MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_014334	TTC	2	6	2525052	2525057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067598
41003	NC_014334	CTTGG	2	10	2525084	2525093	0 %	40 %	40 %	20 %	301067598
41004	NC_014334	CAG	2	6	2525098	2525103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067598
41005	NC_014334	TGC	2	6	2525189	2525194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067598
41006	NC_014334	ATG	2	6	2525336	2525341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067598
41007	NC_014334	TCC	2	6	2525357	2525362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067599
41008	NC_014334	TGCA	2	8	2525395	2525402	25 %	25 %	25 %	25 %	301067599
41009	NC_014334	CAT	2	6	2525415	2525420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
41010	NC_014334	TGA	2	6	2525586	2525591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067599
41011	NC_014334	CAG	2	6	2525626	2525631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067599
41012	NC_014334	CGG	2	6	2525639	2525644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067599
41013	NC_014334	TCA	2	6	2525658	2525663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
41014	NC_014334	CAG	2	6	2525667	2525672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067599
41015	NC_014334	AGT	2	6	2525709	2525714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067599
41016	NC_014334	TTCATC	2	12	2525888	2525899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067599
41017	NC_014334	AGC	2	6	2525926	2525931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067599
41018	NC_014334	TCA	2	6	2525942	2525947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
41019	NC_014334	GTG	2	6	2525979	2525984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067599
41020	NC_014334	GGT	2	6	2526008	2526013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067599
41021	NC_014334	GTT	2	6	2526067	2526072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067599
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41024	NC_014334	ATT	2	6	2526268	2526273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067599
41025	NC_014334	TCA	2	6	2526278	2526283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
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41027	NC_014334	T	6	6	2526337	2526342	0 %	100 %	0 %	0 %	301067599
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41030	NC_014334	TGC	2	6	2526467	2526472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067599
41031	NC_014334	TGA	2	6	2526663	2526668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067599
41032	NC_014334	TGCT	2	8	2526683	2526690	0 %	50 %	25 %	25 %	301067599
41033	NC_014334	TCA	2	6	2526762	2526767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
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41051	NC_014334	GTTCAA	2	12	2527586	2527597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301067600
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41087	NC_014334	GCAT	2	8	2529981	2529988	25 %	25 %	25 %	25 %	301067601
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41222	NC_014334	GCT	2	6	2538013	2538018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067610
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41224	NC_014334	CTT	2	6	2538047	2538052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067610
41225	NC_014334	TAT	2	6	2538055	2538060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067610
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41227	NC_014334	T	6	6	2538230	2538235	0 %	100 %	0 %	0 %	301067610
41228	NC_014334	GAAA	2	8	2538363	2538370	75 %	0 %	25 %	0 %	301067610
41229	NC_014334	GTA	2	6	2538374	2538379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067610
41230	NC_014334	T	6	6	2538415	2538420	0 %	100 %	0 %	0 %	301067610
41231	NC_014334	TGA	2	6	2538462	2538467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067610
41232	NC_014334	TTGA	2	8	2538518	2538525	25 %	50 %	25 %	0 %	301067610
41233	NC_014334	GTT	2	6	2538532	2538537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067610
41234	NC_014334	T	7	7	2538626	2538632	0 %	100 %	0 %	0 %	301067610
41235	NC_014334	TGAT	2	8	2538635	2538642	25 %	50 %	25 %	0 %	301067610
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41341	NC_014334	TTG	2	6	2547891	2547896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067617
41342	NC_014334	A	7	7	2547919	2547925	100 %	0 %	0 %	0 %	301067617
41343	NC_014334	ATC	2	6	2548018	2548023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067617
41344	NC_014334	CGATG	2	10	2548050	2548059	20 %	20 %	40 %	20 %	301067617
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41347	NC_014334	CTA	2	6	2548160	2548165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067617
41348	NC_014334	TTG	2	6	2548712	2548717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067618
41349	NC_014334	TTG	2	6	2548720	2548725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067618
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41451	NC_014334	ATC	2	6	2555687	2555692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067624
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41456	NC_014334	CGC	2	6	2555899	2555904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067624
41457	NC_014334	ATG	2	6	2555951	2555956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067624
41458	NC_014334	TAA	2	6	2555986	2555991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067624
41459	NC_014334	CAA	2	6	2556178	2556183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067625
41460	NC_014334	AGA	2	6	2556203	2556208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067625
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