MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39116	NC_014334	CGC	2	6	2400447	2400452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067491
39117	NC_014334	CTT	2	6	2400511	2400516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067491
39118	NC_014334	TTC	2	6	2400709	2400714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067491
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39120	NC_014334	CTT	2	6	2400778	2400783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067492
39121	NC_014334	TTG	2	6	2400797	2400802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067492
39122	NC_014334	AAG	2	6	2400853	2400858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067492
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39126	NC_014334	CTG	2	6	2401211	2401216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067493
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39128	NC_014334	CG	4	8	2401412	2401419	0 %	0 %	50 %	50 %	301067493
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39135	NC_014334	CTT	2	6	2401904	2401909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067495
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39202	NC_014334	GGTC	2	8	2405281	2405288	0 %	25 %	50 %	25 %	301067502
39203	NC_014334	CGCCA	2	10	2405304	2405313	20 %	0 %	20 %	60 %	301067502
39204	NC_014334	CCG	2	6	2405378	2405383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067502
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39207	NC_014334	ACG	2	6	2405462	2405467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067502
39208	NC_014334	TA	3	6	2405538	2405543	50 %	50 %	0 %	0 %	301067502
39209	NC_014334	TAT	2	6	2405580	2405585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067503
39210	NC_014334	GCT	2	6	2405589	2405594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067503
39211	NC_014334	CAG	2	6	2405599	2405604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
39212	NC_014334	CAG	2	6	2405654	2405659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
39213	NC_014334	ATG	2	6	2405763	2405768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067503
39214	NC_014334	GAC	2	6	2405785	2405790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
39215	NC_014334	CTT	2	6	2405837	2405842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067503
39216	NC_014334	CTG	2	6	2405899	2405904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067503
39217	NC_014334	CGAA	2	8	2405970	2405977	50 %	0 %	25 %	25 %	301067503
39218	NC_014334	ACA	2	6	2406129	2406134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067503
39219	NC_014334	T	6	6	2406185	2406190	0 %	100 %	0 %	0 %	301067503
39220	NC_014334	TAATT	2	10	2406243	2406252	40 %	60 %	0 %	0 %	301067504
39221	NC_014334	CGC	2	6	2406263	2406268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067504
39222	NC_014334	TCA	2	6	2406284	2406289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067504
39223	NC_014334	TTG	2	6	2406443	2406448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067504
39224	NC_014334	TTTTG	2	10	2406535	2406544	0 %	80 %	20 %	0 %	301067504
39225	NC_014334	TGA	2	6	2406871	2406876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067505
39226	NC_014334	TCAAC	2	10	2406901	2406910	40 %	20 %	0 %	40 %	301067505
39227	NC_014334	T	6	6	2406929	2406934	0 %	100 %	0 %	0 %	301067505
39228	NC_014334	GCTAC	2	10	2406959	2406968	20 %	20 %	20 %	40 %	301067505
39229	NC_014334	TTTG	2	8	2407013	2407020	0 %	75 %	25 %	0 %	301067505
39230	NC_014334	CTT	2	6	2407046	2407051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067505
39231	NC_014334	TCA	2	6	2407100	2407105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067505
39232	NC_014334	TGC	2	6	2407165	2407170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067505
39233	NC_014334	CCAA	2	8	2407465	2407472	50 %	0 %	0 %	50 %	301067506
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39238	NC_014334	ATC	2	6	2408317	2408322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067507
39239	NC_014334	TTC	2	6	2408336	2408341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067507
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39243	NC_014334	TCA	2	6	2408657	2408662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067507
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39330	NC_014334	AGT	3	9	2414130	2414138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067511
39331	NC_014334	CATTGC	2	12	2414208	2414219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067511
39332	NC_014334	ATC	2	6	2414374	2414379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067511
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39334	NC_014334	CAG	2	6	2414416	2414421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067511
39335	NC_014334	GATCAT	2	12	2414439	2414450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301067511
39336	NC_014334	TGGT	2	8	2414471	2414478	0 %	50 %	50 %	0 %	301067511
39337	NC_014334	GTT	2	6	2414483	2414488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067511
39338	NC_014334	ACGATA	2	12	2414524	2414535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301067511
39339	NC_014334	ATC	2	6	2414581	2414586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067511
39340	NC_014334	CTT	2	6	2414602	2414607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067511
39341	NC_014334	CTT	2	6	2414629	2414634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067511
39342	NC_014334	TCAGCT	2	12	2414649	2414660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067511
39343	NC_014334	CGC	2	6	2414733	2414738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067511
39344	NC_014334	TGAG	2	8	2414853	2414860	25 %	25 %	50 %	0 %	301067511
39345	NC_014334	GCT	2	6	2414869	2414874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067511
39346	NC_014334	TGC	2	6	2414875	2414880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067511
39347	NC_014334	TTG	2	6	2414933	2414938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067511
39348	NC_014334	CAT	2	6	2415000	2415005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067511
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39352	NC_014334	GCA	2	6	2415279	2415284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067511
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39445	NC_014334	ATC	2	6	2422240	2422245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067512
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39453	NC_014334	GCCT	2	8	2422489	2422496	0 %	25 %	25 %	50 %	301067512
39454	NC_014334	GCCC	2	8	2422510	2422517	0 %	0 %	25 %	75 %	301067512
39455	NC_014334	TTC	2	6	2422879	2422884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067513
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39457	NC_014334	GGAA	2	8	2423013	2423020	50 %	0 %	50 %	0 %	301067513
39458	NC_014334	GGCC	2	8	2423078	2423085	0 %	0 %	50 %	50 %	301067513
39459	NC_014334	ACC	2	6	2423350	2423355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067513
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39461	NC_014334	GCA	2	6	2423666	2423671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067513
39462	NC_014334	ATC	2	6	2423810	2423815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067513
39463	NC_014334	ACCA	2	8	2423902	2423909	50 %	0 %	0 %	50 %	301067513
39464	NC_014334	TCATT	2	10	2423931	2423940	20 %	60 %	0 %	20 %	301067513
39465	NC_014334	CGGT	2	8	2423972	2423979	0 %	25 %	50 %	25 %	301067513
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39473	NC_014334	TCG	2	6	2424353	2424358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067513
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39492	NC_014334	ATT	2	6	2425639	2425644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067513
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39500	NC_014334	T	6	6	2426347	2426352	0 %	100 %	0 %	0 %	301067513

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