MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_014334	ATCA	2	8	2426428	2426435	50 %	25 %	0 %	25 %	301067513
39502	NC_014334	CCT	2	6	2426445	2426450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067514
39503	NC_014334	TCG	2	6	2426459	2426464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39504	NC_014334	TGC	2	6	2426497	2426502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39505	NC_014334	CTT	2	6	2426515	2426520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39506	NC_014334	TTC	2	6	2426521	2426526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39507	NC_014334	CTG	2	6	2426527	2426532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39508	NC_014334	AGC	2	6	2426533	2426538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39509	NC_014334	TCG	3	9	2426576	2426584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39510	NC_014334	T	6	6	2426608	2426613	0 %	100 %	0 %	0 %	301067514
39511	NC_014334	ACC	2	6	2426842	2426847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067514
39512	NC_014334	ACC	2	6	2426860	2426865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067514
39513	NC_014334	GTA	2	6	2426947	2426952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067514
39514	NC_014334	AGAC	2	8	2427009	2427016	50 %	0 %	25 %	25 %	301067514
39515	NC_014334	CAA	2	6	2427243	2427248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39516	NC_014334	GAC	2	6	2427273	2427278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39517	NC_014334	CAT	2	6	2427334	2427339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39518	NC_014334	CGC	3	9	2427405	2427413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067514
39519	NC_014334	GCA	2	6	2427474	2427479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39520	NC_014334	TTC	2	6	2427484	2427489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39521	NC_014334	ACGA	2	8	2427565	2427572	50 %	0 %	25 %	25 %	301067514
39522	NC_014334	CTT	2	6	2427600	2427605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39523	NC_014334	CTT	2	6	2427633	2427638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39524	NC_014334	TTC	2	6	2427676	2427681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39525	NC_014334	CAT	2	6	2427702	2427707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39526	NC_014334	GAT	2	6	2427775	2427780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067514
39527	NC_014334	GAT	2	6	2427832	2427837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067514
39528	NC_014334	TCAACA	2	12	2427842	2427853	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39529	NC_014334	TAC	2	6	2427903	2427908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39530	NC_014334	TCA	2	6	2427918	2427923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39531	NC_014334	ACG	2	6	2427952	2427957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39532	NC_014334	TTA	2	6	2428001	2428006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067514
39533	NC_014334	CAA	2	6	2428059	2428064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39534	NC_014334	CAA	2	6	2428176	2428181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39535	NC_014334	GA	3	6	2428221	2428226	50 %	0 %	50 %	0 %	301067514
39536	NC_014334	TGT	2	6	2428233	2428238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067514
39537	NC_014334	CAA	2	6	2428269	2428274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39538	NC_014334	TCG	2	6	2428283	2428288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39539	NC_014334	TCT	2	6	2428325	2428330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39540	NC_014334	ACG	2	6	2428387	2428392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39541	NC_014334	AAC	2	6	2428423	2428428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39542	NC_014334	AAG	2	6	2428434	2428439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067514
39543	NC_014334	CCA	2	6	2428556	2428561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067514
39544	NC_014334	CAGA	2	8	2428572	2428579	50 %	0 %	25 %	25 %	301067514
39545	NC_014334	GAA	2	6	2428648	2428653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067514
39546	NC_014334	TTG	2	6	2428693	2428698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067514
39547	NC_014334	ACA	2	6	2428742	2428747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067514
39548	NC_014334	CCG	2	6	2428810	2428815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067514
39549	NC_014334	TCA	2	6	2428835	2428840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39550	NC_014334	AGT	2	6	2428872	2428877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067514
39551	NC_014334	T	6	6	2428918	2428923	0 %	100 %	0 %	0 %	301067514
39552	NC_014334	TCG	2	6	2429057	2429062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39553	NC_014334	CTT	2	6	2429200	2429205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067514
39554	NC_014334	GAA	2	6	2429254	2429259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067514
39555	NC_014334	ATC	2	6	2429356	2429361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39556	NC_014334	CGAT	2	8	2429492	2429499	25 %	25 %	25 %	25 %	301067514
39557	NC_014334	CAAGC	2	10	2429538	2429547	40 %	0 %	20 %	40 %	301067514
39558	NC_014334	TAA	3	9	2429667	2429675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067514
39559	NC_014334	TCA	2	6	2429691	2429696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067514
39560	NC_014334	TGGT	2	8	2429747	2429754	0 %	50 %	50 %	0 %	301067514
39561	NC_014334	AGT	2	6	2429784	2429789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067514
39562	NC_014334	CAG	2	6	2429833	2429838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39563	NC_014334	ATCG	2	8	2429881	2429888	25 %	25 %	25 %	25 %	301067514
39564	NC_014334	ATA	2	6	2429891	2429896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067514
39565	NC_014334	TCG	2	6	2429897	2429902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067514
39566	NC_014334	TTGC	2	8	2430417	2430424	0 %	50 %	25 %	25 %	301067515
39567	NC_014334	T	6	6	2430459	2430464	0 %	100 %	0 %	0 %	301067515
39568	NC_014334	CCG	2	6	2430552	2430557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067515
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39573	NC_014334	CCG	2	6	2430915	2430920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067515
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39579	NC_014334	CGG	2	6	2431295	2431300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067515
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39583	NC_014334	T	6	6	2431371	2431376	0 %	100 %	0 %	0 %	301067515
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39589	NC_014334	TCG	2	6	2431831	2431836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067515
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39598	NC_014334	CAT	2	6	2432130	2432135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067515
39599	NC_014334	TTG	2	6	2432143	2432148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067515
39600	NC_014334	T	6	6	2432180	2432185	0 %	100 %	0 %	0 %	301067515
39601	NC_014334	GTT	2	6	2432244	2432249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067515
39602	NC_014334	CCG	2	6	2432256	2432261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067515
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39604	NC_014334	CAA	2	6	2432303	2432308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067515
39605	NC_014334	ATCC	2	8	2432313	2432320	25 %	25 %	0 %	50 %	301067515
39606	NC_014334	CG	3	6	2432327	2432332	0 %	0 %	50 %	50 %	301067515
39607	NC_014334	GAC	2	6	2432414	2432419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067515
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39609	NC_014334	TCT	2	6	2432447	2432452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067515
39610	NC_014334	TGC	2	6	2432508	2432513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067515
39611	NC_014334	CAAGC	2	10	2432535	2432544	40 %	0 %	20 %	40 %	301067515
39612	NC_014334	CAT	2	6	2432711	2432716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067515
39613	NC_014334	ATG	3	9	2432808	2432816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067515
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39615	NC_014334	ATC	2	6	2433159	2433164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067516
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39731	NC_014334	CAC	2	6	2447660	2447665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067522
39732	NC_014334	GTC	2	6	2447732	2447737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067522
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39751	NC_014334	ATC	2	6	2448724	2448729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067523
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39842	NC_014334	CCAA	2	8	2454053	2454060	50 %	0 %	0 %	50 %	301067528
39843	NC_014334	TGC	2	6	2454164	2454169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067528
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