MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014554	TGTA	2	8	1352223	1352230	25 %	50 %	25 %	0 %	308180407
21502	NC_014554	GTG	2	6	1352708	1352713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180408
21503	NC_014554	TGGT	2	8	1352750	1352757	0 %	50 %	50 %	0 %	308180408
21504	NC_014554	TTTTA	2	10	1352855	1352864	20 %	80 %	0 %	0 %	308180408
21505	NC_014554	ATC	2	6	1352923	1352928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180408
21506	NC_014554	TTGG	2	8	1352971	1352978	0 %	50 %	50 %	0 %	308180408
21507	NC_014554	AGA	2	6	1353006	1353011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180408
21508	NC_014554	GCAG	2	8	1353037	1353044	25 %	0 %	50 %	25 %	308180408
21509	NC_014554	ATT	2	6	1353045	1353050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180408
21510	NC_014554	TAG	2	6	1353071	1353076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180408
21511	NC_014554	TAAG	2	8	1353170	1353177	50 %	25 %	25 %	0 %	308180408
21512	NC_014554	GTT	3	9	1353351	1353359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180409
21513	NC_014554	ATT	2	6	1353385	1353390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180409
21514	NC_014554	GGTGTT	2	12	1353449	1353460	0 %	50 %	50 %	0 %	308180409
21515	NC_014554	GAA	2	6	1353514	1353519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180409
21516	NC_014554	TGA	2	6	1353522	1353527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180409
21517	NC_014554	CAAA	2	8	1353546	1353553	75 %	0 %	0 %	25 %	308180409
21518	NC_014554	CCA	2	6	1353554	1353559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180409
21519	NC_014554	GAA	2	6	1353562	1353567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180409
21520	NC_014554	TCT	3	9	1353648	1353656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180409
21521	NC_014554	TTC	2	6	1353658	1353663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180409
21522	NC_014554	GTA	2	6	1353799	1353804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180409
21523	NC_014554	AGT	2	6	1353833	1353838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180409
21524	NC_014554	ACC	2	6	1353853	1353858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180409
21525	NC_014554	TTC	2	6	1353919	1353924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180409
21526	NC_014554	GTC	2	6	1353929	1353934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180409
21527	NC_014554	GCT	2	6	1353935	1353940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180409
21528	NC_014554	T	6	6	1353957	1353962	0 %	100 %	0 %	0 %	308180409
21529	NC_014554	T	6	6	1353987	1353992	0 %	100 %	0 %	0 %	308180409
21530	NC_014554	TTG	2	6	1353994	1353999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180409
21531	NC_014554	GTT	2	6	1354014	1354019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180409
21532	NC_014554	ATC	2	6	1354025	1354030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180409
21533	NC_014554	GAT	2	6	1354069	1354074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180409
21534	NC_014554	GTT	2	6	1354087	1354092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180409
21535	NC_014554	AAAC	2	8	1354152	1354159	75 %	0 %	0 %	25 %	308180409
21536	NC_014554	CA	3	6	1354189	1354194	50 %	0 %	0 %	50 %	308180409
21537	NC_014554	T	7	7	1354246	1354252	0 %	100 %	0 %	0 %	308180409
21538	NC_014554	AAC	2	6	1354417	1354422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180410
21539	NC_014554	ACGA	2	8	1354492	1354499	50 %	0 %	25 %	25 %	308180410
21540	NC_014554	CGC	2	6	1354509	1354514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180410
21541	NC_014554	A	6	6	1354832	1354837	100 %	0 %	0 %	0 %	308180411
21542	NC_014554	CAAA	2	8	1354882	1354889	75 %	0 %	0 %	25 %	308180411
21543	NC_014554	ACA	2	6	1354902	1354907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180411
21544	NC_014554	TGA	2	6	1355049	1355054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180411
21545	NC_014554	CGC	2	6	1355084	1355089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180411
21546	NC_014554	CTGC	2	8	1355113	1355120	0 %	25 %	25 %	50 %	308180411
21547	NC_014554	TGC	2	6	1355223	1355228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180411
21548	NC_014554	CATC	2	8	1355268	1355275	25 %	25 %	0 %	50 %	308180411
21549	NC_014554	GTTG	2	8	1355346	1355353	0 %	50 %	50 %	0 %	308180411
21550	NC_014554	ATT	2	6	1355487	1355492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180411
21551	NC_014554	GCT	2	6	1355560	1355565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180411
21552	NC_014554	TAA	2	6	1355704	1355709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180412
21553	NC_014554	CAA	2	6	1355717	1355722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180412
21554	NC_014554	TCG	2	6	1355742	1355747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180412
21555	NC_014554	TTA	2	6	1355753	1355758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180412
21556	NC_014554	GCCG	2	8	1355764	1355771	0 %	0 %	50 %	50 %	308180412
21557	NC_014554	CAC	2	6	1355798	1355803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180412
21558	NC_014554	GAA	2	6	1355860	1355865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180412
21559	NC_014554	ACG	2	6	1355879	1355884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180412
21560	NC_014554	GTG	2	6	1355895	1355900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180412
21561	NC_014554	ATT	2	6	1355902	1355907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180412
