MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_014334	GGC	2	6	2559067	2559072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067629
41503	NC_014334	CCA	2	6	2559155	2559160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067629
41504	NC_014334	CCA	2	6	2559179	2559184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067629
41505	NC_014334	GGAATG	2	12	2559235	2559246	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	301067629
41506	NC_014334	ATC	2	6	2559310	2559315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067629
41507	NC_014334	GTC	2	6	2559333	2559338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067629
41508	NC_014334	GGA	2	6	2559413	2559418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067629
41509	NC_014334	A	6	6	2559721	2559726	100 %	0 %	0 %	0 %	301067630
41510	NC_014334	CGAA	2	8	2559750	2559757	50 %	0 %	25 %	25 %	301067630
41511	NC_014334	TCA	2	6	2559850	2559855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067630
41512	NC_014334	GCA	2	6	2559863	2559868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067630
41513	NC_014334	TGG	2	6	2559873	2559878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067630
41514	NC_014334	CAA	2	6	2559888	2559893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067630
41515	NC_014334	TTG	2	6	2559948	2559953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067630
41516	NC_014334	CCA	2	6	2560006	2560011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067630
41517	NC_014334	CAA	3	9	2560016	2560024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067630
41518	NC_014334	CTG	2	6	2560145	2560150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067631
41519	NC_014334	T	7	7	2560172	2560178	0 %	100 %	0 %	0 %	301067631
41520	NC_014334	AACT	2	8	2560250	2560257	50 %	25 %	0 %	25 %	301067631
41521	NC_014334	CCA	2	6	2560303	2560308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067631
41522	NC_014334	TCA	2	6	2560326	2560331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067631
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41524	NC_014334	ATTGC	2	10	2560344	2560353	20 %	40 %	20 %	20 %	301067631
41525	NC_014334	CTG	2	6	2560406	2560411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067631
41526	NC_014334	TAA	2	6	2560508	2560513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067631
41527	NC_014334	ACG	2	6	2560524	2560529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067631
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41530	NC_014334	CAC	2	6	2560613	2560618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067631
41531	NC_014334	GCG	2	6	2560652	2560657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067631
41532	NC_014334	TTG	2	6	2560663	2560668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067631
41533	NC_014334	TCG	2	6	2560678	2560683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067631
41534	NC_014334	CGA	2	6	2560688	2560693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067631
41535	NC_014334	ATGCGG	2	12	2560704	2560715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	301067631
41536	NC_014334	TGT	2	6	2560735	2560740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067631
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41539	NC_014334	GCA	2	6	2560792	2560797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067631
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41541	NC_014334	CCG	3	9	2560918	2560926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067631
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41546	NC_014334	TCATT	2	10	2561313	2561322	20 %	60 %	0 %	20 %	301067632
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41550	NC_014334	CAA	2	6	2561528	2561533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067632
41551	NC_014334	GTT	2	6	2561582	2561587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067632
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41553	NC_014334	TGC	2	6	2561614	2561619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067632
41554	NC_014334	GGCA	2	8	2561781	2561788	25 %	0 %	50 %	25 %	301067632
41555	NC_014334	ATT	2	6	2561789	2561794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067632
41556	NC_014334	ATG	2	6	2561811	2561816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067632
41557	NC_014334	CGA	2	6	2561874	2561879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067632
41558	NC_014334	ATCT	2	8	2561909	2561916	25 %	50 %	0 %	25 %	301067632
41559	NC_014334	TTCT	2	8	2561934	2561941	0 %	75 %	0 %	25 %	301067632
41560	NC_014334	TGGT	2	8	2561960	2561967	0 %	50 %	50 %	0 %	301067632
41561	NC_014334	GGC	2	6	2562008	2562013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067632
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41571	NC_014334	CTTT	2	8	2562794	2562801	0 %	75 %	0 %	25 %	301067634
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41600	NC_014334	GGCG	2	8	2564696	2564703	0 %	0 %	75 %	25 %	301067635
41601	NC_014334	TA	3	6	2564725	2564730	50 %	50 %	0 %	0 %	301067635
41602	NC_014334	T	6	6	2564849	2564854	0 %	100 %	0 %	0 %	301067635
41603	NC_014334	TGA	2	6	2564878	2564883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067635
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41609	NC_014334	T	8	8	2565164	2565171	0 %	100 %	0 %	0 %	301067636
41610	NC_014334	GCT	2	6	2565213	2565218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067637
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41734	NC_014334	ACA	2	6	2571614	2571619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067642
41735	NC_014334	CAT	2	6	2571641	2571646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067642
41736	NC_014334	CAACC	2	10	2571650	2571659	40 %	0 %	0 %	60 %	301067642
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41738	NC_014334	TCG	2	6	2571754	2571759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067642
41739	NC_014334	CAT	2	6	2571765	2571770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067642
41740	NC_014334	TGA	3	9	2572233	2572241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067643
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41750	NC_014334	CTTG	2	8	2573484	2573491	0 %	50 %	25 %	25 %	301067645
41751	NC_014334	GC	3	6	2573518	2573523	0 %	0 %	50 %	50 %	301067645
41752	NC_014334	TGA	2	6	2573556	2573561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067645
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41764	NC_014334	GCA	2	6	2574191	2574196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067646
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41846	NC_014334	CAC	2	6	2580023	2580028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067651
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