MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014554	GTT	2	6	1195887	1195892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180269
19002	NC_014554	TTTA	2	8	1195903	1195910	25 %	75 %	0 %	0 %	308180269
19003	NC_014554	TTGG	2	8	1196025	1196032	0 %	50 %	50 %	0 %	308180269
19004	NC_014554	TAT	2	6	1196033	1196038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180269
19005	NC_014554	TTGT	2	8	1196562	1196569	0 %	75 %	25 %	0 %	308180270
19006	NC_014554	TGA	2	6	1196586	1196591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180270
19007	NC_014554	GCG	2	6	1196621	1196626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180270
19008	NC_014554	GCG	2	6	1196639	1196644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180270
19009	NC_014554	ACCA	2	8	1196727	1196734	50 %	0 %	0 %	50 %	308180270
19010	NC_014554	TGG	2	6	1196758	1196763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180270
19011	NC_014554	ATGCC	2	10	1196805	1196814	20 %	20 %	20 %	40 %	308180270
19012	NC_014554	CAG	2	6	1196858	1196863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180270
19013	NC_014554	GCG	2	6	1196864	1196869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180270
19014	NC_014554	TA	3	6	1196895	1196900	50 %	50 %	0 %	0 %	308180270
19015	NC_014554	GAC	2	6	1196965	1196970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180270
19016	NC_014554	ATT	2	6	1197011	1197016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180270
19017	NC_014554	TGAC	2	8	1197033	1197040	25 %	25 %	25 %	25 %	308180270
19018	NC_014554	GCAA	2	8	1197042	1197049	50 %	0 %	25 %	25 %	308180270
19019	NC_014554	GC	3	6	1197052	1197057	0 %	0 %	50 %	50 %	308180270
19020	NC_014554	TTG	2	6	1197072	1197077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180270
19021	NC_014554	CGG	2	6	1197189	1197194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180270
19022	NC_014554	ATT	2	6	1197200	1197205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180270
19023	NC_014554	AAC	2	6	1197323	1197328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180270
19024	NC_014554	TTA	2	6	1197348	1197353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180270
19025	NC_014554	TTTAT	2	10	1197359	1197368	20 %	80 %	0 %	0 %	308180270
19026	NC_014554	CGA	2	6	1197514	1197519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180271
19027	NC_014554	CAG	2	6	1197605	1197610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180271
19028	NC_014554	ATT	2	6	1197714	1197719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180271
19029	NC_014554	CGA	2	6	1197732	1197737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180271
19030	NC_014554	TAT	2	6	1197764	1197769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180271
19031	NC_014554	TGA	2	6	1197792	1197797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180271
19032	NC_014554	GCT	2	6	1197802	1197807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180271
19033	NC_014554	GAA	2	6	1197808	1197813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180271
19034	NC_014554	TTG	2	6	1197848	1197853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180271
19035	NC_014554	AAGC	2	8	1197854	1197861	50 %	0 %	25 %	25 %	308180271
19036	NC_014554	CAC	2	6	1197866	1197871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180271
19037	NC_014554	A	6	6	1197902	1197907	100 %	0 %	0 %	0 %	308180271
19038	NC_014554	AT	3	6	1197952	1197957	50 %	50 %	0 %	0 %	308180271
19039	NC_014554	TGA	2	6	1198027	1198032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180271
19040	NC_014554	TAA	2	6	1198106	1198111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180271
19041	NC_014554	GTA	2	6	1198311	1198316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180272
19042	NC_014554	CAT	2	6	1198322	1198327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180272
19043	NC_014554	GGGGA	2	10	1198330	1198339	20 %	0 %	80 %	0 %	308180272
19044	NC_014554	T	7	7	1198404	1198410	0 %	100 %	0 %	0 %	308180272
19045	NC_014554	AATC	2	8	1198423	1198430	50 %	25 %	0 %	25 %	308180272
19046	NC_014554	TGT	2	6	1198500	1198505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180273
19047	NC_014554	GAC	2	6	1198508	1198513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180273
19048	NC_014554	ATC	2	6	1198523	1198528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180273
19049	NC_014554	TGGC	2	8	1198693	1198700	0 %	25 %	50 %	25 %	308180273
19050	NC_014554	CGC	2	6	1198750	1198755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180273
19051	NC_014554	AAG	2	6	1198772	1198777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180273
19052	NC_014554	GTCGCG	2	12	1198841	1198852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308180273
19053	NC_014554	CAA	2	6	1199021	1199026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180273
19054	NC_014554	TGA	2	6	1199134	1199139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180273
19055	NC_014554	ACA	2	6	1199149	1199154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180273
19056	NC_014554	ATT	2	6	1199255	1199260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180273
19057	NC_014554	GC	3	6	1199279	1199284	0 %	0 %	50 %	50 %	308180273
19058	NC_014554	GCAATT	2	12	1199330	1199341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308180273
19059	NC_014554	GTG	2	6	1199412	1199417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180273
19060	NC_014554	TGG	2	6	1199454	1199459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180273
19061	NC_014554	ATC	2	6	1199484	1199489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180273
19062	NC_014554	GTT	2	6	1199575	1199580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180273
19063	NC_014554	TAT	2	6	1199635	1199640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180273
19064	NC_014554	AGTG	2	8	1199651	1199658	25 %	25 %	50 %	0 %	308180273
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19066	NC_014554	TGT	2	6	1199679	1199684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180274
