MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014554	GAA	2	6	1000650	1000655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16002	NC_014554	ATG	2	6	1000718	1000723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16003	NC_014554	A	7	7	1000756	1000762	100 %	0 %	0 %	0 %	308180108
16004	NC_014554	GAA	2	6	1000786	1000791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16005	NC_014554	CGC	2	6	1000853	1000858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180108
16006	NC_014554	AGA	2	6	1000896	1000901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16007	NC_014554	GAA	2	6	1000969	1000974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16008	NC_014554	CGGC	2	8	1001008	1001015	0 %	0 %	50 %	50 %	308180108
16009	NC_014554	GAA	2	6	1001049	1001054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16010	NC_014554	GAA	2	6	1001095	1001100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16011	NC_014554	CAA	3	9	1001107	1001115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180108
16012	NC_014554	CAA	2	6	1001140	1001145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180108
16013	NC_014554	TGA	2	6	1001160	1001165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16014	NC_014554	AAC	2	6	1001166	1001171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180108
16015	NC_014554	AAGG	2	8	1001197	1001204	50 %	0 %	50 %	0 %	308180108
16016	NC_014554	GAT	2	6	1001209	1001214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16017	NC_014554	CAG	2	6	1001243	1001248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180108
16018	NC_014554	GAT	2	6	1001257	1001262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16019	NC_014554	AAG	2	6	1001281	1001286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16020	NC_014554	ATG	2	6	1001351	1001356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16021	NC_014554	GT	3	6	1001360	1001365	0 %	50 %	50 %	0 %	308180108
16022	NC_014554	CTT	2	6	1001391	1001396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180108
16023	NC_014554	ACT	2	6	1001441	1001446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180108
16024	NC_014554	GACT	2	8	1001499	1001506	25 %	25 %	25 %	25 %	308180108
16025	NC_014554	AACT	2	8	1001514	1001521	50 %	25 %	0 %	25 %	308180108
16026	NC_014554	GAT	2	6	1001529	1001534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16027	NC_014554	GAT	2	6	1001538	1001543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16028	NC_014554	AAG	2	6	1001575	1001580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16029	NC_014554	GAC	2	6	1001680	1001685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180108
16030	NC_014554	ATA	2	6	1001693	1001698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180108
16031	NC_014554	CAA	2	6	1001701	1001706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180108
16032	NC_014554	TGA	2	6	1001712	1001717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180108
16033	NC_014554	GAA	2	6	1001769	1001774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180108
16034	NC_014554	GTC	2	6	1001800	1001805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180108
16035	NC_014554	CAT	2	6	1001822	1001827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180108
16036	NC_014554	TTAT	2	8	1001965	1001972	25 %	75 %	0 %	0 %	308180109
16037	NC_014554	ACG	2	6	1002066	1002071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180109
16038	NC_014554	CGG	2	6	1002085	1002090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180109
16039	NC_014554	TGA	2	6	1002092	1002097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180109
16040	NC_014554	AGC	2	6	1002137	1002142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180109
16041	NC_014554	TGG	2	6	1002143	1002148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180109
16042	NC_014554	ATCA	2	8	1002159	1002166	50 %	25 %	0 %	25 %	308180109
16043	NC_014554	AGT	2	6	1002167	1002172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180109
16044	NC_014554	GCG	2	6	1002194	1002199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180109
16045	NC_014554	TAT	2	6	1002212	1002217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180109
16046	NC_014554	CGG	2	6	1002220	1002225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180109
16047	NC_014554	GCG	2	6	1002279	1002284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180109
16048	NC_014554	TGG	2	6	1002365	1002370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180109
16049	NC_014554	TTA	2	6	1002456	1002461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180109
16050	NC_014554	ATG	2	6	1002496	1002501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180109
16051	NC_014554	TGG	2	6	1002557	1002562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180109
16052	NC_014554	GAT	2	6	1002594	1002599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180109
16053	NC_014554	ATT	2	6	1002615	1002620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180109
16054	NC_014554	TGG	2	6	1002674	1002679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180109
16055	NC_014554	ATT	2	6	1002702	1002707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180109
16056	NC_014554	GTC	2	6	1002726	1002731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180109
16057	NC_014554	GGT	2	6	1002783	1002788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180109
16058	NC_014554	CGGAT	2	10	1002844	1002853	20 %	20 %	40 %	20 %	308180109
