MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014554	CTT	2	6	1166153	1166158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180243
18502	NC_014554	ATTT	2	8	1166173	1166180	25 %	75 %	0 %	0 %	308180243
18503	NC_014554	TCT	2	6	1166185	1166190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180243
18504	NC_014554	ACG	2	6	1166220	1166225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180243
18505	NC_014554	TTA	2	6	1166230	1166235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180243
18506	NC_014554	GTT	2	6	1166264	1166269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180243
18507	NC_014554	GAT	2	6	1166280	1166285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180243
18508	NC_014554	ATTC	2	8	1166340	1166347	25 %	50 %	0 %	25 %	308180243
18509	NC_014554	GCCC	2	8	1166526	1166533	0 %	0 %	25 %	75 %	308180243
18510	NC_014554	GGC	2	6	1166554	1166559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180243
18511	NC_014554	GTTA	2	8	1166603	1166610	25 %	50 %	25 %	0 %	308180243
18512	NC_014554	TACGGC	2	12	1166643	1166654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308180243
18513	NC_014554	GAA	2	6	1166691	1166696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180243
18514	NC_014554	AAT	2	6	1166709	1166714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180243
18515	NC_014554	TTA	2	6	1166721	1166726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180243
18516	NC_014554	ATC	2	6	1166731	1166736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180243
18517	NC_014554	ATG	2	6	1166755	1166760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180243
18518	NC_014554	TTG	2	6	1166788	1166793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180243
18519	NC_014554	TGG	2	6	1166795	1166800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180243
18520	NC_014554	GATTG	2	10	1166874	1166883	20 %	40 %	40 %	0 %	308180243
18521	NC_014554	CAAT	2	8	1166918	1166925	50 %	25 %	0 %	25 %	308180243
18522	NC_014554	GAA	2	6	1166966	1166971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180243
18523	NC_014554	GCC	2	6	1166991	1166996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180243
18524	NC_014554	AAG	2	6	1167000	1167005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180243
18525	NC_014554	CAA	2	6	1167048	1167053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180243
18526	NC_014554	AGG	2	6	1167070	1167075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308180243
18527	NC_014554	TAT	2	6	1167085	1167090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180244
18528	NC_014554	GACT	2	8	1167149	1167156	25 %	25 %	25 %	25 %	308180244
18529	NC_014554	AAG	2	6	1167163	1167168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180244
18530	NC_014554	CTT	2	6	1167273	1167278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180244
18531	NC_014554	AGTC	2	8	1167286	1167293	25 %	25 %	25 %	25 %	308180244
18532	NC_014554	ATT	2	6	1167403	1167408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180244
18533	NC_014554	TGG	2	6	1167484	1167489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180244
18534	NC_014554	ATT	2	6	1167519	1167524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180244
18535	NC_014554	AAG	2	6	1167548	1167553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180244
18536	NC_014554	GGAT	2	8	1167567	1167574	25 %	25 %	50 %	0 %	308180244
18537	NC_014554	ATGA	2	8	1167676	1167683	50 %	25 %	25 %	0 %	308180244
18538	NC_014554	ATG	2	6	1167701	1167706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180244
18539	NC_014554	ATG	2	6	1167722	1167727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180244
18540	NC_014554	ATA	2	6	1167818	1167823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180244
18541	NC_014554	AAT	2	6	1167868	1167873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180244
18542	NC_014554	AAT	2	6	1167889	1167894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180244
18543	NC_014554	GGC	2	6	1167897	1167902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180244
18544	NC_014554	TCG	2	6	1168058	1168063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180244
18545	NC_014554	TTG	2	6	1168118	1168123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180244
18546	NC_014554	TGC	2	6	1168209	1168214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180244
18547	NC_014554	TGT	2	6	1168328	1168333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180244
18548	NC_014554	ATT	2	6	1168396	1168401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180244
18549	NC_014554	CAA	2	6	1168444	1168449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180244
18550	NC_014554	TTG	2	6	1168471	1168476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180244
18551	NC_014554	AGA	2	6	1168539	1168544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180244
18552	NC_014554	GGT	2	6	1168707	1168712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180245
18553	NC_014554	AAG	2	6	1168743	1168748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180245
18554	NC_014554	CAA	2	6	1168949	1168954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180246
18555	NC_014554	GGC	2	6	1168959	1168964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180246
18556	NC_014554	TAA	2	6	1168978	1168983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180246
18557	NC_014554	CAC	2	6	1169059	1169064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180246
