MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_014554	GCC	2	6	2217404	2217409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181257
35502	NC_014554	AAC	2	6	2217457	2217462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181257
35503	NC_014554	CGT	2	6	2217507	2217512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181257
35504	NC_014554	GCC	2	6	2217645	2217650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181257
35505	NC_014554	AAT	2	6	2217670	2217675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181257
35506	NC_014554	CG	3	6	2217956	2217961	0 %	0 %	50 %	50 %	308181258
35507	NC_014554	TTC	2	6	2217998	2218003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181258
35508	NC_014554	CAT	2	6	2218046	2218051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181258
35509	NC_014554	TTG	2	6	2218156	2218161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181258
35510	NC_014554	CAA	2	6	2218309	2218314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181258
35511	NC_014554	GAT	2	6	2218344	2218349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181258
35512	NC_014554	GTC	2	6	2218560	2218565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181259
35513	NC_014554	CCCA	2	8	2218638	2218645	25 %	0 %	0 %	75 %	308181259
35514	NC_014554	AATG	2	8	2218663	2218670	50 %	25 %	25 %	0 %	308181259
35515	NC_014554	AACTA	2	10	2218673	2218682	60 %	20 %	0 %	20 %	308181259
35516	NC_014554	CAA	2	6	2218702	2218707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181259
35517	NC_014554	TCA	2	6	2218784	2218789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181260
35518	NC_014554	GTA	2	6	2218832	2218837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181260
35519	NC_014554	CAT	2	6	2218872	2218877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181260
35520	NC_014554	TAA	2	6	2218908	2218913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181260
35521	NC_014554	GCA	2	6	2218994	2218999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181260
35522	NC_014554	ACCT	2	8	2219332	2219339	25 %	25 %	0 %	50 %	308181261
35523	NC_014554	TCG	2	6	2219358	2219363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181261
35524	NC_014554	TTC	2	6	2219507	2219512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181261
35525	NC_014554	ATT	2	6	2219551	2219556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181261
35526	NC_014554	TGGCCA	2	12	2219633	2219644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308181261
35527	NC_014554	GTC	2	6	2219662	2219667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181261
35528	NC_014554	TA	3	6	2219732	2219737	50 %	50 %	0 %	0 %	308181261
35529	NC_014554	TGG	2	6	2219746	2219751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181261
35530	NC_014554	TCA	2	6	2219798	2219803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181261
35531	NC_014554	CAA	2	6	2219890	2219895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181261
35532	NC_014554	CTGG	2	8	2220055	2220062	0 %	25 %	50 %	25 %	308181261
35533	NC_014554	TTGAAC	2	12	2220095	2220106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308181261
35534	NC_014554	GCA	2	6	2220116	2220121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181261
35535	NC_014554	GAA	2	6	2220151	2220156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181261
35536	NC_014554	TCA	2	6	2220161	2220166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181261
35537	NC_014554	AAT	2	6	2220201	2220206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181261
35538	NC_014554	CAAC	2	8	2220298	2220305	50 %	0 %	0 %	50 %	308181261
35539	NC_014554	GAC	2	6	2220340	2220345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181261
35540	NC_014554	GACCA	2	10	2220376	2220385	40 %	0 %	20 %	40 %	308181261
35541	NC_014554	TAA	2	6	2220412	2220417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181261
35542	NC_014554	AGATT	2	10	2220764	2220773	40 %	40 %	20 %	0 %	308181262
35543	NC_014554	CTT	2	6	2220806	2220811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181262
35544	NC_014554	AAG	2	6	2220853	2220858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181262
35545	NC_014554	CAAG	2	8	2220875	2220882	50 %	0 %	25 %	25 %	308181262
35546	NC_014554	CGC	2	6	2220942	2220947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181262
35547	NC_014554	TTGA	2	8	2221059	2221066	25 %	50 %	25 %	0 %	308181262
35548	NC_014554	AAT	2	6	2221067	2221072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181262
35549	NC_014554	CAA	2	6	2221221	2221226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181262
35550	NC_014554	ACAG	2	8	2221243	2221250	50 %	0 %	25 %	25 %	308181262
35551	NC_014554	TTG	2	6	2221440	2221445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181262
35552	NC_014554	CTT	2	6	2221481	2221486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181262
35553	NC_014554	TAA	2	6	2221523	2221528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181262
35554	NC_014554	GA	3	6	2221589	2221594	50 %	0 %	50 %	0 %	308181262
35555	NC_014554	AAT	2	6	2221625	2221630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181262
35556	NC_014554	CCAA	2	8	2221634	2221641	50 %	0 %	0 %	50 %	308181262
35557	NC_014554	TCG	2	6	2221667	2221672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181262
35558	NC_014554	TCA	2	6	2221675	2221680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181262
35559	NC_014554	AAT	2	6	2221683	2221688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181262
35560	NC_014554	GAT	2	6	2221722	2221727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181262
35561	NC_014554	ACC	2	6	2221740	2221745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181262
35562	NC_014554	TGA	2	6	2221757	2221762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181262
