MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014554	GAA	2	6	820080	820085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179936
13002	NC_014554	GAT	2	6	820201	820206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179936
13003	NC_014554	TGA	2	6	820221	820226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179936
13004	NC_014554	GTT	2	6	820251	820256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179936
13005	NC_014554	TTA	2	6	820270	820275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179936
13006	NC_014554	GTC	2	6	820283	820288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179936
13007	NC_014554	ATT	2	6	820314	820319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179936
13008	NC_014554	CAGC	2	8	820331	820338	25 %	0 %	25 %	50 %	308179936
13009	NC_014554	TGA	2	6	820410	820415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179936
13010	NC_014554	GGT	2	6	820475	820480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179936
13011	NC_014554	GAT	2	6	820504	820509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179936
13012	NC_014554	AGC	2	6	820555	820560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179936
13013	NC_014554	AGTT	2	8	820787	820794	25 %	50 %	25 %	0 %	308179936
13014	NC_014554	AGC	2	6	820881	820886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179936
13015	NC_014554	CGA	2	6	820902	820907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179936
13016	NC_014554	TGG	2	6	820932	820937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179936
13017	NC_014554	ATG	2	6	821377	821382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13018	NC_014554	CG	3	6	821497	821502	0 %	0 %	50 %	50 %	308179937
13019	NC_014554	TGATT	2	10	821577	821586	20 %	60 %	20 %	0 %	308179937
13020	NC_014554	GTT	2	6	821632	821637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13021	NC_014554	TGA	3	9	821667	821675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13022	NC_014554	AGC	2	6	821677	821682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13023	NC_014554	GTC	2	6	821759	821764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13024	NC_014554	ATG	2	6	821777	821782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13025	NC_014554	ATT	2	6	821866	821871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13026	NC_014554	ATA	2	6	822017	822022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179937
13027	NC_014554	TAG	2	6	822111	822116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13028	NC_014554	TTA	2	6	822130	822135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13029	NC_014554	AT	3	6	822151	822156	50 %	50 %	0 %	0 %	308179937
13030	NC_014554	ATT	2	6	822169	822174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13031	NC_014554	AAGC	2	8	822175	822182	50 %	0 %	25 %	25 %	308179937
13032	NC_014554	ACC	2	6	822188	822193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179937
13033	NC_014554	TG	3	6	822210	822215	0 %	50 %	50 %	0 %	308179937
13034	NC_014554	ACG	2	6	822220	822225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13035	NC_014554	CCT	2	6	822245	822250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308179937
13036	NC_014554	CAGT	2	8	822258	822265	25 %	25 %	25 %	25 %	308179937
13037	NC_014554	TTA	2	6	822268	822273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13038	NC_014554	AAC	2	6	822366	822371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179937
13039	NC_014554	CTG	2	6	822407	822412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13040	NC_014554	AGC	2	6	822422	822427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13041	NC_014554	GAC	2	6	822456	822461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13042	NC_014554	AGA	2	6	822467	822472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179937
13043	NC_014554	AAT	2	6	822475	822480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179937
13044	NC_014554	A	6	6	822585	822590	100 %	0 %	0 %	0 %	308179937
13045	NC_014554	GAG	2	6	822850	822855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179937
13046	NC_014554	TTG	2	6	822883	822888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13047	NC_014554	GTT	2	6	822972	822977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13048	NC_014554	GAC	2	6	823042	823047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13049	NC_014554	GAT	2	6	823069	823074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13050	NC_014554	GTACG	2	10	823125	823134	20 %	20 %	40 %	20 %	308179937
13051	NC_014554	ATT	2	6	823160	823165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13052	NC_014554	ATA	2	6	823217	823222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179937
13053	NC_014554	TTG	2	6	823235	823240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13054	NC_014554	CAAA	2	8	823356	823363	75 %	0 %	0 %	25 %	308179937
13055	NC_014554	ATT	2	6	823378	823383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13056	NC_014554	GTT	2	6	823425	823430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13057	NC_014554	CTT	2	6	823452	823457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179937