21562	NC_014554	TAT	2	6	1355921	1355926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180412
21563	NC_014554	CGCA	2	8	1355958	1355965	25 %	0 %	25 %	50 %	308180412
21564	NC_014554	TGA	2	6	1356109	1356114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180412
21565	NC_014554	T	6	6	1356134	1356139	0 %	100 %	0 %	0 %	308180412
21566	NC_014554	AAC	2	6	1356165	1356170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180412
21567	NC_014554	CCG	2	6	1356195	1356200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180412
21568	NC_014554	TCGT	2	8	1356421	1356428	0 %	50 %	25 %	25 %	308180413
21569	NC_014554	GAA	2	6	1356441	1356446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180413
21570	NC_014554	CCG	2	6	1356973	1356978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180414
21571	NC_014554	GAA	2	6	1357074	1357079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180414
21572	NC_014554	TGA	2	6	1357136	1357141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180414
21573	NC_014554	GAA	2	6	1357149	1357154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180414
21574	NC_014554	AGC	2	6	1357163	1357168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180414
21575	NC_014554	GACGT	2	10	1357200	1357209	20 %	20 %	40 %	20 %	308180414
21576	NC_014554	ATT	2	6	1357257	1357262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180414
21577	NC_014554	TTG	2	6	1357303	1357308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180414
21578	NC_014554	TGA	2	6	1357313	1357318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180414
21579	NC_014554	GAA	2	6	1357323	1357328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180414
21580	NC_014554	TAC	2	6	1357332	1357337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180414
21581	NC_014554	CCCG	2	8	1357371	1357378	0 %	0 %	25 %	75 %	308180414
21582	NC_014554	CTA	2	6	1357416	1357421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180414
21583	NC_014554	CGCA	2	8	1357422	1357429	25 %	0 %	25 %	50 %	308180414
21584	NC_014554	CTG	2	6	1357435	1357440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180414
21585	NC_014554	GAT	2	6	1357527	1357532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180414
21586	NC_014554	TCA	2	6	1357553	1357558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180414
21587	NC_014554	TTTG	2	8	1357634	1357641	0 %	75 %	25 %	0 %	308180414
21588	NC_014554	CTT	2	6	1357673	1357678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180414
21589	NC_014554	AGA	2	6	1357829	1357834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180414
21590	NC_014554	TGG	2	6	1357838	1357843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180414
21591	NC_014554	ATT	2	6	1357998	1358003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180415
21592	NC_014554	ACGG	2	8	1358047	1358054	25 %	0 %	50 %	25 %	308180415
21593	NC_014554	A	6	6	1358096	1358101	100 %	0 %	0 %	0 %	308180415
21594	NC_014554	ATC	2	6	1358148	1358153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180415
21595	NC_014554	TGG	2	6	1358266	1358271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180415
21596	NC_014554	AAG	2	6	1358285	1358290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180415
21597	NC_014554	TGA	2	6	1358350	1358355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180415
21598	NC_014554	AGTT	2	8	1358358	1358365	25 %	50 %	25 %	0 %	308180415
21599	NC_014554	AAG	2	6	1358370	1358375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180415
21600	NC_014554	GATG	2	8	1358443	1358450	25 %	25 %	50 %	0 %	308180415
21601	NC_014554	ATT	2	6	1358456	1358461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180415
21602	NC_014554	GTG	2	6	1358484	1358489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180415
21603	NC_014554	TGC	2	6	1358524	1358529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180415
21604	NC_014554	CAA	2	6	1358540	1358545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180415
21605	NC_014554	ACG	2	6	1358582	1358587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180415
21606	NC_014554	GAT	2	6	1358597	1358602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180415
21607	NC_014554	CGA	2	6	1358623	1358628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180415
21608	NC_014554	ATG	2	6	1358631	1358636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180415
21609	NC_014554	CAAT	2	8	1358730	1358737	50 %	25 %	0 %	25 %	308180415
21610	NC_014554	CGT	2	6	1358740	1358745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180415
21611	NC_014554	ACG	2	6	1358861	1358866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180415
21612	NC_014554	TTTG	2	8	1358931	1358938	0 %	75 %	25 %	0 %	308180415
21613	NC_014554	CAAC	2	8	1359200	1359207	50 %	0 %	0 %	50 %	308180415
21614	NC_014554	GAA	2	6	1359383	1359388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180415
21615	NC_014554	CCAA	2	8	1359439	1359446	50 %	0 %	0 %	50 %	308180415
21616	NC_014554	ACGCT	2	10	1359626	1359635	20 %	20 %	20 %	40 %	308180415
21617	NC_014554	GAT	2	6	1359659	1359664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180415
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21728	NC_014554	GAC	2	6	1367365	1367370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180423
21729	NC_014554	GATAA	2	10	1367462	1367471	60 %	20 %	20 %	0 %	308180423
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21848	NC_014554	GATTCA	2	12	1374478	1374489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308180429
21849	NC_014554	GTTA	2	8	1374764	1374771	25 %	50 %	25 %	0 %	308180430
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