MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_014334	CAG	2	6	2831088	2831093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067902
46002	NC_014334	CG	3	6	2831166	2831171	0 %	0 %	50 %	50 %	301067902
46003	NC_014334	GCCT	2	8	2831188	2831195	0 %	25 %	25 %	50 %	301067902
46004	NC_014334	TCA	2	6	2831213	2831218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067902
46005	NC_014334	TCA	2	6	2831378	2831383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46006	NC_014334	CTT	2	6	2831412	2831417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
46007	NC_014334	CCA	2	6	2831427	2831432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067903
46008	NC_014334	CAT	2	6	2831475	2831480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46009	NC_014334	CAT	2	6	2831500	2831505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46010	NC_014334	TCG	2	6	2831579	2831584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067903
46011	NC_014334	ATC	2	6	2831626	2831631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46012	NC_014334	ACA	3	9	2831715	2831723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067903
46013	NC_014334	TTC	2	6	2831924	2831929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
46014	NC_014334	CAA	2	6	2831943	2831948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067903
46015	NC_014334	ATC	2	6	2831986	2831991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46016	NC_014334	TTG	2	6	2831998	2832003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067903
46017	NC_014334	ACGT	2	8	2832041	2832048	25 %	25 %	25 %	25 %	301067903
46018	NC_014334	CAA	2	6	2832051	2832056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067903
46019	NC_014334	CTT	2	6	2832094	2832099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
46020	NC_014334	TGA	2	6	2832152	2832157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067903
46021	NC_014334	TTG	2	6	2832158	2832163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067903
46022	NC_014334	GGT	2	6	2832235	2832240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067903
46023	NC_014334	TCT	3	9	2832324	2832332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067903
46024	NC_014334	GCT	2	6	2832341	2832346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067903
46025	NC_014334	CGC	2	6	2832363	2832368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067903
46026	NC_014334	TGA	2	6	2832384	2832389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067903
46027	NC_014334	CAT	2	6	2832493	2832498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067903
46028	NC_014334	TCC	2	6	2832533	2832538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067904
46029	NC_014334	ACA	2	6	2832603	2832608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067904
46030	NC_014334	AAC	2	6	2832646	2832651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067904
46031	NC_014334	TCA	2	6	2832665	2832670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067904
46032	NC_014334	ATC	2	6	2832676	2832681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067904
46033	NC_014334	AT	3	6	2832734	2832739	50 %	50 %	0 %	0 %	301067904
46034	NC_014334	GGCC	2	8	2832867	2832874	0 %	0 %	50 %	50 %	301067904
46035	NC_014334	CTT	2	6	2832885	2832890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067904
46036	NC_014334	TCA	2	6	2832942	2832947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067904
46037	NC_014334	T	7	7	2832964	2832970	0 %	100 %	0 %	0 %	301067904
46038	NC_014334	TCAT	2	8	2832975	2832982	25 %	50 %	0 %	25 %	301067904
46039	NC_014334	TGA	2	6	2832994	2832999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067905
46040	NC_014334	GTT	2	6	2833047	2833052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067905
46041	NC_014334	GCG	2	6	2833180	2833185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067905
46042	NC_014334	ACT	2	6	2833229	2833234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067905
46043	NC_014334	GAC	2	6	2833310	2833315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067905
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46045	NC_014334	TCA	2	6	2833425	2833430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067905
46046	NC_014334	GCT	2	6	2833431	2833436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067905
46047	NC_014334	CTT	2	6	2833507	2833512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067905
46048	NC_014334	TCA	2	6	2833554	2833559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067905
46049	NC_014334	TGA	2	6	2833576	2833581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067905
46050	NC_014334	TCG	2	6	2833615	2833620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067905
46051	NC_014334	TGATCT	2	12	2833675	2833686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301067905
46052	NC_014334	GCT	2	6	2833770	2833775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067905
46053	NC_014334	ACA	2	6	2833816	2833821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067905
46054	NC_014334	TTG	2	6	2833880	2833885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067905
46055	NC_014334	TCG	2	6	2833911	2833916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067905
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46061	NC_014334	TGC	2	6	2834390	2834395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067905
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46086	NC_014334	GAAA	2	8	2835845	2835852	75 %	0 %	25 %	0 %	301067906
46087	NC_014334	CAA	2	6	2835874	2835879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067906
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46092	NC_014334	TCA	2	6	2836036	2836041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067906
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46094	NC_014334	CCTGGA	2	12	2836161	2836172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301067906
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46097	NC_014334	ATT	2	6	2836259	2836264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067906
46098	NC_014334	CAA	2	6	2836310	2836315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067906
46099	NC_014334	TGAT	2	8	2836320	2836327	25 %	50 %	25 %	0 %	301067906
46100	NC_014334	AAT	2	6	2836370	2836375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067906
46101	NC_014334	GAA	2	6	2836388	2836393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067906
46102	NC_014334	AAT	2	6	2836418	2836423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067906
46103	NC_014334	GTT	2	6	2836436	2836441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067906
46104	NC_014334	ATCTT	2	10	2836467	2836476	20 %	60 %	0 %	20 %	301067906
46105	NC_014334	GTC	2	6	2836484	2836489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067906
46106	NC_014334	CTT	2	6	2836493	2836498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067906
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46109	NC_014334	GCA	2	6	2836578	2836583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067906
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46111	NC_014334	CGC	2	6	2836597	2836602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067906
46112	NC_014334	CCA	2	6	2836615	2836620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067906
46113	NC_014334	ACCA	2	8	2836705	2836712	50 %	0 %	0 %	50 %	301067906
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46115	NC_014334	TAA	2	6	2836732	2836737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067906
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46333	NC_014334	TGAG	2	8	2850226	2850233	25 %	25 %	50 %	0 %	301067916
46334	NC_014334	A	6	6	2850301	2850306	100 %	0 %	0 %	0 %	301067916
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46342	NC_014334	TTG	2	6	2850664	2850669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067916
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46344	NC_014334	CGG	2	6	2850905	2850910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067916
46345	NC_014334	GAT	2	6	2851038	2851043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067916
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46460	NC_014334	CAA	2	6	2857137	2857142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
46461	NC_014334	CCTTG	2	10	2857170	2857179	0 %	40 %	20 %	40 %	301067924
46462	NC_014334	AGC	2	6	2857235	2857240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067924
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46464	NC_014334	TCA	2	6	2857256	2857261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067924
46465	NC_014334	CAA	2	6	2857536	2857541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
46466	NC_014334	ACA	2	6	2857565	2857570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
46467	NC_014334	TCA	2	6	2857619	2857624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067924
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46470	NC_014334	ACGT	2	8	2858404	2858411	25 %	25 %	25 %	25 %	301067926
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46475	NC_014334	GTG	2	6	2858746	2858751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067926
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46483	NC_014334	CGCT	2	8	2859152	2859159	0 %	25 %	25 %	50 %	301067927
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46485	NC_014334	CTG	2	6	2859242	2859247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067927
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46491	NC_014334	TCA	2	6	2859606	2859611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067927
46492	NC_014334	CTT	2	6	2859650	2859655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067927
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