MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014554	CAAA	2	8	345657	345664	75 %	0 %	0 %	25 %	308179508
5502	NC_014554	AAG	2	6	345822	345827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179509
5503	NC_014554	AAG	2	6	345890	345895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179509
5504	NC_014554	TGA	2	6	345917	345922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179509
5505	NC_014554	TGG	2	6	345927	345932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179509
5506	NC_014554	TAAA	2	8	345946	345953	75 %	25 %	0 %	0 %	308179509
5507	NC_014554	AGA	2	6	346056	346061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179510
5508	NC_014554	ATT	2	6	346091	346096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179510
5509	NC_014554	A	7	7	346098	346104	100 %	0 %	0 %	0 %	308179510
5510	NC_014554	ATGG	2	8	346110	346117	25 %	25 %	50 %	0 %	308179510
5511	NC_014554	TGG	2	6	346140	346145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179510
5512	NC_014554	TTG	2	6	346151	346156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179510
5513	NC_014554	ATG	2	6	346181	346186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179510
5514	NC_014554	TTA	2	6	346218	346223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179510
5515	NC_014554	AAT	2	6	346252	346257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179510
5516	NC_014554	GGC	2	6	346278	346283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179510
5517	NC_014554	AGG	2	6	346326	346331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179510
5518	NC_014554	TA	3	6	346336	346341	50 %	50 %	0 %	0 %	308179510
5519	NC_014554	AAT	2	6	346377	346382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179510
5520	NC_014554	ATA	2	6	346411	346416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179510
5521	NC_014554	A	6	6	346807	346812	100 %	0 %	0 %	0 %	308179511
5522	NC_014554	TAG	2	6	346909	346914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179512
5523	NC_014554	ATT	2	6	346920	346925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179512
5524	NC_014554	TGA	2	6	346963	346968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179512
5525	NC_014554	TAA	2	6	347066	347071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179512
5526	NC_014554	TA	3	6	347534	347539	50 %	50 %	0 %	0 %	308179513
5527	NC_014554	ATATTA	2	12	347565	347576	50 %	50 %	0 %	0 %	308179513
5528	NC_014554	TATT	2	8	347626	347633	25 %	75 %	0 %	0 %	308179513
5529	NC_014554	TTA	2	6	347727	347732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179513
5530	NC_014554	AT	3	6	347761	347766	50 %	50 %	0 %	0 %	308179513
5531	NC_014554	TCAAAG	2	12	347788	347799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308179513
5532	NC_014554	ATT	2	6	347804	347809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179513
5533	NC_014554	A	6	6	347816	347821	100 %	0 %	0 %	0 %	308179513
5534	NC_014554	TAG	2	6	347838	347843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179513
5535	NC_014554	TGA	2	6	348498	348503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179514
5536	NC_014554	ATT	2	6	348549	348554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179514
5537	NC_014554	TGGT	2	8	348814	348821	0 %	50 %	50 %	0 %	308179515
5538	NC_014554	TAA	2	6	348849	348854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179515
5539	NC_014554	AAT	2	6	348857	348862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179515
5540	NC_014554	TAG	2	6	348892	348897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179515
5541	NC_014554	TATT	2	8	349186	349193	25 %	75 %	0 %	0 %	308179516
5542	NC_014554	GATT	2	8	349201	349208	25 %	50 %	25 %	0 %	308179516
5543	NC_014554	CGG	2	6	349210	349215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179516
5544	NC_014554	TGT	2	6	349405	349410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179516
5545	NC_014554	GAC	2	6	349420	349425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179516
5546	NC_014554	AGT	2	6	349874	349879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179517
5547	NC_014554	CGA	2	6	349934	349939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179517
5548	NC_014554	ACG	2	6	349981	349986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179517
5549	NC_014554	GTA	2	6	350012	350017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179517
5550	NC_014554	ATG	2	6	350093	350098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179517
5551	NC_014554	ATC	2	6	350175	350180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179517
5552	NC_014554	CCA	2	6	350236	350241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179517
5553	NC_014554	GGT	2	6	350257	350262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179517
5554	NC_014554	TTA	2	6	350440	350445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179517
5555	NC_014554	ATTA	2	8	350452	350459	50 %	50 %	0 %	0 %	308179517
5556	NC_014554	GAT	2	6	350474	350479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179518
5557	NC_014554	AAAG	2	8	350592	350599	75 %	0 %	25 %	0 %	308179518
5558	NC_014554	TGG	2	6	350609	350614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179518
5559	NC_014554	TAAA	2	8	350704	350711	75 %	25 %	0 %	0 %	308179518
5560	NC_014554	ATA	2	6	350762	350767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179518
5561	NC_014554	GCT	2	6	350782	350787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179518
5562	NC_014554	TAAGGT	2	12	350799	350810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179518
5563	NC_014554	CCAG	2	8	350851	350858	25 %	0 %	25 %	50 %	308179518
5564	NC_014554	GCT	2	6	350878	350883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179518
