MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
2	NC_014554	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	308179192
3	NC_014554	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
4	NC_014554	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
5	NC_014554	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	308179192
6	NC_014554	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
7	NC_014554	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179192
8	NC_014554	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	308179192
9	NC_014554	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	308179192
10	NC_014554	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	308179192
11	NC_014554	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179192
12	NC_014554	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
13	NC_014554	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179192
14	NC_014554	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179192
15	NC_014554	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	308179192
16	NC_014554	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
17	NC_014554	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179192
18	NC_014554	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179192
19	NC_014554	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	308179192
20	NC_014554	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179192
21	NC_014554	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179192
22	NC_014554	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	308179192
23	NC_014554	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	308179192
24	NC_014554	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179192
25	NC_014554	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179193
26	NC_014554	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179193
27	NC_014554	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179193
28	NC_014554	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
29	NC_014554	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
30	NC_014554	A	7	7	1800	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	308179193
31	NC_014554	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
32	NC_014554	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
33	NC_014554	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
34	NC_014554	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
35	NC_014554	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
36	NC_014554	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179193
37	NC_014554	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
38	NC_014554	ACGATT	2	12	2440	2451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308179193
39	NC_014554	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
40	NC_014554	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
41	NC_014554	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	308179193
42	NC_014554	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
43	NC_014554	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	308179194
44	NC_014554	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179194
45	NC_014554	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179194
46	NC_014554	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179194
47	NC_014554	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	308179194
48	NC_014554	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179194
49	NC_014554	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179194
50	NC_014554	TTGAAG	2	12	3385	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179194
51	NC_014554	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	308179194
52	NC_014554	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	308179195
53	NC_014554	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
54	NC_014554	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179195
55	NC_014554	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179195
56	NC_014554	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	308179195
57	NC_014554	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
58	NC_014554	TATGGA	2	12	3845	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
59	NC_014554	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
60	NC_014554	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
61	NC_014554	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
62	NC_014554	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
63	NC_014554	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	308179195
64	NC_014554	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
65	NC_014554	GAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
66	NC_014554	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
67	NC_014554	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
68	NC_014554	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
69	NC_014554	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
70	NC_014554	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179195
71	NC_014554	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
72	NC_014554	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179195
73	NC_014554	CGAAAA	2	12	4570	4581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	308179196
74	NC_014554	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
75	NC_014554	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
76	NC_014554	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
77	NC_014554	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
78	NC_014554	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
79	NC_014554	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179196
80	NC_014554	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	308179196
81	NC_014554	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
82	NC_014554	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
83	NC_014554	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
84	NC_014554	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
85	NC_014554	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
86	NC_014554	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179196
87	NC_014554	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
88	NC_014554	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
89	NC_014554	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
90	NC_014554	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
91	NC_014554	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
92	NC_014554	ATAAGA	2	12	5295	5306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308179196
93	NC_014554	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	308179196
94	NC_014554	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
95	NC_014554	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
96	NC_014554	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179196
97	NC_014554	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	308179196
98	NC_014554	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
99	NC_014554	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
100	NC_014554	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
101	NC_014554	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
102	NC_014554	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
103	NC_014554	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179196
104	NC_014554	A	6	6	5785	5790	100 %	0 %	0 %	0 %	308179196
105	NC_014554	TAG	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
106	NC_014554	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
107	NC_014554	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
108	NC_014554	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
109	NC_014554	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	308179196
110	NC_014554	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
111	NC_014554	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
112	NC_014554	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
113	NC_014554	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	308179196
114	NC_014554	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
115	NC_014554	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
116	NC_014554	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
117	NC_014554	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179196
118	NC_014554	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	308179196
119	NC_014554	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
120	NC_014554	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179197
121	NC_014554	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
122	NC_014554	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179197
123	NC_014554	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
124	NC_014554	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
125	NC_014554	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
126	NC_014554	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179197
127	NC_014554	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
128	NC_014554	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	308179197
129	NC_014554	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
130	NC_014554	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179197
131	NC_014554	AAG	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
132	NC_014554	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
133	NC_014554	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
134	NC_014554	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
135	NC_014554	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
136	NC_014554	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	308179197
137	NC_014554	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179197
138	NC_014554	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
139	NC_014554	TGAAGA	2	12	8166	8177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	308179197
140	NC_014554	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
141	NC_014554	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179197
142	NC_014554	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
143	NC_014554	GAC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
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145	NC_014554	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179197
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153	NC_014554	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	308179197
154	NC_014554	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179197
155	NC_014554	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179197
156	NC_014554	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179197
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159	NC_014554	TGA	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179197
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162	NC_014554	CGA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179198
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169	NC_014554	TGG	2	6	10258	10263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179199
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241	NC_014554	CAAT	2	8	13406	13413	50 %	25 %	0 %	25 %	308179202
242	NC_014554	AGC	2	6	13440	13445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179202
243	NC_014554	TGA	2	6	13500	13505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179202
244	NC_014554	GTT	2	6	13510	13515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179202
245	NC_014554	GTT	2	6	13548	13553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179202
246	NC_014554	CAAA	2	8	13569	13576	75 %	0 %	0 %	25 %	308179202
247	NC_014554	AAC	2	6	13750	13755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179203
248	NC_014554	CAC	2	6	13775	13780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179203
249	NC_014554	GC	3	6	13881	13886	0 %	0 %	50 %	50 %	308179203
250	NC_014554	TTA	2	6	13963	13968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179203
251	NC_014554	GAT	2	6	13987	13992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179203
252	NC_014554	TGG	2	6	13995	14000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179203
253	NC_014554	CTA	2	6	14055	14060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179203
254	NC_014554	GCG	2	6	14091	14096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179203
255	NC_014554	ATG	2	6	14144	14149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179203
256	NC_014554	TTA	2	6	14161	14166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179203
257	NC_014554	GAA	2	6	14257	14262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179203
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259	NC_014554	CCG	2	6	14336	14341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179203
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388	NC_014554	ATG	2	6	22370	22375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179209
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392	NC_014554	GAT	2	6	22684	22689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179209
393	NC_014554	GCT	2	6	22750	22755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179209
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497	NC_014554	ATTG	2	8	28148	28155	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
498	NC_014554	GGC	3	9	28177	28185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
499	NC_014554	TTA	2	6	28194	28199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179213
500	NC_014554	CAA	2	6	28218	28223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213

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