MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_014334	GATT	2	8	2649420	2649427	25 %	50 %	25 %	0 %	301067718
43003	NC_014334	GCTT	2	8	2649501	2649508	0 %	50 %	25 %	25 %	301067718
43004	NC_014334	TTC	2	6	2649550	2649555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067718
43005	NC_014334	T	6	6	2649628	2649633	0 %	100 %	0 %	0 %	301067718
43006	NC_014334	CAT	2	6	2649643	2649648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067718
43007	NC_014334	T	6	6	2649655	2649660	0 %	100 %	0 %	0 %	301067718
43008	NC_014334	TTTA	2	8	2649730	2649737	25 %	75 %	0 %	0 %	301067718
43009	NC_014334	TCT	2	6	2649765	2649770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067718
43010	NC_014334	TGC	2	6	2649808	2649813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067718
43011	NC_014334	TGA	2	6	2649918	2649923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067718
43012	NC_014334	ATA	2	6	2649989	2649994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067718
43013	NC_014334	TTCA	2	8	2649997	2650004	25 %	50 %	0 %	25 %	301067718
43014	NC_014334	TCCT	2	8	2650101	2650108	0 %	50 %	0 %	50 %	301067719
43015	NC_014334	GT	3	6	2650136	2650141	0 %	50 %	50 %	0 %	301067719
43016	NC_014334	CCG	2	6	2650195	2650200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067719
43017	NC_014334	CAC	2	6	2650292	2650297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067719
43018	NC_014334	TC	3	6	2650361	2650366	0 %	50 %	0 %	50 %	301067719
43019	NC_014334	T	7	7	2650406	2650412	0 %	100 %	0 %	0 %	301067719
43020	NC_014334	T	6	6	2650427	2650432	0 %	100 %	0 %	0 %	301067719
43021	NC_014334	TCT	2	6	2650438	2650443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067719
43022	NC_014334	TCG	2	6	2650446	2650451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067719
43023	NC_014334	CTT	2	6	2650478	2650483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067719
43024	NC_014334	T	6	6	2650664	2650669	0 %	100 %	0 %	0 %	301067719
43025	NC_014334	CTT	2	6	2650716	2650721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067719
43026	NC_014334	TCA	2	6	2650759	2650764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067719
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43028	NC_014334	GTC	2	6	2650963	2650968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067719
43029	NC_014334	CCG	2	6	2650973	2650978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067719
43030	NC_014334	CAA	2	6	2650994	2650999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067719
43031	NC_014334	TGC	2	6	2651145	2651150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067719
43032	NC_014334	ATC	2	6	2651286	2651291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067719
43033	NC_014334	ATA	2	6	2651296	2651301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067719
43034	NC_014334	TGGA	2	8	2651371	2651378	25 %	25 %	50 %	0 %	301067720
43035	NC_014334	TCT	2	6	2651382	2651387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067720
43036	NC_014334	AAT	2	6	2651437	2651442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067720
43037	NC_014334	TGC	3	9	2651443	2651451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067720
43038	NC_014334	AGC	2	6	2651470	2651475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067720
43039	NC_014334	GCA	2	6	2651501	2651506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067720
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43042	NC_014334	AAC	2	6	2651617	2651622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067720
43043	NC_014334	AGA	2	6	2651628	2651633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067720
43044	NC_014334	ATA	2	6	2651642	2651647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067720
43045	NC_014334	CAA	2	6	2651664	2651669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067720
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43049	NC_014334	GCC	2	6	2651953	2651958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067720
43050	NC_014334	TTG	2	6	2651963	2651968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067720
43051	NC_014334	GAA	2	6	2652022	2652027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067720
43052	NC_014334	ACA	2	6	2652083	2652088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067720
43053	NC_014334	GCC	2	6	2652199	2652204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067720
43054	NC_014334	A	6	6	2652211	2652216	100 %	0 %	0 %	0 %	301067720
43055	NC_014334	AGC	2	6	2652251	2652256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067720
43056	NC_014334	CAT	2	6	2652265	2652270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067720
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43058	NC_014334	A	8	8	2652597	2652604	100 %	0 %	0 %	0 %	301067721
43059	NC_014334	TGT	2	6	2652619	2652624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067721
43060	NC_014334	TC	3	6	2652627	2652632	0 %	50 %	0 %	50 %	301067721
43061	NC_014334	GGT	2	6	2652635	2652640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067721
43062	NC_014334	ACT	2	6	2652649	2652654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067721
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43064	NC_014334	AGAC	2	8	2652667	2652674	50 %	0 %	25 %	25 %	301067721
