MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014554	TAT	2	6	150645	150650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179331
2502	NC_014554	GAA	2	6	150654	150659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179331
2503	NC_014554	TTG	2	6	150724	150729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179331
2504	NC_014554	TGA	2	6	150878	150883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179331
2505	NC_014554	TAT	2	6	150930	150935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179331
2506	NC_014554	TGC	2	6	150943	150948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179331
2507	NC_014554	AAC	2	6	151006	151011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179331
2508	NC_014554	TACC	2	8	151016	151023	25 %	25 %	0 %	50 %	308179331
2509	NC_014554	TGA	2	6	151028	151033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179331
2510	NC_014554	AGC	2	6	151046	151051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179331
2511	NC_014554	GCGCAA	2	12	151071	151082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179331
2512	NC_014554	TGG	2	6	151103	151108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179331
2513	NC_014554	GTG	2	6	151129	151134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179331
2514	NC_014554	TAG	2	6	151544	151549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179332
2515	NC_014554	AAG	2	6	151632	151637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2516	NC_014554	GTTAAG	2	12	151644	151655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179332
2517	NC_014554	TGA	2	6	151676	151681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179332
2518	NC_014554	CAACG	2	10	151811	151820	40 %	0 %	20 %	40 %	308179332
2519	NC_014554	GAA	2	6	151823	151828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2520	NC_014554	TAC	2	6	151890	151895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179332
2521	NC_014554	AAG	2	6	151899	151904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2522	NC_014554	AAG	2	6	151959	151964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2523	NC_014554	CTT	2	6	152000	152005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179332
2524	NC_014554	TCA	2	6	152041	152046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179332
2525	NC_014554	TGG	2	6	152054	152059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179332
2526	NC_014554	AAG	2	6	152091	152096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2527	NC_014554	TAA	2	6	152225	152230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179332
2528	NC_014554	CTG	3	9	152233	152241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179332
2529	NC_014554	AAG	2	6	152274	152279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179332
2530	NC_014554	GGT	2	6	152349	152354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179332
2531	NC_014554	ACT	2	6	152374	152379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179332
2532	NC_014554	CTG	2	6	152392	152397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179332
2533	NC_014554	GCT	2	6	152481	152486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179332
2534	NC_014554	TGC	2	6	152618	152623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179332
2535	NC_014554	GCT	2	6	152649	152654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179332
2536	NC_014554	AAAG	2	8	152835	152842	75 %	0 %	25 %	0 %	308179333
2537	NC_014554	ATT	2	6	152857	152862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2538	NC_014554	ATT	3	9	152914	152922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2539	NC_014554	TTAA	2	8	153115	153122	50 %	50 %	0 %	0 %	308179333
2540	NC_014554	TAG	2	6	153170	153175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
2541	NC_014554	TGG	2	6	153177	153182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179333
2542	NC_014554	TTAT	2	8	153189	153196	25 %	75 %	0 %	0 %	308179333
2543	NC_014554	ACT	2	6	153255	153260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179333
2544	NC_014554	CCA	2	6	153295	153300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179333
2545	NC_014554	ATTGG	3	15	153309	153323	20 %	40 %	40 %	0 %	308179333
2546	NC_014554	TTC	2	6	153346	153351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179333
2547	NC_014554	AGT	2	6	153355	153360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
2548	NC_014554	TTGG	2	8	153386	153393	0 %	50 %	50 %	0 %	308179333
2549	NC_014554	ATT	3	9	153430	153438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2550	NC_014554	TCA	2	6	153473	153478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179333
2551	NC_014554	CTT	2	6	153489	153494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179333
2552	NC_014554	TAT	3	9	153681	153689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2553	NC_014554	GGTT	2	8	153697	153704	0 %	50 %	50 %	0 %	308179333
2554	NC_014554	AGA	2	6	153756	153761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179333
2555	NC_014554	CAA	2	6	153810	153815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179333
2556	NC_014554	GAT	2	6	153894	153899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179333
2557	NC_014554	AAC	2	6	153984	153989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179333
2558	NC_014554	CAC	2	6	153998	154003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179333
2559	NC_014554	ATT	2	6	154033	154038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179333
2560	NC_014554	ATTG	2	8	154062	154069	25 %	50 %	25 %	0 %	308179333
2561	NC_014554	AAG	2	6	154075	154080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179333
2562	NC_014554	GC	3	6	154164	154169	0 %	0 %	50 %	50 %	308179334
2563	NC_014554	ATT	4	12	154226	154237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179334
2564	NC_014554	TCA	2	6	154257	154262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179334
