MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_014334	GCA	2	6	2622181	2622186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42502	NC_014334	TTC	2	6	2622188	2622193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067693
42503	NC_014334	TCTG	2	8	2622208	2622215	0 %	50 %	25 %	25 %	301067693
42504	NC_014334	TTC	2	6	2622218	2622223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067693
42505	NC_014334	GCCC	2	8	2622264	2622271	0 %	0 %	25 %	75 %	301067693
42506	NC_014334	TCG	2	6	2622304	2622309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42507	NC_014334	AAC	2	6	2622348	2622353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067693
42508	NC_014334	GTT	2	6	2622379	2622384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067693
42509	NC_014334	CAC	2	6	2622452	2622457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067693
42510	NC_014334	GTC	2	6	2622535	2622540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42511	NC_014334	GAC	2	6	2622557	2622562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42512	NC_014334	ATC	2	6	2622582	2622587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067693
42513	NC_014334	GTA	2	6	2622677	2622682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067693
42514	NC_014334	T	6	6	2622749	2622754	0 %	100 %	0 %	0 %	301067693
42515	NC_014334	TAA	2	6	2622768	2622773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067693
42516	NC_014334	ATGAAC	2	12	2622803	2622814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301067693
42517	NC_014334	TCA	3	9	2622864	2622872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067693
42518	NC_014334	GCA	2	6	2622900	2622905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42519	NC_014334	GCC	2	6	2622954	2622959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067693
42520	NC_014334	CCA	2	6	2622994	2622999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067693
42521	NC_014334	GCA	2	6	2623026	2623031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067693
42522	NC_014334	TTGA	2	8	2623033	2623040	25 %	50 %	25 %	0 %	301067693
42523	NC_014334	TCAA	2	8	2623057	2623064	50 %	25 %	0 %	25 %	301067693
42524	NC_014334	CGC	2	6	2623114	2623119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067694
42525	NC_014334	ATGA	2	8	2623127	2623134	50 %	25 %	25 %	0 %	301067694
42526	NC_014334	ATC	2	6	2623154	2623159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067694
42527	NC_014334	AT	3	6	2623195	2623200	50 %	50 %	0 %	0 %	301067694
42528	NC_014334	CAAG	2	8	2623237	2623244	50 %	0 %	25 %	25 %	301067694
42529	NC_014334	CAA	2	6	2623276	2623281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067694
42530	NC_014334	TCACC	2	10	2623324	2623333	20 %	20 %	0 %	60 %	301067694
42531	NC_014334	CCA	2	6	2623360	2623365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067694
42532	NC_014334	ATC	2	6	2623370	2623375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067694
42533	NC_014334	TCC	2	6	2623449	2623454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067694
42534	NC_014334	ATC	2	6	2623478	2623483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067694
42535	NC_014334	CAGT	2	8	2623492	2623499	25 %	25 %	25 %	25 %	301067694
42536	NC_014334	ATA	3	9	2623539	2623547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067694
42537	NC_014334	GCA	2	6	2623603	2623608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067694
42538	NC_014334	TCCAA	2	10	2623609	2623618	40 %	20 %	0 %	40 %	301067694
42539	NC_014334	AAT	2	6	2623619	2623624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067694
42540	NC_014334	TGT	2	6	2623718	2623723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067694
42541	NC_014334	TCA	2	6	2624107	2624112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067695
42542	NC_014334	ATC	2	6	2624154	2624159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067695
42543	NC_014334	CTTC	2	8	2624165	2624172	0 %	50 %	0 %	50 %	301067695
42544	NC_014334	TGAT	2	8	2624236	2624243	25 %	50 %	25 %	0 %	301067695
42545	NC_014334	ATC	2	6	2624287	2624292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067695
42546	NC_014334	GTC	3	9	2624376	2624384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067695
42547	NC_014334	CACCG	2	10	2624394	2624403	20 %	0 %	20 %	60 %	301067695
42548	NC_014334	CGA	2	6	2624465	2624470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067695
42549	NC_014334	GGC	2	6	2624538	2624543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067695
42550	NC_014334	GC	3	6	2624584	2624589	0 %	0 %	50 %	50 %	301067695
42551	NC_014334	CCA	2	6	2624612	2624617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067695
42552	NC_014334	ATA	2	6	2624634	2624639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067695
42553	NC_014334	CAA	2	6	2624679	2624684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067695
42554	NC_014334	TTGC	2	8	2624705	2624712	0 %	50 %	25 %	25 %	301067695
42555	NC_014334	ATG	2	6	2624763	2624768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067695
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42560	NC_014334	ATA	2	6	2625058	2625063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067695
42561	NC_014334	GACC	2	8	2625116	2625123	25 %	0 %	25 %	50 %	301067695
42562	NC_014334	GCC	2	6	2625171	2625176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067695
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42566	NC_014334	CAT	2	6	2625372	2625377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067695
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42589	NC_014334	CG	3	6	2626275	2626280	0 %	0 %	50 %	50 %	301067696
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42601	NC_014334	CA	3	6	2626892	2626897	50 %	0 %	0 %	50 %	301067696
42602	NC_014334	GGTT	2	8	2626912	2626919	0 %	50 %	50 %	0 %	301067696
42603	NC_014334	ATT	2	6	2626973	2626978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067696
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42607	NC_014334	TTG	2	6	2627248	2627253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067697
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42967	NC_014334	TTG	2	6	2647253	2647258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067716
42968	NC_014334	TGC	2	6	2647269	2647274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067716
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