MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_014554	CGA	2	6	1226580	1226585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180299
19502	NC_014554	GCT	2	6	1226634	1226639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180299
19503	NC_014554	CAG	2	6	1226671	1226676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180299
19504	NC_014554	GCA	2	6	1226730	1226735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180299
19505	NC_014554	ACG	2	6	1226782	1226787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180299
19506	NC_014554	TTTA	2	8	1226861	1226868	25 %	75 %	0 %	0 %	308180299
19507	NC_014554	TCG	2	6	1227201	1227206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180300
19508	NC_014554	AAC	2	6	1227267	1227272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180300
19509	NC_014554	TCG	2	6	1227363	1227368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180300
19510	NC_014554	GTT	2	6	1227398	1227403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180300
19511	NC_014554	CTT	3	9	1227424	1227432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180300
19512	NC_014554	AAGA	2	8	1227434	1227441	75 %	0 %	25 %	0 %	308180300
19513	NC_014554	TGG	2	6	1227481	1227486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180300
19514	NC_014554	TAAG	2	8	1227618	1227625	50 %	25 %	25 %	0 %	308180300
19515	NC_014554	GAAGC	2	10	1227711	1227720	40 %	0 %	40 %	20 %	308180300
19516	NC_014554	CAAT	2	8	1227738	1227745	50 %	25 %	0 %	25 %	308180300
19517	NC_014554	TTA	2	6	1227749	1227754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180300
19518	NC_014554	AGA	2	6	1227778	1227783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19519	NC_014554	ATC	2	6	1227789	1227794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180300
19520	NC_014554	TGA	2	6	1227844	1227849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180300
19521	NC_014554	AAG	2	6	1227902	1227907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19522	NC_014554	AAG	2	6	1227975	1227980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19523	NC_014554	GTG	2	6	1228034	1228039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180300
19524	NC_014554	CGT	2	6	1228168	1228173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180300
19525	NC_014554	ACCA	2	8	1228187	1228194	50 %	0 %	0 %	50 %	308180300
19526	NC_014554	CCA	2	6	1228252	1228257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180300
19527	NC_014554	TGG	2	6	1228282	1228287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180300
19528	NC_014554	AAG	2	6	1228289	1228294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19529	NC_014554	GAA	2	6	1228453	1228458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19530	NC_014554	GAA	2	6	1228490	1228495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180300
19531	NC_014554	GTT	2	6	1228496	1228501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180300
19532	NC_014554	GTA	2	6	1228664	1228669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180300
19533	NC_014554	ACA	2	6	1228734	1228739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180300
19534	NC_014554	TAT	2	6	1228742	1228747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180300
19535	NC_014554	GAT	2	6	1228772	1228777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180300
19536	NC_014554	GAAG	2	8	1228825	1228832	50 %	0 %	50 %	0 %	308180300
19537	NC_014554	ATGA	2	8	1229181	1229188	50 %	25 %	25 %	0 %	308180301
19538	NC_014554	ATATC	2	10	1229207	1229216	40 %	40 %	0 %	20 %	308180301
19539	NC_014554	GA	3	6	1229234	1229239	50 %	0 %	50 %	0 %	308180301
19540	NC_014554	CAT	2	6	1229315	1229320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180301
19541	NC_014554	GAA	2	6	1229403	1229408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180301
19542	NC_014554	GGTT	2	8	1229429	1229436	0 %	50 %	50 %	0 %	308180301
19543	NC_014554	A	7	7	1229500	1229506	100 %	0 %	0 %	0 %	308180301
19544	NC_014554	TGA	2	6	1229823	1229828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
19545	NC_014554	ACAA	2	8	1229871	1229878	75 %	0 %	0 %	25 %	308180302
19546	NC_014554	GGT	3	9	1229951	1229959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180302
19547	NC_014554	TGA	2	6	1229970	1229975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
19548	NC_014554	ATT	2	6	1229978	1229983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180302
19549	NC_014554	GGA	2	6	1229984	1229989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308180302
19550	NC_014554	ATC	2	6	1230042	1230047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180302
19551	NC_014554	GCG	2	6	1230187	1230192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180302
19552	NC_014554	A	7	7	1230235	1230241	100 %	0 %	0 %	0 %	308180302
19553	NC_014554	CAA	2	6	1230248	1230253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180302
19554	NC_014554	GGT	2	6	1230260	1230265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180302
19555	NC_014554	AAC	2	6	1230270	1230275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180302
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19557	NC_014554	A	6	6	1230384	1230389	100 %	0 %	0 %	0 %	308180302
19558	NC_014554	TG	3	6	1230416	1230421	0 %	50 %	50 %	0 %	308180302
19559	NC_014554	GCG	2	6	1230446	1230451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180302
19560	NC_014554	ACC	2	6	1230500	1230505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180302
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19562	NC_014554	ATG	2	6	1230575	1230580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
19563	NC_014554	ATT	2	6	1230646	1230651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180302
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19566	NC_014554	TGA	2	6	1230775	1230780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
19567	NC_014554	CGG	2	6	1230814	1230819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180302
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19569	NC_014554	ACA	2	6	1230937	1230942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180302
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19571	NC_014554	AGT	2	6	1230977	1230982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
19572	NC_014554	CTGTGA	2	12	1231101	1231112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308180302
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19574	NC_014554	GT	3	6	1231158	1231163	0 %	50 %	50 %	0 %	308180302
19575	NC_014554	TAG	2	6	1231179	1231184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180302
