAT	2	6	2524294	2524299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181538
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40122	NC_014554	ACC	2	6	2524346	2524351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181538
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40201	NC_014554	ATA	3	9	2528319	2528327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181542
40202	NC_014554	ATT	2	6	2528363	2528368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181542
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40208	NC_014554	AAAT	2	8	2528739	2528746	75 %	25 %	0 %	0 %	308181543
40209	NC_014554	TTG	2	6	2528834	2528839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181543
40210	NC_014554	AGCA	2	8	2528912	2528919	50 %	0 %	25 %	25 %	308181543
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40212	NC_014554	TAG	2	6	2528983	2528988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181543
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40216	NC_014554	CTG	2	6	2529112	2529117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181543
40217	NC_014554	T	6	6	2529140	2529145	0 %	100 %	0 %	0 %	308181543
40218	NC_014554	ACC	2	6	2529268	2529273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181544
40219	NC_014554	AATA	2	8	2529277	2529284	75 %	25 %	0 %	0 %	308181544
40220	NC_014554	AGCC	2	8	2529319	2529326	25 %	0 %	25 %	50 %	308181544
40221	NC_014554	AGC	2	6	2529328	2529333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181544
40222	NC_014554	CTG	2	6	2529400	2529405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181544
40223	NC_014554	GT	3	6	2529435	2529440	0 %	50 %	50 %	0 %	308181544
40224	NC_014554	AGC	2	6	2529532	2529537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181544
40225	NC_014554	ATA	2	6	2529593	2529598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181544
40226	NC_014554	AC	3	6	2529654	2529659	50 %	0 %	0 %	50 %	308181544
40227	NC_014554	ATC	2	6	2529691	2529696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181544
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40229	NC_014554	TCGC	2	8	2529809	2529816	0 %	25 %	25 %	50 %	308181544
40230	NC_014554	CAC	2	6	2529843	2529848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181544
40231	NC_014554	GCT	2	6	2529851	2529856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181544
40232	NC_014554	GCT	2	6	2529869	2529874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181544
40233	NC_014554	CGG	2	6	2529885	2529890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181544
40234	NC_014554	TAT	2	6	2529897	2529902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181544
40235	NC_014554	T	6	6	2529921	2529926	0 %	100 %	0 %	0 %	308181544
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40237	NC_014554	GAC	2	6	2530539	2530544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181545
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40239	NC_014554	ATGT	2	8	2530705	2530712	25 %	50 %	25 %	0 %	308181545
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40242	NC_014554	TTA	2	6	2530793	2530798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181545
40243	NC_014554	CAT	2	6	2530821	2530826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181545
40244	NC_014554	GTC	2	6	2530909	2530914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181545
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40303	NC_014554	ACT	2	6	2534551	2534556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181550
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40311	NC_014554	AGC	2	6	2534833	2534838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181550
40312	NC_014554	TAT	2	6	2534847	2534852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181550
40313	NC_014554	GTGA	2	8	2534855	2534862	25 %	25 %	50 %	0 %	308181550
40314	NC_014554	ACA	2	6	2534868	2534873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181550
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40323	NC_014554	TCA	2	6	2535137	2535142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181551
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40329	NC_014554	TCAA	2	8	2535224	2535231	50 %	25 %	0 %	25 %	308181551
40330	NC_014554	TTG	2	6	2535742	2535747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181552
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40333	NC_014554	CGG	2	6	2535778	2535783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181552
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40337	NC_014554	GT	3	6	2536038	2536043	0 %	50 %	50 %	0 %	308181552
40338	NC_014554	AGA	2	6	2536052	2536057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181552
40339	NC_014554	TTGATA	2	12	2536131	2536142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308181552
40340	NC_014554	TTTTC	2	10	2536168	2536177	0 %	80 %	0 %	20 %	308181552
40341	NC_014554	ATA	2	6	2536197	2536202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181552
40342	NC_014554	ATT	2	6	2536208	2536213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181552
40343	NC_014554	TATC	2	8	2536240	2536247	25 %	50 %	0 %	25 %	308181552
40344	NC_014554	ATC	2	6	2536277	2536282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181552
40345	NC_014554	AGC	2	6	2536304	2536309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181552
40346	NC_014554	TTC	2	6	2536532	2536537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181553
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40348	NC_014554	TTC	2	6	2536569	2536574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181553
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40467	NC_014554	TTG	2	6	2545132	2545137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181562
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40491	NC_014554	TGA	2	6	2546005	2546010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181562
40492	NC_014554	ACG	2	6	2546021	2546026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181562
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