MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_014554	AAG	2	6	1321718	1321723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21002	NC_014554	TTC	2	6	1321768	1321773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180379
21003	NC_014554	TCG	2	6	1321830	1321835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180379
21004	NC_014554	CCA	2	6	1321966	1321971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180379
21005	NC_014554	ATG	2	6	1322095	1322100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180379
21006	NC_014554	CGTTG	2	10	1322178	1322187	0 %	40 %	40 %	20 %	308180379
21007	NC_014554	GAA	3	9	1322197	1322205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21008	NC_014554	GAT	2	6	1322314	1322319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180379
21009	NC_014554	GAT	2	6	1322365	1322370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180379
21010	NC_014554	GCT	2	6	1322404	1322409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180379
21011	NC_014554	TGG	2	6	1322451	1322456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180379
21012	NC_014554	GAA	2	6	1322458	1322463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21013	NC_014554	CTT	2	6	1322487	1322492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180379
21014	NC_014554	GAA	2	6	1322536	1322541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21015	NC_014554	TCG	2	6	1322591	1322596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180379
21016	NC_014554	CTTA	2	8	1322597	1322604	25 %	50 %	0 %	25 %	308180379
21017	NC_014554	ATC	2	6	1322659	1322664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180379
21018	NC_014554	TCG	3	9	1322706	1322714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180379
21019	NC_014554	GAA	2	6	1322793	1322798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21020	NC_014554	AAG	2	6	1322828	1322833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21021	NC_014554	GAA	2	6	1322869	1322874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180379
21022	NC_014554	GTG	2	6	1322942	1322947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180379
21023	NC_014554	AAT	2	6	1322954	1322959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180379
21024	NC_014554	AAG	2	6	1323280	1323285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180380
21025	NC_014554	ACC	2	6	1323344	1323349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180380
21026	NC_014554	CAA	2	6	1323390	1323395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180380
21027	NC_014554	AAG	2	6	1323396	1323401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180380
21028	NC_014554	AAG	2	6	1323417	1323422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180380
21029	NC_014554	CTA	2	6	1323613	1323618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180380
21030	NC_014554	GATG	2	8	1323650	1323657	25 %	25 %	50 %	0 %	308180380
21031	NC_014554	CAAAA	2	10	1323727	1323736	80 %	0 %	0 %	20 %	308180381
21032	NC_014554	GCT	2	6	1323747	1323752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180381
21033	NC_014554	AAC	2	6	1323838	1323843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180381
21034	NC_014554	TAT	2	6	1323866	1323871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180381
21035	NC_014554	TTA	2	6	1323903	1323908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180381
21036	NC_014554	AAT	2	6	1323913	1323918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180381
21037	NC_014554	GTG	2	6	1324027	1324032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180382
21038	NC_014554	TCG	2	6	1324100	1324105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180382
21039	NC_014554	CGT	2	6	1324125	1324130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180382
21040	NC_014554	GATGCT	2	12	1324257	1324268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308180382
21041	NC_014554	TCA	2	6	1324548	1324553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180383
21042	NC_014554	TGA	2	6	1324657	1324662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180383
21043	NC_014554	A	6	6	1324684	1324689	100 %	0 %	0 %	0 %	308180383
21044	NC_014554	GCG	2	6	1324702	1324707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180383
21045	NC_014554	GTT	2	6	1324780	1324785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180383
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21047	NC_014554	TAAA	2	8	1325058	1325065	75 %	25 %	0 %	0 %	308180384
21048	NC_014554	TTCATT	2	12	1325102	1325113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	308180384
21049	NC_014554	TAA	3	9	1325124	1325132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180384
21050	NC_014554	CGA	2	6	1325133	1325138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180384
21051	NC_014554	TTG	2	6	1325165	1325170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180384
