MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_014554	ATC	2	6	3247451	3247456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182181
51502	NC_014554	CAC	2	6	3247466	3247471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182181
51503	NC_014554	ATG	2	6	3247490	3247495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182181
51504	NC_014554	CCG	2	6	3247624	3247629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182181
51505	NC_014554	ACC	2	6	3247647	3247652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182181
51506	NC_014554	GCAA	2	8	3247653	3247660	50 %	0 %	25 %	25 %	308182181
51507	NC_014554	CA	3	6	3247666	3247671	50 %	0 %	0 %	50 %	308182181
51508	NC_014554	GCT	2	6	3247695	3247700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182181
51509	NC_014554	GC	3	6	3247703	3247708	0 %	0 %	50 %	50 %	308182181
51510	NC_014554	CAG	2	6	3247747	3247752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182181
51511	NC_014554	GGT	2	6	3247817	3247822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182181
51512	NC_014554	ACTG	2	8	3247986	3247993	25 %	25 %	25 %	25 %	308182181
51513	NC_014554	CGT	2	6	3248021	3248026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182181
51514	NC_014554	TGC	2	6	3248033	3248038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182181
51515	NC_014554	CAC	2	6	3248048	3248053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182181
51516	NC_014554	T	7	7	3248099	3248105	0 %	100 %	0 %	0 %	308182181
51517	NC_014554	ACTTCA	2	12	3248118	3248129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182181
51518	NC_014554	GTT	2	6	3248152	3248157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182181
51519	NC_014554	TCA	2	6	3248723	3248728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51520	NC_014554	TGA	2	6	3248750	3248755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182182
51521	NC_014554	GATTG	2	10	3248812	3248821	20 %	40 %	40 %	0 %	308182182
51522	NC_014554	CAG	2	6	3248853	3248858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182182
51523	NC_014554	GCC	2	6	3249041	3249046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182182
51524	NC_014554	CTT	2	6	3249073	3249078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182182
51525	NC_014554	TCT	2	6	3249120	3249125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182182
51526	NC_014554	CAT	2	6	3249190	3249195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51527	NC_014554	TCA	3	9	3249206	3249214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51528	NC_014554	GCC	2	6	3249290	3249295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182182
51529	NC_014554	ATG	2	6	3249310	3249315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182182
51530	NC_014554	GCT	2	6	3249329	3249334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182182
51531	NC_014554	CTT	2	6	3249339	3249344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182182
51532	NC_014554	ATC	2	6	3249361	3249366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51533	NC_014554	CAT	2	6	3249403	3249408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51534	NC_014554	GCC	2	6	3249484	3249489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182182
51535	NC_014554	ACC	2	6	3249502	3249507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182182
51536	NC_014554	TCA	2	6	3249534	3249539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182182
51537	NC_014554	TAT	2	6	3249675	3249680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182182
51538	NC_014554	CCA	2	6	3249721	3249726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182182
51539	NC_014554	ATG	2	6	3249764	3249769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182182
51540	NC_014554	TGTC	2	8	3249795	3249802	0 %	50 %	25 %	25 %	308182182
51541	NC_014554	ACCG	2	8	3249835	3249842	25 %	0 %	25 %	50 %	308182182
51542	NC_014554	GAT	2	6	3249844	3249849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182182
51543	NC_014554	CGT	2	6	3249861	3249866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182182
51544	NC_014554	ATA	2	6	3249947	3249952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182182
51545	NC_014554	CCA	2	6	3250142	3250147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182183
51546	NC_014554	AGA	2	6	3250171	3250176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182183
51547	NC_014554	TCA	2	6	3250209	3250214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182183
51548	NC_014554	GCTT	2	8	3250226	3250233	0 %	50 %	25 %	25 %	308182183
51549	NC_014554	CATCC	2	10	3250348	3250357	20 %	20 %	0 %	60 %	308182183
51550	NC_014554	TCT	2	6	3250524	3250529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182183
51551	NC_014554	TCG	2	6	3250541	3250546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182183
51552	NC_014554	TTGC	2	8	3250570	3250577	0 %	50 %	25 %	25 %	308182183
51553	NC_014554	GCTT	2	8	3250613	3250620	0 %	50 %	25 %	25 %	308182183
51554	NC_014554	AGT	2	6	3250669	3250674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182183
51555	NC_014554	TCG	2	6	3250707	3250712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182183
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51558	NC_014554	AAAT	2	8	3250823	3250830	75 %	25 %	0 %	0 %	308182183
51559	NC_014554	ATT	2	6	3250834	3250839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
51560	NC_014554	TAT	2	6	3250869	3250874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
51561	NC_014554	ATT	2	6	3250879	3250884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
51562	NC_014554	TAT	2	6	3250950	3250955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
51563	NC_014554	AGT	2	6	3251010	3251015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182183
51564	NC_014554	TAA	2	6	3251064	3251069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182183
51565	NC_014554	CGT	2	6	3251089	3251094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182183
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51569	NC_014554	TTA	2	6	3251264	3251269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
51570	NC_014554	GTT	2	6	3251321	3251326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182183
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51580	NC_014554	TAA	3	9	3251665	3251673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182183
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51582	NC_014554	TTGC	2	8	3251709	3251716	0 %	50 %	25 %	25 %	308182183
51583	NC_014554	CAC	2	6	3251855	3251860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182184
51584	NC_014554	CG	3	6	3252454	3252459	0 %	0 %	50 %	50 %	308182185
51585	NC_014554	CGTT	2	8	3252478	3252485	0 %	50 %	25 %	25 %	308182185
51586	NC_014554	GCTT	2	8	3252500	3252507	0 %	50 %	25 %	25 %	308182185
51587	NC_014554	TAA	2	6	3252547	3252552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
51588	NC_014554	AAT	2	6	3252634	3252639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
51589	NC_014554	CGC	2	6	3252730	3252735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182185
51590	NC_014554	GTA	2	6	3252751	3252756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
51591	NC_014554	GAAC	2	8	3252787	3252794	50 %	0 %	25 %	25 %	308182185
51592	NC_014554	CTT	2	6	3252910	3252915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
51593	NC_014554	CTT	2	6	3252964	3252969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
51594	NC_014554	CTT	2	6	3252996	3253001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182185
51595	NC_014554	ATC	2	6	3253031	3253036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182185
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51598	NC_014554	AAT	2	6	3253120	3253125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182185
51599	NC_014554	GAT	2	6	3253144	3253149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182185
51600	NC_014554	TAC	2	6	3253194	3253199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182185
51601	NC_014554	CAG	2	6	3253294	3253299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182186
51602	NC_014554	TGAT	2	8	3253422	3253429	25 %	50 %	25 %	0 %	308182186
51603	NC_014554	TCT	2	6	3253476	3253481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182186
51604	NC_014554	ACCG	2	8	3253483	3253490	25 %	0 %	25 %	50 %	308182186
51605	NC_014554	TTG	2	6	3253582	3253587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182186
51606	NC_014554	T	7	7	3253600	3253606	0 %	100 %	0 %	0 %	308182186
51607	NC_014554	CTT	2	6	3253845	3253850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182187
51608	NC_014554	TGGT	2	8	3253851	3253858	0 %	50 %	50 %	0 %	308182187
51609	NC_014554	TCA	2	6	3253868	3253873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182187

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