35563	NC_014554	CCGA	2	8	2221770	2221777	25 %	0 %	25 %	50 %	308181262
35564	NC_014554	CAT	2	6	2221826	2221831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181262
35565	NC_014554	ATT	2	6	2221836	2221841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181262
35566	NC_014554	CATC	2	8	2221889	2221896	25 %	25 %	0 %	50 %	308181262
35567	NC_014554	GTT	2	6	2221919	2221924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181262
35568	NC_014554	TGT	2	6	2222228	2222233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181262
35569	NC_014554	CTT	2	6	2222418	2222423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181263
35570	NC_014554	CG	3	6	2222479	2222484	0 %	0 %	50 %	50 %	308181263
35571	NC_014554	GCG	2	6	2222497	2222502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181263
35572	NC_014554	TCAGCT	2	12	2222584	2222595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181263
35573	NC_014554	CAT	2	6	2222615	2222620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181263
35574	NC_014554	CGT	2	6	2222645	2222650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181263
35575	NC_014554	TCGGCC	2	12	2222707	2222718	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308181263
35576	NC_014554	CGT	2	6	2222724	2222729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181263
35577	NC_014554	AAT	2	6	2222744	2222749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181263
35578	NC_014554	GTC	2	6	2222802	2222807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181263
35579	NC_014554	TCA	2	6	2222827	2222832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181263
35580	NC_014554	ATTA	2	8	2222841	2222848	50 %	50 %	0 %	0 %	308181263
35581	NC_014554	CGT	2	6	2222867	2222872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181263
35582	NC_014554	TGA	2	6	2223978	2223983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181264
35583	NC_014554	TAA	2	6	2223996	2224001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181264
35584	NC_014554	ATT	2	6	2224005	2224010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181264
35585	NC_014554	A	6	6	2224166	2224171	100 %	0 %	0 %	0 %	308181264
35586	NC_014554	ATA	2	6	2224259	2224264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181264
35587	NC_014554	TGA	2	6	2224266	2224271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181264
35588	NC_014554	AAC	2	6	2224378	2224383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181264
35589	NC_014554	TTGA	2	8	2224384	2224391	25 %	50 %	25 %	0 %	308181264
35590	NC_014554	A	6	6	2224409	2224414	100 %	0 %	0 %	0 %	308181264
35591	NC_014554	CTA	2	6	2224581	2224586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181265
35592	NC_014554	GTT	2	6	2224628	2224633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181265
35593	NC_014554	AAG	2	6	2224635	2224640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181265
35594	NC_014554	CTA	2	6	2224641	2224646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181265
35595	NC_014554	CTTAA	2	10	2224784	2224793	40 %	40 %	0 %	20 %	308181265
35596	NC_014554	AGC	2	6	2224797	2224802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181265
35597	NC_014554	AGT	2	6	2224829	2224834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181265
35598	NC_014554	AAC	2	6	2224837	2224842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181265
35599	NC_014554	A	6	6	2224856	2224861	100 %	0 %	0 %	0 %	308181265
35600	NC_014554	CAT	2	6	2224862	2224867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181265
35601	NC_014554	CGA	2	6	2225041	2225046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181265
35602	NC_014554	CAT	2	6	2225104	2225109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181265
35603	NC_014554	CTT	2	6	2225149	2225154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181265
35604	NC_014554	ATT	2	6	2225163	2225168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181265
35605	NC_014554	ATT	2	6	2225376	2225381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181265
35606	NC_014554	AGC	2	6	2225575	2225580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181265
35607	NC_014554	TCA	2	6	2225652	2225657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181265
35608	NC_014554	TTTA	2	8	2225762	2225769	25 %	75 %	0 %	0 %	308181265
35609	NC_014554	TCAAAA	2	12	2225787	2225798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	308181265
35610	NC_014554	A	7	7	2225802	2225808	100 %	0 %	0 %	0 %	308181265
35611	NC_014554	GAC	2	6	2226079	2226084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181266
35612	NC_014554	TGG	2	6	2226092	2226097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181266
35613	NC_014554	GTC	2	6	2226112	2226117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181266
35614	NC_014554	AATACT	2	12	2226257	2226268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308181266
35615	NC_014554	AATCA	2	10	2226491	2226500	60 %	20 %	0 %	20 %	308181267
35616	NC_014554	CAT	2	6	2226569	2226574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181267
35617	NC_014554	AGC	2	6	2226602	2226607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35618	NC_014554	CATT	2	8	2226682	2226689	25 %	50 %	0 %	25 %	308181267
35619	NC_014554	TAA	2	6	2226713	2226718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181267
35620	NC_014554	TCG	2	6	2226733	2226738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35621	NC_014554	GTC	2	6	2226996	2227001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35622	NC_014554	AAT	2	6	2227017	2227022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181267
35623	NC_014554	CGA	2	6	2227039	2227044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35624	NC_014554	CAG	2	6	2227111	2227116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35625	NC_014554	CGGC	2	8	2227123	2227130	0 %	0 %	50 %	50 %	308181267