16059	NC_014554	ACGGAT	2	12	1002870	1002881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308180109
16060	NC_014554	GAC	2	6	1002948	1002953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180109
16061	NC_014554	A	6	6	1002955	1002960	100 %	0 %	0 %	0 %	308180109
16062	NC_014554	AGA	2	6	1003427	1003432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180110
16063	NC_014554	A	6	6	1003432	1003437	100 %	0 %	0 %	0 %	308180110
16064	NC_014554	GAC	2	6	1003457	1003462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180110
16065	NC_014554	GAA	2	6	1003463	1003468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180110
16066	NC_014554	CAC	2	6	1003558	1003563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180110
16067	NC_014554	ACA	2	6	1003565	1003570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180110
16068	NC_014554	ATT	2	6	1003619	1003624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180110
16069	NC_014554	GAT	2	6	1003641	1003646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180110
16070	NC_014554	AAG	2	6	1003752	1003757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180110
16071	NC_014554	TCA	2	6	1003763	1003768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180110
16072	NC_014554	ATT	2	6	1003786	1003791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180110
16073	NC_014554	CAT	2	6	1003878	1003883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180110
16074	NC_014554	GAT	2	6	1003934	1003939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180110
16075	NC_014554	GTT	2	6	1003941	1003946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180110
16076	NC_014554	CGAA	2	8	1003956	1003963	50 %	0 %	25 %	25 %	308180110
16077	NC_014554	CA	3	6	1003988	1003993	50 %	0 %	0 %	50 %	308180110
16078	NC_014554	AGC	2	6	1004003	1004008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180110
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16081	NC_014554	GAT	2	6	1004109	1004114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180110
16082	NC_014554	CAAG	2	8	1004291	1004298	50 %	0 %	25 %	25 %	308180110
16083	NC_014554	CAG	2	6	1004320	1004325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180110
16084	NC_014554	TCG	2	6	1004446	1004451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180110
16085	NC_014554	GGT	2	6	1004519	1004524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180110
16086	NC_014554	ATG	2	6	1005129	1005134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180111
16087	NC_014554	AGA	2	6	1005141	1005146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180111
16088	NC_014554	TTA	2	6	1005291	1005296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180111
16089	NC_014554	TGA	2	6	1005368	1005373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180111
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16091	NC_014554	TTA	2	6	1005438	1005443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180111
16092	NC_014554	GAT	2	6	1005531	1005536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180111
16093	NC_014554	GTT	2	6	1005572	1005577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180111
16094	NC_014554	GGC	2	6	1005600	1005605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180111
16095	NC_014554	TGA	2	6	1005632	1005637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180111
16096	NC_014554	AC	3	6	1005675	1005680	50 %	0 %	0 %	50 %	308180111
16097	NC_014554	CTG	2	6	1005685	1005690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180111
16098	NC_014554	A	6	6	1005699	1005704	100 %	0 %	0 %	0 %	308180111
16099	NC_014554	CCA	2	6	1005969	1005974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180112
16100	NC_014554	TTAT	2	8	1005985	1005992	25 %	75 %	0 %	0 %	308180112
16101	NC_014554	ATT	2	6	1006267	1006272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180112
16102	NC_014554	CCG	2	6	1006294	1006299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180112
16103	NC_014554	GAT	2	6	1006343	1006348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16104	NC_014554	TTA	2	6	1006455	1006460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180112
16105	NC_014554	TGA	2	6	1006471	1006476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16106	NC_014554	TGG	2	6	1006501	1006506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180112
16107	NC_014554	AGC	2	6	1006567	1006572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180112
16108	NC_014554	CGG	2	6	1006583	1006588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180112
16109	NC_014554	ATT	2	6	1006646	1006651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180112
16110	NC_014554	ATG	2	6	1006682	1006687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16111	NC_014554	GAT	2	6	1006741	1006746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16112	NC_014554	GCT	2	6	1006784	1006789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180112
16113	NC_014554	AGTT	2	8	1006905	1006912	25 %	50 %	25 %	0 %	308180112
16114	NC_014554	CAG	2	6	1006950	1006955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180112
16115	NC_014554	TGA	3	9	1006990	1006998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16116	NC_014554	CCA	2	6	1007039	1007044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180112
16117	NC_014554	TTC	2	6	1007061	1007066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180112
16118	NC_014554	TTC	2	6	1007071	1007076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180112