21052	NC_014554	ACC	3	9	1325210	1325218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180384
21053	NC_014554	TG	3	6	1325289	1325294	0 %	50 %	50 %	0 %	308180384
21054	NC_014554	TGG	2	6	1325359	1325364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180384
21055	NC_014554	TG	3	6	1325433	1325438	0 %	50 %	50 %	0 %	308180384
21056	NC_014554	CGG	2	6	1325490	1325495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180384
21057	NC_014554	TCA	2	6	1325511	1325516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180384
21058	NC_014554	T	6	6	1325517	1325522	0 %	100 %	0 %	0 %	308180384
21059	NC_014554	AGT	2	6	1325536	1325541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180384
21060	NC_014554	CGC	2	6	1325546	1325551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180384
21061	NC_014554	AGCC	2	8	1325563	1325570	25 %	0 %	25 %	50 %	308180384
21062	NC_014554	GCA	2	6	1325661	1325666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180384
21063	NC_014554	TCG	2	6	1325781	1325786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180384
21064	NC_014554	CGAA	2	8	1325876	1325883	50 %	0 %	25 %	25 %	308180384
21065	NC_014554	CAA	2	6	1325960	1325965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180384
21066	NC_014554	A	6	6	1325964	1325969	100 %	0 %	0 %	0 %	308180384
21067	NC_014554	AAT	2	6	1326116	1326121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180384
21068	NC_014554	CGG	2	6	1326149	1326154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180384
21069	NC_014554	AAT	2	6	1326191	1326196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180384
21070	NC_014554	TGGC	2	8	1326206	1326213	0 %	25 %	50 %	25 %	308180384
21071	NC_014554	GTG	2	6	1326280	1326285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180384
21072	NC_014554	ATTT	2	8	1327998	1328005	25 %	75 %	0 %	0 %	308180385
21073	NC_014554	GTT	2	6	1328052	1328057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180385
21074	NC_014554	CGG	2	6	1328060	1328065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180385
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21080	NC_014554	CAT	2	6	1328814	1328819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180386
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21083	NC_014554	CAA	2	6	1329041	1329046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180386
21084	NC_014554	AGC	3	9	1329087	1329095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180386
21085	NC_014554	TGA	2	6	1329105	1329110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180386
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21087	NC_014554	ATT	2	6	1329181	1329186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180386
21088	NC_014554	TGC	2	6	1329190	1329195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180386
21089	NC_014554	TGC	2	6	1329247	1329252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180386
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21098	NC_014554	AGA	2	6	1329924	1329929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180387
21099	NC_014554	GAT	2	6	1329940	1329945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180387
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21101	NC_014554	TGAC	2	8	1329998	1330005	25 %	25 %	25 %	25 %	308180387
21102	NC_014554	ACC	2	6	1330039	1330044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180387
21103	NC_014554	TGA	2	6	1330064	1330069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180387
21104	NC_014554	ATAGA	2	10	1330102	1330111	60 %	20 %	20 %	0 %	308180387
21105	NC_014554	GTC	2	6	1330130	1330135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180387
21106	NC_014554	CG	3	6	1330180	1330185	0 %	0 %	50 %	50 %	308180387
21107	NC_014554	ACG	2	6	1330222	1330227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180387
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21109	NC_014554	GAT	2	6	1330336	1330341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180387
21110	NC_014554	TTC	2	6	1330396	1330401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180387
21111	NC_014554	AT	3	6	1330418	1330423	50 %	50 %	0 %	0 %	308180387
21112	NC_014554	TGGAA	2	10	1330444	1330453	40 %	20 %	40 %	0 %	308180387
21113	NC_014554	CAC	2	6	1330479	1330484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180387
21114	NC_014554	TCA	2	6	1330598	1330603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180387
21115	NC_014554	TG	3	6	1330672	1330677	0 %	50 %	50 %	0 %	308180387
21116	NC_014554	CTT	2	6	1330689	1330694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180387
21117	NC_014554	GTT	2	6	1330728	1330733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180387
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21120	NC_014554	TGC	2	6	1331093	1331098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180388
21121	NC_014554	ATT	2	6	1331110	1331115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180388