35626	NC_014554	CGT	2	6	2227172	2227177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35627	NC_014554	TTG	2	6	2227182	2227187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181267
35628	NC_014554	ACC	2	6	2227208	2227213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181267
35629	NC_014554	TTTGC	2	10	2227228	2227237	0 %	60 %	20 %	20 %	308181267
35630	NC_014554	ATC	2	6	2227253	2227258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181267
35631	NC_014554	TGC	2	6	2227262	2227267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35632	NC_014554	CACC	2	8	2227294	2227301	25 %	0 %	0 %	75 %	308181267
35633	NC_014554	TAA	2	6	2227380	2227385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181267
35634	NC_014554	GTTG	2	8	2227426	2227433	0 %	50 %	50 %	0 %	308181267
35635	NC_014554	AATA	2	8	2227455	2227462	75 %	25 %	0 %	0 %	308181267
35636	NC_014554	TAA	2	6	2227550	2227555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181267
35637	NC_014554	ATGA	2	8	2227578	2227585	50 %	25 %	25 %	0 %	308181267
35638	NC_014554	ACG	2	6	2227618	2227623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35639	NC_014554	CTT	2	6	2227654	2227659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181267
35640	NC_014554	T	7	7	2227658	2227664	0 %	100 %	0 %	0 %	308181267
35641	NC_014554	CAT	2	6	2227718	2227723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181267
35642	NC_014554	GAA	2	6	2227730	2227735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181267
35643	NC_014554	TGGC	2	8	2227773	2227780	0 %	25 %	50 %	25 %	308181267
35644	NC_014554	GTG	2	6	2227841	2227846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181267
35645	NC_014554	CCG	2	6	2227975	2227980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181267
35646	NC_014554	AGC	2	6	2228000	2228005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35647	NC_014554	TCG	2	6	2228179	2228184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35648	NC_014554	TGAC	2	8	2228263	2228270	25 %	25 %	25 %	25 %	308181267
35649	NC_014554	ACC	2	6	2228327	2228332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181267
35650	NC_014554	TCCCAA	2	12	2228377	2228388	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308181267
35651	NC_014554	GCT	2	6	2228397	2228402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181267
35652	NC_014554	TGAC	2	8	2228432	2228439	25 %	25 %	25 %	25 %	308181267
35653	NC_014554	CAT	2	6	2228696	2228701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181268
35654	NC_014554	TCT	2	6	2228889	2228894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181268
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35656	NC_014554	CAT	2	6	2228935	2228940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181268
35657	NC_014554	ACATGC	2	12	2229061	2229072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308181268
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35667	NC_014554	TTC	2	6	2229428	2229433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181268
35668	NC_014554	ATA	2	6	2229437	2229442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181268
35669	NC_014554	ATTG	2	8	2229446	2229453	25 %	50 %	25 %	0 %	308181268
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35672	NC_014554	TGCGCC	2	12	2229599	2229610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308181268
35673	NC_014554	AAT	2	6	2229611	2229616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181268
35674	NC_014554	GTC	2	6	2230259	2230264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181269
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35677	NC_014554	TGA	2	6	2230425	2230430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181269
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35683	NC_014554	GCC	2	6	2230670	2230675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181269
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35685	NC_014554	CAGC	2	8	2230737	2230744	25 %	0 %	25 %	50 %	308181269
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35687	NC_014554	ACT	2	6	2230858	2230863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181269
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35691	NC_014554	CAC	2	6	2231113	2231118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181269
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35721	NC_014554	AAG	2	6	2232970	2232975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181271
35722	NC_014554	CAA	2	6	2232977	2232982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181271
35723	NC_014554	CAA	3	9	2233041	2233049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181271
35724	NC_014554	GCC	2	6	2233215	2233220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181271
35725	NC_014554	CAA	2	6	2233223	2233228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181271
35726	NC_014554	GTC	2	6	2233243	2233248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181271
35727	NC_014554	ACC	2	6	2233254	2233259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181271
35728	NC_014554	TAT	2	6	2233337	2233342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181271
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35730	NC_014554	AAT	2	6	2233353	2233358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181271
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35732	NC_014554	CTT	2	6	2233518	2233523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181271
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35843	NC_014554	TAA	2	6	2241615	2241620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181280
35844	NC_014554	AATC	2	8	2241626	2241633	50 %	25 %	0 %	25 %	308181280
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