MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_014334	GAT	2	6	2800106	2800111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067875
45503	NC_014334	TAA	2	6	2800141	2800146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067875
45504	NC_014334	CCAG	2	8	2800165	2800172	25 %	0 %	25 %	50 %	301067875
45505	NC_014334	ATC	2	6	2800218	2800223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067875
45506	NC_014334	TGA	2	6	2800247	2800252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067875
45507	NC_014334	TTG	2	6	2800267	2800272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067875
45508	NC_014334	ATC	2	6	2800275	2800280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067875
45509	NC_014334	CCG	2	6	2800424	2800429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067875
45510	NC_014334	TAA	2	6	2800435	2800440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067875
45511	NC_014334	TGC	2	6	2800462	2800467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067875
45512	NC_014334	ATT	2	6	2800626	2800631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067875
45513	NC_014334	GCC	2	6	2800693	2800698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067875
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45516	NC_014334	ACTG	2	8	2801123	2801130	25 %	25 %	25 %	25 %	301067877
45517	NC_014334	CGA	3	9	2801132	2801140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067877
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45519	NC_014334	CG	3	6	2801406	2801411	0 %	0 %	50 %	50 %	301067877
45520	NC_014334	CTT	2	6	2801489	2801494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067877
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45522	NC_014334	GCA	2	6	2801697	2801702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067878
45523	NC_014334	ATC	2	6	2801709	2801714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067878
45524	NC_014334	ATG	3	9	2801718	2801726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067878
45525	NC_014334	ACG	2	6	2801761	2801766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067878
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45527	NC_014334	A	7	7	2801789	2801795	100 %	0 %	0 %	0 %	301067878
45528	NC_014334	TTGA	2	8	2801799	2801806	25 %	50 %	25 %	0 %	301067878
45529	NC_014334	TTG	2	6	2801820	2801825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067878
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45532	NC_014334	ATA	2	6	2801978	2801983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067878
45533	NC_014334	GGAATC	2	12	2802003	2802014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301067878
45534	NC_014334	CGTT	2	8	2802045	2802052	0 %	50 %	25 %	25 %	301067878
45535	NC_014334	AG	3	6	2802110	2802115	50 %	0 %	50 %	0 %	301067878
45536	NC_014334	CAA	2	6	2802178	2802183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067878
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45539	NC_014334	CGA	2	6	2802686	2802691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067879
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45550	NC_014334	A	6	6	2803178	2803183	100 %	0 %	0 %	0 %	301067879
45551	NC_014334	TGC	2	6	2803187	2803192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067879
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45554	NC_014334	A	6	6	2803264	2803269	100 %	0 %	0 %	0 %	301067879
45555	NC_014334	CGACA	2	10	2803336	2803345	40 %	0 %	20 %	40 %	301067879
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45599	NC_014334	CA	3	6	2805620	2805625	50 %	0 %	0 %	50 %	301067881
45600	NC_014334	GCGA	2	8	2805636	2805643	25 %	0 %	50 %	25 %	301067881
45601	NC_014334	GCA	2	6	2805677	2805682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067881
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45603	NC_014334	GCA	2	6	2805997	2806002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067881
45604	NC_014334	AACA	2	8	2806068	2806075	75 %	0 %	0 %	25 %	301067881
45605	NC_014334	CAT	2	6	2806079	2806084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067881
45606	NC_014334	ATTT	2	8	2806116	2806123	25 %	75 %	0 %	0 %	301067881
45607	NC_014334	CAA	2	6	2806124	2806129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067881
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45610	NC_014334	CAGC	2	8	2806231	2806238	25 %	0 %	25 %	50 %	301067881
45611	NC_014334	CAG	2	6	2806243	2806248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067881
45612	NC_014334	TCAGC	2	10	2806249	2806258	20 %	20 %	20 %	40 %	301067881
45613	NC_014334	TCT	2	6	2806317	2806322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067881
45614	NC_014334	TC	3	6	2806329	2806334	0 %	50 %	0 %	50 %	301067881
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45616	NC_014334	GTC	2	6	2806371	2806376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067881
45617	NC_014334	TGG	2	6	2806417	2806422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067881
45618	NC_014334	CCG	2	6	2806463	2806468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067881
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45647	NC_014334	TTTA	2	8	2808799	2808806	25 %	75 %	0 %	0 %	301067883
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45724	NC_014334	AGCA	2	8	2813605	2813612	50 %	0 %	25 %	25 %	301067888
45725	NC_014334	ATT	2	6	2813614	2813619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067888
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45733	NC_014334	AAC	2	6	2814281	2814286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067888
45734	NC_014334	AGC	2	6	2814313	2814318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067888
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45748	NC_014334	AAAT	2	8	2815107	2815114	75 %	25 %	0 %	0 %	301067889
45749	NC_014334	GCA	2	6	2815181	2815186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067889
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45966	NC_014334	CGCC	2	8	2828805	2828812	0 %	0 %	25 %	75 %	301067900
45967	NC_014334	AAT	2	6	2829025	2829030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067900
45968	NC_014334	TTA	2	6	2829283	2829288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067901
45969	NC_014334	CCG	2	6	2829308	2829313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067901
45970	NC_014334	CGC	2	6	2829337	2829342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067901
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45996	NC_014334	GCC	3	9	2831002	2831010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067902
45997	NC_014334	ATCA	2	8	2831017	2831024	50 %	25 %	0 %	25 %	301067902
45998	NC_014334	GCG	2	6	2831044	2831049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067902
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46000	NC_014334	CTG	2	6	2831077	2831082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067902

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