MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_014334	TGA	2	6	2707854	2707859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067778
44003	NC_014334	AGC	2	6	2707865	2707870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067778
44004	NC_014334	CAA	2	6	2707993	2707998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067778
44005	NC_014334	CCA	2	6	2708019	2708024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067778
44006	NC_014334	AT	3	6	2708042	2708047	50 %	50 %	0 %	0 %	301067778
44007	NC_014334	GGT	2	6	2708117	2708122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067778
44008	NC_014334	TAAAC	2	10	2708130	2708139	60 %	20 %	0 %	20 %	301067778
44009	NC_014334	A	6	6	2708156	2708161	100 %	0 %	0 %	0 %	301067778
44010	NC_014334	CCA	2	6	2708162	2708167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067778
44011	NC_014334	CTA	2	6	2708191	2708196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067778
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44013	NC_014334	ATC	2	6	2708263	2708268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067779
44014	NC_014334	TAA	2	6	2708339	2708344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067779
44015	NC_014334	ATGT	2	8	2708396	2708403	25 %	50 %	25 %	0 %	301067779
44016	NC_014334	ATTTTT	2	12	2708583	2708594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	301067779
44017	NC_014334	T	6	6	2708661	2708666	0 %	100 %	0 %	0 %	301067779
44018	NC_014334	CT	3	6	2708670	2708675	0 %	50 %	0 %	50 %	301067779
44019	NC_014334	CAA	2	6	2708681	2708686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067779
44020	NC_014334	ATCAA	2	10	2708785	2708794	60 %	20 %	0 %	20 %	301067779
44021	NC_014334	AGC	2	6	2708829	2708834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067779
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44027	NC_014334	CTTCA	2	10	2709162	2709171	20 %	40 %	0 %	40 %	301067779
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44031	NC_014334	TCA	2	6	2709677	2709682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067780
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44033	NC_014334	A	7	7	2709756	2709762	100 %	0 %	0 %	0 %	301067780
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44044	NC_014334	ACT	2	6	2710090	2710095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067780
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44054	NC_014334	TCA	2	6	2711097	2711102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067782
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44233	NC_014334	GC	3	6	2722151	2722156	0 %	0 %	50 %	50 %	301067794
44234	NC_014334	CAAC	2	8	2722181	2722188	50 %	0 %	0 %	50 %	301067794
44235	NC_014334	TGCT	2	8	2722303	2722310	0 %	50 %	25 %	25 %	301067795
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44338	NC_014334	GCCAA	2	10	2728005	2728014	40 %	0 %	20 %	40 %	301067801
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44340	NC_014334	AGAA	2	8	2728073	2728080	75 %	0 %	25 %	0 %	301067801
44341	NC_014334	CCGCC	2	10	2728189	2728198	0 %	0 %	20 %	80 %	301067801
44342	NC_014334	AAT	2	6	2728212	2728217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067801
44343	NC_014334	ACGGC	2	10	2729144	2729153	20 %	0 %	40 %	40 %	301067802
44344	NC_014334	TCA	2	6	2729230	2729235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067802
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44346	NC_014334	CGG	2	6	2729258	2729263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067802
44347	NC_014334	T	6	6	2729266	2729271	0 %	100 %	0 %	0 %	301067802
44348	NC_014334	GAT	2	6	2729279	2729284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067802
44349	NC_014334	AT	3	6	2729335	2729340	50 %	50 %	0 %	0 %	301067802
44350	NC_014334	AAC	2	6	2729344	2729349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067802
44351	NC_014334	CTG	2	6	2729364	2729369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067802
44352	NC_014334	TA	3	6	2729626	2729631	50 %	50 %	0 %	0 %	301067802
44353	NC_014334	TTG	2	6	2729640	2729645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067802
44354	NC_014334	CTTCA	2	10	2729664	2729673	20 %	40 %	0 %	40 %	301067802
44355	NC_014334	TGT	2	6	2729680	2729685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067802
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44454	NC_014334	GCTC	2	8	2736410	2736417	0 %	25 %	25 %	50 %	301067811
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44465	NC_014334	T	6	6	2737001	2737006	0 %	100 %	0 %	0 %	301067812
44466	NC_014334	CAG	2	6	2737039	2737044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067812
44467	NC_014334	CAT	2	6	2737090	2737095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067812
44468	NC_014334	GCG	2	6	2737282	2737287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067812
44469	NC_014334	TGA	2	6	2737319	2737324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067812
44470	NC_014334	TGG	2	6	2737354	2737359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067812
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44473	NC_014334	GTT	2	6	2737516	2737521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067813
44474	NC_014334	TCT	2	6	2737536	2737541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067813
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44484	NC_014334	CAA	2	6	2738508	2738513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067814
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44488	NC_014334	A	7	7	2738724	2738730	100 %	0 %	0 %	0 %	301067815
44489	NC_014334	GCC	2	6	2738744	2738749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067815
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44492	NC_014334	ACA	2	6	2738875	2738880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067815
44493	NC_014334	CCA	2	6	2738887	2738892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067815
44494	NC_014334	TCA	2	6	2738908	2738913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067815
44495	NC_014334	GGC	2	6	2739024	2739029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067815
44496	NC_014334	TATGG	2	10	2739182	2739191	20 %	40 %	40 %	0 %	301067816
44497	NC_014334	TTTC	2	8	2739383	2739390	0 %	75 %	0 %	25 %	301067816
44498	NC_014334	GCT	2	6	2739410	2739415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067816
44499	NC_014334	TCCTTA	2	12	2739445	2739456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067816
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