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19577	NC_014554	CAAC	2	8	1231265	1231272	50 %	0 %	0 %	50 %	308180302
19578	NC_014554	GGC	2	6	1231432	1231437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180302
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19582	NC_014554	GCTTG	2	10	1231745	1231754	0 %	40 %	40 %	20 %	308180302
19583	NC_014554	GTTTT	2	10	1232495	1232504	0 %	80 %	20 %	0 %	308180303
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19589	NC_014554	CAA	2	6	1232836	1232841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180303
19590	NC_014554	ATT	2	6	1232842	1232847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180303
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19592	NC_014554	AC	3	6	1232924	1232929	50 %	0 %	0 %	50 %	308180303
19593	NC_014554	TGC	2	6	1233054	1233059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180303
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19595	NC_014554	TTAT	2	8	1233313	1233320	25 %	75 %	0 %	0 %	308180304
19596	NC_014554	TTA	2	6	1233489	1233494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180304
19597	NC_014554	GGGC	2	8	1233631	1233638	0 %	0 %	75 %	25 %	308180304
19598	NC_014554	TTG	2	6	1233670	1233675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180304
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19601	NC_014554	ATT	2	6	1233764	1233769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180304
19602	NC_014554	TTG	2	6	1233823	1233828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180304
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19605	NC_014554	TCG	2	6	1234034	1234039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180304
19606	NC_014554	T	6	6	1234040	1234045	0 %	100 %	0 %	0 %	308180304
19607	NC_014554	CAA	2	6	1234059	1234064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180304
19608	NC_014554	CGATT	2	10	1234075	1234084	20 %	40 %	20 %	20 %	308180304
19609	NC_014554	CGCC	2	8	1234237	1234244	0 %	0 %	25 %	75 %	308180304
19610	NC_014554	CAA	2	6	1234248	1234253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180304
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19614	NC_014554	GTC	2	6	1234331	1234336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180304
19615	NC_014554	CAA	2	6	1234374	1234379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180304
19616	NC_014554	GCGT	2	8	1234469	1234476	0 %	25 %	50 %	25 %	308180304
19617	NC_014554	ATT	2	6	1234515	1234520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180304
19618	NC_014554	GT	3	6	1234582	1234587	0 %	50 %	50 %	0 %	308180304
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19620	NC_014554	TTA	2	6	1234770	1234775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180304
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19624	NC_014554	TGA	2	6	1234945	1234950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180304
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19962	NC_014554	ATCA	2	8	1254027	1254034	50 %	25 %	0 %	25 %	308180322
19963	NC_014554	GAA	2	6	1254128	1254133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180322
19964	NC_014554	ATC	2	6	1254136	1254141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180322
19965	NC_014554	GCTTA	2	10	1254157	1254166	20 %	40 %	20 %	20 %	308180322
19966	NC_014554	CGA	2	6	1254298	1254303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180322
19967	NC_014554	GGTC	2	8	1254326	1254333	0 %	25 %	50 %	25 %	308180322
19968	NC_014554	ATG	2	6	1254531	1254536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180322
19969	NC_014554	ATGG	2	8	1254591	1254598	25 %	25 %	50 %	0 %	308180322
19970	NC_014554	ACTA	2	8	1254658	1254665	50 %	25 %	0 %	25 %	308180322
19971	NC_014554	GAAC	2	8	1255051	1255058	50 %	0 %	25 %	25 %	308180323
19972	NC_014554	TTG	2	6	1255096	1255101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180323
19973	NC_014554	GAC	2	6	1255139	1255144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180323
19974	NC_014554	ACT	2	6	1255171	1255176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180323
19975	NC_014554	CGG	2	6	1255212	1255217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180323
19976	NC_014554	TGA	2	6	1255294	1255299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180323
19977	NC_014554	AGA	2	6	1255357	1255362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180323
19978	NC_014554	GGC	2	6	1255438	1255443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180323
19979	NC_014554	GTG	2	6	1255455	1255460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180323
19980	NC_014554	GCAT	2	8	1255494	1255501	25 %	25 %	25 %	25 %	308180323
19981	NC_014554	GCC	2	6	1255511	1255516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180323
19982	NC_014554	CTG	2	6	1255530	1255535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180323
19983	NC_014554	A	6	6	1255635	1255640	100 %	0 %	0 %	0 %	308180323
19984	NC_014554	ACGC	2	8	1255813	1255820	25 %	0 %	25 %	50 %	308180323
19985	NC_014554	ATG	2	6	1255836	1255841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180323
19986	NC_014554	GAC	2	6	1255843	1255848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180323
19987	NC_014554	CGG	2	6	1255929	1255934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180323
19988	NC_014554	GAA	2	6	1255943	1255948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180323
19989	NC_014554	GAA	2	6	1255964	1255969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180323
19990	NC_014554	T	6	6	1256211	1256216	0 %	100 %	0 %	0 %	308180323
19991	NC_014554	ATG	2	6	1256325	1256330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180324
19992	NC_014554	CGG	2	6	1256503	1256508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180324
19993	NC_014554	CCA	2	6	1256523	1256528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180324
19994	NC_014554	GAA	2	6	1256550	1256555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180324
19995	NC_014554	ATG	2	6	1256595	1256600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180324
19996	NC_014554	AAT	2	6	1256633	1256638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180324
19997	NC_014554	GTTG	2	8	1256667	1256674	0 %	50 %	50 %	0 %	308180324
19998	NC_014554	CCA	2	6	1256703	1256708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180324
19999	NC_014554	GAT	2	6	1256746	1256751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180324
20000	NC_014554	ATG	2	6	1256787	1256792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180324

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