16119	NC_014554	AGTGG	2	10	1007085	1007094	20 %	20 %	60 %	0 %	308180112
16120	NC_014554	ATTT	2	8	1007137	1007144	25 %	75 %	0 %	0 %	308180112
16121	NC_014554	CAA	2	6	1007192	1007197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180112
16122	NC_014554	GCC	2	6	1007228	1007233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180112
16123	NC_014554	ACG	2	6	1007237	1007242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180112
16124	NC_014554	GAC	2	6	1007311	1007316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180112
16125	NC_014554	T	7	7	1007323	1007329	0 %	100 %	0 %	0 %	308180112
16126	NC_014554	CGC	2	6	1007505	1007510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180112
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16128	NC_014554	GTA	2	6	1007613	1007618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
16129	NC_014554	CGC	2	6	1007717	1007722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180112
16130	NC_014554	AAT	2	6	1007729	1007734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180112
16131	NC_014554	CGC	2	6	1007746	1007751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180112
16132	NC_014554	TGGT	2	8	1007862	1007869	0 %	50 %	50 %	0 %	308180112
16133	NC_014554	TCA	2	6	1007988	1007993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180112
16134	NC_014554	TAA	2	6	1008004	1008009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180112
16135	NC_014554	GT	3	6	1008045	1008050	0 %	50 %	50 %	0 %	308180112
16136	NC_014554	TGA	2	6	1008051	1008056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180112
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16139	NC_014554	TACC	2	8	1008221	1008228	25 %	25 %	0 %	50 %	308180112
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16142	NC_014554	TGA	2	6	1008562	1008567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180113
16143	NC_014554	TTG	2	6	1008599	1008604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180113
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16146	NC_014554	CATT	2	8	1008663	1008670	25 %	50 %	0 %	25 %	308180113
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16167	NC_014554	ATCT	2	8	1009592	1009599	25 %	50 %	0 %	25 %	308180113
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16202	NC_014554	ATA	2	6	1011380	1011385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180115
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16223	NC_014554	TGA	2	6	1013562	1013567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180118
16224	NC_014554	GCT	2	6	1013593	1013598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180118
16225	NC_014554	GTT	2	6	1013602	1013607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180118
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16227	NC_014554	ACA	2	6	1013841	1013846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180119
16228	NC_014554	TGC	2	6	1013856	1013861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180119
16229	NC_014554	GCC	2	6	1013929	1013934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180119
16230	NC_014554	TCG	2	6	1014074	1014079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180119
16231	NC_014554	AGCC	2	8	1014083	1014090	25 %	0 %	25 %	50 %	308180119
16232	NC_014554	CAA	2	6	1014100	1014105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180119
16233	NC_014554	TAT	2	6	1014152	1014157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180119
16234	NC_014554	AGC	2	6	1014162	1014167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180119
16235	NC_014554	GAA	2	6	1014292	1014297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180119
16236	NC_014554	TCT	2	6	1014305	1014310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180119
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16238	NC_014554	TAC	2	6	1014403	1014408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180119
16239	NC_014554	TACGC	2	10	1014455	1014464	20 %	20 %	20 %	40 %	308180119
16240	NC_014554	CTG	2	6	1014560	1014565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180119
16241	NC_014554	CCAAT	2	10	1014632	1014641	40 %	20 %	0 %	40 %	308180119
16242	NC_014554	GC	3	6	1014652	1014657	0 %	0 %	50 %	50 %	308180119
16243	NC_014554	GGC	2	6	1014713	1014718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180119
16244	NC_014554	TAA	2	6	1014735	1014740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180119
16245	NC_014554	TAT	2	6	1014743	1014748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180119
16246	NC_014554	GCG	3	9	1014850	1014858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180120
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16249	NC_014554	G	8	8	1015110	1015117	0 %	0 %	100 %	0 %	308180120
16250	NC_014554	TTG	2	6	1015166	1015171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180120
16251	NC_014554	GAT	3	9	1015233	1015241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180120
16252	NC_014554	CGA	2	6	1015245	1015250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180120
16253	NC_014554	CTT	2	6	1015335	1015340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180120
16254	NC_014554	A	6	6	1015400	1015405	100 %	0 %	0 %	0 %	308180120
16255	NC_014554	GGT	2	6	1015437	1015442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180120
16256	NC_014554	TTC	2	6	1015531	1015536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180120
16257	NC_014554	GGCAA	2	10	1015655	1015664	40 %	0 %	40 %	20 %	308180120
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