MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_014554	GAA	2	6	537345	537350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179686
8503	NC_014554	CCAAT	2	10	537433	537442	40 %	20 %	0 %	40 %	308179686
8504	NC_014554	T	6	6	537457	537462	0 %	100 %	0 %	0 %	308179686
8505	NC_014554	AGTG	2	8	537525	537532	25 %	25 %	50 %	0 %	308179686
8506	NC_014554	GGC	2	6	537539	537544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179686
8507	NC_014554	GT	4	8	537565	537572	0 %	50 %	50 %	0 %	308179686
8508	NC_014554	TAT	2	6	537665	537670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179686
8509	NC_014554	CGT	2	6	537720	537725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8510	NC_014554	GTT	2	6	537741	537746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179686
8511	NC_014554	GCT	2	6	537786	537791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8512	NC_014554	ATC	2	6	537832	537837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179686
8513	NC_014554	CTTT	2	8	537893	537900	0 %	75 %	0 %	25 %	308179686
8514	NC_014554	TGC	2	6	537990	537995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8515	NC_014554	T	6	6	538042	538047	0 %	100 %	0 %	0 %	308179686
8516	NC_014554	TGG	2	6	538065	538070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179686
8517	NC_014554	TTC	2	6	538132	538137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179686
8518	NC_014554	AGC	2	6	538164	538169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8519	NC_014554	TCC	2	6	538175	538180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308179686
8520	NC_014554	GAC	2	6	538197	538202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8521	NC_014554	TTG	2	6	538214	538219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179686
8522	NC_014554	CGT	2	6	538236	538241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8523	NC_014554	AGC	2	6	538292	538297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179686
8524	NC_014554	GCC	2	6	538306	538311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179686
8525	NC_014554	TGA	3	9	538314	538322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179686
8526	NC_014554	TCA	2	6	538328	538333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179686
8527	NC_014554	ATTA	2	8	538364	538371	50 %	50 %	0 %	0 %	308179686
8528	NC_014554	ATA	2	6	538567	538572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179687
8529	NC_014554	CAG	2	6	538603	538608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179687
8530	NC_014554	TCA	2	6	538625	538630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179687
8531	NC_014554	GGC	2	6	538855	538860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179687
8532	NC_014554	GCC	2	6	538877	538882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179687
8533	NC_014554	GTT	2	6	538883	538888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179687
8534	NC_014554	GCC	2	6	538935	538940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179687
8535	NC_014554	CAT	2	6	538982	538987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179687
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8538	NC_014554	GTA	2	6	539056	539061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179687
8539	NC_014554	TGCG	2	8	539065	539072	0 %	25 %	50 %	25 %	308179687
8540	NC_014554	AGA	2	6	539183	539188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179687
8541	NC_014554	ATG	2	6	539615	539620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179688
8542	NC_014554	TAT	3	9	539634	539642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179688
8543	NC_014554	ACG	2	6	539759	539764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179688
8544	NC_014554	CTA	2	6	539776	539781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179688
8545	NC_014554	TA	3	6	539813	539818	50 %	50 %	0 %	0 %	308179688
8546	NC_014554	TCA	2	6	539868	539873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179688
8547	NC_014554	AGACG	2	10	540013	540022	40 %	0 %	40 %	20 %	308179688
8548	NC_014554	GAC	2	6	540025	540030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179688
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8551	NC_014554	GT	3	6	540109	540114	0 %	50 %	50 %	0 %	308179688
8552	NC_014554	CCAG	2	8	540134	540141	25 %	0 %	25 %	50 %	308179688
8553	NC_014554	AAC	2	6	540215	540220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179688
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8557	NC_014554	AAC	3	9	540590	540598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179689
8558	NC_014554	TCCA	2	8	540615	540622	25 %	25 %	0 %	50 %	308179689
8559	NC_014554	GAA	2	6	540638	540643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179689
8560	NC_014554	GTTG	2	8	540693	540700	0 %	50 %	50 %	0 %	308179689
8561	NC_014554	TCA	2	6	540742	540747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179689
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8563	NC_014554	GGA	2	6	540854	540859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179689
8564	NC_014554	AACCA	2	10	540874	540883	60 %	0 %	0 %	40 %	308179689
8565	NC_014554	GTC	2	6	541019	541024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179689
8566	NC_014554	TGA	2	6	541036	541041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179689
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8568	NC_014554	ATC	2	6	541130	541135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179689
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8570	NC_014554	CGT	2	6	541234	541239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179689
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8572	NC_014554	TGT	2	6	541333	541338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179689
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8579	NC_014554	AATG	2	8	541581	541588	50 %	25 %	25 %	0 %	308179689
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8581	NC_014554	TGCT	2	8	541714	541721	0 %	50 %	25 %	25 %	308179689
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8588	NC_014554	GGC	2	6	542282	542287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179690
8589	NC_014554	CCA	2	6	542289	542294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179690
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8601	NC_014554	CAC	2	6	543093	543098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179692
8602	NC_014554	CAAG	2	8	543099	543106	50 %	0 %	25 %	25 %	308179692
8603	NC_014554	GCG	2	6	543127	543132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179692
8604	NC_014554	CAT	2	6	543193	543198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179692
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8606	NC_014554	ATGA	2	8	543283	543290	50 %	25 %	25 %	0 %	308179692
8607	NC_014554	TACT	2	8	543298	543305	25 %	50 %	0 %	25 %	308179692
8608	NC_014554	ACT	2	6	543380	543385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179692
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8610	NC_014554	ACT	2	6	544022	544027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179693
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8613	NC_014554	GTTT	2	8	544635	544642	0 %	75 %	25 %	0 %	308179694
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8617	NC_014554	TAC	2	6	544928	544933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179694
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8619	NC_014554	GAA	2	6	544990	544995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179694
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