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21202	NC_014554	GGGAC	2	10	1335884	1335893	20 %	0 %	60 %	20 %	308180395
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21212	NC_014554	GAT	2	6	1336451	1336456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180395
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21214	NC_014554	AGT	2	6	1336488	1336493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180395
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21217	NC_014554	TGA	2	6	1336613	1336618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180396
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21219	NC_014554	T	6	6	1336723	1336728	0 %	100 %	0 %	0 %	308180396
21220	NC_014554	ATTT	2	8	1336745	1336752	25 %	75 %	0 %	0 %	308180396
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21222	NC_014554	ACT	2	6	1336770	1336775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180396
21223	NC_014554	GTT	2	6	1336798	1336803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180396
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21226	NC_014554	CGA	3	9	1337048	1337056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180396
21227	NC_014554	GCG	2	6	1337125	1337130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180396
21228	NC_014554	TGA	2	6	1337322	1337327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180396
21229	NC_014554	TCA	2	6	1337334	1337339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180396
21230	NC_014554	GTCAA	2	10	1337341	1337350	40 %	20 %	20 %	20 %	308180396
21231	NC_014554	ACT	2	6	1337394	1337399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180396
21232	NC_014554	GAA	2	6	1337496	1337501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180396
21233	NC_014554	ATCA	2	8	1337530	1337537	50 %	25 %	0 %	25 %	308180396
21234	NC_014554	CGGG	2	8	1337572	1337579	0 %	0 %	75 %	25 %	308180396
21235	NC_014554	AATT	2	8	1337591	1337598	50 %	50 %	0 %	0 %	308180396
21236	NC_014554	AAATG	2	10	1337781	1337790	60 %	20 %	20 %	0 %	308180397
21237	NC_014554	TGA	2	6	1337836	1337841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180397
21238	NC_014554	TGA	2	6	1337865	1337870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180397
21239	NC_014554	TCGC	2	8	1337989	1337996	0 %	25 %	25 %	50 %	308180397
21240	NC_014554	GAA	2	6	1338077	1338082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180397
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21242	NC_014554	GAT	2	6	1338110	1338115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180397
21243	NC_014554	GGA	2	6	1338139	1338144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308180397
21244	NC_014554	TTCT	2	8	1338174	1338181	0 %	75 %	0 %	25 %	308180397
21245	NC_014554	TC	3	6	1338232	1338237	0 %	50 %	0 %	50 %	308180397
21246	NC_014554	GAC	2	6	1338242	1338247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180397
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21250	NC_014554	TAC	2	6	1338538	1338543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180398
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21254	NC_014554	A	6	6	1338876	1338881	100 %	0 %	0 %	0 %	308180399
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21259	NC_014554	TCA	2	6	1339183	1339188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180399
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21262	NC_014554	CAC	2	6	1339349	1339354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180399
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21316	NC_014554	TAG	3	9	1342563	1342571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180402
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21324	NC_014554	CAA	2	6	1342894	1342899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180402
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21327	NC_014554	TAC	2	6	1343220	1343225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180402
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21330	NC_014554	GGCA	2	8	1343447	1343454	25 %	0 %	50 %	25 %	308180402
21331	NC_014554	GAC	2	6	1343730	1343735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180402
21332	NC_014554	GCT	2	6	1343815	1343820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180402
21333	NC_014554	GAT	2	6	1343863	1343868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180402
21334	NC_014554	ATTA	2	8	1344079	1344086	50 %	50 %	0 %	0 %	308180403
21335	NC_014554	A	7	7	1344096	1344102	100 %	0 %	0 %	0 %	308180403
21336	NC_014554	GAATTA	2	12	1344119	1344130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	308180403
21337	NC_014554	CGG	2	6	1344260	1344265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180403
21338	NC_014554	ATG	2	6	1344296	1344301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180403
21339	NC_014554	TGAT	2	8	1344318	1344325	25 %	50 %	25 %	0 %	308180403
21340	NC_014554	GAT	2	6	1344353	1344358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180403