2565	NC_014554	TGG	2	6	154306	154311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
2566	NC_014554	ATT	2	6	154385	154390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179334
2567	NC_014554	ACCA	2	8	154510	154517	50 %	0 %	0 %	50 %	308179334
2568	NC_014554	TAC	2	6	154535	154540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179334
2569	NC_014554	TGG	3	9	154600	154608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
2570	NC_014554	TGA	2	6	154629	154634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179334
2571	NC_014554	CATT	2	8	154854	154861	25 %	50 %	0 %	25 %	308179334
2572	NC_014554	CAA	2	6	154877	154882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179334
2573	NC_014554	TGC	2	6	154927	154932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179334
2574	NC_014554	TTC	2	6	154937	154942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179334
2575	NC_014554	TTC	2	6	154955	154960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179334
2576	NC_014554	TGG	2	6	154978	154983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179334
2577	NC_014554	AAAAC	2	10	155037	155046	80 %	0 %	0 %	20 %	308179335
2578	NC_014554	TCCGG	2	10	155056	155065	0 %	20 %	40 %	40 %	308179335
2579	NC_014554	T	6	6	155066	155071	0 %	100 %	0 %	0 %	308179335
2580	NC_014554	GAA	2	6	155091	155096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179335
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2582	NC_014554	TTTA	2	8	155140	155147	25 %	75 %	0 %	0 %	308179335
2583	NC_014554	CA	3	6	155229	155234	50 %	0 %	0 %	50 %	308179335
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2586	NC_014554	ACGA	2	8	155366	155373	50 %	0 %	25 %	25 %	308179335
2587	NC_014554	TCGG	2	8	155432	155439	0 %	25 %	50 %	25 %	308179335
2588	NC_014554	TGA	2	6	155532	155537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179335
2589	NC_014554	ATTA	2	8	155566	155573	50 %	50 %	0 %	0 %	308179335
2590	NC_014554	GCG	2	6	155606	155611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179335
2591	NC_014554	TTC	2	6	155612	155617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179335
2592	NC_014554	ATA	2	6	155634	155639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179335
2593	NC_014554	TTAAC	2	10	155673	155682	40 %	40 %	0 %	20 %	308179335
2594	NC_014554	TGA	3	9	155685	155693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179335
2595	NC_014554	GTTGT	2	10	155786	155795	0 %	60 %	40 %	0 %	308179335
2596	NC_014554	ACGCAA	2	12	155900	155911	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308179336
2597	NC_014554	GAT	2	6	155923	155928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179336
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2599	NC_014554	CTG	2	6	155982	155987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2600	NC_014554	CAAT	2	8	156036	156043	50 %	25 %	0 %	25 %	308179336
2601	NC_014554	ACG	2	6	156258	156263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2602	NC_014554	AC	3	6	156354	156359	50 %	0 %	0 %	50 %	308179336
2603	NC_014554	GTCT	2	8	156537	156544	0 %	50 %	25 %	25 %	308179336
2604	NC_014554	ACG	2	6	156585	156590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2605	NC_014554	CTT	2	6	156700	156705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179336
2606	NC_014554	ATG	2	6	156728	156733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179336
2607	NC_014554	TAA	2	6	156763	156768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179336
2608	NC_014554	ACCA	2	8	156837	156844	50 %	0 %	0 %	50 %	308179336
2609	NC_014554	TGC	2	6	156943	156948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2610	NC_014554	AGA	2	6	156970	156975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179336
2611	NC_014554	TTAC	2	8	156990	156997	25 %	50 %	0 %	25 %	308179336
2612	NC_014554	AGGTC	2	10	157039	157048	20 %	20 %	40 %	20 %	308179336
2613	NC_014554	CAG	2	6	157050	157055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2614	NC_014554	AGC	2	6	157069	157074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179336
2615	NC_014554	ATTA	2	8	157153	157160	50 %	50 %	0 %	0 %	308179336
2616	NC_014554	CGG	2	6	157176	157181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179336
2617	NC_014554	A	6	6	157342	157347	100 %	0 %	0 %	0 %	308179337
2618	NC_014554	TCT	2	6	157412	157417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179337
2619	NC_014554	GAT	2	6	157458	157463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179337
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2621	NC_014554	A	6	6	157533	157538	100 %	0 %	0 %	0 %	308179337
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2742	NC_014554	TCA	2	6	166193	166198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179342
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2862	NC_014554	TCA	2	6	173983	173988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179346
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2981	NC_014554	TAGC	2	8	184005	184012	25 %	25 %	25 %	25 %	308179352
2982	NC_014554	ATT	2	6	184081	184086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179352
2983	NC_014554	CGC	2	6	184107	184112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179352
2984	NC_014554	TTG	2	6	184133	184138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179352
2985	NC_014554	T	6	6	184210	184215	0 %	100 %	0 %	0 %	308179352
2986	NC_014554	TGG	2	6	184305	184310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179352
2987	NC_014554	GAA	2	6	184363	184368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179352
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2991	NC_014554	TAT	3	9	184692	184700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179352
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2993	NC_014554	CCG	2	6	185197	185202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179353
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