13058	NC_014554	ATG	2	6	823469	823474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13059	NC_014554	CAGT	2	8	823534	823541	25 %	25 %	25 %	25 %	308179937
13060	NC_014554	GAC	2	6	823543	823548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13061	NC_014554	TCC	2	6	823604	823609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308179937
13062	NC_014554	TA	3	6	823613	823618	50 %	50 %	0 %	0 %	308179937
13063	NC_014554	ATG	2	6	823634	823639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
13064	NC_014554	GTC	2	6	823854	823859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179937
13065	NC_014554	TTG	2	6	823897	823902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13066	NC_014554	TTG	2	6	823942	823947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179937
13067	NC_014554	TGAA	2	8	823958	823965	50 %	25 %	25 %	0 %	308179937
13068	NC_014554	GAT	2	6	823990	823995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179937
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13070	NC_014554	ATT	2	6	824140	824145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179937
13071	NC_014554	GA	3	6	824177	824182	50 %	0 %	50 %	0 %	308179937
13072	NC_014554	TGA	2	6	826188	826193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179938
13073	NC_014554	CAC	2	6	826195	826200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179938
13074	NC_014554	ACT	2	6	826275	826280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179938
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13076	NC_014554	TGG	2	6	826476	826481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179938
13077	NC_014554	TCG	2	6	826564	826569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179938
13078	NC_014554	GAG	2	6	826619	826624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179938
13079	NC_014554	CAGT	2	8	826771	826778	25 %	25 %	25 %	25 %	308179938
13080	NC_014554	CTAG	2	8	826802	826809	25 %	25 %	25 %	25 %	308179938
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13089	NC_014554	TTAC	2	8	827354	827361	25 %	50 %	0 %	25 %	308179939
13090	NC_014554	AAC	3	9	827374	827382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179939
13091	NC_014554	TGA	2	6	827467	827472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179939
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13095	NC_014554	GT	3	6	827599	827604	0 %	50 %	50 %	0 %	308179939
13096	NC_014554	AAGG	2	8	827650	827657	50 %	0 %	50 %	0 %	308179939
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13101	NC_014554	CTAC	2	8	827876	827883	25 %	25 %	0 %	50 %	308179939
13102	NC_014554	TAA	2	6	827894	827899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179939
13103	NC_014554	TTGA	2	8	828006	828013	25 %	50 %	25 %	0 %	308179939
13104	NC_014554	TAAAC	2	10	828038	828047	60 %	20 %	0 %	20 %	308179939
13105	NC_014554	GAA	2	6	828062	828067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179939
13106	NC_014554	TGTT	2	8	828085	828092	0 %	75 %	25 %	0 %	308179939
13107	NC_014554	TAT	2	6	828242	828247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179940
13108	NC_014554	T	7	7	828275	828281	0 %	100 %	0 %	0 %	308179940
13109	NC_014554	GAA	2	6	828504	828509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179940
13110	NC_014554	ATCG	2	8	828516	828523	25 %	25 %	25 %	25 %	308179940
13111	NC_014554	AAC	2	6	828630	828635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179940
13112	NC_014554	ACT	2	6	828649	828654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179940
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13115	NC_014554	ATC	2	6	828883	828888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179940
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13118	NC_014554	GAC	2	6	829070	829075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179940
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13120	NC_014554	AAT	2	6	829826	829831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179941
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13354	NC_014554	GAA	2	6	843312	843317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179952
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13478	NC_014554	TTA	2	6	850575	850580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179960
13479	NC_014554	ATG	2	6	850587	850592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179960
13480	NC_014554	AAC	2	6	850653	850658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179960
13481	NC_014554	TAA	2	6	850699	850704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179960
13482	NC_014554	GCG	2	6	850904	850909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179960
13483	NC_014554	CAC	2	6	851017	851022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179960
13484	NC_014554	ACG	2	6	851042	851047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179960
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13491	NC_014554	GACT	2	8	851510	851517	25 %	25 %	25 %	25 %	308179961
13492	NC_014554	AAAT	2	8	851591	851598	75 %	25 %	0 %	0 %	308179961
13493	NC_014554	TAC	2	6	851613	851618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179961
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