43065	NC_014334	TA	3	6	2652735	2652740	50 %	50 %	0 %	0 %	301067721
43066	NC_014334	TCT	2	6	2652839	2652844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067721
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43070	NC_014334	TGA	2	6	2652967	2652972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067721
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43084	NC_014334	AAT	2	6	2653723	2653728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067721
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43086	NC_014334	TGCGC	2	10	2653765	2653774	0 %	20 %	40 %	40 %	301067721
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43093	NC_014334	ACCA	2	8	2654520	2654527	50 %	0 %	0 %	50 %	301067722
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43099	NC_014334	CT	3	6	2654776	2654781	0 %	50 %	0 %	50 %	301067722
43100	NC_014334	A	6	6	2654793	2654798	100 %	0 %	0 %	0 %	301067722
43101	NC_014334	GCT	2	6	2654827	2654832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067722
43102	NC_014334	CAAG	2	8	2654894	2654901	50 %	0 %	25 %	25 %	301067722
43103	NC_014334	AATT	2	8	2654985	2654992	50 %	50 %	0 %	0 %	301067722
43104	NC_014334	T	6	6	2655000	2655005	0 %	100 %	0 %	0 %	301067722
43105	NC_014334	TTGC	2	8	2655779	2655786	0 %	50 %	25 %	25 %	301067723
43106	NC_014334	TTG	2	6	2655911	2655916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067723
43107	NC_014334	AGA	2	6	2655948	2655953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067723
43108	NC_014334	AAGA	2	8	2655997	2656004	75 %	0 %	25 %	0 %	301067723
43109	NC_014334	TCAT	2	8	2656146	2656153	25 %	50 %	0 %	25 %	301067724
43110	NC_014334	GCA	2	6	2656242	2656247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067724
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43112	NC_014334	GGT	2	6	2656449	2656454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067724
43113	NC_014334	TTC	2	6	2656464	2656469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067724
43114	NC_014334	ATT	3	9	2656524	2656532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067724
43115	NC_014334	TGG	2	6	2656604	2656609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067724
43116	NC_014334	A	6	6	2656680	2656685	100 %	0 %	0 %	0 %	301067724
43117	NC_014334	CGA	2	6	2656691	2656696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067724
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43231	NC_014334	CG	3	6	2663940	2663945	0 %	0 %	50 %	50 %	301067730
43232	NC_014334	TGT	2	6	2664102	2664107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067730
43233	NC_014334	ATCA	2	8	2664145	2664152	50 %	25 %	0 %	25 %	301067730
43234	NC_014334	ATC	2	6	2664190	2664195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067730
43235	NC_014334	ATA	2	6	2664196	2664201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067730
43236	NC_014334	ATC	2	6	2664232	2664237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067730
43237	NC_014334	ATG	2	6	2664265	2664270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067730
43238	NC_014334	GTT	2	6	2664357	2664362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067730
43239	NC_014334	CTG	2	6	2664402	2664407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067730
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43241	NC_014334	GAT	2	6	2664737	2664742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067731
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43247	NC_014334	GCC	2	6	2665169	2665174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067731
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43259	NC_014334	TCG	2	6	2665569	2665574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067732
43260	NC_014334	CAACA	2	10	2665598	2665607	60 %	0 %	0 %	40 %	301067732
43261	NC_014334	ATC	2	6	2665629	2665634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067732
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43335	NC_014334	ACG	2	6	2670126	2670131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067737
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43339	NC_014334	CCAA	2	8	2670330	2670337	50 %	0 %	0 %	50 %	301067737
43340	NC_014334	CCTT	2	8	2670402	2670409	0 %	50 %	0 %	50 %	301067737
43341	NC_014334	TGG	2	6	2670427	2670432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067737
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43346	NC_014334	TCA	2	6	2670822	2670827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067739
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43464	NC_014334	ATG	2	6	2677909	2677914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067746
43465	NC_014334	TTGA	2	8	2677935	2677942	25 %	50 %	25 %	0 %	301067746
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43492	NC_014334	CGT	2	6	2679786	2679791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067748
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43494	NC_014334	TGCT	2	8	2679934	2679941	0 %	50 %	25 %	25 %	301067749
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43497	NC_014334	GCC	2	6	2680157	2680162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067749
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