19067	NC_014554	GTT	2	6	1199793	1199798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180274
19068	NC_014554	ACG	2	6	1199970	1199975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180274
19069	NC_014554	CAAG	2	8	1200072	1200079	50 %	0 %	25 %	25 %	308180274
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19071	NC_014554	TTAT	2	8	1200151	1200158	25 %	75 %	0 %	0 %	308180274
19072	NC_014554	TAA	2	6	1200177	1200182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180274
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19075	NC_014554	GTCG	2	8	1200351	1200358	0 %	25 %	50 %	25 %	308180274
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19083	NC_014554	ATC	2	6	1201183	1201188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180276
19084	NC_014554	ATTTCA	2	12	1201206	1201217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	308180276
19085	NC_014554	TTG	2	6	1201267	1201272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180276
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19088	NC_014554	GTT	2	6	1201362	1201367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180276
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19090	NC_014554	ATTGGC	2	12	1201390	1201401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308180276
19091	NC_014554	TGA	2	6	1201436	1201441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180276
19092	NC_014554	TGG	2	6	1201444	1201449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180276
19093	NC_014554	TTA	2	6	1201489	1201494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180276
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19095	NC_014554	ATG	2	6	1201573	1201578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180277
19096	NC_014554	CG	3	6	1201620	1201625	0 %	0 %	50 %	50 %	308180277
19097	NC_014554	TAGC	2	8	1201652	1201659	25 %	25 %	25 %	25 %	308180277
19098	NC_014554	ACT	2	6	1201704	1201709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180277
19099	NC_014554	TTG	2	6	1201758	1201763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180277
19100	NC_014554	CAA	2	6	1201805	1201810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180277
19101	NC_014554	A	7	7	1201819	1201825	100 %	0 %	0 %	0 %	308180277
19102	NC_014554	GGC	2	6	1201884	1201889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180277
19103	NC_014554	GTT	2	6	1201890	1201895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180277
19104	NC_014554	GCC	2	6	1201941	1201946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180277
19105	NC_014554	AAT	2	6	1201980	1201985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180277
19106	NC_014554	TGAT	2	8	1202013	1202020	25 %	50 %	25 %	0 %	308180277
19107	NC_014554	GCC	2	6	1202053	1202058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180277
19108	NC_014554	TTAA	2	8	1202143	1202150	50 %	50 %	0 %	0 %	308180277
19109	NC_014554	TGG	2	6	1202163	1202168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180277
19110	NC_014554	CAA	2	6	1202180	1202185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180277
19111	NC_014554	CAG	2	6	1202192	1202197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180277
19112	NC_014554	CAGT	2	8	1202911	1202918	25 %	25 %	25 %	25 %	308180278
19113	NC_014554	TCG	2	6	1203360	1203365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180278
19114	NC_014554	T	6	6	1203375	1203380	0 %	100 %	0 %	0 %	308180278
19115	NC_014554	TTAA	2	8	1203507	1203514	50 %	50 %	0 %	0 %	308180279
19116	NC_014554	GTT	2	6	1203528	1203533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180279
19117	NC_014554	CTG	2	6	1203571	1203576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180279
19118	NC_014554	ATC	2	6	1203649	1203654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180279
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19225	NC_014554	TAA	2	6	1210287	1210292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180286
19226	NC_014554	TTAA	2	8	1210381	1210388	50 %	50 %	0 %	0 %	308180287
19227	NC_014554	GC	3	6	1210470	1210475	0 %	0 %	50 %	50 %	308180287
19228	NC_014554	ATCA	2	8	1210485	1210492	50 %	25 %	0 %	25 %	308180287
19229	NC_014554	GCAATG	2	12	1210501	1210512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308180287
19230	NC_014554	CGTT	2	8	1210522	1210529	0 %	50 %	25 %	25 %	308180287
19231	NC_014554	TAACT	2	10	1210747	1210756	40 %	40 %	0 %	20 %	308180287
19232	NC_014554	CTT	2	6	1210835	1210840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180287
19233	NC_014554	TCA	2	6	1210892	1210897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180287
19234	NC_014554	GTC	2	6	1211047	1211052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180287
19235	NC_014554	TCG	2	6	1211102	1211107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180287
19236	NC_014554	T	6	6	1211246	1211251	0 %	100 %	0 %	0 %	308180287
19237	NC_014554	TGG	2	6	1211304	1211309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180287
19238	NC_014554	TGC	2	6	1211345	1211350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180287
19239	NC_014554	CAA	2	6	1211401	1211406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180287
19240	NC_014554	CCA	2	6	1211407	1211412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180287
19241	NC_014554	TTC	2	6	1211451	1211456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180287
19242	NC_014554	ACC	2	6	1211482	1211487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180287
19243	NC_014554	TGA	2	6	1211708	1211713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180287
19244	NC_014554	AGT	2	6	1211755	1211760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180287
19245	NC_014554	ATA	2	6	1211772	1211777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180287
19246	NC_014554	TGGT	2	8	1211803	1211810	0 %	50 %	50 %	0 %	308180287
19247	NC_014554	GTT	2	6	1211828	1211833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180287
