MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_014554	CAC	2	6	2318001	2318006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181354
37002	NC_014554	GTAAC	2	10	2318044	2318053	40 %	20 %	20 %	20 %	308181354
37003	NC_014554	GTC	2	6	2318069	2318074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
37004	NC_014554	AACC	2	8	2318217	2318224	50 %	0 %	0 %	50 %	308181354
37005	NC_014554	TCA	2	6	2318225	2318230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
37006	NC_014554	TTGC	2	8	2318363	2318370	0 %	50 %	25 %	25 %	308181354
37007	NC_014554	TTA	3	9	2318438	2318446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181354
37008	NC_014554	GTT	3	9	2318453	2318461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
37009	NC_014554	ATC	2	6	2318468	2318473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
37010	NC_014554	ACCG	2	8	2318524	2318531	25 %	0 %	25 %	50 %	308181354
37011	NC_014554	TTA	2	6	2318681	2318686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181354
37012	NC_014554	CTT	2	6	2318718	2318723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181354
37013	NC_014554	ATG	2	6	2318753	2318758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
37014	NC_014554	TTG	2	6	2318803	2318808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
37015	NC_014554	CCATT	2	10	2318957	2318966	20 %	40 %	0 %	40 %	308181354
37016	NC_014554	GATT	2	8	2318983	2318990	25 %	50 %	25 %	0 %	308181354
37017	NC_014554	GTT	2	6	2319022	2319027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
37018	NC_014554	CAT	2	6	2319190	2319195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
37019	NC_014554	TGA	2	6	2319199	2319204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
37020	NC_014554	GCC	2	6	2319218	2319223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181354
37021	NC_014554	GCTT	2	8	2319275	2319282	0 %	50 %	25 %	25 %	308181354
37022	NC_014554	TGGCT	2	10	2319414	2319423	0 %	40 %	40 %	20 %	308181354
37023	NC_014554	CCG	2	6	2319483	2319488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181354
37024	NC_014554	AGC	2	6	2319496	2319501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181354
37025	NC_014554	GGA	2	6	2319529	2319534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308181354
37026	NC_014554	GTA	2	6	2319611	2319616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181354
37027	NC_014554	CGT	3	9	2319619	2319627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181354
37028	NC_014554	TTG	2	6	2319736	2319741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181354
37029	NC_014554	AGC	2	6	2319754	2319759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181354
37030	NC_014554	GCA	2	6	2319831	2319836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181354
37031	NC_014554	AAT	2	6	2319851	2319856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181354
37032	NC_014554	TAC	2	6	2319862	2319867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181354
37033	NC_014554	T	7	7	2319868	2319874	0 %	100 %	0 %	0 %	308181354
37034	NC_014554	CAT	2	6	2320388	2320393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181355
37035	NC_014554	TGA	3	9	2320408	2320416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181355
37036	NC_014554	T	6	6	2320464	2320469	0 %	100 %	0 %	0 %	308181355
37037	NC_014554	TGT	2	6	2320485	2320490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181355
37038	NC_014554	TCAC	2	8	2320555	2320562	25 %	25 %	0 %	50 %	308181355
37039	NC_014554	ACTTA	2	10	2320566	2320575	40 %	40 %	0 %	20 %	308181355
37040	NC_014554	ACC	2	6	2320596	2320601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181355
37041	NC_014554	CA	3	6	2320610	2320615	50 %	0 %	0 %	50 %	308181355
37042	NC_014554	ACA	2	6	2320621	2320626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181355
37043	NC_014554	ATC	2	6	2320674	2320679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181355
37044	NC_014554	TA	3	6	2320698	2320703	50 %	50 %	0 %	0 %	308181355
37045	NC_014554	TTG	2	6	2320739	2320744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181355
37046	NC_014554	ACTA	2	8	2320776	2320783	50 %	25 %	0 %	25 %	308181355
37047	NC_014554	CCAT	2	8	2320806	2320813	25 %	25 %	0 %	50 %	308181356
37048	NC_014554	TCT	2	6	2320872	2320877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181356
37049	NC_014554	CAATA	2	10	2320886	2320895	60 %	20 %	0 %	20 %	308181356
37050	NC_014554	TAA	2	6	2320915	2320920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181356
37051	NC_014554	A	6	6	2320939	2320944	100 %	0 %	0 %	0 %	308181356
37052	NC_014554	CTG	2	6	2320971	2320976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181356
37053	NC_014554	AAT	2	6	2321126	2321131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181356
37054	NC_014554	A	7	7	2321174	2321180	100 %	0 %	0 %	0 %	308181356
37055	NC_014554	CAA	2	6	2321232	2321237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181356
37056	NC_014554	T	6	6	2321325	2321330	0 %	100 %	0 %	0 %	308181356
37057	NC_014554	TTC	2	6	2321338	2321343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181356
37058	NC_014554	GCA	2	6	2321375	2321380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181356
37059	NC_014554	ATT	2	6	2321383	2321388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181356
37060	NC_014554	TAA	2	6	2321394	2321399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181356
37061	NC_014554	AGC	3	9	2321419	2321427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181356