5565	NC_014554	GTGC	2	8	351031	351038	0 %	25 %	50 %	25 %	308179518
5566	NC_014554	GTT	2	6	351049	351054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179518
5567	NC_014554	CCACG	2	10	351081	351090	20 %	0 %	20 %	60 %	308179518
5568	NC_014554	CAA	2	6	351098	351103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179518
5569	NC_014554	CAG	2	6	351153	351158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179518
5570	NC_014554	CAA	2	6	351255	351260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179518
5571	NC_014554	CCTAAT	2	12	351292	351303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179518
5572	NC_014554	ATG	2	6	351361	351366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179518
5573	NC_014554	TAA	2	6	351539	351544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179518
5574	NC_014554	TGG	3	9	351587	351595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179518
5575	NC_014554	CGC	2	6	351725	351730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179519
5576	NC_014554	AGCC	2	8	351827	351834	25 %	0 %	25 %	50 %	308179519
5577	NC_014554	ATGTCG	2	12	351859	351870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308179519
5578	NC_014554	CTG	2	6	351880	351885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179519
5579	NC_014554	TGG	2	6	351948	351953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179519
5580	NC_014554	TCA	3	9	351979	351987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179519
5581	NC_014554	ACG	2	6	352006	352011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179519
5582	NC_014554	TGA	2	6	352018	352023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179519
5583	NC_014554	TAA	2	6	352024	352029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179519
5584	NC_014554	ATC	2	6	352225	352230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179519
5585	NC_014554	GAA	2	6	352245	352250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179519
5586	NC_014554	ATTG	2	8	352268	352275	25 %	50 %	25 %	0 %	308179519
5587	NC_014554	TTG	2	6	352314	352319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179519
5588	NC_014554	TCG	2	6	352342	352347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179519
5589	NC_014554	GTC	2	6	352356	352361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179519
5590	NC_014554	CCAT	2	8	352375	352382	25 %	25 %	0 %	50 %	308179519
5591	NC_014554	TTAAT	2	10	352394	352403	40 %	60 %	0 %	0 %	308179519
5592	NC_014554	AT	3	6	352607	352612	50 %	50 %	0 %	0 %	308179520
5593	NC_014554	GGTC	2	8	352623	352630	0 %	25 %	50 %	25 %	308179520
5594	NC_014554	AGG	2	6	352637	352642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179520
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5596	NC_014554	TTGA	2	8	352786	352793	25 %	50 %	25 %	0 %	308179520
5597	NC_014554	GTT	2	6	352838	352843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179520
5598	NC_014554	CAG	2	6	352918	352923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179520
5599	NC_014554	GTC	2	6	352937	352942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179520
5600	NC_014554	TTG	2	6	352966	352971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179520
5601	NC_014554	TCG	2	6	353072	353077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179520
5602	NC_014554	ATG	3	9	353081	353089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179520
5603	NC_014554	TAG	2	6	353148	353153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179520
5604	NC_014554	ATTC	2	8	353175	353182	25 %	50 %	0 %	25 %	308179520
5605	NC_014554	TCA	2	6	353346	353351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179520
5606	NC_014554	GGT	2	6	353622	353627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179521
5607	NC_014554	CCGG	2	8	353636	353643	0 %	0 %	50 %	50 %	308179521
5608	NC_014554	ATT	2	6	353663	353668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179521
5609	NC_014554	TGA	2	6	353691	353696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179521
5610	NC_014554	TCG	2	6	353750	353755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179521
5611	NC_014554	ACA	2	6	353808	353813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179521
5612	NC_014554	GAC	2	6	354021	354026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179521
5613	NC_014554	AACT	2	8	354060	354067	50 %	25 %	0 %	25 %	308179521
5614	NC_014554	CAA	2	6	354093	354098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179521
5615	NC_014554	GCAG	2	8	354102	354109	25 %	0 %	50 %	25 %	308179521
5616	NC_014554	CTA	2	6	354266	354271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179521
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5618	NC_014554	CAT	2	6	354885	354890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179522
5619	NC_014554	T	6	6	354916	354921	0 %	100 %	0 %	0 %	308179522
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5621	NC_014554	CGA	2	6	355103	355108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179522
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5989	NC_014554	AGA	2	6	376914	376919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179548
5990	NC_014554	TCG	2	6	376925	376930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179548
5991	NC_014554	TAA	2	6	376963	376968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179548
5992	NC_014554	TCG	2	6	376982	376987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179548
5993	NC_014554	GCT	2	6	377105	377110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179548
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5999	NC_014554	GTTCT	2	10	377587	377596	0 %	60 %	20 %	20 %	308179548
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