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19250	NC_014554	GGT	2	6	1211985	1211990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180287
19251	NC_014554	AAT	2	6	1212054	1212059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180287
19252	NC_014554	TTCA	2	8	1212223	1212230	25 %	50 %	0 %	25 %	308180287
19253	NC_014554	CCT	2	6	1212236	1212241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308180288
19254	NC_014554	GC	3	6	1212280	1212285	0 %	0 %	50 %	50 %	308180288
19255	NC_014554	GCT	2	6	1212305	1212310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180288
19256	NC_014554	GAT	2	6	1212568	1212573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180288
19257	NC_014554	GTG	2	6	1212635	1212640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180288
19258	NC_014554	GCT	2	6	1212687	1212692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180288
19259	NC_014554	TCA	2	6	1212722	1212727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180288
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19261	NC_014554	CTT	2	6	1212768	1212773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180288
19262	NC_014554	TCG	2	6	1212821	1212826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180288
19263	NC_014554	GTG	2	6	1212855	1212860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180288
19264	NC_014554	CAGT	2	8	1213023	1213030	25 %	25 %	25 %	25 %	308180288
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19266	NC_014554	TGC	2	6	1213183	1213188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180288
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19307	NC_014554	CGA	2	6	1216275	1216280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180290
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19311	NC_014554	AAT	2	6	1216552	1216557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180290
19312	NC_014554	ACG	2	6	1216636	1216641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180290
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19322	NC_014554	ATG	2	6	1217018	1217023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180290
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19329	NC_014554	AAT	2	6	1217159	1217164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180291
19330	NC_014554	AATT	2	8	1217184	1217191	50 %	50 %	0 %	0 %	308180291
19331	NC_014554	TGG	2	6	1217197	1217202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180291
19332	NC_014554	TGA	2	6	1217233	1217238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180291
19333	NC_014554	GT	3	6	1217307	1217312	0 %	50 %	50 %	0 %	308180291
19334	NC_014554	ATTGA	2	10	1217333	1217342	40 %	40 %	20 %	0 %	308180291
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19337	NC_014554	ATT	2	6	1217559	1217564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180291
19338	NC_014554	AT	3	6	1217662	1217667	50 %	50 %	0 %	0 %	308180291
19339	NC_014554	TTGG	2	8	1217714	1217721	0 %	50 %	50 %	0 %	308180291
19340	NC_014554	GAT	2	6	1217735	1217740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180291
19341	NC_014554	CAG	2	6	1217745	1217750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180291
19342	NC_014554	AGA	2	6	1217797	1217802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180291
19343	NC_014554	TCGT	2	8	1217874	1217881	0 %	50 %	25 %	25 %	308180291
19344	NC_014554	TCG	2	6	1217907	1217912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180291
19345	NC_014554	AGATG	2	10	1217983	1217992	40 %	20 %	40 %	0 %	308180291
19346	NC_014554	CTT	2	6	1218001	1218006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180291
19347	NC_014554	AGA	2	6	1218057	1218062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180291
19348	NC_014554	GCTG	2	8	1218121	1218128	0 %	25 %	50 %	25 %	308180291
19349	NC_014554	ACC	2	6	1218139	1218144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180291
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19351	NC_014554	ATA	2	6	1218242	1218247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180292
19352	NC_014554	CAT	2	6	1218298	1218303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180292
19353	NC_014554	TCCGGT	2	12	1218334	1218345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180292
19354	NC_014554	CGA	2	6	1218350	1218355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180292
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19463	NC_014554	CTATTA	2	12	1224015	1224026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	308180296
19464	NC_014554	TGTGA	2	10	1224035	1224044	20 %	40 %	40 %	0 %	308180296
19465	NC_014554	T	6	6	1224352	1224357	0 %	100 %	0 %	0 %	308180297
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19467	NC_014554	TAGT	2	8	1224601	1224608	25 %	50 %	25 %	0 %	308180297
19468	NC_014554	TTG	2	6	1224613	1224618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180297
19469	NC_014554	TTG	2	6	1224663	1224668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180297
19470	NC_014554	TGT	2	6	1224760	1224765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180297
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19474	NC_014554	CAT	2	6	1224944	1224949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180297
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19479	NC_014554	GAC	2	6	1225124	1225129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180297
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19482	NC_014554	ATT	2	6	1225305	1225310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180297
19483	NC_014554	TTC	2	6	1225332	1225337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180297
19484	NC_014554	TCA	2	6	1225343	1225348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180297
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19492	NC_014554	GTT	2	6	1226004	1226009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180298
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19494	NC_014554	GCG	2	6	1226037	1226042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180298
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