MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014334	ATG	2	6	215552	215557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065344
3502	NC_014334	TGG	2	6	215667	215672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065344
3503	NC_014334	GCCA	2	8	215765	215772	25 %	0 %	25 %	50 %	301065344
3504	NC_014334	GGTG	2	8	215792	215799	0 %	25 %	75 %	0 %	301065344
3505	NC_014334	TGT	2	6	215962	215967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065344
3506	NC_014334	GCC	2	6	216024	216029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065344
3507	NC_014334	GT	3	6	216077	216082	0 %	50 %	50 %	0 %	301065344
3508	NC_014334	GCA	2	6	216153	216158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065344
3509	NC_014334	TGC	2	6	216176	216181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065344
3510	NC_014334	GAT	2	6	216843	216848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065345
3511	NC_014334	GGCAT	2	10	216884	216893	20 %	20 %	40 %	20 %	301065345
3512	NC_014334	AAG	2	6	216909	216914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065345
3513	NC_014334	CAT	2	6	216981	216986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065345
3514	NC_014334	CAT	2	6	217029	217034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065345
3515	NC_014334	CAG	2	6	217039	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065345
3516	NC_014334	TTGA	2	8	217113	217120	25 %	50 %	25 %	0 %	301065345
3517	NC_014334	ATG	2	6	217360	217365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065346
3518	NC_014334	ATC	2	6	217384	217389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065346
3519	NC_014334	GGCT	2	8	217444	217451	0 %	25 %	50 %	25 %	301065346
3520	NC_014334	CGG	2	6	217464	217469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065346
3521	NC_014334	CGGCA	2	10	217488	217497	20 %	0 %	40 %	40 %	301065346
3522	NC_014334	CAT	2	6	217560	217565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065346
3523	NC_014334	CGT	2	6	217566	217571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065346
3524	NC_014334	AGG	2	6	217616	217621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065346
3525	NC_014334	CAT	2	6	217660	217665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065347
3526	NC_014334	CAA	2	6	217745	217750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065347
3527	NC_014334	TCA	2	6	217809	217814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065347
3528	NC_014334	GTT	2	6	217928	217933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065347
3529	NC_014334	AAG	2	6	217979	217984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065347
3530	NC_014334	GAA	2	6	218057	218062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065347
3531	NC_014334	GCCA	2	8	218128	218135	25 %	0 %	25 %	50 %	301065347
3532	NC_014334	TGC	2	6	218349	218354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065348
3533	NC_014334	GCA	2	6	218372	218377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065348
3534	NC_014334	GGCT	2	8	218378	218385	0 %	25 %	50 %	25 %	301065348
3535	NC_014334	GCAT	2	8	218413	218420	25 %	25 %	25 %	25 %	301065348
3536	NC_014334	GTTG	2	8	218427	218434	0 %	50 %	50 %	0 %	301065348
3537	NC_014334	CCG	2	6	218436	218441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065348
3538	NC_014334	AGC	2	6	218505	218510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065349
3539	NC_014334	A	6	6	218579	218584	100 %	0 %	0 %	0 %	301065349
3540	NC_014334	GA	3	6	218603	218608	50 %	0 %	50 %	0 %	301065349
3541	NC_014334	GAT	2	6	218637	218642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065349
3542	NC_014334	GCG	2	6	218669	218674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065349
3543	NC_014334	AAC	2	6	218777	218782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065349
3544	NC_014334	A	6	6	218789	218794	100 %	0 %	0 %	0 %	301065349
3545	NC_014334	A	8	8	218882	218889	100 %	0 %	0 %	0 %	301065349
3546	NC_014334	ACA	2	6	218931	218936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065350
3547	NC_014334	GGC	2	6	219041	219046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065350
3548	NC_014334	ATG	2	6	219047	219052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065350
3549	NC_014334	GAT	2	6	219119	219124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065350
3550	NC_014334	CAA	2	6	219187	219192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065350
3551	NC_014334	CAGC	2	8	219341	219348	25 %	0 %	25 %	50 %	301065350
3552	NC_014334	GCA	2	6	219745	219750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065351
3553	NC_014334	CAG	2	6	219758	219763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065351
3554	NC_014334	T	6	6	219764	219769	0 %	100 %	0 %	0 %	301065351
3555	NC_014334	T	6	6	219841	219846	0 %	100 %	0 %	0 %	301065351
3556	NC_014334	GAT	2	6	219858	219863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065351
3557	NC_014334	GGT	2	6	219976	219981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065351
3558	NC_014334	CGG	3	9	220046	220054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065351
3559	NC_014334	TTA	2	6	220094	220099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065351
3560	NC_014334	GCG	2	6	220111	220116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065351
3561	NC_014334	CAG	2	6	220163	220168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065351
3562	NC_014334	TTG	2	6	220174	220179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065351
3563	NC_014334	ATC	2	6	220205	220210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065351
3564	NC_014334	CAG	2	6	220312	220317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065351