21341	NC_014554	GAA	2	6	1344383	1344388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180403
21342	NC_014554	GCG	2	6	1344415	1344420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180403
21343	NC_014554	AAC	2	6	1344438	1344443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180403
21344	NC_014554	AAAC	2	8	1344452	1344459	75 %	0 %	0 %	25 %	308180403
21345	NC_014554	CGA	2	6	1344517	1344522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180403
21346	NC_014554	TCA	2	6	1344525	1344530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180403
21347	NC_014554	TTA	2	6	1344557	1344562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180403
21348	NC_014554	CTCG	2	8	1344590	1344597	0 %	25 %	25 %	50 %	308180403
21349	NC_014554	GTC	2	6	1344650	1344655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180403
21350	NC_014554	TTAC	2	8	1344670	1344677	25 %	50 %	0 %	25 %	308180403
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21352	NC_014554	TGAC	2	8	1344755	1344762	25 %	25 %	25 %	25 %	308180404
21353	NC_014554	AAATGG	2	12	1344811	1344822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	308180404
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21374	NC_014554	TGG	2	6	1346210	1346215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180404
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21459	NC_014554	TG	3	6	1350185	1350190	0 %	50 %	50 %	0 %	308180406
21460	NC_014554	TTG	3	9	1350202	1350210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180406
21461	NC_014554	TGCT	2	8	1350220	1350227	0 %	50 %	25 %	25 %	308180406
21462	NC_014554	GATT	2	8	1350258	1350265	25 %	50 %	25 %	0 %	308180406
21463	NC_014554	CGT	2	6	1350307	1350312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180406
21464	NC_014554	GTA	2	6	1350324	1350329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180406
21465	NC_014554	T	6	6	1350336	1350341	0 %	100 %	0 %	0 %	308180406
21466	NC_014554	CAT	2	6	1350378	1350383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180406
21467	NC_014554	T	6	6	1350519	1350524	0 %	100 %	0 %	0 %	308180406
21468	NC_014554	T	7	7	1350585	1350591	0 %	100 %	0 %	0 %	308180406
21469	NC_014554	CAG	2	6	1350600	1350605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180406
21470	NC_014554	CGGC	2	8	1350642	1350649	0 %	0 %	50 %	50 %	308180406
21471	NC_014554	CCA	2	6	1350677	1350682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180406
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21473	NC_014554	GC	3	6	1350769	1350774	0 %	0 %	50 %	50 %	308180406
21474	NC_014554	ACTG	2	8	1350843	1350850	25 %	25 %	25 %	25 %	308180406
21475	NC_014554	CAT	2	6	1350882	1350887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180406
21476	NC_014554	TCG	2	6	1350888	1350893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180406
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21479	NC_014554	TAAA	2	8	1351039	1351046	75 %	25 %	0 %	0 %	308180406
21480	NC_014554	GTT	3	9	1351100	1351108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180407
21481	NC_014554	CAA	2	6	1351154	1351159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180407
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21483	NC_014554	T	6	6	1351186	1351191	0 %	100 %	0 %	0 %	308180407
21484	NC_014554	TGG	2	6	1351213	1351218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180407
21485	NC_014554	TAC	2	6	1351289	1351294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180407
21486	NC_014554	GGT	2	6	1351614	1351619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180407
21487	NC_014554	GTT	2	6	1351648	1351653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180407
21488	NC_014554	GTC	2	6	1351671	1351676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180407
21489	NC_014554	CAA	2	6	1351710	1351715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180407
21490	NC_014554	GGT	2	6	1351737	1351742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180407
21491	NC_014554	GCATC	2	10	1351766	1351775	20 %	20 %	20 %	40 %	308180407
21492	NC_014554	TTG	2	6	1351818	1351823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180407
21493	NC_014554	TAG	2	6	1351828	1351833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180407
21494	NC_014554	CG	3	6	1351837	1351842	0 %	0 %	50 %	50 %	308180407
21495	NC_014554	A	6	6	1351854	1351859	100 %	0 %	0 %	0 %	308180407
21496	NC_014554	ATT	2	6	1351935	1351940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180407
21497	NC_014554	CAT	2	6	1351982	1351987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180407
21498	NC_014554	GCA	2	6	1352039	1352044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180407
21499	NC_014554	AGTGA	2	10	1352053	1352062	40 %	20 %	40 %	0 %	308180407
21500	NC_014554	GCT	2	6	1352161	1352166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180407

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