18558	NC_014554	GCT	2	6	1169292	1169297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180246
18559	NC_014554	GTC	2	6	1169313	1169318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180246
18560	NC_014554	AGT	2	6	1169363	1169368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180246
18561	NC_014554	GAC	2	6	1169444	1169449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180246
18562	NC_014554	TA	4	8	1169581	1169588	50 %	50 %	0 %	0 %	308180247
18563	NC_014554	ATC	2	6	1169660	1169665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180247
18564	NC_014554	AGCC	2	8	1169699	1169706	25 %	0 %	25 %	50 %	308180247
18565	NC_014554	AGT	2	6	1169727	1169732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180247
18566	NC_014554	GTT	2	6	1169771	1169776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180247
18567	NC_014554	C	6	6	1169803	1169808	0 %	0 %	0 %	100 %	308180247
18568	NC_014554	TGGCCG	2	12	1169833	1169844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308180247
18569	NC_014554	ATG	2	6	1169846	1169851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180247
18570	NC_014554	TGA	2	6	1169859	1169864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180247
18571	NC_014554	GGT	2	6	1169893	1169898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180247
18572	NC_014554	AGA	2	6	1169907	1169912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180247
18573	NC_014554	CCAG	2	8	1169934	1169941	25 %	0 %	25 %	50 %	308180247
18574	NC_014554	ATGGTG	2	12	1169969	1169980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	308180247
18575	NC_014554	ATG	2	6	1170037	1170042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180247
18576	NC_014554	GT	3	6	1170070	1170075	0 %	50 %	50 %	0 %	308180247
18577	NC_014554	TCC	2	6	1170185	1170190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308180247
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18579	NC_014554	ATT	2	6	1170200	1170205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180247
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18581	NC_014554	ATT	2	6	1170713	1170718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180248
18582	NC_014554	GGAA	2	8	1170719	1170726	50 %	0 %	50 %	0 %	308180248
18583	NC_014554	ACG	2	6	1170751	1170756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180248
18584	NC_014554	AAG	3	9	1170760	1170768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180248
18585	NC_014554	GTGAA	2	10	1171037	1171046	40 %	20 %	40 %	0 %	308180248
18586	NC_014554	TAC	2	6	1171063	1171068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180248
18587	NC_014554	AAG	2	6	1171102	1171107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180248
18588	NC_014554	GGCTT	2	10	1171108	1171117	0 %	40 %	40 %	20 %	308180248
18589	NC_014554	ATG	2	6	1171153	1171158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18590	NC_014554	GTT	2	6	1171168	1171173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180248
18591	NC_014554	GAA	2	6	1171180	1171185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180248
18592	NC_014554	ATG	2	6	1171217	1171222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18593	NC_014554	TTGA	2	8	1171279	1171286	25 %	50 %	25 %	0 %	308180248
18594	NC_014554	ATTG	2	8	1171300	1171307	25 %	50 %	25 %	0 %	308180248
18595	NC_014554	CAA	2	6	1171327	1171332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180248
18596	NC_014554	GAC	2	6	1171491	1171496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180248
18597	NC_014554	CAT	2	6	1171686	1171691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180248
18598	NC_014554	ATG	2	6	1171706	1171711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18599	NC_014554	ATTTG	2	10	1171737	1171746	20 %	60 %	20 %	0 %	308180248
18600	NC_014554	CAA	2	6	1171786	1171791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180248
18601	NC_014554	TTG	2	6	1171829	1171834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180248
18602	NC_014554	GAT	2	6	1171866	1171871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18603	NC_014554	AAG	2	6	1171903	1171908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180248
18604	NC_014554	TCT	2	6	1171934	1171939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180248
18605	NC_014554	ACG	2	6	1171996	1172001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180248
18606	NC_014554	CGA	2	6	1172091	1172096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180248
18607	NC_014554	GTC	2	6	1172107	1172112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180248
18608	NC_014554	CTT	2	6	1172181	1172186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180248
18609	NC_014554	CCAA	2	8	1172347	1172354	50 %	0 %	0 %	50 %	308180248
18610	NC_014554	AGTT	2	8	1172369	1172376	25 %	50 %	25 %	0 %	308180248
18611	NC_014554	GAT	2	6	1172385	1172390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18612	NC_014554	GAT	2	6	1172446	1172451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
18613	NC_014554	TTG	2	6	1172453	1172458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180248
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18615	NC_014554	ATG	2	6	1172722	1172727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180248
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18731	NC_014554	GCT	2	6	1179551	1179556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180254
18732	NC_014554	GAT	2	6	1179560	1179565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180254
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