3565	NC_014334	CGT	2	6	220382	220387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065352
3566	NC_014334	GTTT	2	8	220450	220457	0 %	75 %	25 %	0 %	301065352
3567	NC_014334	GTT	2	6	220524	220529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065352
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3569	NC_014334	GGT	2	6	220695	220700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065352
3570	NC_014334	GGCATT	2	12	220707	220718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065352
3571	NC_014334	GCG	2	6	220722	220727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065352
3572	NC_014334	ATC	2	6	220746	220751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065352
3573	NC_014334	TGC	2	6	220814	220819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065352
3574	NC_014334	CTG	3	9	220864	220872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065352
3575	NC_014334	TCAC	2	8	220881	220888	25 %	25 %	0 %	50 %	301065352
3576	NC_014334	ATTG	2	8	220895	220902	25 %	50 %	25 %	0 %	301065352
3577	NC_014334	GGC	2	6	220932	220937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065352
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3579	NC_014334	ATT	2	6	220974	220979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065352
3580	NC_014334	TGC	2	6	220994	220999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065352
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3583	NC_014334	GGC	2	6	221120	221125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065352
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3585	NC_014334	CTT	2	6	221240	221245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065352
3586	NC_014334	CGA	2	6	221306	221311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065353
3587	NC_014334	TGG	2	6	221477	221482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065353
3588	NC_014334	ATGGCG	2	12	221578	221589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	301065353
3589	NC_014334	GCA	2	6	221658	221663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065353
3590	NC_014334	CAG	2	6	221674	221679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065353
3591	NC_014334	T	6	6	221701	221706	0 %	100 %	0 %	0 %	301065353
3592	NC_014334	GAT	3	9	221823	221831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065353
3593	NC_014334	TAT	2	6	222077	222082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065354
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3598	NC_014334	CCAG	2	8	222356	222363	25 %	0 %	25 %	50 %	301065354
3599	NC_014334	GCA	2	6	222369	222374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065354
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3601	NC_014334	A	6	6	222420	222425	100 %	0 %	0 %	0 %	301065354
3602	NC_014334	GCCAA	2	10	222474	222483	40 %	0 %	20 %	40 %	301065354
3603	NC_014334	CAGC	2	8	222486	222493	25 %	0 %	25 %	50 %	301065354
3604	NC_014334	GAA	2	6	222496	222501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065354
3605	NC_014334	GAT	2	6	222522	222527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065354
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3607	NC_014334	GTT	2	6	222632	222637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065354
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3610	NC_014334	TG	3	6	223069	223074	0 %	50 %	50 %	0 %	301065355
3611	NC_014334	TGA	2	6	223098	223103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065355
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3615	NC_014334	ACC	2	6	223252	223257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065355
3616	NC_014334	GAA	2	6	223261	223266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065355
3617	NC_014334	GTC	2	6	223279	223284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065355
3618	NC_014334	ATCGAC	2	12	223315	223326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301065355
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3620	NC_014334	TAA	2	6	223345	223350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065355
3621	NC_014334	ATTTTA	2	12	223418	223429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065355
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3623	NC_014334	TTG	2	6	223694	223699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065356
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3742	NC_014334	ATC	2	6	230366	230371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065364
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3983	NC_014334	GCAA	2	8	244622	244629	50 %	0 %	25 %	25 %	301065376
3984	NC_014334	GAA	2	6	244688	244693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065376
3985	NC_014334	TTG	2	6	244719	244724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065376
3986	NC_014334	CTG	2	6	244749	244754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065376
3987	NC_014334	GT	3	6	244818	244823	0 %	50 %	50 %	0 %	301065376
3988	NC_014334	TCA	2	6	244936	244941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065376
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3990	NC_014334	TTA	2	6	245024	245029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065376
3991	NC_014334	CATGAT	2	12	245081	245092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301065376
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3995	NC_014334	GAT	2	6	245180	245185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065376
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3999	NC_014334	ATT	2	6	245351	245356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065376
4000	NC_014334	ATTTG	2	10	245416	245425	20 %	60 %	20 %	0 %	301065377

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