37062	NC_014554	CTGC	2	8	2321493	2321500	0 %	25 %	25 %	50 %	308181356
37063	NC_014554	CCAA	2	8	2321542	2321549	50 %	0 %	0 %	50 %	308181356
37064	NC_014554	CAT	2	6	2321559	2321564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181356
37065	NC_014554	GCCATC	2	12	2321606	2321617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308181356
37066	NC_014554	T	6	6	2321657	2321662	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
37067	NC_014554	GTTT	2	8	2321673	2321680	0 %	75 %	25 %	0 %	308181357
37068	NC_014554	T	6	6	2321678	2321683	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
37069	NC_014554	TAA	2	6	2321752	2321757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
37070	NC_014554	CGC	2	6	2321762	2321767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181357
37071	NC_014554	TAA	2	6	2321780	2321785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
37072	NC_014554	CAA	2	6	2321822	2321827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181357
37073	NC_014554	AC	3	6	2321934	2321939	50 %	0 %	0 %	50 %	308181357
37074	NC_014554	CAA	2	6	2321968	2321973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181357
37075	NC_014554	T	6	6	2322005	2322010	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
37076	NC_014554	CGC	2	6	2322023	2322028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181357
37077	NC_014554	T	6	6	2322041	2322046	0 %	100 %	0 %	0 %	308181357
37078	NC_014554	AAT	2	6	2322067	2322072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
37079	NC_014554	AT	3	6	2322084	2322089	50 %	50 %	0 %	0 %	308181357
37080	NC_014554	GGT	2	6	2322146	2322151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181357
37081	NC_014554	CCA	2	6	2322207	2322212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181357
37082	NC_014554	ACC	2	6	2322248	2322253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181357
37083	NC_014554	AAT	2	6	2322257	2322262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181357
37084	NC_014554	AT	3	6	2322322	2322327	50 %	50 %	0 %	0 %	308181357
37085	NC_014554	GTT	2	6	2322430	2322435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
37086	NC_014554	T	6	6	2322434	2322439	0 %	100 %	0 %	0 %	308181358
37087	NC_014554	CTT	2	6	2322451	2322456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181358
37088	NC_014554	ATC	2	6	2322512	2322517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
37089	NC_014554	T	6	6	2322582	2322587	0 %	100 %	0 %	0 %	308181358
37090	NC_014554	ACC	2	6	2322596	2322601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181358
37091	NC_014554	CTA	2	6	2322604	2322609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
37092	NC_014554	CGA	2	6	2322612	2322617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181358
37093	NC_014554	TGT	2	6	2322651	2322656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
37094	NC_014554	CAG	2	6	2322730	2322735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181358
37095	NC_014554	TGC	2	6	2322737	2322742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181358
37096	NC_014554	TTG	2	6	2322752	2322757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181358
37097	NC_014554	TCA	2	6	2322777	2322782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181358
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37099	NC_014554	ACA	2	6	2322825	2322830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181358
37100	NC_014554	GCT	2	6	2322960	2322965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181359
37101	NC_014554	ATT	2	6	2322978	2322983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181359
37102	NC_014554	TCT	2	6	2322990	2322995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181359
37103	NC_014554	A	6	6	2323125	2323130	100 %	0 %	0 %	0 %	308181359
37104	NC_014554	ATT	2	6	2323142	2323147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181359
37105	NC_014554	GAT	2	6	2323219	2323224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181359
37106	NC_014554	ATA	2	6	2323247	2323252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181359
37107	NC_014554	CAAT	2	8	2323312	2323319	50 %	25 %	0 %	25 %	308181359
37108	NC_014554	T	6	6	2323416	2323421	0 %	100 %	0 %	0 %	308181359
37109	NC_014554	CCTTGT	2	12	2323431	2323442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	308181359
37110	NC_014554	T	6	6	2323442	2323447	0 %	100 %	0 %	0 %	308181359
37111	NC_014554	CAT	2	6	2323507	2323512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181359
37112	NC_014554	AATCA	2	10	2323583	2323592	60 %	20 %	0 %	20 %	308181359
37113	NC_014554	ACA	2	6	2324351	2324356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181360
37114	NC_014554	CGA	2	6	2324399	2324404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181360
37115	NC_014554	TTC	2	6	2324407	2324412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181360
37116	NC_014554	CGG	2	6	2324498	2324503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181360
37117	NC_014554	GTG	2	6	2324512	2324517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181360
37118	NC_014554	GAA	2	6	2324559	2324564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181360
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37230	NC_014554	GC	4	8	2332421	2332428	0 %	0 %	50 %	50 %	308181368
37231	NC_014554	CTT	2	6	2332485	2332490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181368
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